Fág T4

Fág T4
A T4 fág szerkezete
tudományos osztályozás
Csoport:Vírusok [2]Birodalom:DuplodnaviriaKirályság:HeunggongviraeTípusú:UroviricotaOsztály:CaudoviricetesRendelés:CaudoviralesCsalád:MyovírusokAlcsalád:TevenvirinaeNemzetség:TequatrovírusKilátás:Fág T4
Nemzetközi tudományos név
Escherichia vírus T4
Szinonimák
az ICTV [3] szerint : T2 kolifág Kolifág T4 Kolifág T6 Enterobaktérium fág C16 Enterobaktérium fág PST Enterobaktérium fág T4 Fázis C16 Phage PST
A Baltimore Csoport
I: dsDNS vírusok
Szisztematika a Wikifajtáknál Képek a Wikimedia Commons oldalon

A T4 fág [4] ( Escherichia virus T4 ,  korábban Enterobacteria phage T4 ) az egyik legtöbbet tanulmányozott vírus , egy bakteriofág , amely enterobaktériumokat , köztük Escherichia colit is megfertőz . 169-170 ezer bázispár nagyságrendű genomiális DNS -e van, ikozaéderes fejbe csomagolva [5] . A virionnak van szára, száralapja és szárfolyamai is – hat hosszú és hat rövid.

A T4 fág cirkuláris típusú DNS-polimerázt használ; a csúszó mandzsetta a PCNA - hoz hasonló trimer , de nem osztozik sem a PCNA-val, sem a β polimerázzal.

A T4 egy viszonylag nagy fág, körülbelül 90 nm átmérőjű és körülbelül 200 nm hosszú. A vírus csak a litikus fejlődési ciklust használja, a lizogént nem [6] .

Max Delbrück , Salvador Luria , Alfred Hershey , James Watson és Francis Crick Nobel - díjasok , valamint más híres tudósok -- Michael Rossmann , Vadim Mesjanzsinov , Fumio Arisaka , Seymour Benzer , Bruce Alberts dolgoztak T4 fággal vagy hasonló bakteriofágokkal .

2016-ban a többi bakteriofághoz hasonlóan a T4 tudományos nevét Escherichia vírus T4 -re változtatta [7] .

Irodalom

• T4 fehérje-összeállítás (animáció)
• Leiman, PG, Kanamaru, S., Mesyanzhinov, V. V., Arisaka, F., és Rossmann, MG, "Structure and morphogenesis of bacteriophage T4". [egy]
• Karam, J., Petrov, V., Nolan, J., Chin, D., Shatley, C., Krisch, H., and Letarov, A. The T4-like phages genome project. https://web.archive.org/web/20070523215704/http://phage.bioc.tulane.edu/ . (A T4-szerű fág teljes genomiális szekvencia letéteményese)
• Mosig, G. és F. Eiserling. 2006. T4 és rokon fágok: szerkezet és fejlődés, R. Calendar and ST Abedon (szerk.), The Bacteriophages. Oxford University Press, Oxford. (A T4 fág biológiájának áttekintése) ISBN 0-19-514850-9
• Filee J. Tetart F., Suttle CA, Krisch HM Marine T4 típusú bakteriofágok, a bioszféra sötét anyagának mindenütt jelenlévő összetevője   // Proc . Natl. Acad. sci. USA: folyóirat. - 2005. - 20. évf. 102 , sz. 35 . - P. 12471-12476 . - doi : 10.1073/pnas.0503404102 . — PMID 16116082 . (A prevalencia és a T4-szerű fágok jelzése a vadonban)
• Chibani-Chennoufi S., Canchaya C., Bruttin A., Brussow H. A T4-szerű Escherichia coli JS98 fág összehasonlító genomikája: implikációk a T4 fágok evolúciójára  //  Journal of Bacteriology : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 186. sz . 24 . - P. 8276-8286 . - doi : 10.1128/JB.186.24.8276-8286.2004 . — PMID 15576776 . (A T4-szerű fág jellemzése)
• Desplats C., Krisch HM A T4-típusú bakteriofágok sokfélesége és fejlődése  (angol)  // Res. mikrobiol. : folyóirat. - 2003. - május ( 154. évf. , 4. sz.). - 259-267 . o . - doi : 10.1016/S0923-2508(03)00069-X . — PMID 12798230 .
• Miller, ES, Kutter E., Mosig G., Arisaka F., Kunisawa T., Ruger W. Bakteriofág T4 genom  (neopr.)  // Microbiol. Mol. Biol. Rev.. - 2003. - T. 67 , 1. sz . - S. 86-156 . - doi : 10.1128/MMBR.67.1.86-156.2003 . — PMID 12626685 . (A T4 fág áttekintése genomja szempontjából)
• Desplats C., Dez C., Tetart F., Eleaume H., Krisch HM Pillanatkép az RB49 pszeudo-T-ventil bakteriofág genomjáról  //  Journal of Bacteriology : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 184. sz . 10 . - P. 2789-2804 . - doi : 10.1128/JB.184.10.2789-2804.2002 . — PMID 11976309 . (Az RB49 genom, egy T4-szerű fág áttekintése)
• Malys N., Chang DY, Baumann RG, Xie D., Black LW A bipartite bakteriofág T4 SOC és HOC randomizált peptid display könyvtár: a fág T4 termináz (gp17) és a késői szigma faktor (gp55)  interakció kimutatása és elemzése  // J Mol Biol: folyóirat. - 2002. - 20. évf. 319. sz . 2 . - P. 289-304 . - doi : 10.1016/S0022-2836(02)00298-X . — PMID 12051907 . (T4 fág alkalmazása a biotechnológiában fehérjekölcsönhatások tanulmányozására)
• Tétart F., Desplats C., Kutateladze M., Monod C., Ackermann H.-W., Krisch HM Phylogeny of the major head and tail genes of the wide-range T4-type bacteriophages  (angol)  // Journal of Bacteriology : folyóirat. - 2001. - Vol. 183. sz . 1 . - P. 358-366 . - doi : 10.1128/JB.183.1.358-366.2001 . — PMID 11114936 . (A T4 típusú szekvenciák vadon előfordulásának jelzése)
• Abedon ST Hófehérke homályos eredete és T-even törpéi  //  Genetika: folyóirat. - 2000. - Vol. 155 , sz. 2 . - P. 481-486 . — PMID 10835374 . (A T4-szerű T2, T4 és T6 fágok izolálásának történeti leírása)
• Ackermann HW, Krisch HM T4-típusú bakteriofágok katalógusa  (neopr.)  // Arch. Virol .. - 1997. - T. 142 , 12. sz . - S. 2329-2345 . - doi : 10.1007/s007050050246 . — PMID 9672598 . Az eredetiből archiválva : 2001. november 1. (Az akkor ismert T4-szerű fágok csaknem teljes listája)
• Monod C., Repoila F., Kutateladze M., Tétart F., Krisch HM The genome of the pseudo T-even bacteriophages, a diverse group that resembles T4  //  J. Mol. Biol. : folyóirat. - 1997. - március ( 267. évf. , 2. sz.). - 237-249 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0867 . — PMID 9096222 . (A különböző T4-szerű fágok áttekintése genomjuk szemszögéből)
• Kutter E., Gachechiladze K., Poglazov A., Marusich E., Shneider M., Aronsson P., Napuli A., Porter D., Mesyanzhinov V. Evolution of T4-related  phages (neopr.)  // Virus Genes. - 1995. - T. 11 , 2-3 . - S. 285-297 . - doi : 10.1007/BF01728666 . — PMID 8828153 .  (nem elérhető link) (Különböző T4-szerű fágok genomjainak összehasonlítása)
• Karam, JD et al. 1994. A T4 bakteriofág molekuláris biológiája. ASM Press, Washington, DC. (A második T4-biblia ide kattintva, valamint Mosig és Eiserling, 2006, hogy megismerkedjen a biológiával, a T4-fággal) ISBN 1-55581-064-0
• Eddy, S.R. 1992. Introns in the T-Even Bacteriophages. Ph.D. tézis. Coloradói Egyetem, Boulder. (A 3. fejezet áttekintést nyújt a különböző T4-szerű fágokról, valamint az akkor még új T4-szerű fágok izolálásáról)
• Mathews, CK, EM Kutter, G. Mosig és PB Berget. 1983. Bakteriofág T4. Amerikai Mikrobiológiai Társaság, Washington, DC. (Az első T4 biblia; itt nem minden információt duplikál meg Karam et al. , 1994; különösen lásd Doermann bevezető fejezetét a T4-szerű fágok történeti áttekintéséért) ISBN 0-914826-56-5
• Russell, R.L. 1967. Speciation among the T-Even Bacteriophages. Ph.D. tézis. California Institute of Technology. (A T4-szerű fágok RB sorozatának izolálása)
• Kay D., Fildes P. Városi szennyvízből izolált hidroxi-metilcitozin-tartalmú és triptofán-függő bakteriofágok  //  J. Gen. mikrobiol. : folyóirat. - 1962. - 1. évf. 27 . - 143-146 . o . — PMID 14454648 . (T4-szerű fág izolálása, beleértve az Ox2 fág izolálását is)

Jegyzetek

1. ↑ Victor Padilla Sanchez. A T4 bakteriofág szerkezeti modellje  // WikiJournal of Science. - 2021. - 4. évf. , no. 1 . - S. 5 . - doi : 10.15347/WJS/2021.005 . Archiválva az eredetiből 2022. április 28-án.
2. ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok  Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján .
3. ↑ ICTV rendszertani előzmények: Escherichia virus T4 az ICTV webhelyén  ( Hozzáférés:  2019. április 30.) .
4. ↑ Pinevics A. V. , Sirotkin A. K. , Gavrilova O. V. , Potekhin A. A. Virológia: tankönyv. - Szentpétervár.  : St. Petersburg University Press, 2012. - P. 177. - ISBN 978-5-288-05328-3 .
5. ↑ Eric S. Miller, Elizabeth Kutter, Gisela Mosig, Fumio Arisaka, Takashi Kunisawa. Bakteriofág T4 genom  // Mikrobiológiai és molekuláris biológiai áttekintések: MMBR. - 2003. - T. 67 , sz. 1 . - 86-156. o., tartalomjegyzék . — ISSN 1092-2172 . - doi : 10.1128/MMBR.67.1.86-156.2003 . Az eredetiből archiválva : 2018. augusztus 20.
6. ↑ HW Ackermann, HM Krisch. A T4 típusú bakteriofágok katalógusa  // Archives of Virology. - 1997. - T. 142 , sz. 12 . - S. 2329-2345 . — ISSN 0304-8608 . Az eredetiből archiválva : 2018. június 29.
7. ↑ Az összes (522) létező bakteriális vírus és 2 archaeális vírus faj átnevezése  : [ eng. ]  : [ arch. 2019. április 30. ] // ICTV. — Hozzárendelt kód: 2015.025aB. - 2015. - 18 p.

Szótárak és enciklopédiák	Britannica (online)
Taxonómia	IRMNG