Alfa-5 integrin

Alfa-5 integrin
Elérhető struktúrák
EKT Ortológus keresés: PDBe , RCSB
Azonosítók
SzimbólumITGA5  ; CD49e; FNRA; VLA5A
Külső azonosítókOMIM:  135620 MGI :  96604 Homologén :  20508 ChEMBL : 3955 GeneCards : ITGA5 gén
RNS expressziós profil
Több információ
ortológusok
KilátásEmberiEgér
Entrez367816402
EgyüttesENSG00000161638ENSMUSG00000000555
UniProtP08648P11688
RefSeq (mRNS)NM_002205NM_010577
RefSeq (fehérje)NP_002196NP_034707
Locus (UCSC)Chr 12:
54,79 – 54,81 Mb
Chr 15:
103,34 – 103,37 Mb
Keresés a PubMedben[egy][2]


Az integrin alfa-5 (α5, CD49e ) egy membránfehérje , az integrin szupercsaládból származó glikoprotein , az ITGA5 gén terméke , az α5β1 integrin ( VLA-5 ), az egyik fő fibronektin receptor alfa alegysége . Szerepet játszik az intercelluláris interakciókban.

Funkciók

Az alfa-5/ béta-1 integrin (α5β1, angolul  nagyon késői antigén-5 , VLA-5 ) a fibronektin és a fibrinogén receptora . Felismeri a glicin-prolin-arginin (RGD) specifikus aminosavszekvenciát a ligandumok széles körében. A HIV-fertőzés során a vírusos Tat-peptiddel való kölcsönhatás fokozza az angiogenezist Kaposi-szarkómában [1] .

Kölcsönhatásba lép a HPS5 , NISCH intracelluláris fehérjékkel , valamint a RAB21 -gyel és a COMP-val. A HIV-1 vírus Tat peptidjéhez kötődik.

Szerkezet

Az alfa-5 integrin egy nagy fehérje, 1008 aminosavból áll , a fehérjerész molekulatömege 114,5 kDa . Az N-terminális régió (954 aminosav) extracelluláris, ezt követi egyetlen transzmembrán fragmentum és egy rövid intracelluláris fragmentum (28 aminosav). Az extracelluláris fragmentum 7 FG-GAP ismétlődést tartalmaz, egy SG1 motívumot, amely részt vesz a kondroitin-szulfátokkal való kölcsönhatásban, és 5-15 N-glikozilációs helyet . A citoszolikus hely tartalmazza a GFFKR motívumot és a HPS5 kötőhelyet.

A korlátozott proteolízis során az intramolekuláris kötés hidrolizálódik, és nehéz és könnyű láncok képződnek, amelyeket diszulfidkötés köt össze [2] .

Jegyzetek

  1. Uniprot adatbázis-bejegyzés a CD49e-hez (hozzáférési szám: P08648) . Letöltve: 2012. február 21. Az eredetiből archiválva : 2017. február 2..
  2. Entrez gén: ITGA5 integrin, alfa 5 (fibronektin receptor, alfa polipeptid) .

Lásd még

Bibliográfia

Linkek