Syndekan 1

Syndekan 1
Elérhető struktúrák
EKT Ortológus keresés: PDBe , RCSB
Azonosítók
SzimbólumSDC1  ; CD138; SDC; SYND1; Syndecan
Külső azonosítókOMIM:  186355 MGI :  1349162 HomoloGene :  2252 GeneCards : SDC1 gén
RNS expressziós profil
Több információ
ortológusok
KilátásEmberiEgér
Entrez638220969
EgyüttesENSG00000115884ENSMUSG00000020592
UniProtP18827P18828
RefSeq (mRNS)NM_001006946NM_011519
RefSeq (fehérje)NP_001006947NP_035649
Locus (UCSC)Chr 2:
20,4 – 20,43 Mb
Chr 12:
8,77 – 8,79 Mb
Keresés a PubMedben[egy][2]

A Syndecan 1 ( angolul  syndecan 1; CD138 ) egy membránfehérje , a syndecan család proteoglikánja vagy transzmembrán heparán-szulfát proteoglikánok. Ebből a családból összesen 4 fehérjét írtak le. Humán géntermék SDC1 .

Funkciók

A fehérje egy transzmembrán heparán-szulfát proteoglikán, a szindekán család tagja. A szindekánok közvetítik a sejtkötést , a sejtjelátvitelt és a citoszkeleton szerveződését . Ezek a HIV vírus Tat fehérjéjének receptorai . A Syndecan 1 részt vesz a sejtproliferációban, a sejtmigrációban és az extracelluláris mátrix fehérjékkel való kölcsönhatásban. [egy]

Szerkezet

A Syndecan 1 heparán-szulfát és kondroitin-szulfát láncokat hordoz, amelyek kommunikációt biztosítanak a citoszkeleton és az extracelluláris mátrix között. CDCP1 -hez kötődik .

Az ektodomén hasítása a fehérje oldható formájának kialakulásához vezet. Hasadás történhet heparanáz, trombin és epidermális növekedési faktor hatására, valamint stressz és sebgyógyulás során.

A fehérje 288 aminosavból áll, a fehérjerész molekulatömege 32,5 kDa. Tartalmaz egy N-terminális extracelluláris domént (232 aminosav), egyetlen helikális transzmembrán fragmentumot és egy kis citoszol régiót. Az extracelluláris doménben 6 glikozilációs hely található : 3 O -kondroitin-szulfát lánc kapcsolódási hely, 2 O -heparán-szulfát lánc kapcsolódási hely és 1 N -glikozilációs hely . A citoszolos fragmens foszforilált tirozint tartalmaz .

Alkalmazás

A Syndecan 1-et plazmasejtek markereként használják [2] , ha ismert, hogy a sejtek vérsejtekből származnak. [3]

Lásd még

Jegyzetek

  1. Entrez gén: SDC1 syndecan 1 .
  2. ↑ Rawstron AC A plazmasejtek  immunfenotipizálása (neopr.)  // Curr Protoc Cytom. - 2006. - május ( 6. kötet ). — C. Egység6.23 . - ISBN 0-471-14295-6 . - doi : 10.1002/0471142956.cy0623s36 . — PMID 18770841 .
  3. O'Connell FP, Pinkus JL, Pinkus GS CD138 (syndecan-1), plazmasejtes marker immunhisztokémiai profil hematopoietikus és nem hematopoietikus daganatokban   // Am . J. Clin. Pathol.  : folyóirat. - 2004. - február ( 121. évf. , 2. sz.). - P. 254-263 . - doi : 10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L . — PMID 14983940 . Archiválva az eredetiből 2011. június 9-én.  (nem elérhető link)

Irodalom

Linkek