Kofaktor F430

Kofaktor F430
Tábornok
Chem. képlet C 42 H 51 N 5 NiO 13 –
Fizikai tulajdonságok
Moláris tömeg 906,58014 g/ mol
Osztályozás
Reg. CAS szám 73145-13-8
PubChem
MOSOLYOK   CC12CC(=O)NC13CC4C(C(C(=N4)CC5C(C6CCC(=O)C(=C7C(C(C(=CC(=N3))C2CCC(=O)O)[N-]7)CC (=O)O)CCC(=O)O)C6=N5)CC(=O)O)(C)CC(=O)N)CCC(=O)O.[Ni]
InChI   InChI=1S/C42H52N6O13.Ni/c1-40(16-30(43)50)22(5-9-33(54)55)27-15-42-41(2,17-31(51)48-42) 23(6-10-34(56)57)26(47-42)13-24-20(11-35(58)59)19(4-8-32(52)53)39(45-24) 37-28(49)7-3-18-21(12-36(60)61)25(46-38(18)37)14-29(40)44-27;/h13,18-23 ,25 ,27H,3-12,14-17H2,1-2H3,(H9,43,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58, 59, 60,61);/p-1/t18-,19-,20-,21-,22+,23+,25+,27-,40-,41-,42-;/m0./s1QFGKGCZCUVIENT-SXMZNAGASA-M, XLFIRMYGVLUNOY-SXMZNAGASA-M
CHEBI 28265
ChemSpider
Az adatok standard körülményeken (25 °C, 100 kPa) alapulnak, hacsak nincs másképp jelezve.
 Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon

Az F 430  a metilkoenzim-M-reduktáz enzim protéziscsoportja . A metanogén Archaeában [1] találták meg . Ez az enzim katalizálja a metán felszabadulását a metanogenezis végső szakaszában : CH 3 -S-CoM + HS-CoB → CH 4 + CoB-SS-CoM

Corfin más tetrapirrolok összefüggésében

A természet különféle tetrapirrolokat  - hemeket , klorofillt és kobalamint használ . Az F 430 a leginkább redukált természetes tetrapirrol - mindössze öt kettős kötést tartalmaz . Ezt a kizárólagos tetrapirrol származékot korfinnak nevezik . A konjugált kötések viszonylagos hiánya miatt inkább sárga, mint a telítetlenebb tetrapirrolok élénk lilásvöröse. Ez az egyetlen tetrapirrol származék, amely nikkelt tartalmaz . A Ni(II) túl kicsi a corphin N4 kötőhelyéhez, ami miatt a makrociklus zsugorodottabb alakot vesz fel.

A metanogenezis javasolt mechanizmusa

Az F 430 aktív forma Ni(I)-t tartalmaz, hasonlóan a Co(I) tartalmú redukált B 12 kofaktorhoz. Figyelembe véve, hogy a Co(I) elektronok d 8 állapotban vannak és ezért demágnesesek, a Ni(I) elektronok d 9 állapotban vannak és paramágnesesek. Az a mechanizmus, amellyel a természet megszakítja a CH3-S kötést a metil-koenzim M-ben, még nem teljesen ismert, bár ismert, hogy a koenzim B és a koenzim M átjuthat a nikkel axiális helyén végződő csatornába. Egy elfogadható mechanizmus magában foglalja az elektrontranszfert a Ni(I)-ből (tehát Ni(II) lesz belőle), és ez az elektrontranszfer elindítja a CH 4 képződését . A metil-CoM gyök és a koenzim HS csoportja kombinációjának eredményeként egy proton (H + ) szabadul fel, amely befog egy elektront, elvonja azt a Ni(II)-től és redukálja a Ni(I)-t [2] .

Az F 430 szerkezetét röntgenkrisztallográfia és magmágneses rezonancia spektrográfia segítségével vizsgálták [3] .

A metán oxigénmentes oxidációja

Az F 430 magas koncentrációban található meg azokban a baktériumokban, amelyek úgy tűnik, hogy részt vesznek a fordított metanogenezisben, amelynek során a metán metil-Com-má alakul. Azokban a szervezetekben, amelyek ezt a csodálatos reakciót végrehajtják, legfeljebb 7% és tömeg nikkelfehérje [4] .

Források

  1. Thauer RK Biochemistry of Methanogenesis: a Tribute to Marjory Stephenson  //  Mikrobiológia : folyóirat. - 1998. - 1. évf. 144. sz . 9 . - P. 2377-2406 . - doi : 10.1099/00221287-144-9-2377 . — PMID 9782487 .
  2. Finazzo C., Harmer J., Bauer C. és mtsai. A koenzim B indukálta az M koenzim koordinációját tiolcsoportján keresztül az F 430 Ni(I)-jéhez az aktív metil-koenzim M reduktázban  (angol)  // J. Am. Chem. szoc. : folyóirat. - 2003. - április ( 125. évf. , 17. sz.). - P. 4988-4989 . - doi : 10.1021/ja0344314 . — PMID 12708843 .
  3. Farber G., Keller W., Kratky C., Jaun B., Pfaltz A., Spinner C., Kobelt A., Eschenmoser A. Coenzyme F 430 from Methanogenic Bacteria: Complete Assignment of Configuration Based on an an X-ray Analysis 12,13-diepi-F430 pentametil-észter és n-NMR spektroszkópia  // Helvetica Chimica  Acta : folyóirat. - 1991. - 1. évf. 74 . - P. 697-716 .
  4. Kruger M., Meyerdierks A., Glockner F.O. et al. Egy szembetűnő nikkelfehérje a mikrobiális szőnyegekben, amelyek anaerob módon oxidálják a metánt  //  Nature : Journal. - 2003. - december ( 426. évf. , 6968. sz.). - P. 878-881 . - doi : 10.1038/nature02207 . — PMID 14685246 .