Alternatív oxidáz

Az oldal jelenlegi verzióját még nem ellenőrizték tapasztalt közreműködők, és jelentősen eltérhet a 2021. július 13-án felülvizsgált verziótól ; az ellenőrzések 2 szerkesztést igényelnek .
Alternatív oxidáz
Azonosítók
Szimbólum AOX
Pfam PF01786
InterPro IPR002680
OPM szupercsalád 471
OPM fehérje 3w54
Elérhető fehérjeszerkezetek
Pfam szerkezetek
EKT RCSB EKT ; PDBe ; EKTj
EKT-összeg 3D modell

Az alternatív oxidáz (AO) egy olyan enzim , amely alternatív elektrontranszportot biztosít minden magnövény , gomba , valamint algák , egyes protozoonok és számos ülő vagy hozzátartozó állat mitokondriumában [ 1] [2] [3] . Ennek a fehérjének homológjait számos baktérium genomjában találták meg [4] [5] . A bioinformatikai módszerekkel az archaea kivételével minden királyságban sikerült alternatív oxidázt azonosítani [1] .

Az alternatív oxidáz közvetlenül redukálja az O 2 -t H 2 O -vá , oxidálja az ubikinonkészletet , és hőként disszipálja az energiát . Ezzel a mechanizmussal azonban 3 konjugációs pontból legalább 2 elveszik, és potenciálisan protongradiens keletkezése csak az I. komplexen lehetséges a NADH oxidációja során , ami jelentősen csökkenti a végső ATP hozamot [6] .

Felfedezési előzmények

A 19. században a botanikusok leírtak egy jelenséget, amelyet később az aroid növények termogenezisének neveztek : egyes fajok virágzása során a virág hőmérséklete meredeken emelkedett, néha több tíz fokkal meghaladta a környezeti hőmérsékletet. Ez a jelenség különösen szembetűnő olyan növények virágzása során, mint a foltos aronnik ( Arum maculatum ), Symplocarpus foetidus , Sauromatum guttatum [en , philodendron bipinnate ( Philodendron selloum ). Így a liliomvirág Arum italicum hőmérséklete 15 °C-os levegőhőmérséklet mellett elérheti az 51 °C-ot [6] . A jelenség adaptív jelentősége a szagos anyagok elpárolgásának fokozása és a beporzó rovarok vonzása . A jelenség tanulmányozása során kiderült, hogy a hőmérséklet-emelkedés a légzési aktivitás felrobbanásával jár együtt, míg a légzést a cianid és a CO , az állati légzés  klasszikus gátlói nem nyomják el . Így felfedezték a cianid-rezisztens növényi légzést . Ennek a jelenségnek a céltudatos vizsgálata egy alternatív oxidáz és a hozzá kapcsolódó alternatív elektrontranszport -útvonal felfedezéséhez vezetett [7] .

Szerkezet

Egy alternatív oxidáz, az ubikinon oxigénoxidoreduktáz  egyetlen polipeptid , amelynek tömege körülbelül 32 kDa . Szilárdan rögzítve van a mitokondriumok belső membránján a mátrix oldaláról [8] . Szintézisét növényekben az Aox1 nukleáris gén kódolja . A Sauromatum guttatum , a szójabab és az Arabidopsis növények három AO izoformát kódoló maggénnel rendelkeznek, amelyek expressziója a szövet típusától függ [6] .

A reakcióközpontban az enzim két vasatomot tartalmaz , amelyeket négy glutamát , egy aszpartát és aszparagin , valamint két hisztidin köt össze [9] . Az Arabidopsis thaliana -ból származó alternatív AOX1a oxidáz EPR -vizsgálata kimutatta, hogy az enzim valóban tartalmaz egy hidroxo -hidas binukleáris centrumot két vegyes vegyértékű vasatomból (Fe(II)/Fe(III)) [10] . Az oxigénredukció pontos mechanizmusa nem ismert, de feltételezhető, hogy egy kétmagvú vascentrum és legalább egy , a fehérje által alkotott szabad gyököt magában foglaló katalitikus ciklus zajlik le , amely valószínűleg a tirozinmaradékon képződik [11] .

Funkciók

Növények

Az AO élettani szerepe csak az aroidok termogenezisében egyértelmű . Más esetekben az ilyen típusú enzim előnyei a növény számára nem mindig egyértelműek. Az Aox alternatív oxidáz gén expresszióját olyan stressztényezők befolyásolják, mint a hideg, a reaktív oxigénfajták és a kórokozók támadása , valamint olyan tényezők, amelyek csökkentik az elektronok áramlását a citokróm légzési útvonalon ( cianid ) [12] [13] .

Mivel több mint 2500 különböző családba tartozó növényfaj ( kúszó lóhere ( Trifolium repens ), szarvas lótusz ( Lotus corniculatus ), borsó ( Vicia ) sp.) [6] természetes körülmények között halmoz fel cianogén glikozidokat , amelyek bomlása A HCN képződés kíséri , úgy vélik, hogy az AO egy evolúciós módszer a légzés fenntartására, miközben azt cianiddal elnyomják. Egyes patogén gombák és baktériumok viszont cianidot termelnek . Ez azonban nem magyarázza meg, hogy miért van minden növényben AO, és milyen szerepet játszik a sejt normális működésében.

A modern koncepciók szerint az alternatív légzés a szénhidrát- anyagcsere és az elektronikus szállítás sebessége közötti egyensúly fenntartásának módja . Ismeretes, hogy a TCA enzimeket allosztérikusan szabályozzák a NAD H/NAD + és ATP / ADP arányok . A citoplazmatikus NADH és ATP magas szintje esetén a TCA működése blokkolva lesz, ami a kloroplasztiszok aktív munkájával fordulhat elő erős fényviszonyok mellett. Az AO funkciója a NADH gyors oxidációja lehet a légzőláncban . Ennek eredményeként a fék kikerül a TCA-ciklusból , amelynek intermediereit aktívan használják különféle bioszintetikus folyamatokban [6] .

Az AO második fontos funkciója a sejtek oxidatív stresszel szembeni védelme . A mitokondriumok  a szuperoxid és a hidrogén-peroxid képződésének helyei . Ezeknek a veszélyes anyagoknak az intenzív képződését és felhalmozódását elősegíti az elektrontranszport gátlása és a lánc „regenerációja” magas proton gradiens esetén . Az AO a szállítás sebességének növekedéséhez és a lánc "kirakásához" vezet azáltal, hogy elektronokat dob ​​az oxigénre biztonságos víz képződésével. Erős bizonyíték van arra, hogy az alternatív oxidáz zavarja a reaktív oxigénfajták képződését [14] . Így a hidrogén-peroxid egy második hírvivő az Aox1 gén expressziójához és az AO de novo szintéziséhez vezető jelátviteli kaszkádban [6] .

Protozoa

Az alvászavart okozó, véráramban élő protozoon parazita , a Trypanosoma brucei kizárólag alternatív elektrontranszport segítségével lélegzik [15] [16] . A parazita és humán gazdaszervezete közötti metabolizmusban tapasztalható jelentős különbség miatt a T. brucei alternatív oxidáz vonzó célponttá vált a gyógyszerfejlesztésben [17] [18] . Például az egyik ismert alternatív oxidáz inhibitor , az aszkofuranon antibiotikum  gátolja ezt az enzimet a T. brucei -ben , és képes gyógyítani az egerek fertőzését [19] [20] .

Gomba

A gombákban az alternatív légzés képessége segít leküzdeni az elektrontranszport lánc egyes részeinek gátlását, és fontos szerepet játszik a gombák fungicidekkel szembeni rezisztenciájában . Ez egyértelműen látható az azoxistrobin , pikoxistrobin és fluoxastrobin strobilurinokon , amelyek a III-as komplexre hatnak [21] . Mivel azonban az alternatív légzési útvonal kevesebb ATP -t termel , ezek a fungicidek még mindig hatékonyan megakadályozzák a spórák csírázását , ami nagyon energiaigényes folyamat [22] .

Állatok

Sokáig azt hitték, hogy az alternatív oxidáz kizárólag a gombák, növények és protozoonok mitokondriumaiban van jelen. 2004 óta azonban a teljes genom szekvenálási módszereinek köszönhetően számos gerinctelen állat genomjában találtak alternatív oxidáz géneket [2] . Eddig tízféle állatfajban találtak alternatív oxidázt, például szivacsokban , lamellákban , cnidárokban ( korallpolipok és hidroidok ), puhatestűekben ( csigák és kagylók ), annelidákban , fonálférgekben , tüskésbőrűekben , hemihordátumokban és húrokban ( lándzsafélékben és zsákállatokban ). Cianid-rezisztens légzésről is beszámoltak szipunkulidák és kétlábú százlábúak esetében. A Ciona intestinalis zsákállat AO génjét emberi vese sejtkultúrába vitték át. Kimutatták, hogy az alternatív oxidáz a mitokondriumokban expresszálódik és lokalizálódik, és a sejtek rezisztenssé váltak a cianiddal szemben [1] .

Az állati alternatív oxidáz egyedi C-terminális motívummal rendelkezik, amely csak állatokban található meg. Hiányoznak belőle az N-terminális cisztein-maradékok is, amelyek fontosak ennek az enzimnek a szabályozásában a növényekben [1] .

Van egy hipotézis, amely megmagyarázza, hogy a legtöbb gerinces és ízeltlábú miért veszítette el az AO-t, annak ellenére, hogy nyilvánvaló előnyei vannak. A legtöbb faj, amelyben AO-t találtak, nyílt tengeri vagy kapcsolódó organizmus, ami azt jelenti, hogy mitokondriumaikat rendszeresen ki kell téve olyan energiastressznek, amelyet nem tudnak elkerülni, például: fotoszintézis növényekben, toxikus xenobiotikumok mikroorganizmusokban vagy helyi ingadozások tengeri környezet (hőmérséklet, oxigénszint). Ilyen körülmények között az AO segíti az inaktív szervezetek túlélését és megbirkózni a terhelésekkel, de az aktív, gyorsan mozgó szervezetek számára gyakorlatilag használhatatlan, ezért valószínűleg a természetes szelekciós nyomás hiánya miatt veszett el [23] .

rendelet

Az alternatív oxidáz monomer és dimer formában létezhet . A növényi fehérje szerkezetében két ciszteinmaradék található , amelyek oxidációja során diszulfid kötés jön létre , kovalensen összekötve a két monomert. Erős megvilágítás mellett a NADP H pool a mitokondriális NADPH tioredoxin reduktázon keresztül redukálja a tioredoxin fehérjét , amely viszont helyreállítja a diszulfid kötést az AO dimerben. Az AO monomer felszabadulása aktivitásának többszörös növekedésével jár [24] [25] . Az enzimet allosztérikusan a piruvát aktiválja [26] .

A hidroxámsavak sói ( szalicilhidroxámsav ) és az n-propil-gallát [6] az AO specifikus inhibitorainak tekinthetők .

Alternatív oxidáz emlősökben

2013-ban egy olyan genetikailag módosított egérvonal létrehozásáról számoltak be, amely a Ciona intestinalisból származó integrált AO gént tartalmazza . Az enzim különböző intenzitással expresszálódott minden szövetben (legerősebben az agyban és a hasnyálmirigyben ). Egy alternatív oxidáz bevezetése nem okozott semmilyen rendellenességet az egerek fiziológiájában, viselkedésében vagy fejlődésében. Az ehhez a vonalhoz tartozó egerek fokozottan ellenállnak a cianid hatásának, valamint néhány más anyagnak, például az antimicinnek , amelyek blokkolják a légzőkomplexeket . Ezenkívül ezek az egerek csökkent reaktív oxigénfajták képződését mutatták a mitokondriumokban [23] .

Lásd még

Jegyzetek

  1. 1 2 3 4 Allison E. McDonald, Greg C. Vanlerberghe, James F. Staples. Alternatív oxidáz állatokban: egyedi jellemzők és taxonómiai eloszlás  (angol)  // The Journal of Experimental Biology  : folyóirat. — A biológusok társasága, 2009. - 20. évf. 212 . - P. 2627-2634 . - doi : 10.1242/jeb.032151 .
  2. 1 2 McDonald A., Vanlerberghe G. Elágazó mitokondriális elektrontranszport az Animaliában: alternatív oxidáz jelenléte több állati törzsben  //  IUBMB Life: Journal. - 2004. - 20. évf. 56 , sz. 6 . - P. 333-341 . - doi : 10.1080/1521-6540400000876 . — PMID 15370881 .
  3. Sluse FE, Jarmuszkiewicz W. Alternatív oxidáz az elágazó mitokondriális légzőhálózatban: áttekintés a szerkezetről, funkcióról, szabályozásról és szerepről   // Braz . J. Med. Biol. Res. : folyóirat. - 1998. - Vol. 31 , sz. 6 . - P. 733-747 . - doi : 10.1590/S0100-879X1998000600003 . — PMID 9698817 .
  4. McDonald AE, Amirsadeghi S., Vanlerberghe GC A mitokondriális alternatív oxidáz és a plasztid terminális oxidáz prokarióta ortológusai  //  Plant Mol. Biol. : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 53 , sz. 6 . - P. 865-876 . - doi : 10.1023/B:PLAN.0000023669.79465.d2 . — PMID 15082931 .
  5. Atteia A., van Lis R., van Hellemond JJ, Tielens AG, Martin W., Henze K. A prokarióta homológok azonosítása endoszimbiotikus eredetet jelez a mitokondriumok (AOX) és kloroplasztiszok (PTOX  ) alternatív oxidázai számára  // Gene : folyóirat. — Elsevier , 2004. — 20. évf. 330 . - P. 143-148 . - doi : 10.1016/j.gene.2004.01.015 . — PMID 15087133 .
  6. 1 2 3 4 5 6 7 Ermakov, 2005 , p. 252-268.
  7. Moore AL, Siedow JN . A növényi mitokondriumok cianid-rezisztens alternatív oxidázának szabályozása és természete   // Biochim . Biophys. Acta : folyóirat. - 1991. - 1. évf. 1059 , sz. 2 . - P. 121-140 . - doi : 10.1016/S0005-2728(05)80197-5 . — PMID 1883834 .
  8. Berthold DA, Stenmark P. Membránhoz kötött diiron carboxylate proteins  (neopr.)  // Annual review of plant biology. - 2003. - T. 54 . - S. 497-517 . - doi : 10.1146/annurev.arplant.54.031902.134915 . — PMID 14503001 .
  9. Berthold DA, Andersson ME, Nordlund P. Új betekintés az alternatív oxidáz szerkezetébe és működésébe   // Biochim . Biophys. Acta : folyóirat. - 2000. - Vol. 1460 , sz. 2-3 . - P. 241-254 . - doi : 10.1016/S0005-2728(00)00149-3 . — PMID 11106766 .
  10. Berthold DA, Voevodskaya N., Stenmark P., Graslund A., Nordlund P. EPR vizsgálatok a mitokondriális alternatív oxidázról. Bizonyíték egy divas-karboxilát centrumra  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 46 . - P. 43608-43614 . - doi : 10.1074/jbc.M206724200 . — PMID 12215444 .
  11. Affourtit C., Albury MS, Crichton PG, Moore AL . Az alternatív oxidázszabályozás és katalízis molekuláris természetének feltárása  // FEBS Lett  . : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 510 , sz. 3 . - 121-126 . o . - doi : 10.1016/S0014-5793(01)03261-6 . — PMID 11801238 .
  12. Vanlerberghe GC, McIntosh L. Alternative oxidase: From Gene to Function  // Plant Physiology  : Journal  . - American Society of Plant Biologists , 1997. - Vol. 48 . - P. 703-734 . - doi : 10.1146/annurev.arplant.48.1.703 . — PMID 15012279 .
  13. Ito Y., Saisho D., Nakazono M., Tsutsumi N., Hirai A. A rizs tandem-arranged alternatív oxidáz gének  transzkriptumszintjeit növeli az alacsony hőmérséklet //  Gene : folyóirat. - Elsevier , 1997. - Vol. 203 , sz. 2 . - 121-129 . o . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00502-7 . — PMID 9426242 .
  14. Maxwell DP, Wang Y., McIntosh L. Az alternatív oxidáz csökkenti a mitokondriális reaktív oxigéntermelést a növényi sejtekben  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 1999. - 1. évf. 96 , sz. 14 . - P. 8271-8276 . - doi : 10.1073/pnas.96.14.8271 . — PMID 10393984 .
  15. Chaudhuri M., Ott RD, Hill GC Trypanosome alternative oxidase: from molekula to function  // Trends Parasitol  . : folyóirat. - 2006. - 20. évf. 22 , sz. 10 . - P. 484-491 . - doi : 10.1016/j.pt.2006.08.007 . — PMID 16920028 .
  16. Clarkson AB, Bienen EJ, Pollakis G., Grady RW A Trypanosoma brucei brucei parazita véráramformáinak légzése egy növényszerű alternatív oxidáztól függ  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 1989. - 1. évf. 264 , sz. 30 . - P. 17770-17776 . — PMID 2808350 .
  17. Nihei C., Fukai Y., Kita K. Trypanosome alternative oxidase as a target of chemotherapy   // Biochim . Biophys. Acta : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 1587 , sz. 2-3 . - 234-239 . - doi : 10.1016/s0925-4439(02)00086-8 . — PMID 12084465 .
  18. Grady RW, Bienen EJ, Dieck HA, Saric M., Clarkson AB Nn-alkil-3,4-dihidroxibenzamidok, mint a tripanoszóma alternatív oxidáz inhibitorai: aktivitás in vitro és in vivo   // Antimicrob . Agents Chemother. : folyóirat. - 1993. - 1. évf. 37 , sz. 5 . - P. 1082-1085 . - doi : 10.1128/aac.37.5.1082 . — PMID 8517695 .
  19. Minagawa N., Yabu Y., Kita K., Nagai K., Ohta N., Meguro K., Sakajo S., Yoshimoto A. Egy antibiotikum, az aszkofuranon, specifikusan gátolja a légzést és az in vitro növekedést a hosszú karcsú véráram formáiban Trypanosoma brucei brucei  (angol)  // Mol. Biochem. parazita. : folyóirat. - 1997. - 1. évf. 84 , sz. 2 . - 271-280 . - doi : 10.1016/S0166-6851(96)02797-1 . — PMID 9084049 .
  20. Yabu Y., Yoshida A., Suzuki T., Nihei C., Kawai K., Minagawa N., Hosokawa T., Nagai K., Kita K., Ohta N. The efficacy of ascofuranone in a consecutive treatment on Trypanosoma brucei brucei egérben  (angol)  // Parasitol. Int. : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 52 , sz. 2 . - 155-164 . o . - doi : 10.1016/S1383-5769(03)00012-6 . — PMID 12798927 .
  21. Miguez M., Reeve C., Wood PM, Hollomon DW Az alternatív oxidáz csökkenti a Mycosphaerella graminicola QOI gombaölő szerekkel szembeni érzékenységét   // Pest Manag . sci. : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 60 , sz. 1 . - P. 3-7 . - doi : 10.1002/ps.837 . — PMID 14727735 .
  22. Avila-Adame C., Koller W. Alternatív légzés és célhelyi mutációk hatása a Magnaporthe grisea csírázó konídiumainak Qo-inhibiting fungicidekre adott válaszaira   // Pest Manag . sci. : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 59 , sz. 3 . - P. 303-309 . - doi : 10.1002/ps.638 . — PMID 12639047 .
  23. 1 2 Riyad El-Khoury, Eric Dufour, Malgorzata Rak, Nelina Ramanantsoa, ​​​​Nicolas Grandchamp, Csaba Zsolt, Bertrand Duvillié, Paule Bénit, Jorge Gallego, Pierre Gressens, Chamsy Sarkis, Howard T. Rustin Jacobs, Pierre Az alternatív oxidáz expresszió az egérben lehetővé teszi a citokróm c oxidáz blokád megkerülését és korlátozza a mitokondriális ROS túltermelést   // Plos One  : Journal . - 2013. január. - doi : 10.1371/journal.pgen.1003182 .
  24. Gelhaye E. , Rouhier N. , Gerard J. , Jolivet Y. , Gualberto J. , Navrot N. , Ohlsson P.-I. , Wingsle G. , Hirasawa M. , Knaff DB , Wang H. , Dizengremel P. , Meyer Y. , Jacquot J.-P. A tioredoxin h egy specifikus formája a növényi mitokondriumokban fordul elő, és szabályozza az alternatív oxidázt  // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2004. - szeptember 22. ( 101. évf. , 40. szám ). - S. 14545-14550 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.0405282101 .
  25. Ann L. Umbach, Vicki S. Ng, James Siedow. A növényi alternatív oxidáz aktivitás szabályozása: Mese két ciszteinről. (angol)  // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics : folyóirat. - 2006. február . 106 , sz. 2 . - 135-142 . o . - doi : 10.1016/j.bbabio.2005.12.005 .
  26. David A. Day, A. Harvey Millar, Joseph T. Wiskich és James Whelan. Az alternatív oxidázaktivitás szabályozása piruváttal a szójabab mitokondriumában  (angol)  // PlantPhysiol. : folyóirat. - 1994. - 1. évf. 106 . - P. 1421-1427 .

Irodalom

Linkek