PiRNS

A piRNS ( piwi -interacting  RNA, piRNA, piwiRNA , egyes forrásokban piRNS -ként is megtalálható [1] ) az állati sejtekben expresszálódó kisméretű, nem kódoló RNS legnagyobb osztálya [2] ; a Piwi család fehérjéivel alkotott komplexekben találhatók meg , amelyekről a nevüket kapták. A piRNS-ek általában hosszabbak, mint a miRNS -ek és a kis interferáló RNS -ek , és 26-32 nukleotid hosszúak [3] , ráadásul a miRNS-ekkel ellentétben nem annyira konzervatívak [2] . A Piwi fehérjék az Argonaute fehérjék nagy csoportjába tartoznak, és szinte kizárólag csíravonal sejtekben expresszálódnak ; szükségesek a csíravonal őssejtek fenntartásához, a spermatogenezishez és a transzponálható elemek elnyomásához . A piRNS-ekkel alkotott Piwi-komplexek nemcsak a retrotranszpozonok és más genetikai elemek elnémításában vesznek részt a poszttranszlációs szinten, hanem más, jórészt leíratlan hatásokkal is bírnak, például epigenetikai [4] .

Továbbra sem világos, hogyan keletkeznek a piRNS-ek, de lehetséges kutatási módszereket javasoltak erre a kérdésre, és azt találták, hogy a képződésük bizonyos módjai eltérnek a miRNS-ek és a kis interferáló RNS-ekétől. Ugyanakkor egy másik csoport, a rasiRNA néhány kis nem kódoló RNS-ét a piRNS-ekhez tartozónak tekintik [3] [5] .

A kimutatott piRNS-ek száma emlősökben mintegy 50 ezer, a Drosophila melanogasterben pedig 13 ezer [ 6] , ami lényegesen több, mint a többi osztályba tartozó ismert kis RNS-ek száma. Mivel a piRNS jelentős része, különösen emlősökben, nem kapcsolódik transzponálható elemekhez, feltételezhető, hogy más, még nem leírt funkciókat is ellátnak [3] .

A piRNS-eket 2006-ban fedezték fel [3] .

Szerkezet

A piRNS-eket gerincesekben és gerinctelenekben is találták , és bár a biogenezis mintázata és a célpontokkal való kölcsönhatás típusai fajonként eltérőek lehetnek, számos, az összes piRNS-re jellemző konzervált tulajdonság létezik. A másodlagos szerkezet [7] markáns motívumait nem találtuk a piRNS-ekben , hosszuk 26-32 nt, és az esetek 80-90%-ában gerinceseknél és gerincteleneknél is az 5'-végen lévő első nukleotid uridin (U ). A Caenorhabditis elegans fonálféreg 5' -végén foszfátcsoport , 3'-végén 2'-O- metiláció található [8] . Ezt a módosulást Drosophila [9] , zebrahal [10] , egerek [11] és patkányok [10] esetében is azonosították . Az 5' végén lévő foszfátcsoport az emlős piRNS-ekben is megtalálható [3] . Ennek a módosításnak a jelentősége még nem tisztázott egyértelműen, de feltételezik, hogy növeli a piRNS stabilitását [3] [10] .

Egerekben a Piwi család három fehérjét foglal magában: Mili, Miwi és Miwi2 [3] ; emberben HIWI (vagy PIWIL1), HILI (vagy PIWIL2), HIWI2 (vagy PIWIL4) és HIWI3 (vagy PIWIL3) [12] .

Lokalizáció

Emlősökben a piRNS gének körülbelül 17%-a felel meg ismétlődő szekvenciáknak , beleértve a transzponálható elemeket is. Meg kell jegyezni, hogy az ismétlődéseknek megfelelő piRNS-ek száma kisebb, mint az ismétlődések aránya a genomban . Így a rágcsálókban ezek az arányok 17, illetve ~42%. Más piRNS-eket egyedi gének kódolnak, a piRNS-t kódoló gének klaszterekben helyezkednek el a genomban. Az ilyen klaszterek 90%-a olyan területeken található, amelyek nem tartalmaznak annotált géneket vagy ismétlődéseket, de néha előfordulhatnak intronokban és exonokban [3] . Így míg a D. melanogasterben és a gerincesekben ezek a klaszterek olyan területeken helyezkednek el, ahol hiányoznak a fehérjét kódoló gének, addig a C. elegansban a piRNS gének a fehérjét kódoló gének között helyezkednek el [5] [8] [13] . Mindegyik ilyen klaszter 10-től sok ezerig terjedő piRNS-t kódolhat, mérete pedig 1-100 kilobázis között változhat [14] . Néha a piRNS-klaszterek egymás mellett helyezkednek el, de különböző szálak kódolják őket; ez kétirányú transzkripcióra utalhat egy közös promoterről . A genomokban a piRNS klaszterek kimutatása és rövid annotációja bioinformatikai módszerekkel történik , amelyek egyre bonyolultabbak [15] . Bár a piRNS génklaszterek jelenléte erősen konzervált fajok között, ugyanez nem mondható el e gének szekvenciáiról [16] . Például, bár a legnagyobb rágcsáló piRNS klaszterek humán ortológokkal rendelkeznek , a szekvencia hasonlóság ebben az esetben nem figyelhető meg [3] .

Korábban azt hitték, hogy emlősökben a piRNS és a Piwi fehérjék csak a herékben találhatók [3] . Mára azonban megállapították, hogy az emlős oocitákban is jelen van egy specifikus piRNS rendszer [17] . Ezenkívül kimutatták, hogy egy további Piwi fehérjegén, a PIWI-LIKE 3 (PIWIL3) expresszálódik a szarvasmarha petesejtekben a meiózis során . Ennek ellenére úgy tűnik, hogy az emlős piRNS-ek csak férfiakban működnek [18] . Gerincteleneknél a piRNS-eket mind a hím, mind a női csíravonal sejtekben azonosították [10] .

Sejtszinten a piRNS-eket mind a sejtmagban , mind a citoplazmában találták , ami arra utal, hogy a piRNS-ek mindkettőben működhetnek [5] , és így többféle hatásuk is van [19] .

Kialakulása és hatásmechanizmusa

A piRNS expressziós szintje a spermatogenezis során változik. A pachyténben ( a meiotikus osztódás I. profázisában ) a diploid spermatociták meiózisos osztódása során kezdik kimutatni őket (bár a piRNS képződése már a prepachitizált sejtekben is megindul [20] ), azonban a haploid spermatidák képződése során a A piRNS bennük élesen lecsökken, az érett spermiumokban pedig – a környékről ítélve – hiányoznak [3] .

A piRNS képződésének mechanizmusai még nem teljesen ismertek, bár számos lehetséges mechanizmust javasoltak. Azokban az esetekben, amikor a piRNS gének exonokba esnek, a piRNS-ek csak a szensz (sens-) mRNS -szálnak felelnek meg , tehát csak egy DNS-szálból képződnek, és valószínűleg hosszú primer prekurzor transzkriptumok származékai. Ez a feltevés összhangban van a here-specifikus EST -ek és a piRNS- lókuszoknak megfelelő mRNS-ek jelenlétére vonatkozó adatokkal. Ezenkívül a piRNS-klaszterekben nem találtunk pri-miRNS-ekre jellemző fejlett másodlagos struktúrákat. Ezért úgy tűnik, hogy a piRNS - feldolgozás különbözik a mikroRNS-től és a kis interferáló RNS-feldolgozástól. A kettős szálú prekurzorok hiányát, amelyek különösen a miRNS-ekre jellemzőek, bizonyítja, hogy néhány egyedi piRNS-ben csak szensz szekvenciák vannak jelen [3] .

Drosophilában és egerekben a piRNS feldolgozásában két szakasz különböztethető meg: az elsődleges feldolgozás és a „ping-pong” ciklus (amplifikációs hurok) [20] .

Elsődleges feldolgozás

Mint fentebb említettük, a piRNS-ek hosszú prekurzor transzkriptumokból jönnek létre. A Drosophilában az elsődleges transzkriptumok piRNS-szerű kis RNS-ekké rövidülnek. A folyamatban szerepet játszó tényezőket még mindig rosszul ismerik, de a legújabb vizsgálatok kimutatták, hogy lehetséges, hogy az ilyen piRNS-szerű RNS-ek 5'-végét a Cukkini endonukleáz alkotja. Egerekben a cukkini homológja a MitoPLD fehérje, amely endonukleáz tulajdonságokkal is rendelkezik. Ezt követően a piRNS-szerű RNS-eket a Piwi fehérjék kötik meg, majd a 3'-végüket lerövidíti egy még le nem írt endonukleáz, és a piRNS-szerű RNS-ek a primer piRNS-eknek megfelelő méreteket kapnak. Lehetséges, hogy a Hsp83/Shu fehérje komplex fontos szerepet játszik a piRNS-nek a Piwi fehérjékre való betöltésében. Ezenkívül a piRNS-eket 2'-O-metilezi a HEN1/Pimet komplex [20] .

A ping-pong ciklus

Az elsődleges feldolgozáson átesett PiRNS olyan állapotban van, amely a Piwi fehérjékhez kapcsolódik. Az ilyen primer piRNS-ek antiszensz piRNS-ek, amelyek komplementerek a transzponálható elemek átirataival. A Drosophilában a Piwi fehérjecsaládot három fehérje képviseli: Piwi, Padlizsán (Aub) és Ago3, de csak a Piwi és Aub fehérjék kötik meg az elsődleges piRNS-eket. A piRNS-sel alkotott Piwi komplexek átkerülnek a sejtmagba , és nem vesznek részt a citoplazmában végbemenő „ping-pong” ciklusban , de részt vesznek a nukleáris elnémításban. Az Aub-asszociált piRNS-ek komplementer módon kötik meg a mobil genetikai elemek átiratait. Az Aub az Argonaute csoport többi fehérjéhez hasonlóan képes elvágni a foszfodiészter kötést a cél RNS-ben, amely a vezető RNS 10. és 11. nukleotidjával szemben helyezkedik el (jelen esetben primer piRNS-ek). A törés eredményeként a mobil elem transzkriptumának két fragmentuma képződik, amelyek közül az egyikben az 5'-vég 10 nukleotid távolságra van az elsődleges piRNS 5'-végétől. Ez a fragmentum, egy másodlagos piRNS, ellentétben az elsődleges piRNS-sel, nem komplementer a mobil elem transzkriptumával, és egy szensz piRNS. Mivel a primer piRNS-ekben leggyakrabban az első nukleotid az uridin, az adenin nukleotid leggyakrabban a 10. pozícióban található az 5'-végtől a szekunder piRNS-ekben . A másodlagos piRNS-ek 3'-végének feldolgozásának mechanizmusa még mindig nem tisztázott. A másodlagos piRNS megköti az Ago3 fehérjét, és az elsődleges piRNS prekurzor transzkriptum levágására irányul, amelyből az antiszensz piRNS-t kivágják. Az ilyen antiszensz piRNS-ek vagy elnémíthatják a transzponálható elemeket, vagy irányíthatják az új szensz piRNS-ek képződését. Így a ping-pong ciklus egyesíti a piRNS-feldolgozást és a mobil elemek citoplazmatikus elnémítását a transzkriptum szintjén. Lehetővé teszi továbbá a csendesítés fokozását az új antiszensz piRNS-ek képződése miatt, válaszul a transzponálható elemek fokozott expressziójára [3] . A Drosophilában a „ping-pong” ciklus nemcsak az elsődleges piRNS-eket, hanem az anyától örökölt piRNS-eket is magában foglalhatja. A Drosophila ping-pong ciklusát heterotípusosnak nevezik , mert két különböző Piwi fehérjét, az Aub-t és az Ago3-at foglal magában [20] .

Egerekben az elsődleges piRNS-ek a Mili és Miwi fehérjékhez kötődnek, míg a másodlagos piRNS-ek a Miwi2 fehérjéhez. A Miwi-hez kapcsolódó piRNS-ek részt vesznek a citoplazmatikus elnémításban, de célpontjaik nagyrészt ismeretlenek. Mili-asszociált primer piRNS-ek részt vesznek a ping-pong ciklusban. Az ebben a ciklusban képződő másodlagos piRNS-ek a Miwi2-hez kötődnek, a Miwi2-vel alkotott piRNS komplex pedig a sejtmagba kerül, ahol részt vesz a nukleáris elnémításban. Az egér ping-pong ciklusát homotipikusnak nevezik , mert egy Piwi fehérjét, a Milit tartalmaz. A HSP90/FKBP6 fehérjekomplex bizonyos szerepet játszik a Miwi2-hez kötődő másodlagos piRNS-ek képződésében. A másodlagos piRNS-ek 2'-O-metilációját a HEN1/Pimet komplex biztosítja [20] .

Drosophilában az ivarmirigyek szomatikus sejtjeiben (például tüszősejtekben) a Piwi fehérjék is expresszálódnak és kötődnek a primer piRNS-ekhez, azonban az Aub és Ago3 fehérjék itt alacsony szinten expresszálódnak, és nem elegendőek a hordozáshoz. ki a „ping-pong” ciklusból [20] .

Úgy tűnik, a mozgékony elemek elnyomásának hasonló mechanizmusa létezik a zebrahalban [3] . A "ping-pong" mechanizmus jelenlétére utaló jeleket találtak a legprimitívebb állatoknál - szivacsoknál és cnidarianoknál , ami azt jelzi, hogy a "ping-pong" mechanizmus a Metazoa legkorábbi ágaiban jelent meg, és az elnyomás konzervatív mechanizmusa. mobil elemek [3] [21] .

Egyéb fehérjefaktorok

Más fehérjék, amelyek nem tartoznak a Piwi csoportba, szintén részt vesznek a piRNS biogenezisében. Ezek különösen a Tudor szupercsaládhoz (TDRD) tartozó fehérjék. Tartalmazzák a Tudor domént , amely biztosítja a TDRD fehérje kötődését egy másik fehérje szubsztráthoz a szubsztrátban lévő szimmetrikus vagy aszimmetrikus dimetil-arginin-maradékok miatt. A Piwi fehérjék szimmetrikus dimetilarginin- maradékai vannak az N-terminális közelében, így a TDRD fehérjék képesek kötődni hozzájuk és részt venni az RNS elnémításában . 2011-ig 11, a piRNS biogenezisében részt vevő TDRD fehérjét azonosítottak Drosophilában, és 7 ilyen TDRD fehérjét azonosítottak egerekben [20] .

Például a TDRD Tud fehérjében mutáns legyekről azt találták, hogy fenotípusosan konzisztensek az Aub fehérje mutánsaival. A Tud fehérje 11 Tudor-domént tartalmaz, és szimmetrikus dimetilarginin-oldalláncokon keresztül képes kötődni az Aub-hoz és az Ago3-hoz is, így a "ping-pong" ciklus "platformjaként" szolgál. Tud mutánsokban az Aub és Ago3 fehérjék aktívabban kötődnek a piRNS-hez, mint a vad típusú legyekben , ami eltéréseket okozott a normál fenotípustól [20] .

Számos olyan fehérje is ismert, amelyek részt vesznek a piRNS biogenezisében, és nem kapcsolódnak sem Piwi, sem TDRD fehérjékhez. Így Drosophilában a következő fehérjéknél mutattak ki ilyen hatást: Vasa (Vas), Maelstrom (Mael), Armi, Zuc, Squash (Squ) és Shu, amelyek mindegyike – a Squ kivételével – homológokkal rendelkezik egerek. E tényezők többsége a „ping-pong” mechanizmusban vesz részt [20] .

C. elegans

Megállapítást nyert , hogy a C. elegans rendelkezik piRNS-sel, de hiányzik belőle a „ping-pong” mechanizmus [22] . A C. elegansban a piRNS biogenezisével kapcsolatos legújabb tanulmányok azonban részben rávilágítottak arra a kérdésre, hogy a piRNS által közvetített védekezési rendszer a parazita mobil elemekkel szemben hogyan ismeri fel az „önmagát” és az „idegen”, például az immunrendszert [20] .

A C. elegans piRNS-ei 21 nukleotid hosszúak, és a IV. kromoszómán található két klaszter kódolja őket , amelyek elkülönülten helyezkednek el a fehérjét kódoló génektől. Az egyes klaszterek előtt ~42 nukleotid távolságra található a CTGTTTCA szekvencia, amely nyilvánvalóan szükséges a klaszter RNS-polimeráz II általi transzkripciójához. A szintetizált piRNS-ek a Piwi PRG-1 fehérjéhez kötődnek. Az így létrejövő piRNS komplexek PRG-1-gyel idegen transzkriptumokat keresnek, és a komplementaritás hiánya (legfeljebb 4 eltérés) elegendő a transzkriptumhoz való kötődéshez. és kiváltják az RNS-függő RNS-polimerázok képződését, amelyek biztosítják a specifikus kis interferáló RNS-ek (22G-RNS-ek) képződését és amplifikációját. Ez utóbbiak a WAGO fehérjéhez, az Argonaute csoport C. elegans - specifikus fehérjéhez kötődnek . A citoplazmában ezek a komplexek biztosítják a géncsendesítést mRNS szinten, elpusztítva az idegen transzkriptumot, míg a sejtmagban transzkripciós szinten blokkolják a transzponálható elemeket [20] .

A "saját" és "idegen" felismerése és a saját átiratok megsemmisüléstől való védelme nyilvánvalóan több szinten történik:

• Azok a piRNS-ek, amelyek a szervezet génjeinek elnémítását okozzák, negatív szelekciónak vannak kitéve. Pontosabban, a csíravonal sejtekben gyakorlatilag nincsenek piRNS-ek, amelyek nagyszámú bázis eltérést tesznek lehetővé a célponthoz való komplementer kötődés esetén. Az a tény, hogy a primer piRNS-ek komplementaritása a transzpozon transzkriptumokkal annak tudható be, hogy a piRNS klaszterek és transzpozonok átfedik egymást, vagyis DNS-szekvenciáik antiparallel szálakon helyezkedhetnek el, és részben átfedhetik egymást. Ezért a piRNS-ek kevésbé komplementerek a transzpozon transzkriptumokkal, mint a közönséges sejtes transzkriptumokkal. Elmondható, hogy a piRNS klaszterek a transzpozonok „csapdáját” jelentik.
• A „saját” mRNS további védelmét a 22G-RNS komplexnek a szintén az Argonaute csoportba tartozó CSR-1 fehérjéhez való kötődése biztosítja. Előfordulhat, hogy nem okozza a hozzá kapcsolódó mRNS pusztulását, mivel kisebb mennyiségben expresszálódik, mint a WAGO, de megakadályozza, hogy a transzkriptum kötődjön a PRG-1-hez. Ezen túlmenően, a CSR-1 emléket ad a csíravonal sejtekben a múltbeli génexpressziós folyamatokból származó „én”-re [20] .

Elnémítással kapcsolatos funkciók

A piRNS-eket „a genom őrzőinek” nevezték el a mobil elemek elhallgattatására és a genom védelmére való képességük miatt [20] . Úgy tűnik, emlősökben a piRNS transzpozoncsendesítő aktivitása különösen fontos az embrió fejlődése során , emellett mind az emberben, mind a C. elegans szükséges a spermatogenezishez [23] [24] . A hím egerekben a transzponálható elemek piRNS által közvetített csendesítő rendszerét megzavaró mutációk csökkentik a termékenységet , vagy akár sterilitáshoz vezetnek [3] [25] . Az is lehetséges, hogy az emberi reproduktív rendszer egyes betegségeit, például az azoospermiát a piRNS-rendszer hibái okozzák [20] .

Megfigyelték a piRNS-ek bizonyos hatását egyes metiltranszferázokra , amelyek a transzpozonok felismeréséhez és elnémításához szükséges metilációt hajtanak végre, de ez a kapcsolat még mindig kevéssé ismert [23] .

Egyéb effektusok

A piRNS-ek anyai úton terjedhetnek, és az ilyen anyai öröklődés epigenetikai hatásait kimutatták Drosophilában [13] . A specifikus piRNS-ek aktivitása az epigenetikai folyamatokban megköveteli a piRNS-ek kölcsönhatását Piwi fehérjékkel, HP1a-val és más tényezőkkel [6] . Lehetséges, hogy a piRNS-ek részt vesznek a karcinogenezis epigenetikai szabályozásában [20] .

A haslábú Aplysia ( tengeri nyúl ) esetében kimutatták, hogy a központi idegrendszer neuronjaiban található piRNS -ek elnyomják a CREB2 gén, egy memóriarepresszor expresszióját azáltal, hogy DNS-metilációt indukálnak régiójában, és ezáltal biztosítják a memória működését. Ezenkívül a közelmúltban piRNS-eket találtak egér hippokampusz neuronjaiban. Valószínűleg ezek a piRNS-ek részt vesznek a dendrit tüskék kialakulásában [20] .

Tanulmányi módszerek

A piRNS-ek tanulmányozásában a legnagyobb előrelépést olyan specifikus szekvenálási technikák alkalmazásával érték el , mint a Solexa és a 454. Ezekkel heterogén és összetett RNS-populációk, például piRNS-ek elemezhetők. Ezen RNS-ek kis mérete bizonyos nehézségeket okoz mesterséges expressziójukban és amplifikációjukban , azonban ezek leküzdésére a polimeráz láncreakción alapuló speciális technikákat fejlesztettek ki [26] [27] .

Lásd még

• Retrotranszpozonok
• Kis RNS

Jegyzetek

1. ↑ Markov A. V. A komplexitás születése. Az evolúcióbiológia ma. Váratlan felfedezések és új kérdések . - Moszkva: Astrel, Corpus, 2010. - S.  480-483 . — 552 p. — ISBN 978-5-271-24663-0 .
2. ↑ 1 2 Seto AG , Kingston RE , Lau NC A Piwi fehérjék nagykorúsága.  (angol)  // Molekuláris sejt. - 2007. - Vol. 26. sz. 5 . - P. 603-609. - doi : 10.1016/j.molcel.2007.05.021 . — PMID 17560367 .
3. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 Makarova Yu. A., Kramerov D. A. Nem kódoló RNS-ek  (orosz)  // Biokémia. - 2007. - T. 72 , 11. sz . - S. 1427-1448 . Az eredetiből archiválva : 2014. július 14.
4. ↑ Siomi MC , Sato K. , Pezic D. , Aravin AA PIWI-interacting small RNS-ek: a genomvédelem élcsapata.  (angol)  // Természetismertetők. Molekuláris sejtbiológia. - 2011. - Kt. 12, sz. 4 . - P. 246-258. - doi : 10.1038/nrm3089 . — PMID 21427766 .
5. ↑ 1 2 3 Klattenhoff C. , Theurkauf W. A piRNS-ek biogenezise és csíravonal-funkciói.  (angol)  // Fejlesztés (Cambridge, Anglia). - 2008. - Vol. 135. sz. 1 . - P. 3-9. - doi : 10.1242/dev.006486 . — PMID 18032451 .
6. ↑ 1 2 Haifan Lin, Hang Yin, Ergin Beyret, Seth Findley, Wei Deng. A piRNS útvonal szerepe az őssejtek önmegújulásában. (angol)  // Fejlődésbiológia. - 2008. - Vol. 319, 2. sz . - P. 479. - doi : 10.1016/j.ydbio.2008.05.048 .
7. ↑ Kandhavelu M,* Lammi C, Buccioni M, Dal Ben D, Volpini R, Marucci G. A snoRNS, microRNS, piRNS jellemzőinek megléte egy új, nem kódoló RNS-ben: x-ncRNS és biológiai vonatkozásai a Homo sapiensben // Journal bioinformatika és szekvenciaelemzés. - 2009. - 1. évf. 1, 2. sz . — P. 031–040.
8. ↑ 1 2 Ruby JG , Jan C. , Player C. , Axtell MJ , Lee W. , Nusbaum C. , Ge H. , Bartel DP A nagyléptékű szekvenálás 21U-RNS-t, valamint további mikroRNS-eket és endogén siRNS-eket tár fel a C. elegans-ban.  (angol)  // Cell. - 2006. - Vol. 127. sz. 6 . - P. 1193-1207. - doi : 10.1016/j.cell.2006.10.040 . — PMID 17174894 .
9. ↑ Vagin VV , Sigova A. , Li C. , Seitz H. , Gvozdev V. , Zamore PD A különálló kis RNS útvonal elhallgatja az önző genetikai elemeket a csíravonalban.  (angol)  // Tudomány (New York, NY). - 2006. - Vol. 313. sz. 5785 . - P. 320-324. - doi : 10.1126/tudomány.1129333 . — PMID 16809489 .
10. ↑ 1 2 3 4 Houwing S. , Kamminga LM , Berezikov E. , Cronembold D. , Girard A. , van den Elst H. , Filippov DV , Blaser H. , Raz E. , Moens CB , Plasterk RH , Hannon GJ , Draper BW , Ketting RF A Piwi és a piRNS-ek szerepe a csírasejt-karbantartásban és a transzpozon-csendesítésben Zebrafish-ben.  (angol)  // Cell. - 2007. - Vol. 129. sz. 1 . - P. 69-82. - doi : 10.1016/j.cell.2007.03.026 . — PMID 17418787 .
11. ↑ Kirino Y. , Mourelatos Z. Mouse Piwi-kölcsönhatásba lépő RNS-ek 2'-O-metilezettek a 3'-végükön.  (angol)  // Természeti strukturális és molekuláris biológia. - 2007. - Vol. 14. sz. 4 . - P. 347-348. - doi : 10.1038/nsmb1218 . — PMID 17384647 .
12. ↑ Ross RJ , Weiner MM , Lin H. PIWI fehérjék és PIWI-vel kölcsönható RNS-ek a szómában.  (angol)  // Természet. - 2014. - Kt. 505, sz. 7483 . - P. 353-359. - doi : 10.1038/nature12987 . — PMID 24429634 .
13. ↑ 1 2 Brennecke J. , Malone CD , Aravin AA , Sachidanandam R. , Stark A. , Hannon GJ An epigenetic role for maternally herited piRNAs in transposon silenceing.  (angol)  // Tudomány (New York, NY). - 2008. - Vol. 322. sz. 5906 . - P. 1387-1392. - doi : 10.1126/tudomány.1165171 . — PMID 19039138 .
14. ↑ O'Donnell KA , Boeke JD Mighty Piwis védi a csíravonalat a genombehatolókkal szemben.  (angol)  // Cell. - 2007. - Vol. 129. sz. 1 . - P. 37-44. - doi : 10.1016/j.cell.2007.03.028 . — PMID 17418784 .
15. ↑ Rosenkranz D. , Zischler H. proTRAC – valószínűségi piRNS klaszterek detektálására, megjelenítésére és elemzésére szolgáló szoftver.  (angol)  // BMC bioinformatika. - 2012. - Kt. 13. - P. 5. - doi : 10.1186/1471-2105-13-5 . — PMID 22233380 .
16. ↑ Malone CD , Hannon GJ Kis RNS-ek, mint a genom őrzői.  (angol)  // Cell. - 2009. - 1. évf. 136. sz. 4 . - P. 656-668. - doi : 10.1016/j.cell.2009.01.045 . — PMID 19239887 .
17. ↑ Tam OH , Aravin AA , Stein P. , Girard A. , Murchison EP , Cheloufi S. , Hodges E. , Anger M. , Sachidanandam R. , Schultz RM , Hannon GJ A pszeudogén eredetű kis interferáló RNS-ek szabályozzák a génexpressziót a moban petesejtek.  (angol)  // Természet. - 2008. - Vol. 453. sz. 7194 . - P. 534-538. - doi : 10.1038/nature06904 . — PMID 18404147 .
18. ↑ Silva, Ricardo Andres Zacarias. Piwi fehérjék emlősökben: a tehén perspektívája.  (neopr.) . - 2011. - P. 4. - 50 p.
19. ↑ Ruvkun G. Tiny RNS: Honnan jövünk? Mik vagyunk? Hová megyünk?  (angol)  // Trends in plant science. - 2008. - Vol. 13. sz. 7 . - P. 313-316. - doi : 10.1016/j.tplants.2008.05.005 . — PMID 18562240 .
20. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 Ishizu H. , Siomi H. , Siomi MC PIWI-interacting RNAs biology of PIWI-interacting RNAs: new insights to biogenesis and functions in the germlines inside and outside.  (angol)  // Gének és fejlődés. - 2012. - Kt. 26. sz. 21 . - P. 2361-2373. - doi : 10.1101/gad.203786.112 . — PMID 23124062 .
21. ↑ Grimson A. , Srivastava M. , Fahey B. , Woodcroft BJ , Chiang HR , King N. , Degnan BM , Rokhsar DS , Bartel DP MikroRNS-ek és Piwi-kölcsönhatásba lépő RNS-ek korai eredete és fejlődése állatokban.  (angol)  // Természet. - 2008. - Vol. 455. sz. 7217 . - P. 1193-1197. - doi : 10.1038/nature07415 . — PMID 18830242 .
22. ↑ Das PP , Bagijn MP , Goldstein LD , Woolford JR , Lehrbach NJ , Sapetschnig A. , Buhecha HR , Gilchrist MJ , Howe KL , Stark R. , Matthews N. , Berezikov E. , Ketting RF , Tavaka S.EA RF A Piwi és a piRNS-ek egy endogén siRNS útvonal előtt hatnak, hogy elnyomják a Tc3 transzpozon mobilitását a Caenorhabditis elegans csíravonalában.  (angol)  // Molekuláris sejt. - 2008. - Vol. 31. sz. 1 . - P. 79-90. - doi : 10.1016/j.molcel.2008.06.003 . — PMID 18571451 .
23. ↑ 1 2 Aravin AA , Sachidanandam R. , Bourc'his D. , Schaefer C. , Pezic D. , Toth KF , Bestor T. , Hannon GJ Egy egyes transzpozonok által beindított piRNS-útvonal kapcsolódik a de novo DNS-metilációhoz egerekben.  (angol)  // Molekuláris sejt. - 2008. - Vol. 31. sz. 6 . - P. 785-799. - doi : 10.1016/j.molcel.2008.09.003 . — PMID 18922463 .
24. ↑ Wang G. , Reinke V. A C. elegans Piwi, PRG-1, szabályozza a 21U-RNS-t a spermatogenezis során.  (angol)  // Jelenlegi biológia : CB. - 2008. - Vol. 18, sz. 12 . - P. 861-867. - doi : 10.1016/j.cub.2008.05.009 . — PMID 18501605 .
25. ↑ Barrett et. al., 2013 , p. 37.
26. ↑ Ro S. , Park C. , Jin J. , Sanders KM , Yan W. PCR-alapú módszer kis RNS-ek kimutatására és mennyiségi meghatározására.  (angol)  // Biokémiai és biofizikai kutatási kommunikáció. - 2006. - Vol. 351. sz. 3 . - P. 756-763. - doi : 10.1016/j.bbrc.2006.10.105 . — PMID 17084816 .
27. ↑ Tang F. , Hayashi K. , Kaneda M. , Lao K. , Surani MA A piRNS expressziójának érzékeny multiplex vizsgálata.  (angol)  // Biokémiai és biofizikai kutatási kommunikáció. - 2008. - Vol. 369. sz. 4 . - P. 1190-1194. - doi : 10.1016/j.bbrc.2008.03.035 . — PMID 18348866 .

Irodalom

• Siomi MC , Sato K. , Pezic D. , Aravin AA PIWI-kölcsönhatásba lépő kis RNS-ek: a genomvédelem élcsapata.  (angol)  // Természetismertetők. Molekuláris sejtbiológia. - 2011. - Kt. 12, sz. 4 . - P. 246-258. - doi : 10.1038/nrm3089 . — PMID 21427766 .
• Ishizu H. , Siomi H. , Siomi MC A PIWI-vel kölcsönhatásba lépő RNS-ek biológiája: új betekintés a csíravonalakon belüli és kívüli biogenezisbe és működésbe.  (angol)  // Gének és fejlődés. - 2012. - Kt. 26. sz. 21 . - P. 2361-2373. doi :/ gad.203786.112 . — PMID 23124062 .
• Lucy W. Barrett, Sue Fletcher, Steve D. Wilton. Lefordítatlan génrégiók és egyéb nem kódoló elemek . - SpringerBriefs in Biochemistry and Molecular Biology, 2013. - 57 p. - ISBN 978-3-0348-0679-4 .
• Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. A sejt molekuláris biológiája. - 5. - Garland Science, 2008. - 1392 p. — ISBN 0815341059 .

Linkek

• Sztarokadomszkij, Pjotr. A világ összes RNS-éről, kicsikről és nagyokról egyaránt . // A Biomolecula.ru webhely ( 2010.06.9.). Letöltve: 2018. március 22. (határozatlan)
• Kondratenko, Julia. A mikroRNS-ek csökkentik a génexpressziós zajt . // A Biomolecula.ru webhely ( 2015.06.2.). Letöltve: 2018. március 22. (határozatlan)