Dezoxiribonukleáz IV

A dezoxiribonukleáz IV ( fág -  T4 _____________)indukálható endonukleáz egyik típusa, amely a nukleotidok [1] lebomlását katalizálja a kettős szálú DNS- ben az 5'-terminális vég megtámadásával [ 2] [3] [4] .

A dezoxiribonukleáz IV a dezoxiribonukleáz egy típusa, amely nukleotidmentes vagy apurin-apirimidin helyeken ( AP helyek ) működik, amikor egy sejt nukleotid-kivágáson megy keresztül [ 5] . Ezenkívül az endonukleáz IV számos aktivitással rendelkezik, például AP-endonukleáz, 3'-diészteráz, 3'->5'-exonukleáz és 3'-foszfatáz [6] .

Az endonukleáz IV-et a T4 bakteriofág denB génje kódolja, és kötőszekvenciája az 5'-dT || dCdAdCdTdTdC-3'. A 176-os szerinmaradékról azt találták, hogy kritikus szerepet játszik a citidint tartalmazó konszenzusszekvencia endonukleáz-hidrolízisének sebességének növelésében. Az endonukleáz IV szerkezeti hasonlóságokat mutat az apirimidin endonukleáz I-vel (APE1) [7] .

Felfedezés

A dezoxiribonukleáz IV-et először 1968-ban izolálták nyúlszövetből, és molekulatömege 42 000 dalton . Erről az enzimről azt találták, hogy az Escherichia coliban található számos mikrobiális DNS polimeráz I endonukleáz aktivitásra hasonlít , amelyek a DNS-javításhoz és a rekombinációhoz szükségesek [8] .

Szerkezet

A DNáz IV 185 aminosavból áll, és a magnéziumionok kofaktorként működnek. Egy kétértékű fémion, például a Mg2+ kofaktorként működik az 5' mononukleotidok hasítása során [9] . TIM béta-hengeres magját három fémion, három Zn 2+ vagy két Zn 2+ és egy Mn 2+ ionokkal spirál veszi körül , amelyek kritikus szerepet játszanak az AP kimetszés javításában [10] .

Enzimaktivitás a sejtkörnyezetben és a DNS-ben

A teljes DNáz IV aktivitás 70%-a a citoplazmában, 30%-a pedig a sejtmagokban található [1] . Emberben a DNáz IV-re van szükség ahhoz, hogy a hézagkitöltés során a templátszál eltolódása által generált reakció közbenső terméket lehassa [11] .

Az endonukleáz aktivitás során a DNS konformációs változásai oly módon mennek végbe, hogy egy 90 fokos DNS-hajlítás egy nukleotidmentes helyet tár fel, ami ahhoz vezet, hogy a cukorfragment egy kis zsebké alakul, amely nem képez Watson-Crick bázispárt [10] .

Lásd még

• Fág T4
• Nukleotid kivágás javítása
• AP webhely

Jegyzetek

1. ↑ 1 2 „Strukturális és funkcionális homológia az emlős DNáz IV és az Escherichia coli DNS polimeráz I 5'-nukleáz doménje között”. The Journal of Biological Chemistry . 269 ​​(46): 28535-8. 1994. november. doi : 10.1016/ s0021-9258 (19)61935-6 . PMID  7961795 .
2. ↑ „Az E. coli endonukleáz II. I. Izolálás és tisztítás”. Az Amerikai Egyesült Államok Nemzeti Tudományos Akadémiájának közleménye . 62 (3): 934-40. 1969. március. Bibcode : 1969PNAS...62..934F . DOI : 10.1073/pnas.62.3.934 . PMID  4895219 .
3. ↑ „Az Escherichia coli endonukleáz II. A részlegesen depurinált dezoxiribonukleinsav lebontása”. biokémia . 10 (26): 4986-93. 1971. december doi : 10.1021/ bi00802a024 . PMID 4944066 . 
4. ↑ A dezoxiribonukleinsav enzimatikus letörése. I. A T4 fággal fertőzött Escherichia coli endonukleáz II tisztítása és tulajdonságai”. The Journal of Biological Chemistry . 244 (22): 6182-91. 1969. november. DOI : 10.1016/S0021-9258(18)63523-9 . PMID  4310836 .
5. ↑ „Az Escherichia coli endonukleáz II. II. Enzimtulajdonságok és vizsgálatok az alkilezett és natív dezoxiribonukleinsav lebontásáról”. The Journal of Biological Chemistry . 244 (21): 5879-89. 1969. november. DOI : 10.1016/S0021-9258(18)63556-2 . PMID  4981786 .
6. ↑ Kerins, Sinéad M. (2003. január). „Endonukleáz IV 3'-5' exonukleáz aktivitásának jellemzése” . Journal of Biological Chemistry . 278 (5): 3048-3054. doi : 10.1074/ jbc.m210750200 . ISSN 0021-9258 . 
7. ↑ Hirano, N. (2007-11-29). "A T4 endonukleáz IV Ser176-ja kulcsfontosságú az egyszálú DNS korlátozott és polarizált dC-specifikus hasításában, amely szerepet játszik a dC-tartalmú DNS restrikciójában Escherichia coli gazdaszervezetben." Nukleinsav kutatás . 35 (20): 6692-6700. doi : 10.1093/nar/ gkm722 . ISSN 0305-1048 . PMID 17913749 .  
8. ↑ "Dezoxiribonukleáz IV: új exonukleáz emlős szövetekből". Az Amerikai Egyesült Államok Nemzeti Tudományos Akadémiájának közleménye . 62 (2): 597-603. 1969. február. Bibcode : 1969PNAS...62..597L . DOI : 10.1073/pnas.62.2.597 . PMID  5256235 .
9. ↑ A nukleázok molekuláris biológiája : [] . - 1995. - ISBN 978-0-8493-7658-0 .
10. ↑ 1 2 „A DNS-javítás, az engedélyezés és a hűség élvonalai: a DNS- és RNS-javító nukleázok úgy formálják a DNS-t, hogy kétszer mérjék, egyszer vágják le. DNS javítás _ ]. 19 , 95-107. 2014-07-01. DOI : 10.1016/j.dnarep.2014.03.022 . ISSN 1568-7864 . PMID 24754999 .  
11. ↑ "A második út az emberi DNS-bázis kivágásának-javításának befejezéséhez: rekonstitúció eliminált fehérjékkel és DNáz IV (FEN1) szükségessége". Az EMBO Journal . 16 (11): 3341-8. 1997. június doi : 10.1093/emboj/ 16.11.3341 . PMID 9214649 . 

Linkek

• MeSH dezoxiriboendonukleáz+IV