Citokróm-b6f-komplex

Citokróm b 6 f -komplex

A Chlamydomonas reinhardtii citokróm b 6 f komplexének kristályszerkezete [1] . A lipid kettős réteget kék és piros vonalak jelzik.
Azonosítók
KF kód 1.10.99.1
Enzim adatbázisok
IntEnz IntEnz nézet
BRENDA BRENDA bejegyzés
ExPASy NiceZyme nézet
MetaCyc anyagcsere út
KEGG KEGG bejegyzés
PRIAM profil
EKT struktúrák RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Keresés
PMC cikkeket
PubMed cikkeket
NCBI NCBI fehérjék
 Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon

A citokróm b 6 f komplex ( cytochrome b 6 f complex ), vagy a plasztokinol plasztocianin reduktáz  egy multiprotein komplex , amely oxidálja a plasztokinolokat és redukálja a plasztocianin fehérjét , így biztosítja az elektrontranszportot az I. fotorendszer (PSI) és a II. fotorendszer (PSII ) reakcióközpontjai között . ). Csökkenti a kis vízoldható fehérjét, a plasztocianint, amely egy elektront ad át a PSII-nek [2] . Hasonló reakciót katalizál a mitokondriális elektrontranszport lánc citokróm bc 1 komplexe (III. komplex) . A citokróm b 6 f komplex jelen van a növényi kloroplasztiszok , algák és cianobaktériumok tilakoid membránjában [3] . Funkcionálisan két fotorendszert egyesít egyetlen elektronátviteli láncban a vízből a NADP + -ba , azaz résztvevője egy nem ciklikus elektronáramlásnak . Ezenkívül a citokróm komplex részt vesz az I. fotorendszer által végrehajtott ciklikus elektrontranszportban [4] .

A citokróm b 6 f komplex különleges stratégiai helyet foglal el a kloroplasztiszok elektrontranszport láncában (ETC), a PSI és a PSII között. A komplex elektrontranszport láncában figyelhető meg a legnagyobb változás a redoxpotenciálban és ennek következtében a legnagyobb energiaváltozás [4] . A citokróm komplexet érintő redox reakciók során a protonok a stromából a tilakoid lumenbe jutnak, és elektrokémiai potenciál képződik , amelynek energiáját az ATP szintáz enzim segítségével ATP szintézisére használják fel . Így a citokróm b 6 f komplex a fotoszintézisprotonpumpája [5] .

Strukturális szervezet

A citokróm b 6 f komplex a következő alegységekből áll [6] [7] [8] [9] :

Alegység Tömeg ( kDa ) Leírás
PetA ( f idézet ) 32.273 Drágát hordoz c . Megköti és helyreállítja a plasztocianint .
PetB (Cit. b 6 ) 24.712 B p , b n és c n drágaköveket hordoz . Részt vesz az elektronszállításban.
PetC (Protein Riske) 19.295 [2Fe-2S] vas-kén klasztert hordoz . Részt vesz az elektronszállításban.
PetD (IV. alegység) 17.528 Nem tartalmaz kofaktorokat , de szükséges a komplexum működéséhez.
PetG 4.058 A komplexum működéséhez szükséges, annak összeszerelésében részt vesz, stabilitást biztosít.
PetL 3,530 A komplexum működéséhez nem nélkülözhetetlen, de stabilizálja azt.
PetM 3.841 Az összeszerelésében részt vevő és a stabilitást biztosító szükséges alegység.
PetN 3.304 Az összeszerelésében részt vevő és a stabilitást biztosító szükséges alegység.

Fehérje összetétel

A citokróm b 6 f komplex egy transzmembrán fehérje , amely nyolc alegységből áll [10] , és körülbelül 220 kDa össztömegű dimerként létezik [8] . A komplex dimerizációja a citokróm b 6 és a Riske fehérje transzmembrán doménjei [9] kölcsönhatása miatt következik be .

A komplex magja négy nagy alegységből áll: a c-típusú hemet hordozó citokróm f vagy PetA, a három hemet hordozó citokróm b 6 vagy PetB, a 2Fe-t tartalmazó Riske vas-kén fehérje (PetC) . -2S klaszter, valamint a PetD vagy IV alegység, amely nem vesz részt az elektrontranszportban, de a citokróm b 6 -tal együtt Q p -plasztokinon kötőhelyet képez . A másik négy alegység tömege 3-4 kDa, ezeket kis alegységeknek nevezik [10] [11] . Mindegyik egyetlen α-hélixből áll , stabilitást biztosít a komplex számára, és segíti a megfelelő konformáció felvételét az összeszerelés során [7] . Magasabb növényekben a PetG , PetM és PetN szükséges a komplex megfelelő működéséhez [9] .

A citokróm komplex dimerje egy központi csereüreget képez, amelyben a plasztokinonok összes oxidációs és redukciós folyamata lezajlik, és ahol a kötőhelyeik találhatók . A dimer lumen és stroma felőli oldalai nem egyenértékűek: a lumen felé néző oldal elektrokémiailag pozitívabb, ezért p-oldalnak nevezik (az angol  pozitív szóból ), a stróma felé eső oldal pedig elektrokémiailag negatívabb, és n-oldalnak nevezik (az angol  negatívból ). Közelebb a p-oldalhoz, a központi csereüregben, a hem b p és a Riske fehérje vas-kén klasztere között van egy Q p -hely, vagy egy kötőközpont a redukált plasztokinon QH 2 számára. , ahol oxidálódik, és közelebb az n-oldalhoz egy b n / c n hempár mellett található az oxidált plasztokinon Q Q n -kötőhelye, ahol redukálódik [12] .

A nyolc fő alegység mellett a kilencedik, legnagyobb alegységnek tekinthető a ferredoxin-NADP + -reduktáz  , egy 35,3 kDa-os fehérje, amely képes kötődni a citokróm komplexhez . Ilyen komplexeket izoláltak spenótból és zöldborsóból . Feltehetően a citokróm b 6 f komplexhez kapcsolódó FNR részt vesz a ciklikus elektrontranszportban [12] .

A citokróm - b 6 f  nemcsak a legkisebb, hanem a legstabilabb is a fotoszintézisben részt vevő komplexek közül. Ez azzal magyarázható, hogy gyakorlatilag nem tartalmaz olyan fotoaktív anyagokat, amelyek fény jelenlétében károsíthatnák a komplexet. Míg az I. fotorendszer felezési ideje 30-75 óra, a II. fotorendszeré 1-11 óra [13] , addig a citokróm komplex teljes élettartama több mint egy hét. A dohányon végzett vizsgálatok kimutatták, hogy a citokróm b 6 f komplex legintenzívebb szintézise a fiatal levelekben megy végbe , míg az érett levelekben szinte teljesen elnyomott szintézise. Nagyon valószínű, hogy egy ilyen folyamat állhat a levelek öregedésének és elhalásának ontogenetikai programjának hátterében [7] .

Kofaktorok és elektrontranszport láncok

Protein Riske

A Riske fehérje szokatlan vas-kén klasztere.
Azonosítók
Szimbólum CytB6-F_Fe-S
Pfam PF08802
InterPro IPR014909
Elérhető fehérjeszerkezetek
Pfam szerkezetek
EKT RCSB EKT ; PDBe ; EKTj
EKT-összeg 3D modell
 Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon

A citokróm b 6 f komplex hét protéziscsoportot tartalmaz [8] [14] . Mindenekelőtt ezek kovalensen kötött c-típusú hem citokróm f -ből , alacsony potenciálú hem b n és nagy potenciálú hem bp citokróm b 6-ból , valamint a Riske fehérje 2Fe -2S-klasztere . Három másik protéziscsoport a citokróm-b6 f egyedi jellemzője : egy klorofill a molekula és egy β-karotin molekula , amelyek funkciója nem tisztázott, valamint a szokatlan hem c n , más néven hem c i vagy hem x [15] .

A komplex úgy merül a tilakoid membránba, hogy a Riske fehérje és a citokróm f funkcionális csoportja annak belső, lumenális felületére kerül ki, míg a citokróm b 6 két hemje a membrán vastagságában helyezkedik el, a b . p közel a belső oldalához, és b n a külső oldalához. A redox központok ilyen aszimmetrikus elrendezése a membránban biztosítja, hogy egy komplexen belül két térben elkülönülő elektrontranszport lánc létezzen. Az első, alacsony potenciálú elektrontranszport láncot a citokróm b 6 két heme alkotja  - az alacsony potenciálú b n (E°' = -0,15 V) és a nagy potenciálú b p (E°' = -0,05 V). A második, nagy potenciállal rendelkező lánc tartalmazza a Riske fehérjét (E°' = +0,3 V) és a citokróm fhemet (E°' = +0,34 V). A citokróm komplexben a plasztokinolok oxidációja során két konjugált elektronáramlás valósul meg - az alacsony és a nagy potenciálú pályák mentén [16] .

Protein Riske

A Riske fehérje redoxpotenciáljának magas értékét a vassal való koordinációs kötésekben való részvétel magyarázza, két cisztein - maradék mellett két hisztidincsoport . Az ilyen magas redoxpotenciál lehetővé teszi a plasztokinolok oxidációját, ami Q-ciklus reakciókat indukál . A Riske fehérje az egész citokróm komplex kulcseleme, itt jön létre két elektron divergenciája. A komplex kristályszerkezetének vizsgálata kimutatta, hogy a 2Fe-2S centrum helyzete eltolódhat a többi redox centrumhoz képest. Kiderült, hogy a Riske fehérjének van egy mobil doménje, amelyen valójában a 2Fe-2S központ található. A 2Fe-2S központ egy elektron elfogadásával és helyreállásával megváltoztatja helyzetét, és 60°-os elforgatással 17 Å -kal eltávolodik a Q p helytől és a hem b p -től, és így megközelíti a citokróm f -et . Miután egy elektront adományozott a citokrómnak, a 2Fe-2S központ éppen ellenkezőleg, megközelíti a Q p központot, hogy szorosabb kapcsolatot létesítsen. Így egyfajta inga (shuttle) működik, amely garantálja a második elektron távozását a b p és b n hemekhez . Eddig ez az egyetlen ismert példa, amikor az elektrontranszport egy mobil doménhez kapcsolódik a fehérjeszerkezetben [17] .

Gem c n

A citokróm b 6 f komplex megkülönböztető jellemzője, hogy szerkezetében egy szokatlan hem található, amely a citokróm b 6 stromális vagy n-oldali kicserélő üregének belső felületén található . Ezt a drágakövet eredetileg "hem x "-nek hívták, mert váratlan koordinációja volt . Később azonban az áttekinthetőség kedvéért átnevezték c i gem-re vagy c n gem-re . Ez egy c típusú hem , amely kovalensen kapcsolódik a citokróm b 6 Cys35 cisztein oldalláncához, és nem tartalmaz kiemelkedő aminosav ligandumokat . A hem b n közvetlen közelében található, és láthatóan gyorsan elektronokat cserél vele egy vízmolekula hídján keresztül, amely összeköti a hem b n propionát csoportját a hem c n vasatomjával . A c n hem redoxpotenciálja a pH-értéktől függően változik, és átlagosan +0,1 V körül van, ami jóval magasabb, mint a hem b n -é (E°' = -0,05 V), ami a b n -ből történő elektrontranszfer irányát jelzi. to c n [15] [12] .

Mivel a c n és b n hemek csak 4 Å távolságra vannak egymástól, úgy gondolják, hogy egyetlen kéthem citokrómként működnek. Ezenkívül a kinonanalógokkal végzett kísérletek kimutatták , hogy a c n a plasztokinolok kötőhelye a Q n központban, ahol redukálódnak. Az EPR vizsgálatok kimutatták, hogy ha a plasztokinon szintetikus analógjai hem c n - hez kötődnek , annak redoxpotenciálja -0,2 V-kal eltolódik. Ez a kinonredukciós mechanizmus jelentősen eltér attól, ami a citokróm bc 1 komplexben játszódik le, ahol nincs hem c . n . A b n / c n pár jelenléte komoly alapot ad a plasztokinon kételektronos redukciójának feltételezésére. Egy ilyen modell esetében az instabil szemikinon gyök kialakulása kizárt , ami stabilabbá teszi az egész rendszert, és jelentősen csökkenti a reaktív oxigéngyökök képződésének valószínűségét [5] [12] [15] .

A hem c n hiánya a citokróm bc 1 komplexben azt jelzi, hogy lehetséges funkciója a citokróm b 6 f komplexben az I. fotorendszer körüli ciklikus elektrontranszporttal van összefüggésben, amely nyilvánvalóan hiányzik a bc 1 komplexben. Ennek a hemnek az evolúciós eredetére a Firmicute típusú baktériumok tanulmányozása derített fényt . A génszekvenciák vizsgálata kimutatta, hogy ezekben a baktériumokban van citokróm f , a Riske fehérje és hem c n . A cianobaktériumok citokróm b 6 f komplexéhez és a mitokondriumok citokróm bc 1 komplexéhez hasonló citokróm bc komplex jelenlétét primitív fotoszintetikus ( Heliobacillus mobilis [15] ) és nem fotoszintetikus firmicutákban ( Bacillus subtilis és Bacillus stereothermophiphis ) is kimutatták. [6] ). Ez azt jelentheti, hogy a nem fotoszintetikus firmicutokban a hem c n -nek a ciklikus elektrontranszporttól eltérő funkciót kell ellátnia. Itt ez a hem részt vesz egy alternatív elektron- és protonhordozó, a menankinon (MQ), más néven K 2 -vitamin oxidációjában . A pár redoxpotenciálja (MQ/MQH2) körülbelül -0,15 V -tal negatívabb, mint a megfelelő ubikinon- vagy plasztokinon-pároké .

Gének

Amint fentebb említettük, a citokróm komplex nyolc alegységből és hét protéziscsoportból áll. Az eukariótákban a komplex hat alegységét a kloroplaszt genom kódolja , míg a PetM-et és a PetC-t (a Riske fehérjét) a nukleáris gének kódolják . Az alegységeket kódoló gének nem alkotnak egyetlen operont . A citokróm b6 (petB ) és a IV. alegység ( petD ) génjei ugyanazon promoter alatt találhatók, és a petBD operont alkotják . Velük együtt ez a policisztronos operon két Photosystem II alegységet kódol: psbB (CP47), psbT és psbH . A magasabb rendű növényekben a citokróm f ( petA ) gén az operon utolsó génje, amely tartalmazza az I. fotorendszer psaI kis alegységét, az I. fotorendszer összeállításához szükséges ycf4 faktort és az ycf10 nyitott leolvasási keretet is [18]. [9] .

A prokariótákban a Riske fehérje gén ( petC ) és a petA gén egy másik operont , a petCA - t alkot . Így a prokarióták négy nagy alegységének transzkripciója genetikailag koordinált. A négy kis Pet G, L, M és N alegység nem ugyanabban az operonban található , és genetikai koordinációjuk és szintézisük kevéssé ismert [18] .

Reakció mechanizmus

A citokróm - b 6 f - komplex részt vesz a nem ciklikus (1) és ciklikus (2) elektrontranszportban két mobil hordozó között: a plasztokinon (QH 2 ) és a plasztocianin (Pc) között:

H2O _ _ Fotórendszer II Gyors útmutatás 2 Cit. b 6 f PC Fotórendszer I NADPH (egy)
NADPH / Ferredoxin FNR Cit. b 6 f PC Fotórendszer I NADPH (2)

A komplex oxidálja a II. fotoszisztéma által redukált plasztokinolt , majd redukálja a réztartalmú fehérjét, a plasztocianint, amely a vizes fázisban elektrontranszfert hajt végre a következő lánckomplexbe, az I. fotorendszerbe . A baktériumok és mitokondriumok elektrontranszport láncában a plasztocianin helyett citokróm c van jelen , amely ott hasonló funkciót lát el [2] . A citokróm komplex oxidálja a redukált plasztokinont és redukálja a plasztocianint a következő egyenlet szerint:

QH 2 + 2Pc ox +2H + a stromából → Q + 2Pc vörös + 4H + a lumenbe

Q-ciklus

A Q-ciklus első része

  1. A QH 2 a komplex elektrokémiailag pozitív 'p' oldalához (lumenális oldal) kötődik a Qp helyen, a Riske fehérje vas-kén központja szemikinonná (Q•) oxidálja , és lumenenként két protont adományoz.
  2. A redukált vas-kén centrum egy elektront ad a plasztocianinnak a citokróm f -en keresztül .
  3. Q a Q n helyen az 'n' oldalhoz kötődik .
  4. Q• elektronokat ad át a citokróm b 6 hem b p -jébe alacsony potenciálú ETC-n keresztül.
  5. A hem b p egy elektront adományoz b n / c n -nek .
  6. A b n / c n pár visszaállítja Q-t a Q• állapotba.

A Q-ciklus második része

  1. A második QH 2 a komplex Q p helyéhez kötődik .
  2. Miután átment a nagy potenciálú ETC-n, egy elektron további plasztocianint állít vissza. További két proton lép be a lumenbe.
  3. Alacsony potenciálú ETC-n keresztül a b n / c n elektronja átkerül a Q•-be, és teljesen redukált Q 2− megköti a sztrómájuk két protonját, és QH 2 -vé alakul .
  4. Az oxidált Q és a redukált QH 2 bediffundál a membránba.

Az elektrontranszport a komplexben a protonoknak a sztrómából a lumenbe történő átvitelével és a membránon protongradiens keletkezésével jár. A Q-ciklus elve az, hogy a H + átvitele a membránon a plasztokinonok oxidációja és redukciója eredményeként megy végbe magán a komplexen. Ebben az esetben a plasztokinonok szelektíven adnak és vesznek H +-t a vizes fázisból a membrán különböző oldalairól. Az egyik plasztokinon redukciójának hajtóereje az elektronok bifurkációja: az oxidált plasztokinon egyik elektronja a redukált plasztokinonba kerül át, mivel a másik elektronja egy redox-pozitívabb plasztocianinhoz megy át, amihez jelentős energiaveszteség [19] [20] .

Mióta Peter Mitchell 1975-ben javasolta a Q-ciklus sémát [21] , a hipotézist sokszor megkérdőjelezték és megkérdőjelezték, de a kinetikai, biokémiai, termodinamikai és szerkezeti adatok felhalmozódásával ez a modell általánosan elfogadottá vált. Mindazonáltal az elmúlt évek felfedezései arra kényszerítik a tudósokat, hogy módosítsák ezt a modellt, és még alternatív sémákat is javasoljanak a reakcióhoz. A b n / c n elektronpáros hemek jelenléte a citokróm b 6 f komplexben a plasztokinon lehetséges kételektronos redukciójának feltételezéséhez vezetett, amely így megkerüli az instabil szemikinon gyök veszélyes szakaszát, és csökkenti a reaktív csoport képződését. oxigénfajták . Ezt az elméletet támasztja alá az a tény is, hogy az EPR -módszer nem detektálja a szemikinon gyökök jelentős jelenlétét a komplexben, bár vannak közvetett adatok a jelenlétük mellett [8] . Megoldatlan marad a kérdés, hogy a komplex hogyan választja el az elektronok közvetlen és ciklikus transzportját, és hogyan nem zavarják egymást. Ennek a jelenségnek a magyarázatára egy nyitott Q-ciklus modelljét javasolták, amelyben a plasztokinon redukciójához a Q n helyen az egyik elektron az oxidált plasztokinon molekulából, a második pedig a ferredoxin molekulából származik a ferredoxin -NADP + segítségével. -reduktáz . Mivel ebben a sémában a második elektron a ferredoxinból származik, nincs szükség a második plasztokinon oxidálására és a második plasztocianin redukálására. Ennek eredményeként a Q-ciklus második részének reakciója egyszerűen nem megy végbe, és a komplex visszatér eredeti állapotába. Mivel a plasztokinol oxidációja az egész folyamat korlátozó lépése, nagyon valószínű, hogy ez az út lehetővé teszi a kloroplasztiszok ETC-je mentén történő elektrontranszport sebességének növelését , és ezáltal a fotoszintézis egészének sebességét [8] [21 ] ] .

Ciklikus elektrontranszport

A III-as mitokondriális komplextől eltérően a citokróm b 6 f komplex egy másik típusú elektrontranszportot hajt végre, amely a ciklikus fotofoszforilációhoz szükséges . A ferredoxinból származó elektron átkerül a plasztokinonba, majd a citokróm b 6 f komplexbe, ahol a plasztocianin redukálására használják fel, amelyet aztán az I. fotorendszerben P 700 újraoxidál [22] . A plasztokinon ferredoxin általi redukálásának pontos mechanizmusa még nem ismert, és vitatható. Az egyik feltételezés az, hogy létezik egy speciális enzim, a ferredoxin-plasztokinon-reduktáz vagy NADPH-dihidrogenáz [22] . A ferredoxin-NADP + -reduktáz, amely komplexet képezhet a citokróm b 6 f komplexszel, a közelmúltban a legvalószínűbb jelöltnek tekinthető erre a szerepre . Azt is feltételezik, hogy a hem c n elektronakceptorként részt vehet a ciklikus transzportban [20] [21] . Számos bizonyíték támasztja alá a citokróm b 6 f komplex, a PSI, a ferredoxin-NADP + reduktáz és a PGRL1 transzmembrán fehérje szuperkomplexének kialakulását is. Úgy gondolják, hogy egy ilyen komplex kialakulása és bomlása megváltoztatja az elektronáramlás módját nem ciklikusról ciklikusra és fordítva [23] [24] .

A citokróm bc 1 és citokróm b 6 f komplexek összehasonlítása

A citokróm - bc 1 - komplex és a citokróm - b 6 f - komplex szerkezetileg hasonló fehérjekomplexek, amelyek közül az előbbi a mitokondriumok belső membránjában , az utóbbi pedig a kloroplasztiszok tilakoid membránjában található. Mindkét enzim hasonló reakciót hajt végre a Q-ciklus mechanizmusa révén, oxidálja a membránkinonokat, amit protontranszlokáció kísér. Az a tény, hogy mindkét komplexum ugyanazon az elven működik, a bioenergetikai elvek egységének felismeréséhez vezetett az élet minden területén.

A kloroplaszt topológiája egyszerű módon levezethető a mitokondriumok topológiájából : ehhez elképzelhető, hogy a belső mitokondriális membrán invaginációi teljesen kiszáradnak, és a kloroplaszt tilakoidjaival topológiailag egyenértékű kompartmentet alkotnak. A mitokondriumokban a citokróm bc 1 komplex a mátrixból a membrántérbe pumpálja a protonokat, a kloroplasztiszokban pedig a citokróm b 6 f komplex pumpálja a protonokat a sztrómából a tilakoid zárt belső terébe, és így fordított helyzetben van. citokróm bc 1 komplex a sík membránokhoz képest .

A komplex magja szerkezetileg hasonló a citokróm bc 1 magjához . Mindkét komplex Riske vas-kén fehérjéi homológok egymással [25] . A citokróm f és a citokróm c 1 azonban nem homológ [26] , és eltérő harmadlagos szerkezetűek : a citokróm f főleg β-lemezekből , míg a citokróm c 1 α-hélixekből  áll . Mindazonáltal mindkét polipeptid tartalmaz kovalensen kapcsolt c típusú hemet , amely elektront fogad el a Riske-i vas-kén központból. Ebben az esetben e két fehérje konvergens evolúciójáról beszélhetünk [18] .

A citokróm b 6 és a IV alegység homológ a citokróm b -vel [27] . A IV. alegység (PetD) eggyel kevesebb transzmembrán alfa hélixet tartalmaz, mint a citokróm b C-terminálisa, amelynek megfelel. Ennek a helynek a harmadlagos szerkezete is különbözik a IV. alegység α-hélixei közé beépített klorofill molekula miatt. A citokróm b 6 szerkezete összességében megfelel a citokróm b négyszálú N-terminális doménjének [18] .

A citokróm bc 1 komplex nem rendelkezik a citokróm b 6 f komplex kis alegységeivel (Pet G, L, M és N) homológ alegységekkel, és lipidek foglalják el a helyüket a komplexben . A citokróm bc 1 komplex szerkezete több külső, vízoldható és transzmembrán polipeptidet is tartalmaz, amelyek csak eukarióta komplexekben találhatók meg. A fotoszintézisben részt vevő prokarióta bc 1 és b 6 f komplexekben nincsenek ilyen alegységek [18] .

A citokróm b 6 f komplex három további protetikus csoportot tartalmaz , amelyek nincsenek jelen a bc 1 komplexben: a nem gyakori hem c n , a klorofill a és a β-karotin . Ezen csoportok jelenléte jelentősen befolyásolja a komplex szerkezetét, működését, kinetikai és egyensúlyi jellemzőit. A klorofill a fitol farka belép a portálba, amely a komplex Qp helyére vezet, ami befolyásolhatja a kinonok kötődési és tartózkodási idejét . A c n hem kinonkötő helyként szolgál a b 6 f komplex Q n helyén , míg a bc 1 komplexben ez a hely a b n hemet körülvevő aminosavakból áll, és a kinonok számára jobban hozzáférhető. Az ilyen szerkezeti különbségek szignifikánsan csökkentik a Q n helyen történő inhibitorkötődés szelektivitását és hatékonyságát [18] . A β-karotin feltehetően szerkezeti funkciót tölt be, hidrofób kölcsönhatások révén kapcsolja össze a kis alegységeket , hasonlóan ahhoz, ahogy a fogpiszkáló köti össze a szendvicseket [21] .

rendelet

Mivel a citokróm b 6 f komplex a sejt összes fő anyagcsere - folyamatának metszéspontjában található , expresszióját és összeállítását szinte az összes fő külső és belső tényező befolyásolja: a fény minősége és intenzitása, a reaktív oxigén koncentrációja. fajok, a fitohormonok szintje, a plasztokinonkészlet redukciójának mértéke és a cukrok szintje a sejtben. A komplex komponenseinek expresszióját befolyásoló jelátviteli útvonalak közül sok átfedheti és kölcsönhatásba léphet egymással. Tovább bonyolítja a képet, hogy a sejtmag és a kloroplasztiszok közötti jelátvitel koordinálja a plasztidokban és a sejtmagban kódolt alegységek szintézisét [9] .

A szabályozás a transzkripció szintjén történik, valamint a komplex összeszerelése a tilakoid membránban. A szabályozás egész folyamata még mindig kevéssé ismert, és magasabb rendű növényekben gyakorlatilag nem tanulmányozzák. Az egysejtű C. reinhardtii algával végzett kísérletek kimutatták, hogy az MCA1 nukleáris transzkripciós faktor stabilizálja a citokróm f mRNS -t . Az éretlen citokróm f , amely kölcsönhatásba lép az MCA1-gyel, annak proteolíziséhez vezet , így csökkenti saját expressziójának szintjét. Magasabbrendű növényekben a PRFB3 fehérje erős fényviszonyok között stabilizálja a petB transzkriptum 3'-végét, de nagyon csekély mértékben járul hozzá a citokróm b 6 f komplex szintjének változásához. Valószínű az is, hogy a hemeket a b6 és f citokrómokba beillesztő segédfehérjék bizonyos mértékben hozzájárulnak a komplex szabályozásához . A hemek jelenléte stabilizálja ezeket a fehérjéket, és elengedhetetlen a megfelelő feltekeredéshez . A nem megfelelően hajtogatott fehérjék instabilak és gyorsan proteolízisen mennek keresztül [9] .

A citokróm komplex szintézise sztöchiometrikusan összehangolt a kloroplasztisz ATP szintézis szintézisével, és függ az elektronok sebességétől és lineáris áramlásától, valamint a levél CO 2 asszimilációjának sebességétől [9] .

Biológiai funkciók

A fotoszintézis folyamatában a citokróm b 6 f komplex biztosítja az elektronok szállítását két reakciócentrum között - a II. fotorendszerből az I. fotorendszerbe, valamint a protonok szállítását a kloroplasztiszok sztrómájából a tilakoid lumenbe [5] . Az elektrontranszport felelős a proton gradiens létrehozásáért, amely biztosítja az ATP szintézisét a kloroplasztiszokban [11] .

A citokróm b 6 f komplex fontos szabályozó résztvevője a kloroplasztiszok ETC -jének. Itt számos fontos szabályozási funkciót lát el. Először is koordinálja a nem ciklikus elektronáramlás sebességét és a NADP + redukciót az ATP szintézissel. Mindezen folyamatok kapcsolata az intratilakoid tér pH- értékén keresztül valósul meg. Másodszor, a citokróm b 6 f komplex a kloroplasztiszok ETC-jének redox érzékelője, és érzékenyen reagál a plasztokinonkészlet redukciójára. A plasztokinon-készlet redukciós szintjének növekedésével a kloroplasztiszok átmenetét indukálja az 1-es állapotból a 2- es állapotba azáltal, hogy aktivál egy specifikus protein-kinázt , amely foszforilálja a CCKII fehérjéket . A foszforiláció következtében megváltozik a CCKII elhelyezkedése a membránban, és csökken a fényenergia áramlása a II. fotorendszerbe [28] . Az ilyen indukció valószínű modelljei a klorofill a - n keresztüli aktiválás , amelynek fitolfarka a Qp hely régiójában kerül be a csereüregbe , a Riske fehérje kiszorítása, vagy a megfelelő transzmembrán protein kináz diszulfidkötésének közvetlen redukciója a Riske fehérje vas-kén centrumát használó citokróm komplexet [29] veszik figyelembe .

Ennek a komplexnek a forgási száma a legalacsonyabb a kloroplasztiszok ETC más komponenseihez képest, így szabályozza a fotoszintézis sebességét és a fény intenzitásától vagy a pH-tól függően képes csökkenteni a magában lezajló reakciók sebességét. Ennek a folyamatnak a mechanizmusa nem ismert [30] . Szintén látható a komplex szerepe a ciklikus elektronáramlás erősítésében vagy gyengítésében, függetlenül a kloroplasztiszok állapotától , de a redoxpotenciáljuktól való közvetlen függésben [24] .

Pozíció a membránban

A citokróm komplex megközelítőleg azonos mennyiségben van jelen a stroma és a gran tilakoid membránjában . Gran membránokban a nem ciklikus elektrontranszportban, a stroma membránokban, ahol csak az I. fotorendszer van jelen, a ciklikus transzportban [16] . Az I. fotorendszer egy komplexe átlagosan 1,5–1,8 komplex II . fotorendszert , 8 CCKII -t , 1,5 citokróm b 6 f komplexet, 10–14 plasztokinonmolekulát , 6–8 plasztocianin molekulát és körülbelül 10 ferredoxin molekulát [31] tesz ki .

Galéria

Lásd még

Jegyzetek

  1. EKT azonosító: 1q90
  2. 1 2 Heldt, 2011 , p. 95.
  3. Berg, Jeremy M. (Jeremy M.); Tymoczko, John L.; Stryer, Lubert.; Stryer, Lubert. biokémia. Biokémikus  (neopr.) . New York: W. H. Freeman, 2007. - ISBN 978-0-7167-8724-2 .
  4. 1 2 Ermakov, 2005 , p. 176.
  5. 1 2 3 Hasan SS.; Yamashita E.; Banulis D.; Cramer W.A.;. Kinonfüggő protontranszfer útvonalak a fotoszintetikus citokróm b6f komplexben  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - 2013. - február ( 110. évf. , 11. sz.). - P. 4297-4302 . - doi : 10.1073/pnas.1222248110 . — PMID 23440205 .
  6. 12 Cramer Lab. Projektoldal: Citokróm b6f komplex
  7. 1 2 3 Marta Hojka, Wolfram Thiele, Z. Tóth Szilvia, Wolfgang Lein, Ralph Bock és Mark Aurel Schöttler. A citokróm b6f komplex nukleáris kódolt alegységeinek indukálható elnyomása a dohányban a komplex rendkívül hosszú élettartamát tárja fel1  //  Plant Physiology  : Journal. - American Society of Plant Biologists , 2014. - augusztus ( 165. kötet , 4. szám ). - P. 632-1646 . - doi : 10.1104/pp.114.243741 . — PMID 24963068 .
  8. 1 2 3 4 5 D. Baniulis‡, E. Yamashita§, H. Zhang–, SS Hasan és WA Cramer. A citokróm b6f komplex szerkezete – funkciója  //  Fotokémia és fotobiológia : folyóirat. - 2008. - július 30. ( 84. köt. ). - P. 1349-1358 . - doi : 10.1111/j.1751-1097.2008.00444.x . — PMID 19067956 .
  9. 1 2 3 4 5 6 7 Mark Aurel Schöttler, Z. Tóth Szilvia, Alix Boulouis és Sabine Kahlau. Fotoszintetikus komplex sztöchiometriai dinamika magasabb rendű növényekben: az ATP szintáz és a citokróm b6f komplex biogenezise, ​​funkciója és forgalma  (angol)  // Journal of Experimental Botany  : folyóirat. - Oxford University Press , 2014. - november 24. doi : 10.1093 / jxb/eru495 .
  10. 1 2 Whitelegge JP.; Zhang H.; Aguilera R.; Taylor R.M.; Cramer W. A. Teljes alegység lefedettségű folyadékkromatográfiás elektrospray ionizációs tömegspektrometria (LCMS+) egy oligomer membránfehérjéről: spenótból származó citokróm b(6)f komplex és a Mastigocladus laminosus cianobaktérium  //  Molecular & Cellular Proteomics  : Journal. - 2002. - október ( 1. évf. , 10. sz.). - P. 816-827 . - doi : 10.1074/mcp.m200045-mcp200 . — PMID 12438564 .
  11. 1 2 Voet Donald J. Biochemistry / Donald J. Voet ; Judith G.  Voet (neopr.) . — New York, NY: Wiley, J, 2011. — ISBN 978-0-470-57095-1 .
  12. 1 2 3 4 William A. Cramer, Huamin Zhang. A citokróm b6f komplex szerkezetének következményei töltésátviteli útvonalaira  (angolul)  : Journal. - 2006. - április 24. ( 1757. évf . , 5-6. sz. ). - P. 339-345 . - doi : 10.1016/j.bbabio.2006.04.020 .
  13. Danny C.I. Yao, Daniel C. Brune, Wim F.J. Vermaas. A fotorendszer I. és II. fehérjéinek élettartama a Synechocystis sp. cianobaktériumban.  PCC 6803_  _ - 2012. - január 20. ( 586. évf . , 2. sz.). - 169-173 . o . - doi : 10.1016/j.febslet.2011.12.010 .
  14. Cramer W. A. Zhang H. Yan J. Kurisu G. Smith JL. A fotoszintézis evolúciója: a citokróm b6f komplex időtől független szerkezete  (angol)  // Biokémia : folyóirat. - 2004. - május ( 43. évf. , 20. sz.). - P. 5921-5929 . - doi : 10.1021/bi049444o . — PMID 15147175 .
  15. 1 2 3 4 Stroebel D., Choquet Y., Popot JL, Picot D. An atypical hem in the cytochrome b(6)f complex  //  Nature. - 2003. - november ( 426. évf. , 6965. sz.). - P. 413-418 . - doi : 10.1038/nature02155 . — PMID 14647374 .
  16. 1 2 Ermakov, 2005 , p. 177.
  17. Ermakov, 2005 , p. 243.
  18. 1 2 3 4 5 6 S. Saif Hasana, Eiki Yamashitab, William A. Cramera. Transzmembrán jelátvitel és a citokróm b6f-lipid töltésátviteli komplex összeállítása  //  Biochimica et Biophysica Acta : folyóirat. — Vol. 1827 , sz. 11-12 . - P. 1295-1308 . — PMID 23507619 .
  19. Ermakov, 2005 , p. 240.
  20. 1 2 Cramer W.A.; Zhang H.; Yan j.; Kurisu G.; Smith JL. Transzmembrán forgalom a citokróm b6f komplexben  //  Annual Review of Biochemistry : folyóirat. - 2006. - 20. évf. 75 . - P. 769-790 . - doi : 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142756 . — PMID 16756511 .
  21. 1 2 3 4 Cramer W.A.; Yan J.; Zhang H.; Kurisu G.; Smith JL. A citokróm b6f komplex szerkezete: új protéziscsoportok, Q-tér és a komplex összeállításának „hors d'oeuvres hipotézise”  //  Photosynth Res : Journal. - 2005. - 20. évf. 85 , sz. 1 . - 133-143 . o . - doi : 10.1007/s11120-004-2149-5 . — PMID 15977064 .
  22. 1 2 Pierre Joliot és Anne Joliot. Ciklikus elektrontranszfer növénylevélben  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - 2011. - május 17. ( 99. évf. , 15. sz.). - P. 10209-10214 . - doi : 10.1073/pnas.102306999 .
  23. Masakazu Iwai, Kenji Takizawa, Ryutaro Tokutsu, Akira Okamuro, Yuichiro Takahashi és Jun Minagawa. A fotoszintézis ciklikus elektronáramlását irányító megfoghatatlan szuperkomplex izolálása  //  Nature : Journal. - 2010. - április 22. ( 464. köt. ). - P. 1210-1213 . - doi : 10.1038/nature08885 .
  24. 1 2 Hiroko Takahashi, Sophie Clowez, Francis-André Wollman, Olivier Vallon és Fabrice Rappaport. A ciklikus elektronáramlás redox-vezérelt, de független az állapotátmenettől  // Nature Communications  : Journal  . - Nature Publishing Group , 2013. - június 13. ( 4. köt. ). - doi : 10.1038/ncomms2954 .
  25. Carrell CJ.; Zhang H.; Cramer W.A.; Smith JL. Biológiai identitás és diverzitás a fotoszintézisben és a légzésben: a kloroplaszt Rieske fehérje lumen-oldali doménjének szerkezete  (angol)  // Struktúra : folyóirat. - 1997. - december ( 5. köt. , 12. sz.). - P. 1613-1625 . - doi : 10.1016/s0969-2126(97)00309-2 . — PMID 9438861 .
  26. Martinez SE.; Huang D.; Szczepaniak A.; Cramer W.A.; Smith JL. A kloroplasztisz citokróm f kristályszerkezete új citokróm redőt és váratlan hemligációt tár fel  //  Structure : Journal. - 1994. - február ( 2. köt. 2. sz . ). - P. 95-105 . - doi : 10.1016/s0969-2126(00)00012-5 . — PMID 8081747 .
  27. Widger WR.; Cramer W.A.; Herrmann R. G.; Trebst A. A III. mitokondriális komplex citokróm b-je és a kloroplaszt b6-f komplexe közötti szekvencia homológia és szerkezeti hasonlóság  : a citokróm b-hémek helyzete a membránban  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - 1984. - február ( 81. évf. , 3. sz.). - P. 674-678 . - doi : 10.1073/pnas.81.3.674 . — PMID 6322162 .
  28. Ermakov, 2005 , p. 179.
  29. Sujith Puthiyaveetil. A kloroplaszt LHC II kináz plasztokinollal és tioredoxinnal történő szabályozásának mechanizmusa  //  FEBS Letters : folyóirat. - 2011. - május 6. ( 585. évf . , 12. sz.). - P. 1717-1721 . - doi : 10.1016/j.febslet.2011.04.076 .
  30. Alekszandr N. Tyihonov. A citokróm b6f komplex a fotoszintetikus elektronszállítási útvonalak kereszteződésében  (angol)  // Plant Physiology  : Journal. - American Society of Plant Biologists , 2014. - augusztus ( 81. köt. ). - P. 163-183 . - doi : 10.1016/j.plaphy.2013.12.011 .
  31. Ermakov, 2005 , p. 180.

Irodalom

  • Zitte P. et al., Botany / Szerk. V. V. Chuba. - 35. kiadás - M . : Akadémia, 2008. - T. 2. Növényélettan. — 495 p.
  • Medvegyev S.S. Növényélettan. - Szentpétervár. : BHV-Pétervár, 2013. - 335 p.
  • Növényélettan / Szerk. I. P. Ermakova. - M . : Akadémia, 2005. - 634 p.
  • Heldt G. V. Növények biokémiája. — M. : BINOM. Tudáslaboratórium, 2011. - 471 p.

Linkek