Syndekan 1
A Syndecan 1 ( angolul syndecan 1; CD138 ) egy membránfehérje , a syndecan család proteoglikánja vagy transzmembrán heparán-szulfát proteoglikánok. Ebből a családból összesen 4 fehérjét írtak le. Humán géntermék SDC1 .
Funkciók
A fehérje egy transzmembrán heparán-szulfát proteoglikán, a szindekán család tagja. A szindekánok közvetítik a sejtkötést , a sejtjelátvitelt és a citoszkeleton szerveződését . Ezek a HIV vírus Tat fehérjéjének receptorai . A Syndecan 1 részt vesz a sejtproliferációban, a sejtmigrációban és az extracelluláris mátrix fehérjékkel való kölcsönhatásban. [egy]
Szerkezet
A Syndecan 1 heparán-szulfát és kondroitin-szulfát láncokat hordoz, amelyek kommunikációt biztosítanak a citoszkeleton és az extracelluláris mátrix között. CDCP1 -hez kötődik .
Az ektodomén hasítása a fehérje oldható formájának kialakulásához vezet. Hasadás történhet heparanáz, trombin és epidermális növekedési faktor hatására, valamint stressz és sebgyógyulás során.
A fehérje 288 aminosavból áll, a fehérjerész molekulatömege 32,5 kDa. Tartalmaz egy N-terminális extracelluláris domént (232 aminosav), egyetlen helikális transzmembrán fragmentumot és egy kis citoszol régiót. Az extracelluláris doménben 6 glikozilációs hely található : 3 O -kondroitin-szulfát lánc kapcsolódási hely, 2 O -heparán-szulfát lánc kapcsolódási hely és 1 N -glikozilációs hely . A citoszolos fragmens foszforilált tirozint tartalmaz .
Alkalmazás
A Syndecan 1-et plazmasejtek markereként használják [2] , ha ismert, hogy a sejtek vérsejtekből származnak. [3]
Lásd még
Jegyzetek
- ↑ Entrez gén: SDC1 syndecan 1 . (határozatlan)
- ↑ Rawstron AC A plazmasejtek immunfenotipizálása (neopr.) // Curr Protoc Cytom. - 2006. - május ( 6. kötet ). — C. Egység6.23 . - ISBN 0-471-14295-6 . - doi : 10.1002/0471142956.cy0623s36 . — PMID 18770841 .
- ↑ O'Connell FP, Pinkus JL, Pinkus GS CD138 (syndecan-1), plazmasejtes marker immunhisztokémiai profil hematopoietikus és nem hematopoietikus daganatokban // Am . J. Clin. Pathol. : folyóirat. - 2004. - február ( 121. évf. , 2. sz.). - P. 254-263 . - doi : 10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L . — PMID 14983940 . Archiválva az eredetiből 2011. június 9-én. (nem elérhető link)
Irodalom
- Teng YH, Aquino RS, Park PW A syndecan-1 molekuláris funkciói betegségben // Matrix Biol . : folyóirat. - 2012. - január ( 31. évf. , 1. sz.). - P. 3-16 . - doi : 10.1016/j.matbio.2011.10.001 . — PMID 22033227 .
- Katz BZ Adhéziós molekulák – A myeloma multiplex sejtek életvonalai (angol) // Semin. Cancer biol. : folyóirat. - 2010. - június ( 20. évf. , 3. sz.). - P. 186-195 . - doi : 10.1016/j.semcancer.2010.04.003 . — PMID 20416379 .
- Bass MD, Morgan MR, Humphries MJ A Syndecans inert molekulaként vetette hírnevét // Sci Signal : folyóirat. - 2009. - március ( 2. évf. , 64. sz.). — P. pe18 . - doi : 10.1126/scisignal.264pe18 . — PMID 19336838 .
Linkek
Fehérjék : A differenciálódás klaszterei |
---|
1-50 |
- CD1 ( ac , 1A , 1D , 1E )
- CD2
- CD3 ( γ , δ , ε )
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 ( a )
- CD9
- CD10
- CD11 ( a , b , c , d )
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 ( A , B )
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 ( A , B )
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 ( a , b , c , d )
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 ( a , b , c , d , e , f )
- CD50
|
---|
51-100 |
- CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 ( E , L , P )
- CD63
- CD64 ( A , B , C )
- CD66 ( a , b , c , d , e , f )
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 ( a , b )
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 ( a , d , e , h , j , k )
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 |
|
---|
151-200 |
- CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 ( a , b , c )
- CD157
- CD158 ( a , d , e , i , k )
- CD159 ( a , c )
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 ( a , b )
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 ( a , b , g )
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 ( a , b )
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 |
|
---|
251-300 |
|
---|
301-350 |
|
---|
351-400 |
|
---|