Colimovírusok

Colimovírusok
tudományos osztályozás
Csoport:Vírusok [1]Birodalom:RiboviriaKirályság:ParanaviraeTípusú:ArtverviricotaOsztály:RevtraviricetesRendelés:OrterviralesCsalád:Colimovírusok
Nemzetközi tudományos név
Caulimoviridae
A Baltimore Csoport
VII: dsDNS-RT-vírusok

A kolimovírusok [2] ( lat.  Caulimoviridae ) DNS-tartalmú növényi vírusok családja, amelyek reverz transzkripciós mechanizmussal és kettős szálú DNS -sel rendelkeznek, vagyis a replikációs ciklusukban reverz transzkripciós szakaszt tartalmazó vírusok.

A virionok szerkezete

A virion egyszerű, lipidburok nélkül. A nukleokapszid morfológiáját 2 fő forma képviseli: rúd alakú és ikozaéder. A nukleokapszid alakja a vírus méretétől függ. A rúd alakú virionok körülbelül 35-50 nm átmérőjűek, és akár 900 nm hosszúak is lehetnek. Az ikozaéderes kapszid 45-50 nm átmérőjű és körülbelül azonos hosszúságú.

A genom szerkezete és replikációja

Ennek a vírusnak a genomja egy szegmentálatlan lineáris vagy ciklikus kettős szálú DNS . A genom mérete körülbelül 6-8 kbs. A vírustól függően a genomnak vagy egy nyitott leolvasási kerete (ORF) lehet, mint a Petuvirus esetében, vagy nyolcnál több, mint a Soymovirus esetében . Ennek a víruscsaládnak a genomja a következő fehérjéket kódolja: reverz transzkriptáz , proteáz , strukturális fehérjék, valamint egyéb, ismeretlen funkciójú, de a vírusreplikációhoz így vagy úgy szükséges fehérjék .

A replikáció mind a citoplazmában, mind a gazdasejt magjában megtörténik. Először a vírusgenom belép a citoplazmába. Ott szupertekercses minikromoszómát képez. Átírja a vírus mRNS - ét , ami redundáns (mivel a genom egyes részein kétszer expresszálódik). Ez az átírt RNS bejut a citoplazmába, ahol két szerepet tölt be. Használható templátként vírusfehérjék transzlációjához, vagy reverz transzkripcióval dsDNS-vé írható vírus reversetas segítségével . Mivel ezek a vírusok sok hasonlóságot mutatnak a retrovírusokkal , gyakran pararetrovírusokként csoportosítják őket. Van azonban egy fontos különbség a retrovírusok és a Caulimoviridae családba tartozó vírusok között . A retrovírusokkal ellentétben nem integrálják genomjukat kromoszómákba , mivel genomjuk nem kódolja az integráz enzimet.

Vannak azonban a Colimovirus család olyan fajai, mint például a Petunia vein clearing virus , amelyek esetenként (főleg stresszes körülmények között) képesek genomjukat a gazdasági genomba integrálni [3] . Az ilyen provírusokat általában endogén pararetrovírusoknak (EPRV) nevezik.

Osztályozás

A Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) szerint 2016 márciusában a család 8 nemzetséget foglal magában [4] :

A Rose yellow vein vírus faj szokatlan genom-szervezettel rendelkezik, ami egyedülálló fajtá teszi [5] .

Jegyzetek

  1. ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok  Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján .
  2. ↑ Pinevics A. V. , Sirotkin A. K. , Gavrilova O. V. , Potekhin A. A. Virológia: tankönyv. - Szentpétervár.  : St. Petersburg University Press, 2012. - P. 275. - ISBN 978-5-288-05328-3 .
  3. ↑ Harper G., Hull R., Lockhart B. és Olszewski N. (2002). Növényi genomba integrált vírusszekvenciák. Annual Review of Phytopathology 40 : 119-136. doi : 10.1146/annurev.phyto.40.120301.105642 . PMID 12147756 .
  4. ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok  Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján . (Hozzáférés: 2017. március 26.) .
  5. ↑ Mollov D., Lockhart B., Zlesak DC, Olszewski N. (2012). A rózsasárga vénás vírus teljes nukleotidszekvenciája, amely a Caulimoviridae család tagja, új genom-szervezettel. Arch Virol .

Linkek