Citokróm f | |
---|---|
A Spinacia oleracea -ból származó citokróm f (alul) csökkenti a plasztocianint (fent). Középen kékkel látható a két alfa hélix, jobbra a béta szendvics. A világos cseresznye rézatomot mutat . A citokróm f transzmembrán domén nem látható. | |
Azonosítók | |
Szimbólum | Apocytochr_F_C |
Pfam | PF01333 |
Pfam klán | CL0105 |
InterPro | IPR002325 |
PROZIT | PDOC00169 |
SCOP | 1 ctm |
SZUPERCSALÁD | 1 ctm |
TCDB | 3.D.3 |
OPM szupercsalád | 345 |
OPM fehérje | 3h1j |
Elérhető fehérjeszerkezetek | |
Pfam | szerkezetek |
EKT | RCSB EKT ; PDBe ; EKTj |
EKT-összeg | 3D modell |
A citokróm f a citokróm b 6 /f komplex ( plasztokinon-plasztocianin reduktáz ) CF kód 1.10.99.1 legnagyobb alegysége . Felépítésében és funkcióiban a citokróm b 6 /f komplex hasonló a mitokondriumok és lila baktériumok citokróm b / c 1 komplexéhez . A citokróm f a citokróm c 1 - hez hasonló szerepet játszik, annak ellenére, hogy másodlagos szerkezetükben különböznek [1] .
Első alkalommal határozták meg a citokróm f harmadlagos szerkezetét a Brassica rapából való izolálás után [2] . A citokróm f luminális része két szerkezeti tartományból áll: kicsi és nagy. A kicsi a nagy tetején található, amely viszont a membránhorgonyhoz van rögzítve, amely egy hosszú α-hélixből áll. A nagy domén egy antiparallel béta szendvicsből és egy rövid hem-kötő peptidből áll, amely háromrétegű szerkezetet alkot. A kis domén a nagy domén F és G béta láncai között helyezkedik el , és teljes egészében béta struktúrákból áll. A nagy hem-kötő domén harmadlagos szerkezetében hasonló a fibronektin állati fehérje III-as doménjéhez . A hem két rövid alfa hélix között van rögzítve a citokróm f N-terminálisán. Szokatlan módon a citokróm N-terminálisa a hem vas ligandumaként szolgál [3] . A második alfa-láncon belül található a citokróm c -re jellemző szerkezeti motívum , a CxxCH (21-25. aminosavak), amely kovalensen kapcsolódik a hemhez egy tioéterkötéssel a Cys - 21 és Cys - 24 révén. A hem - pirrolgyűrűkből származó négy nitrogén mellett a vasat a His -25 és az első alfa-láncból származó szabad alfa-aminocsoport, a Tyr -1 stabilizálja [2] . A citokróm f belsejében jelentős számú vízmolekula található, amelyek a proton vezető rendszereként működhetnek [2] . A vízmolekulák lánca úgy tűnik, hogy minden citokróm konzervatív tulajdonsága f.
Ez a cikk a Pfam és az InterPro IPR002325 nyilvános tartományából származó szöveget használja