Citokróm f

Citokróm f

A Spinacia oleracea -ból származó citokróm f (alul) csökkenti a plasztocianint (fent). Középen kékkel látható a két alfa hélix, jobbra a béta szendvics. A világos cseresznye rézatomot mutat . A citokróm f transzmembrán domén nem látható.
Azonosítók
Szimbólum Apocytochr_F_C
Pfam PF01333
Pfam klán CL0105
InterPro IPR002325
PROZIT PDOC00169
SCOP 1 ctm
SZUPERCSALÁD 1 ctm
TCDB 3.D.3
OPM szupercsalád 345
OPM fehérje 3h1j
Elérhető fehérjeszerkezetek
Pfam szerkezetek
EKT RCSB EKT ; PDBe ; EKTj
EKT-összeg 3D modell

A citokróm f  a citokróm b 6 /f komplex ( plasztokinon-plasztocianin reduktáz ) CF kód 1.10.99.1 legnagyobb alegysége . Felépítésében és funkcióiban a citokróm b 6 /f komplex hasonló a mitokondriumok és lila baktériumok citokróm b / c 1 komplexéhez . A citokróm f a citokróm c 1 - hez hasonló szerepet játszik, annak ellenére, hogy másodlagos szerkezetükben különböznek [1] .

Első alkalommal határozták meg a citokróm f harmadlagos szerkezetét a Brassica rapából való izolálás után [2] . A citokróm f luminális része két szerkezeti tartományból áll: kicsi és nagy. A kicsi a nagy tetején található, amely viszont a membránhorgonyhoz van rögzítve, amely egy hosszú α-hélixből áll. A nagy domén egy antiparallel béta szendvicsből és egy rövid hem-kötő peptidből áll, amely háromrétegű szerkezetet alkot. A kis domén a nagy domén F és G béta láncai között helyezkedik el , és teljes egészében béta struktúrákból áll. A nagy hem-kötő domén harmadlagos szerkezetében hasonló a fibronektin állati fehérje III-as doménjéhez . A hem két rövid alfa hélix között van rögzítve a citokróm f N-terminálisán. Szokatlan módon a citokróm N-terminálisa a hem vas ligandumaként szolgál [3] . A második alfa-láncon belül található a citokróm c -re jellemző szerkezeti motívum , a CxxCH (21-25. aminosavak), amely kovalensen kapcsolódik a hemhez egy tioéterkötéssel a Cys - 21 és Cys - 24 révén. A hem - pirrolgyűrűkből származó négy nitrogén mellett a vasat a His -25 és az első alfa-láncból származó szabad alfa-aminocsoport, a Tyr -1 stabilizálja [2] . A citokróm f belsejében jelentős számú vízmolekula található, amelyek a proton vezető rendszereként működhetnek [2] . A vízmolekulák lánca úgy tűnik, hogy minden citokróm konzervatív tulajdonsága f.

Galéria


Jegyzetek

  1. Prince RC, George GN Cytochrome f kiderült  // Trends Biochem  . sci. : folyóirat. - 1995. - június ( 20. évf. , 6. sz.). - P. 217-218 . - doi : 10.1016/S0968-0004(00)89018-0 . — PMID 7631417 .
  2. 1 2 3 Martinez SE, Huang D., Ponomarev M., Cramer WA, Smith JL A kloroplasztisz citokróm f hem redox központja egy eltemetett ötvizes lánchoz kapcsolódik  // Protein Sci  . : folyóirat. - 1996. - június ( 5. köt. , 6. sz.). - P. 1081-1092 . - doi : 10.1002/pro.5560050610 . — PMID 8762139 .
  3. Sergio E Martinez, Deru Huang, Andrzej Szczepaniak, William A Cramer, Janet L Smith. A kloroplasztisz citokróm kristályszerkezete új citokróm redőt és váratlan hemligációt eredményez  (angolul)  : folyóirat. - 1994. - február ( 2. köt. 2. sz . ). - P. 95-105 . - doi : 10.1016/S0969-2126(00)00012-5 .

További olvasnivaló

Linkek

Ez a cikk a Pfam és az InterPro IPR002325 nyilvános tartományából származó szöveget használja