Koronavírusok
A koronavírusok [2]
( lat. Coronaviridae ) az RNS -t tartalmazó vírusok családja, amely 2020 májusában 45 fajt tartalmaz, két alcsaládba kombinálva [3] [4] . Emlősöket (beleértve az embert), madarakat és kétéltűeket érintik. A név a vírus szerkezetéhez fűződik, melynek tüskeszerű folyamatai a napkoronára emlékeztetnek [2] . Hét olyan koronavírus ismert, amely megfertőzi az embert [5] [6] [7] :
- A HCoV - 229E egy alfakoronavírus , amelyet először az 1960-as évek közepén azonosítottak;
- HCoV-NL63 - alfacoronavírus , a kórokozót 2004-ben azonosították Hollandiában ;
- HCoV -OC43 – bétacoronavirus A, a kórokozót 1967-ben azonosították;
- HCoV-HKU1 – betacoronavirus A, a kórokozót 2005-ben fedezték fel Hongkongban ;
- A SARS-CoV a bétacoronavirus B, a súlyos akut légúti szindróma kórokozója , amelynek első esetét 2002-ben jelentették;
- MERS-CoV - betacoronavirus C, a közel-keleti légúti szindróma kórokozója , amelynek kitörése 2015-ben történt;
- A 2019 második felében azonosított SARS-CoV-2 - betacoronavirus B okozta a COVID-19 világjárványt , amely határzár és rendkívüli biztonsági intézkedések ( karantén , szigorú elkülönítés, maszk viselése stb.) ).
Etimológia
A "koronavírus" név a latin corona szóból származik , ami "koszorút" jelent, ami viszont más görögökből származik. κορώνη korṓnē, "füzér, koszorú" [8] [9] . A nevet Juna Almeida és David Tyrrell találta ki, akik elsőként fedezték fel és tanulmányozták az emberi koronavírusokat [10] . A szót először 1968-ban használta nyomtatott formában virológusok egy informális csoportja a Nature folyóiratban egy új víruscsaládra utalva [11] . Az elnevezés a virionok (a vírus fertőző formája) jellegzetes megjelenésére utal az elektronmikroszkópos vizsgálaton, amelyek felületükön nagy, kiemelkedő kiemelkedések szegélyezik, így napkoronára vagy fényudvarra emlékeztető kép jön létre [11] [10] . Ezt a morfológiát a vírus tüskés peplomerjei hozzák létre, amelyek a vírus felszínén lévő fehérjék [12] .
A Coronavirus tudományos nevet 1971- ben vette át nemzetségnévként a Vírusnómenklatúra Nemzetközi Bizottsága (később a Nemzetközi Vírustaxonómiai Bizottság ) [13] . Az új fajok számának növekedésével a nemzetséget négy nemzetségre osztották fel, nevezetesen Alphacoronavirus , Betacoronavirus , Deltacoronavirus és Gammacoronavirus 2009-ben [14] . A coronavirus köznév az Orthocoronavirinae alcsalád bármely tagjára utal [15] . 2020-tól 45 fajt ismernek el hivatalosan [16] .
Epidemiológia
A koronavírusok emlősök ( emberek , denevérek , macskák , kutyák , sertések , szarvasmarhák ) és madarak megbetegedését okozzák . Néhány ___madarakban-AvCoV( koronavírusokMadárkori :példa TGEV – sertés fertőző gastroenteritisz koronavírus és patotípusa PRCV – sertés légúti koronavírus), kutyák koronavírusa ( CCoV-1 és CCoV-2 /PanCCoV) ), macska koronavírusos macskákban ( FECV – enteritis coronavirus cats, FIPV – macska fertőző peritonitis coronavirus), egerekben egér koronavírus ( MCoV , vírusos hepatitist okoz egerekben, patkányokban RtCoV – patkány koronavírus, PCoV – petrel puffinosis koronavírus) stb., számos koronavírus létezik a különböző denevérfajokban [3] [17] .
A koronavírus fertőzés forrása lehet beteg ember, állat. Lehetséges átviteli mechanizmusok: levegőben, levegőben, székletben-orálisban, érintkezésben. Az előfordulás télen és kora tavasszal nő. Az ARVI szerkezetében a kórházi betegeknél a koronavírus-fertőzés átlagosan 12%. A koronavírusok széles körű elterjedtségét az emberek 80%-ánál kimutatott specifikus antitestek bizonyítják [18] [19] .
A humán koronavírust először 1965-ben izolálta ARVI -s betegekből D. Tyrrel akut rhinitisben szenvedő orrgaratból , majd 1975-ben E. Kaul és S. Clark izolálta a koronavírust a székletből gyermekkori enterocolitisben . Ezt követően a koronavírusok szinte nem keltették fel a kutatók figyelmét, egészen addig, amíg Kínában 2002-2003 -ban a SARS vagy súlyos akut légúti szindróma (SARS, SARS) kitörését nem jegyezték fel . A betegséget a SARS-CoV vírus okozta. Ennek eredményeként a betegség más országokba is átterjedt, összesen 8273-an betegedtek meg, 775-en haltak meg (a halálozási arány 9,6%).
A MERS-CoV vírus a közel-keleti légúti szindróma (MERS) kórokozója, amelynek első eseteit 2012-ben jelentették [20] . 2015- ben Dél-Koreában kitört a közel-keleti légúti szindróma , amelynek során 183 ember betegedett meg és 33-an haltak meg.
2019 decemberében a tüdőgyulladás kitörése kezdődött Kínában , amelyet az újonnan felfedezett SARS-CoV-2 vírus okozott . Hamarosan átterjedt más országokba is.
Szerkezet és életciklus
A genomot egyszálú (+)RNS képviseli. A nukleokapszidot fehérjemembrán és lipotartalmú külső héj veszi körül , amelyből a koronára emlékeztető, bot alakú tüskés nyúlványok nyúlnak ki, erről kapta a család a nevét.
A SARS-CoV-2 a koronán lévő S-proteint használja, hogy a receptorához , az angiotenzin-konvertáló enzim 2- höz (ACE2), valamint a TMPRSS2 szerinproteázhoz [21] kapcsolódjon , akárcsak a SARS-CoV (SARS) vírus. [22] . A sejt beburkolja a vírust a membránjával, és a keletkező membránvezikula a sejt citoplazmájában van. A fent említett két sejtreceptor fehérje úgy alakítja át a vírus S fehérjét, hogy a vírus és a sejtmembránok összeolvadnak [23] .
A sejtbe jutás után a vírus intracelluláris membránok segítségével membránvezikulumokat hoz létre, amelyekhez speciális fehérjekomplexek kapcsolódnak. Ezek a komplexek a vírus genomiális RNS másolatát és rövid mRNS-eket szintetizálnak a vírusfehérjék szintéziséhez [24] .
A vírus RNS-ének van egy 5'-metilezett kezdete és egy 3'- poliadenilált vége. Ez lehetővé teszi a vírus számára, hogy a sejt riboszómái által kezdeményezze az RNS-én lévő fehérjék összeállítását , amely nem képes meghatározni, hogy a vírus RNS-e vagy magának a sejtnek az RNS-e.
A koronavírusok körülbelül 26-30 ezer bázispár RNS-rel rendelkeznek , ami azt jelenti, hogy a koronavírusok rendelkeznek a legnagyobb nem szegmentált RNS-sel az összes ismert vírus közül, vagyis szerkezetükben a legbonyolultabbak az ismert vírusok között. A vírusgenom több mint 20 000 nukleotidból áll, és két replikatív poliproteint, a pp1a-t és a pp1ab-t kódol [25] [26] , amelyekből a következő replikációs/transzlációs lépésben létrejön a vírus RNS másolata, valamint 8 különálló mRNS templát vírusfehérjék, amelyek végtelenül keletkeznek. A vírus membrán lipidburkába belépő M, S, HE és E fehérjék keletkezése a sejt endoplazmatikus retikulumában a megfelelő mRNS - eken történik; az N-fehérjét, amely körülveszi a vírus genomiális RNS-ét, a sejt citoplazmájában lebegő mRNS-en szintetizálódik [24] .
-
A koronavírus sejtreceptorhoz való kapcsolódásának pillanata : a vírus "koronája" S-fehérje és a
receptor összekapcsolódása
-
A koronavírus életciklusa
-
A koronavírus összeszerelésének befejezése a fertőzött sejt citoplazmájában. A vírus RNS-e köré kapszid épül fel
Miután megkapta a vírus genomiális RNS-ét és a szükséges fehérjéket, ez az N-fehérjébe csomagolt RNS megközelíti az endoplazmatikus retikulumon ülő fehérjéket, és kölcsönhatásba lép velük. Ennek eredményeként az endoplazmatikus retikulum membránja a benne lévő vírusfehérjékkel lefedi ezt az RNS-t, és viriont képez [24] . A virionok ezután exocitózissal szabadulnak fel a fertőzött sejtből . A virionok sejtből való felszabadulása után elpusztul.
Taxonómia
A koronavírusok családja ( lat. Coronaviridae ) 2 alcsaládot és körülbelül 46 fajt foglal magában [27] :
A 2018-ban izolált Letovirinae alcsalád csak egy elfogadott fajt, alnemzetséget és nemzetséget tartalmaz (azonban két további fajt azonosítottak, amelyeket még nem hagytak jóvá hivatalosan):
Orthocoronavirinae alcsalád
- Az Alphacoronavirus nemzetség ( Alphacoronavirus ) 14 alnemzetséget és 19 fajt foglal magában:
- Colacovírus
- Denevér koronavírus CDPHE15
- Decacovírus
- Denevér koronavírus HKU10
- Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
- Duvinacovírus
- Luchacovírus
- Lucheng Rn patkány koronavírus
- Minacovírus
- Minunacovírus
- Miniopterus denevér koronavírus 1
- Miniopterus denevér koronavírus HKU8
- Myotacovírus
- Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
- Nyctacovírus
- Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
- Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398
- Pedacovírus
- Sertésjárványos hasmenés vírus
- Scotophilus denevér koronavírus 512
- Rhinacovírus
- Rhinolophus denevér koronavírus HKU2
- Setracovírus
- Soracovírus
- Sorex araneus koronavírus T14
- sunakovírus
- Suncus murinus coronavirus X74
- Tegacovírus
- A Betacoronavirus nemzetség ( Betacoronavirus ) 5 alnemzetséget és 14 fajt foglal magában:
- Embecovírus
- Betacoronavírus 1
- Kína Rattus koronavírus HKU24
- Humán koronavírus HKU1
- Egér koronavírus
- Myodes coronavirus 2JL14
- Hibecovírus
- Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013
- Merbecovírus
- Nobecovírus
- Eidolon denevér koronavírus C704
- Rousettus denevér koronavírus GCCDC1
- Rousettus denevér koronavírus HKU9
- Sarbecovírus
- A Gammacoronavirus nemzetség ( Gammacoronavirus ) 3 alnemzetséget és 6 fajt foglal magában:
- Brandacovírus
- Cegacovírus
- Beluga bálna koronavírus SW1
- Igacovírus
- Madár koronavírus
- Madár koronavírus 9203
- Kacsa koronavírus 2714
- A Deltacoronavirus nemzetség ( Deltacoronavirus ) 3 alnemzetséget és 7 fajt foglal magában:
- Andecovírus
- Buldecovírus
- Bulbul koronavírus HKU11
- Gyakori moorhen coronavirus HKU21
- Koronavírus HKU15
- Munia koronavírus HKU13
- White-eye koronavírus HKU16
- Herdecovírus
- Éjjeli gém koronavírus HKU19
Lásd még
Jegyzetek
- ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján .
- ↑ 1 2 Orvosi mikrobiológiai, virológiai és immunológiai atlasz: Tankönyv orvostanhallgatóknak / szerk. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Orvosi Információs Ügynökség, 2003. - S. 121. - 236 p. — ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ 1 2 Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. A koronavírusok tanulmányozásának története és modern osztályozása (Nidovirales: Coronaviridae) // Fertőzés és immunitás . - 2020. - T. 10 , 2. sz . - S. 221-246 . - doi : 10.15789/2220-7619-H0I-1412 . Archiválva az eredetiből: 2020. június 25. (Orosz)
- ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján . (Hozzáférés: 2019. július 19.)
- ↑ M. Yu. Shchelkanov, LV Kolobukhina, OA Burgasova, IS Kruzhkova, VV Maleev. COVID-19: etiológia, klinikai kép, kezelés // Russian Journal of Infection and Immunity. — 2020-05-06. - T. 10 , sz. 3 . – S. 421–445 . — ISSN 2220-7619 2313-7398, 2220-7619 . - doi : 10.15789/2220-7619-CEC-1473 . Archiválva az eredetiből 2022. április 3-án.
- ↑ Supotnitsky M. V. Az új koronavírus SARS-CoV-2 a koronavírus-fertőzések globális epidemiológiája szempontjából // Bulletin of the RCB Protection Troops. - 2020. - 4. évf . 1 . - S. 32-65 .
- ↑ Az első koronavírusok titkos története Archiválva 2020. április 22-én a Wayback Machine -nél // Forbes.
- ↑ Merriam-Webster, a koronavírus definíciója . Merriam Webster. Letöltve: 2020. március 24. Az eredetiből archiválva : 2020. március 23. (határozatlan)
- ↑ A Corona meghatározása Merriam-Webstertől . Merriam Webster. Letöltve: 2020. március 24. Az eredetiből archiválva : 2020. március 24. (határozatlan)
- ↑ 1 2 Tyrrell, David Arthur John. Cold Wars: Harc a közönséges hideg ellen ] / David Arthur John Tyrrell, Michael Fielder. - Oxford University Press, 2002. - P. 96. - „Megvizsgáltuk alaposabban az új vírusok megjelenését, és észrevettük, hogy egyfajta glóriát vesznek körül. A szótárhoz folyamodva megszületett a latin megfelelője, a corona, és így született meg a coronavirus név." - ISBN 978-0-19-263285-2 . Archiválva : 2020. november 18. a Wayback Machine -nél
- ↑ 1 2 Almeida JD, Berry DM, Cunningham CH, Hamre D, Hofstad MS, Mallucci L, McIntosh K, Tyrrell DA (1968. november). Virológia: koronavírusok. természet . 220 (5168): 650. Bibcode : 1968Natur.220..650. . DOI : 10.1038/220650b0 . A 200 A hosszúságú, lekerekített vagy szirom alakú kiemelkedések jellegzetes "peremén" is találhatók... Ezt a napkoronát idéző megjelenést az egér hepatitis vírusa és több, az emberből nemrégiben kinyert vírus is megosztja, nevezetesen a törzs. B814, 229E és még sok más.
- ↑ Sturman LS, Holmes KV (1983-01-01). Lauffer MA, Maramorosch K, szerk. "A koronavírusok molekuláris biológiája" . Előrelépések a víruskutatásban . 28 , 35-112. DOI : 10.1016/s0065-3527(08)60721-6 . ISBN 9780120398287 . PMC 7131312 . PMID 6362367 . Ezek a vírusok nagy, jellegzetes, szirom alakú peplomerek vagy tüskék jellegzetes szegélyét mutatták, amelyek koronára emlékeztettek, mint a vallási művészetben a corona spinarum ; innen a koronavírusok elnevezés.
- ↑ Lalchhandama, Kholhring (2020). „A koronavírusok krónikái: a hörghurut, a hepatitis és a megfázás”. Tudományos vízió _ ]. 20 (1):43-53. DOI : 10.33493/scivis.20.01.04 .
- ↑ Carstens EB (2010). „Ratifikációs szavazás a Vírusok Taxonómiai Nemzetközi Bizottságához benyújtott taxonómiai javaslatokról (2009)” . Virológiai archívum . 155 (1): 133-46. DOI : 10.1007/s00705-009-0547-x . PMC 7086975 . PMID 19960211 .
- ↑ Fan Y, Zhao K, Shi ZL, Zhou P (2019. március). Denevér koronavírusok Kínában . Vírusok . 11 (3): 210. doi : 10.3390 / v11030210 . PMC 6466186 . PMID 30832341 .
- ↑ A Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV ) . talk.ictvonline.org . Letöltve: 2020. szeptember 14. Az eredetiből archiválva : 2020. március 20.
- ↑ Gilmutdinov R. Ya., Galiullin A. K., Spiridonov G. N. A vadon élő madarak koronavírus-fertőzései // Állatorvos. - 2020. - Kiadás. 6 . - S. 57-67 . - doi : 10.33632/1998-698X.2020-6-57-67 .
- ↑ Pulmonológia: nemzeti irányelv . - M. : GEOTAR-Média, 2009.
- ↑ Shirobokov V.P. Orvosi mikrobiológia, virológia és immunológia . - Vinnitsa: Új könyv, 2015. - S. 504-505.
- ↑ Korotyaev A.I. , Babichev S.A. Orvosi mikrobiológia, immunológia és virológia . - Szentpétervár: SpecLit, 2008.
- ↑ Stasevich, 2020 , p. 11-12.
- ↑ Xintian Xu, Ping Chen, Jingfang Wang, Jiannan Feng, Hui Zhou. Az új koronavírus evolúciója a folyamatban lévő vuhani járványból, és tüskeproteinjének modellezése az emberi átvitel kockázata szempontjából // SCIENCE CHINA Life Sciences. - 2020. - Kt. 63 . — P. 457–460 . - doi : 10.1007/s11427-020-1637-5 . Archiválva az eredetiből 2021. június 28-án.
- ↑ Stasevich, 2020 , p. 10-12.
- ↑ 1 2 3 Stasevich, 2020 , p. 12.
- ↑ Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology (angol) / V. Thiel (szerkesztő). — 1. kiadás. – Caister Academic Press, 2007. - ISBN 978-1-904455-16-5 .
- ↑ Család – Coronaviridae // Vírustaxonómia: A Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottságának kilencedik jelentése / Andrew MQ King, Michael J. Adams, Eric B. Carstens, Elliot J. Lefkowitz (szerk.). - Elsevier Inc., 2012. - P. 806 -828. — ISBN 978-0-12-384684-6 . - doi : 10.1016/B978-0-12-384684-6.00068-9 .
- ↑ Vírus metaadattár: 2020. május 1-i verzió; MSL35 // Nemzetközi Vírustaxonómiai Bizottság (ICTV). - 2020. - május 1.
Irodalom
- Koronavírusok / Gorbalenya A. E. // Kongó – keresztség. - M .: Great Russian Encyclopedia, 2010. - S. 352. - ( Great Russian Encyclopedia : [35 kötetben] / főszerkesztő Yu. S. Osipov ; 2004-2017, 15. v.). - ISBN 978-5-85270-346-0 .
- Stasevich K. A koronavírusok élete és szerkezete // Tudomány és élet . - 2020. - 4. sz . - S. 8-13 . (Orosz)
- Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. A koronavírusok tanulmányozásának története és modern osztályozása (Nidovirales: Coronaviridae) // Fertőzés és immunitás. - 2020. - T. 10. - 2. sz. - S. 221-246. DOI: 10.15789/2220-7619-HOI-1412
- Shchelkanov M. Yu., Kolobukhina L. V., Burgasova O. A., Kruzhkova I. S., Maleev V. V. COVID-19: etiológia, klinika, kezelés // Fertőzés és immunitás. - 2020. - T. 10. - 3. sz. - S. 421-445. DOI: 10.15789/2220-7619-CEC-1473
Linkek
Szótárak és enciklopédiák |
|
---|
Taxonómia |
|
---|
Bibliográfiai katalógusokban |
|
---|
A vírusok osztályozása Baltimore szerint |
---|
DNS | I: vírusok |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae_ | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales_ |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae_ | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae_
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Besorolatlan | Naldaviricetes | |
---|
Besorolatlan |
- család : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae_
- Thaspiviridae
- Nemzetség : Dinodnavírus
- Rhizidiovírus
|
---|
|
---|
|
| II: DNS-vírusok |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales_ |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxiviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Besorolatlan |
|
---|
|
|
|
---|
RNS | | IV: (+) RNS vírusok |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae_
- Betaflexiviridae_
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae_
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolukaviriceták | Tolivirales_ |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae_
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales_ |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales_ |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Besorolatlan |
- Családok : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
TÓL TŐL | |
---|