Humán koronavírus OC43

Humán koronavírus OC43
tudományos osztályozás
Csoport:Vírusok [1]Birodalom:RiboviriaKirályság:OrthornaviraeTípusú:PisuviricotaOsztály:PisoniviricetesRendelés:NidoviralesAlosztály:CornidovirineaeCsalád:KoronavírusokAlcsalád:KoronavírusokNemzetség:bétakoronavírusAlnemzetség:EmbecovírusKilátás:Betacoronavírus 1Nincs rang:Humán koronavírus OC43
Nemzetközi tudományos név
humán koronavírus OC43
Szinonimák
  • HCoV-OC43
A Baltimore Csoport
IV: (+)ssRNS vírusok

Human coronavirus OC43 [2] ( Eng.  Human coronavirus OC43 ) a koronavírusok családjába tartozó vírus , a Betacoronavirus 1 faj képviselője, emberre és szarvasmarhára fertőző [3] [4] . Burkolt (+) egyszálú RNS vírus , amely az N-acetil-9-O-acetilneuraminsav receptorhoz kötődve jut be a sejtbe [5] . Az Embecovirus alnemzetségbe tartozó többi koronavírushoz hasonlóan rendelkezik egy rövid tüskés fehérjével, az úgynevezett hemagglutinin-észterázzal (HE) [6]. [3] .

Az OC43 egyike annak a hét ismert koronavírusnak, amelyek embert fertőznek, és a SARS -esetek körülbelül 10-15%-áért felelős [7] [8] . A kutatók azt sugallják, hogy az elmúlt évszázadok során mind a négy megfázást okozó koronavírus átterjedt az emberre, és ezzel valószínűleg járványokat okozott az átmenet idején [9] .

Virológia

Négy HCoV-OC43 genotípust (A-tól D-ig) azonosítottak, amelyek közül a D genotípus valószínűleg genetikai rekombináció eredménye . A C és D genotípus két törzsének teljes genom szekvenálása és a bootscan analízis a B és C genotípusok közötti rekombináció jeleit mutatja D genotípus kialakításához. A 29 azonosított törzs közül egyik sem tartozik a régebbi A genotípusba. A tüske és nukleokapszid molekuláris óra módszere hozzárendeli az 1950-es évekre a legközelebbi közös őse az összes genotípusnak, az 1990-es évekre a B genotípusnak, az 1990-es évek végén és a 2000-es évek elején a C genotípusnak. A D genotípusú rekombináns törzseket már 2004-ben fedezték fel [7] .

A HCoV-OC43 összehasonlítása a Betacoronavirus 1 faj legközelebbi törzsével , a szarvasmarha koronavírussal azt mutatta, hogy a 19. század végén volt a legközelebbi közös ősük , számos módszerrel az elválasztást 1890 körülre datálták, ami arra késztette a kutatókat, hogy a az első törzs bejutása az emberi populációba az 1889-1890-es influenzajárványt okozta [10] [9] . A HCoV-OC43 valószínűleg rágcsálóktól származik [11] .

Patogenezis

Az Alphacoronavirus nemzetségbe tartozó HCoV - 229E faj mellett a HCoV-OC43 a közönséges megfázást okozó ismert vírusok közé tartozik . Mindkét vírus súlyos alsó légúti fertőzéseket okozhat, beleértve a tüdőgyulladást csecsemőknél, időseknél és legyengült immunrendszerűeknél, például kemoterápiában részesülőknél és HIV/AIDS -ben szenvedőknél [12] [13] [14] .

Epidemiológia

A koronavírusok világszerte mindenütt jelen vannak, és a megfázások 20-30%-át okozzák [9] (a leggyakoribb megfázást okozó vírus a rinovírus , amely az esetek 30-50%-ában található meg). A fertőzések szezonálisak , a legtöbb eset a téli hónapokban fordul elő [15] [16] [17] .

A vírus rutin jellege sokáig nem keltette fel a kutatók figyelmét: a 229E-hez hasonlóan „árva vírus” volt, amelynek – a SARS -szel és a MERS -szel ellentétben – még csak „bonyolult” neve sem volt. Az 1889-1890-es orosz influenzajárványhoz való kapcsolódásra vonatkozó feltételezések azonban - a genom fenti vizsgálata és az idegrendszeri károsodás tüneteinek hasonlósága alapján - a koronavírus patogenitásának  jelentős és viszonylag gyors gyengülésére utalhatnak . Ha a Covid-19 ugyanazt a pályát követi, idővel újabb megfázás vírussá válik [9] .

Jegyzetek

  1. ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok  Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján .
  2. ↑ Popov N. N., Kolotova T. Yu. A különösen veszélyes feltörekvő vírusfertőzések molekuláris evolúciója A Wayback Machine 2021. december 4-i archív példánya // A Mechnikov Institute évkönyvei. - 2016. - 1. sz. - S. 38-47 [38].
  3. ↑ 1 2 Taxonómia böngésző (Betacoronavirus 1) . www.ncbi.nlm.nih.gov . Letöltve: 2020. február 29. Az eredetiből archiválva : 2020. november 5..
  4. ↑ Lim, Yvonne Xinyi (2016-07-25). „Humán koronavírusok: A vírus-gazdaszervezet interakciók áttekintése.” betegségek . 4 (3):26 . doi : 10.3390/betegségek4030026 . PMID  28933406 . Lásd 1. táblázat.
  5. ↑ Li, Fang (2016. 09. 29.). „A Coronavirus Spike Proteins szerkezete, funkciója és evolúciója.” A virológia éves áttekintése . 3 (1): 237-261. DOI : 10.1146/annurev-virology-110615-042301 . PMID27578435  . _ A BCoV S1-NTD nem ismeri fel a galaktózt, mint a galektineket. Ehelyett felismeri az 5-N-acetil-9-O-acetil-neuraminsavat (Neu5,9Ac2) (30, 43). Ugyanezt a cukorreceptort az OC43 humán koronavírus is felismeri (43, 99). Az OC43 és a BCoV genetikailag szoros rokonságban állnak egymással, és az OC43 a BCoV zoonózisos átterjedésének következménye lehet (100, 101).
  6. ↑ Woo, Patrick CY (2010-08-24). „Koronavírus genomika és bioinformatikai elemzés”. Vírusok . 2 (8): 1804-1820. DOI : 10.3390/v2081803 . PMID21994708  . _ A Betacoronavirus A alcsoportjának minden tagjában egy hemagglutinin-észteráz (HE) gén, amely egy neuraminát O-acetil-észteráz aktivitással rendelkező glikoproteint és az aktív helyet FGDS-t kódol, az ORF1ab-tól lefelé és az S géntől felfelé található (1. ábra).
  7. ↑ 1 2 Lau, Susanna KP (2011). „Az OC43 humán koronavírus molekuláris epidemiológiája feltárja a különböző genotípusok időbeli alakulását, és egy új genotípus közelmúltbeli megjelenését a természetes rekombináció következtében” . Virológiai folyóirat . 85 (21): 11325-11337. DOI : 10.1128/JVI.05512-11 . PMID21849456  . _
  8. ↑ Gaunt, ER (2010). „A négy humán koronavírus, a 229E, a HKU1, az NL63 és az OC43 epidemiológiája és klinikai bemutatása, amelyet 3 év alatt detektáltak egy új, multiplex valós idejű PCR módszerrel . J Clinic Microbiol . 48 (8): 2940-2947. DOI : 10.1128/JCM.00636-10 . PMID20554810  . _
  9. ↑ 1 2 3 4 King A. Egy nem mindennapi megfázás Archivált : 2021. január 7. a Wayback Machine -nél // New Sci. 2020;246(3280):32-35. doi : 10.1016/S0262-4079(20)30862-9
  10. ↑ Vijgen, Leen (2005). „Az OC43 humán koronavírus teljes genomi szekvenciája: A molekuláris óraelemzés egy viszonylag közelmúltbeli zoonotikus koronavírus átviteli eseményt sugall ” Virológiai folyóirat . 79 (3): 1595-1604. DOI : 10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005 . PMID  15650185 .
  11. ↑ Fung, To Sing (2019). „Humán koronavírus: gazda-kórokozó kölcsönhatás”. Mikrobiológiai Éves Szemle . 73 , 529-557. DOI : 10.1146/annurev-micro-020518-115759 . PMID  31226023 .
  12. ↑ Wevers, Brigitte A. (2009). „Nemrég felfedezett emberi koronavírusok”. Laboratóriumi orvosi klinikák . 29 (4): 715-724. DOI : 10.1016/j.cll.2009.07.007 . PMID  19892230 .
  13. ↑ Klinikai mikrobiológiai kézikönyv. - American Society for Microbiology, 2007. - ISBN 978-1-55581-371-0 .
  14. ↑ Pyrc, K. (2007). „Vírusellenes stratégiák a humán koronavírusok ellen”. A fertőző betegségek gyógyszercéljai . 7 (1): 59-66. DOI : 10.2174/187152607780090757 . PMID  17346212 .
  15. ↑ Van Der Hoek, L (2007). "Humán koronavírusok: mit okoznak?" . Vírusellenes terápia . 12 (4 Pt B): 651-658. PMID  17944272 . Archiválva az eredetiből , ekkor: 2022-01-28 . Letöltve: 2020-08-09 . Elavult használt paraméter |deadlink=( súgó )
  16. ↑ Wat, Dennis (2004). „A megfázás: az irodalom áttekintése”. European Journal of Internal Medicine . 15 (2): 79-88. DOI : 10.1016/j.ejim.2004.01.006 . PMID  15172021 .
  17. ↑ Kissler, Stephen M. (2020. április 14.). „A SARS-CoV-2 átviteli dinamikájának előrejelzése a világjárvány utáni időszakban”. Tudomány : eabb5793. doi : 10.1126/science.abb5793 . PMID  32291278 .