Citokróm c

Az oldal jelenlegi verzióját még nem ellenőrizték tapasztalt közreműködők, és jelentősen eltérhet a 2020. január 1-jén felülvizsgált verziótól ; az ellenőrzések 2 szerkesztést igényelnek .
Citokróm c, szomatikus

A citokróm c (zöld) háromdimenziós szerkezete a központi vasatomot koordináló hemmolekulával (szürke) (narancs).
Elérhető struktúrák
EKT Ortológus keresés: PDBe , RCSB
Azonosítók
SzimbólumCYCS  ; CYC; HCS; THC4
Külső azonosítókOMIM:  123970 MGI :  88578 HomoloGene :  133055 GeneCards : CYCS gén
RNS expressziós profil
Több információ
ortológusok
KilátásEmberiEgér
Entrez5420513063
EgyüttesENSG00000172115ENSMUSG00000058927
UniProtP99999P62897
RefSeq (mRNS)NM_018947NM_007808
RefSeq (fehérje)NP_061820NP_031834
Locus (UCSC)Chr 7:
25,16 – 25,16 Mb
Chr 19:
24,88 – 24,88 Mb
Keresés a PubMedben[egy][2]

A citokróm c ( eng.  cyt c ) egy kis hem tartalmú fehérje, a citokrómok osztályába tartozik, szerkezetében c típusú hemet tartalmaz . Két funkciót lát el a cellában. Egyrészt a mitokondriális belső membránhoz lazán kötődő egyelektronos hordozó , a légzési lánc szükséges alkotóeleme . Oxidálható és redukálható, de nem köti meg az oxigént. Másrészt bizonyos körülmények között leválhat a membránról, feloldódhat az intermembrán térben, és aktiválhatja az apoptózist . Ez a kettősség a citokróm c molekula sajátos tulajdonságaihoz kapcsolódik .

Szerkezet és tulajdonságok

A citokróm c egy kicsi , 12 kDa molekulatömegű fehérje . Más citokrómoktól eltérően ez egy jól oldódó fehérje (oldékonysága körülbelül 100 g/l ).

A citokróm c szerkezetében egy c típusú hemet tartalmaz , amely kovalens kötést képez cisztein-maradékokon ( Cys-14 és Cys-17) keresztül.

Bioszintézis

Emberben a citokróm c-t a CYCS nukleáris gén kódolja [2] .

A citokróm c inaktív prekurzorként, az apocitokrómként szintetizálódik . Transzlációja és kotranszlációs módosulása a citoplazmában történik.

A további éréshez az apocitokrómot és a hem b -t (Fe-protoporfirin IX) a mitokondriális intermembrán térbe kell szállítani .

A hem chaperonok gyakran részt vesznek a hem b szállításában az intermembrán térbe. [3]

Az apocitokróm külső membránon keresztüli importja eltér a normál fehérje-transzporttól a mitokondriumokba. Ez a folyamat magában foglalja a holocitokróm-c-szintáz fehérjét (HCCS, a hem-liáz másik neve), amely egyidejűleg a hemet az apocitokrómhoz köti. Ugyanakkor a citokróm tömörebb szerkezetet vesz fel, és aktívvá válik. Fontos, hogy a kovalens kötődés előtt a hem vas mennyiségét redukálni kell, az apocitokróm ciszteineket pedig oxidálni kell. A cisztein oxidációját diszulfid kötés kialakításával a tiol-diszulfid oxidoreduktáz enzim végzi. [3]

A citokróm bioszintézise a különböző szervezetekben eltérő, és még mindig nincs általánosan elfogadott nómenklatúra a folyamatban részt vevő fehérjékre. [3]

Funkciók

A citokróm c fő funkciója az elektronok átvitele a mitokondriális légzési lánc III ( koenzim Q  -Cyt C reduktáz vagy citokróm-bc1-komplex ) és IV ( citokróm c-oxidáz ) komplexei között . Ezenkívül a citokróm c apoptózist (programozott sejthalált) indukál a mitokondriumból a citoplazmába való kilépéskor, az apoptózis jelátviteli útvonalának fokozására szolgál, és számos nem apoptotikus funkcióval is rendelkezik. [négy]

Légzés

Az oxidatív foszforiláció  a sejtlégzés egyik legfontosabb összetevője, amely a mitokondriumok belső membránján történik a légzési lánc öt komplexének részvételével. Ez magában foglalja az elektronok egymás utáni átvitelét a komplexek között a szubsztrátról az oxigénmolekulára, a protonok konjugált pumpálását a membránközi térbe, és az ATP szintézisét a keletkező protonpotenciál miatt. Ehhez a folyamathoz elektronhordozókra van szükség, amelyek ingajáratként működnek a légzési komplexek között. Az elektronhordozók lehetnek lipidoldhatóak, membránhoz kötöttek vagy vízoldhatóak, de membránhoz kötöttek. A citokróm c vízoldható, membránhoz kötött elektronhordozó.

A citokróm c egy elektront fogad el a III-as komplexből. Ennek során visszaállítja a hem csoportját .

Továbbá a redukált citokróm a membrán felületén a IV-es komplexbe diffundál. Ez a komplex a citokróm-c-oxidáz , amely elektront fogad el a citokrómtól, majd a felhalmozott elektronokat az O 2 molekulába továbbítja, hogy létrehozza a H 2 O molekulát.

Összefoglalva, a folyamat a következő: a III-as komplex 2 elektron átvitelét katalizálja az ubikinonról 2 citokróm molekulára, 2 protont pumpálva ki a mátrixból; A IV-es komplex 4 elektron átvitelét katalizálja 4 citokróm molekuláról O 2 -re, 4 protont pumpálva ki a mátrixból.

Apoptózis

A citokróm c szerepét az apoptózisban először olyan kísérletekben fedezték fel, ahol a citokróm kivonatokhoz dezoxiadenozin-trifoszfát hozzáadása a kaszpázaktivitás megjelenését idézte elő , és az aktivitás nem fejlődött ki citokróm nélkül. [5] Később bemutatták a kaszpázaktivitás és a mitokondriumok kapcsolatát, valamint a citokróm fő közvetítő szerepét. Kiderült, hogy még a citokróm mikroinjekciója is emlőssejtekbe apoptózist okoz. [6]

A citokróm c mind a belső, mind a külső apoptózis kialakulásában részt vesz. Az intrinsic apoptózist DNS-károsodás, metabolikus stressz vagy rosszul feltekeredett fehérjék jelenléte váltja ki. A belső apoptózis kialakulásában a legfontosabb lépés a külső mitokondriális membrán permeabilizálása. A külső (külső) apoptózist egy extracelluláris ligandum sejtmembrán receptorhoz való kapcsolódása váltja ki.

Az apoptózis aktiválásakor a citokróm a mitokondriumok intermembrán terét elhagyja a citoplazmába, és az apoptotikus proteáz aktiváló faktorhoz (Apaf-1) kötődik. Ennek eredményeként a citokróm c citoplazmába történő felszabadulása elindítja az apoptszóma kialakulását .

Egyéb jellemzők

A citokróm c képes katalizálni az aromás szénhidrogének hidroxilezését és oxidációját.

Bemutatjuk a citokróm antioxidáns szerepét . Képes katalizálni a szuperoxid gyökök oxidációját molekuláris oxigénné. [7]

A citokróm c katalizálja a zsírsavak amidálását. Ez fontos fiziológiai szabályozók kialakulásához vezet. [nyolc]

Megváltozott, részlegesen kibontott konformáció esetén a citokróm c peroxidáz aktivitást mutat, és fokozza a kardiolipin oxidációját . [9]

Képviselet különböző fajokban

A citokróm c egy konzervált fehérje, amely növényekben, állatokban és sok protistákban található. Ez a tulajdonság kis méretével együtt hasznossá teszi a citokróm c-t a kladisztikai kutatásokban. [tíz]

A citokróm c elsődleges szerkezetét egyetlen, körülbelül 100 aminosavból álló lánc képviseli. Sok jól szervezett szervezet pontosan 104 maradékot tartalmaz a láncban. [11] Emlősökben a citokróm c elsődleges szekvenciája csak néhány maradékban tér el. Például az emberi citokróm c szekvencia megegyezik a csimpánzéval, de különbözik a lóétól. [12]

Osztályozás

A c citokrómok között viszont négy osztályt különböztetnek meg (1. osztály, 2. osztály, 3. osztály, 4. osztály), amelyek képviselői a fehérje részében, a hemek számában, az ötödik és hatodik koordinációs pozícióban lévő ligandumok számában különböznek egymástól. vas mennyisége a hemben, és ezért nagyon eltérő tulajdonságokkal rendelkeznek [13] .

Jegyzetek

  1. Tafani M., Karpinich NO, Hurster KA, Pastorino JG, Schneider T., Russo MA, Farber JL (2002. március). "A citokróm c felszabadulása a Fas receptor aktiválásakor a teljes hosszúságú bid transzlokációjától és a mitokondriális permeabilitási átmenet indukciójától függ." J Biol. Chem. 277(12): 10073-10082. doi: 10.1074/jbc.M111350200 . PMID 11790791
  2. 1 2 3 Mavridou DA, Ferguson SJ, Stevens JM Cytochrome c assembly  (neopr.)  // IUBMB Life.. - 2013. - March ( 65. kötet , 3. szám ). - S. 209-216 . doi : 10.1002 / iub.1123 . — PMID 23341334 .
  3. Ow YP, Green DR, Hao Z., Mak TW Cytochrome c: funkciók a légzésen túl  // Nature Reviews Molecular Cell Biology  : Journal  . - 2008. - július ( 9. köt. , 7. sz.). - P. 532-542 . - doi : 10.1038/nrm2434 . — PMID 18568041 .
  4. Liu X., Kim CN, Yang J., Jemmerson R., Wang X. Apoptotikus program indukciója sejtmentes kivonatokban: dATP és citokróm c követelmény  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 1996. - július ( 86. kötet , 1. szám ). - 147-157 . o . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80085-9 . — PMID 8689682 .
  5. Zhivotovsky B., Orrenius S., Brustugun OT, Døskeland SO Injected cytochrome c induces apoptosis  (angol)  // Nature. - 1998. - január ( 391. évf. , 6666. sz.). - P. 449-450 . - doi : 10.1038/35058 . — PMID 9461210 .
  6. Skulachev VP Cytochrome c az apoptotikus és antioxidáns kaszkádokban  (angolul)  : folyóirat. - 1993. - február ( 423. köt . , 3. sz.). - 275-280 . — PMID 9515723 .
  7. Mueller GP, Driscoll WJ Az oleoilglicin in vitro szintézise a citokróm c által a lipid jelátviteli molekulák előállításának új útjára mutat  //  Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 2007. - augusztus ( 282. évf . , 31. sz.). - P. 22364-22369 . - doi : 10.1074/jbc.M701801200 . — PMID 17537719 .
  8. Kagan VE, Bayir HA, Belikova NA, Kapralov O., Tyurina YY, Tyurin VA, Jiang J., Stoyanovsky DA, Wipf P., Kochanek PM, Greenberger JS, Pitt B., Shvedova AA, Borisenko G. Cytochrome c/ cardiolipin relations in mitochondria: a kiss of death  (angolul)  // Free Radic Biol Med. : folyóirat. - 2009. - június ( 46. évf. , 11. sz.). - P. 1439-1453 . - doi : 10.1016/j.freeradbiomed.2009.03.004 . — PMID 19285551 .
  9. Margoliash E. A citokróm c elsődleges szerkezete és evolúciója  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : folyóirat  . - 1963. - október ( 50. köt. ). - P. 672-679 . - doi : 10.1073/pnas.50.4.672 . — PMID 14077496 .
  10. Aminosavszekvenciák különböző fajokból származó citokróm c fehérjékben , Strahlertől, Arthurtól adaptálva; Tudomány és Földtörténet, 1997. 348. oldal.
  11. Lurquin PF, Stone L., Cavalli-Sforza LL Gének, kultúra és emberi evolúció:  szintézis . - Oxford: Blackwell, 2007. - P. 79. - ISBN 1-4051-5089-0 .
  12. Ambler RP szekvencia variabilitása bakteriális citokrómokban c  //  Biochimica et Biophysica Acta : folyóirat. - 1991. - május ( 1058. évf . , 1. sz.). - P. 42-47 . - doi : 10.1016/S0005-2728(05)80266-X . — PMID 1646017 .