KF kód

A CF kód („enzimek osztályozása”), vagy az enzimkód az enzim besorolási  száma a nemzetközi hierarchikus osztályozás szerint. Az elfogadott rendszer az enzimeket csoportokba sorolja és az egyes enzimeket indexeli, ami a kutatás szabványosítása szempontjából fontos.

Az enzimek osztályozását az Enzyme Commission ( eng.  Enzyme Commission , innen az "EC number" kifejezés az angol szakirodalomban elfogadott) a Nemzetközi Biokémiai és Molekuláris Biológia Szövetségnél alapozza meg és rendszeresen frissíti . Minden CF-kód a megfelelő enzim ajánlott nevéhez is kapcsolódik. Több mint 3500 enzimet osztályoztak.

Az osztályozás elve

Az enzimek osztályozása az enzimek reakcióját és szubsztrátspecifitását veszi figyelembe, nem pedig a fehérje szerkezetét. A CF kód az enzim által katalizált kémiai reakciót határozza meg. Emiatt a különböző szervezetekből származó hasonló enzimek (néha több tucat) ugyanazt a CF-et tartalmaznak, a szerkezeti különbségek ellenére.

Néha ugyanannak a szervezetnek a különböző enzimjei ugyanazzal a CF-vel rendelkeznek. Például a hasnyálmirigy-lipáz és a máj lipáz egyaránt az EC 3.1.1.3 -hoz tartozik , mivel ugyanazt a kémiai reakciót katalizálják ( egy észterkötés hidrolízise trigliceridben ) , bár az első enzim emésztőenzim , és a bélben működik, a második enzim a vérben lévő lipoprotein -anyagcsere enzimekre utal .

Létezik egy UniProt adatbázis [1] , amely az egyes fehérjéket az elsődleges szekvenciája alapján azonosítja. A két adatbázis kiegészíti egymást.

Rejtjelformátum

Minden osztályozási szám tartalmazza a KF rövidítést és egy négy, pontokkal elválasztott számsort, és egy bizonyos elv szerint van összeállítva. Minden egymást követő szám az enzim egyre pontosabb osztályozását jelenti. Mivel az adatbázis folyamatosan frissül, a kódok változhatnak, és egyes szintek kódjai üresek maradhatnak.

osztály

Alosztály

Alosztály

4. szintű kód

Végül az ehhez az alosztályhoz tartozó összes enzim megkapja a sorozatszámát ( a kód negyedik száma ).

CF 1 – Oxidoreduktázok EC 1.1 - Alkohol-oxidoreduktáz EC 1.1.3 - Oxidoreduktázok, amelyek oxidálják a CH-OH csoportot és redukálják az oxigént . EC 1.1.3.4 – Oxidoreduktázok, amelyek oxigén jelenlétében oxidálják a glükózt . Összesen 3 glükóz-oxidáz ismert különböző élőlényekből.

Első szintű kódok

Osztály katalizált reakció Reakció típusa Példák
CF 1
oxidoreduktáz
Redox reakciók. H és O atomok vagy elektronok átvitele egyik szubsztrátumról a másikra AH + B → A + BH ( redukció )
A + O → AO ( oxidáció )
dehidrogenáz , oxidáz
CF 2
transzferázok
Egy funkciós csoport átvitele egyik szubsztrátról a másikra. Ez lehet metil-, acil-, foszfát- vagy aminocsoport. AB+C→A+BC aminotranszferáz , kinázok
KF 3
Hidrolázok
Egy szubsztrátból két termék keletkezése hidrolízissel . AB + H2O → AOH + BH lipáz , amiláz , proteáz , foszfatáz
KF 4
liázok (szintázok)
Egy csoport nem hidrolitikus hozzáadása vagy eltávolítása a szubsztrátumhoz vagy onnan. CC, CN, CO vagy CS kötések kialakulása. RCOCOOH → RCOH + CO2 karboxiláz
KF 5
izomerázok
Intramolekuláris átrendeződés, azaz a szubsztrát molekula izomerizációja . AB→BA izomerázok , mutázok stb.
CF 6
Ligázok (szintetázok)
Két molekula összekapcsolódása egy új CO, CS, CN vagy CC kötés szintézisének eredményeként, az ATP egyidejű hidrolízisével párosulva . X + Y + ATP → XY + ADP + P i szintetáz
KF 7

Transzlokázisok

Ionok vagy molekulák membránokon keresztül történő transzportja vagy szétválása a membránokban. membrán transzport fehérjék [2]

Történelem

Az enzimnómenklatúra rendszerét először 1955 -ben fejlesztették ki, amikor a brüsszeli Nemzetközi Biokémiai Kongresszus létrehozta az Enzimbizottságot . A nómenklatúra első változata 1961 -ben jelent meg, és körülbelül 900 enzimet tartalmazott, az 1978-as változatban pedig több mint 2000 enzim. Az 1995 -ös verzió több mint 3500 enzimet tartalmaz.

Lásd még

Jegyzetek

  1. ENZYME (Enzimnómenklatúra adatbázisa) (hivatkozás nem elérhető) . ExPASy. Letöltve: 2006. március 14. Az eredetiből archiválva : 2006. február 18.. 
  2. Biokémiai és Molekuláris Biológiai Nemzetközi Szövetség. Az enzimek új osztálya: a transzlokázok. . IUBMB HÍREK (2018. augusztus).

Linkek