Pseudoviridae
A Pseudoviridae egy víruscsalád [2] , amely három nemzetséget foglal magában [3] .
A család vírusai valójában a Ty1-copia család LTR retrotranszpozonjai . Vírusszerű részecskéknek (VLP) nevezett struktúrák segítségével replikálódnak . A VLP-k nem fertőzőek, mint a normál virionok, de ennek ellenére fontos részét képezik a pszeudovírusok életciklusának [4] .
Taxonómia
A Pseudoviridae-t informálisan az RNS VI reverz transzkripciós vírusok csoportjába sorolják, és gombákat és gerincteleneket fertőznek meg .
A Pseudoviridae nagyon sokféle tagot tartalmaz, és a legtöbb Pseudoviridae ugyanabban a nyitott olvasási keretben kódolja a Gag-et és a Pol-t .
A Pseudoviridae az Ortervirales rendbe tartozik a Belpaoviridae , Metaviridae , Retroviridae és Caulimoviridae családokkal együtt [5] .
A család a következő nemzetségeket foglalja magában: [3]
- hemivírus
- Pszeudovírus
- Sirevírus
A nemzetségbe nem sorolt egyéb Pseudoviridae fajok közé tartoznak:
- Penicillium camemberti vírus – GP1 [6]
- Phaseolus vulgaris Tpv2-6 vírus
Genom
Ennek a víruscsaládnak a genomja egy szegmentálatlan, -RT, pozitív egyszálú RNS, és 4200-9700 nukleotid hosszú . A genom strukturális fehérjéket és nem strukturális fehérjéket kódol , amelyek RNS-függő DNS-polimerázt , replikázt és reverz transzkriptázt kódolnak a replikáció során a reverz transzkripciós lépéshez .
Virológia
A vírus kapszidjának nincs héja, és nagyjából gömb alakúnak tűnik. A kapszid kerek, ikozaéder szimmetriájú, háromszögelési szám (T) = 3 és 4. Ugyancsak izometrikustól kváziizometrikusig terjed, átmérője 30-50 nm. Az LTR retrotranszpozonokat rosszul jellemezték, lipidjeikről nem számoltak be.
A genom beépül a gazda genomjába, és a gazdasejt enzimei , például az eukarióta nukleáris RNS-polimeráz II írják át . A genom replikációja a gazdaszervezet citoplazmájában történik, vagy a sejtmag és az összeállítás a citoplazmában vagy a sejtmagban fordulhat elő.
Jegyzetek
- ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján .
- ↑ Llorens, C (2021. február 2.). „ICTV vírustaxonómiai profil: Pseudoviridae ”. The Journal of General Virology . 102 (3). doi : 10.1099/ jgv.0.001563 . PMID 33528349 .
- ↑ 1 2 ICTV Report Pseudoviridae . (határozatlan)
- ↑ Család: Pseudoviridae | ICTV (angol) . www.ictv.global . Letöltve: 2022. augusztus 19.
- ↑ "Ortervirales: Új vírusrend, amely egyesíti a fordított transzkripciós vírusok öt családját". Virológiai folyóirat . 92 (12). 2018. június. DOI : 10.1128/JVI.00515-18 . PMID29618642 . _
- ↑ NCBI: Penicillium camemberti vírus - GP1 (faj)
Linkek
A vírusok osztályozása Baltimore szerint |
---|
DNS | I: vírusok |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae_ | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales_ |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae_ | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae_
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Besorolatlan | Naldaviricetes | |
---|
Besorolatlan |
- család : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae_
- Thaspiviridae
- Nemzetség : Dinodnavírus
- Rhizidiovírus
|
---|
|
---|
|
| II: DNS-vírusok |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales_ |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxiviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Besorolatlan |
|
---|
|
|
|
---|
RNS | | IV: (+) RNS vírusok |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae_
- Betaflexiviridae_
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae_
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolukaviriceták | Tolivirales_ |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae_
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales_ |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Besorolatlan |
- Családok : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
TÓL TŐL | |
---|
Retrovírusok |
---|
ssRNS-RT-vírusok | Retrovírusok | Alpharetrovírusok |
- Madár eritroleukémia vírus
- Rous szarkóma vírus
- …
|
---|
Betaretrovírusok |
- Jaagsiekte juh retrovírus
- egér emlőtumor vírus
- …
|
---|
Gammaretrovírusok |
- Macska leukémia vírus
- Egér leukémia vírus
- Abelson egér leukémia vírus
- barát vírus
- Xenotrop rágcsáló leukémia vírussal kapcsolatos vírus
- Koala retrovírus
- …
|
---|
Deltaretrovírusok |
- Szarvasmarha leukémia vírus
- Főemlős T-limfotrop vírus 1
- Főemlős T-limfotrop vírus 2
- Főemlős T-limfotrop vírus 3
|
---|
Epszilonretrovírusok |
- Walleye epidermális hiperplázia vírus
- …
|
---|
Lentivírusok |
- Humán immunhiány vírus 1
- Humán immunhiány vírus 2
- Kecske és juh ízületi encephalitis vírusa
- Simian immundeficiency vírus (SIV)
- Ló fertőző vérszegénység vírusa
- Birka Madi-wisna vírus
- Szarvasmarha immunhiány vírus (BIV)
- Macska immunhiány vírus (FIV)
- Jembrana betegség vírus
- puma lentivírus
|
---|
Spumaretrovirinae |
- Bovispumavírus
- Equipumavírus
- Felispumavírus
- Prosimiiispumavírus
- Simiispumavírus
|
---|
|
---|
Egyéb |
|
---|
|
---|
dsDNA-RT-vírusok |
|
---|
Endogén |
- ERVWE1
- HCP5
- Humán teratocarcinoma eredetű vírus
|
---|