TRNS
A transzfer RNS, a tRNS [1] egy ribonukleinsav, amely biztosítja az aminosav , a riboszóma és a hírvivő RNS (mRNS) kölcsönhatását a transzláció során . Tipikus hossza 73-93 nukleotid , mérete pedig körülbelül 5 nm. A tRNS, mivel kovalensen kapcsolódik az aminosavhoz, közvetlenül részt vesz a polipeptidlánc növekedésében , specifikusan kötődik az mRNS kodonhoz , és biztosítja az új peptidkötés kialakításához szükséges komplex konformációját
.
A sejtben minden proteinogén aminosavnak saját tRNS-e van (egy vagy több).
A tRNS szerkezete
A tRNS másodlagos szerkezetét általában négy karral rendelkező lóhereként ábrázolják. A hosszabb tRNS-eknek van egy rövid további ötödik karja, amelyet változó hajtűnek neveznek. A háromdimenziós térben a tRNS-molekula a hélixek koaxiális elhelyezése miatt L-alakú struktúrává gyűrődik, ami lehetővé teszi, hogy a tRNS beilleszkedjen a riboszómák P- és A-helyére [2] . A karok hossza és a tRNS-molekula másodlagos redőjében lévő hurkok átmérője fajonként változik [2] [3] . A tRNS-molekula fő összetevői a következő szerkezetek és funkcionális csoportok:
- 5'-végű foszfátcsoport. A legtöbb tRNS guanilát (fG) maradékot hordoz az 5' végén.
- Akceptor kar akceptor szárral és CCA farokkal. Az akceptor szárat a tRNS molekula két, egymással komplementeren összefüggő terminális része alkotja, 7-9 bázispárból áll. Az akceptor törzs tartalmazhat a kanonikus Watson-Crick bázispároktól eltérő bázispárokat, például egy AG párt. Az akceptor kar 3'-vége valamivel hosszabb, egyszálú régiót alkot, amely egy szabad OH csoportot tartalmazó CCA szekvenciával végződik . Az aminoacil-tRNS szintetáz ehhez a véghez kapcsolja a szállított aminosavat . Az aminoacil-tRNS szintetáz által a tRNS-re feltöltött aminosav kovalensen kapcsolódik az utolsó adenozin 3'-hidroxilcsoportjához. A terminális CCA-szekvencia fontos az enzimek általi tRNS-felismeréshez és a transzlációhoz [2] [4] [5] [6] [7] [8] . Egyes prokariótákban a CCA-szekvencia jelen van a génszekvenciában, azonban az esetek túlnyomó többségében a terminális CCA-szekvencia a tRNS-feldolgozás során kerül hozzáadásra, ezért hiányzik a tRNS-génből [9] .
- A D-kar 4-6 bázispár hosszúságú szárral rendelkezik, amely gyakran dihidrouridint tartalmazó hurokban végződik [2]
- Az antikodon kar 5 bp hosszú szárral rendelkezik, melynek végén egy hurok található antikodonnal [2] .
- A TΨC kar szára 4-5 bp hosszú, és a kar végén lévő hurok jellemzően ribotimidin T és pszeudouridin Ψ [2] .
A D és TΨC karok fontos kölcsönhatásokat biztosítanak a tRNS molekulák feltekeredésében, a TΨC kar pedig részt vesz a riboszóma nagy alegységének rRNS-ével való kölcsönhatásban.
tRNS feldolgozás
A tRNS - eket prokarióták esetében a hagyományos RNS-polimeráz , eukarióták esetében az RNS-polimeráz III szintetizálja . A tRNS gének transzkriptumai többlépcsős feldolgozáson mennek keresztül , ami végül a tRNS-re jellemző térszerkezet kialakulásához vezet . A tRNS feldolgozás 5 kulcslépést foglal magában [10] :
- az 5' vezető nukleotid szekvencia eltávolítása;
- a 3'-terminális szekvencia eltávolítása;
- CCA-szekvencia hozzáadása a 3'-véghez;
- intronok kivágása (eukariótákban és archaeákban );
- az egyes nukleotidok módosításai.
Az érés befejeztével az eukarióta tRNS-eket át kell vinni a citoplazmába , ahol részt vesznek a fehérje bioszintézisében. A tRNS transzportja egy Ran - függő útvonalon megy végbe az exportin t (élesztőben Los1) transzportfaktor részvételével , amely felismeri az érett tRNS jellegzetes másodlagos és harmadlagos szerkezetét: rövid kétszálú szakaszokat és helyesen feldolgozott 5'- és 3'-végek. Ez a mechanizmus biztosítja, hogy csak az érett tRNS-ek kerüljenek ki a sejtmagból. Feltehetően az exportin 5 egy segédfehérje, amely az exportin t-vel együtt képes tRNS-t szállítani a nukleáris pórusokon keresztül [11] .
Lásd még
Jegyzetek
- ↑ A riboszóma híd lehet a precelluláris és a sejtes élet között . Letöltve: 2015. március 1. Az eredetiből archiválva : 2015. március 1.. (határozatlan)
- ↑ 1 2 3 4 5 6 Itoh Y, Sekine S, Suetsugu S, Yokoyama S (2013. július). "A bakteriális szelenocisztein-tRNS harmadlagos szerkezete" . Nukleinsav kutatás . 41 (13): 6729-6738. doi : 10.1093/nar/ gkt321 . PMC 3711452 . PMID 23649835 .
- ↑ Goodenbour JM, Pan T (2006. október 29.). „A tRNS gének sokfélesége eukariótákban” . Nukleinsav kutatás . 34 (21): 6137-6146. doi : 10.1093/nar/ gkl725 . PMC 1693877 . PMID 17088292 .
- ↑ Jahn M, Rogers MJ, Söll D (1991. július). "A tRNS-ben (Gln) található antikodon és akceptor szár nukleotidjai az E. coli glutaminil-tRNS szintetáz fő felismerő elemei." természet . 352 (6332): 258-260. Bibcode : 1991Natur.352..258J . DOI : 10.1038/352258a0 . PMID 1857423 .
- ↑ O.-Ya. L. Beish. Orvosi biológia. - Vitebsk: Urajay, 2000. - S. 22.
- ↑ Ibba M, Soll D (2000. június). "Aminoacil-tRNS szintézis". Biokémia éves áttekintése . 69 (1): 617-650. DOI : 10.1146/annurev.biochem.69.1.617 . PMID 10966471 .
- ↑ Sprinzl M, Cramer F (1979). „A tRNS -CCA vége és szerepe a fehérjebioszintézisben”. A nukleinsavkutatás és a molekuláris biológia fejlődése . 22 , 1-69. DOI : 10.1016/s0079-6603(08)60798-9 . ISBN 978-0-12-540022-0 . PMID 392600 .
- ↑ Green R, Noller HF (1997). Riboszómák és fordítás . Biokémia éves áttekintése . 66 , 679-716. DOI : 10.1146/annurev.biochem.66.1.679 . PMID 9242921 .
- ↑ Aebi M, Kirchner G, Chen JY, Vijayraghavan U, Jacobson A, Martin NC, Abelson J és mások. (1990. szeptember). "Hőmérsékletre érzékeny mutáns izolálása megváltozott tRNS nukleotid nukleotiddal és a tRNS nukleotidil-transzferázt kódoló gén klónozása Saccharomyces cerevisiae élesztőben." The Journal of Biological Chemistry . 265 (27): 16216-16220. DOI : 10.1016/S0021-9258(17)46210-7 . PMID2204621 _ _
- ↑ Hopper AK, Phizicky EM tRNA transfers to the limelight // Genes Dev.. - 2003. - Vol. 17 , no. 2 . - S. 162-180 . - doi : 10.1101/gad.1049103 . — PMID 12533506 . Az eredetiből archiválva : 2017. szeptember 19.
- ↑ Köhler A., Hurt E. RNS exportálása a sejtmagból a citoplazmába // Nat. Fordulat. Mol. Cell Biol .. - 2007. - T. 8 , sz. 10 . - S. 761-773 . - doi : 10.1038/nrm2255 . — PMID 17786152 .
Linkek
Szótárak és enciklopédiák |
|
---|
Bibliográfiai katalógusokban |
|
---|
Fordítás baktériumokban |
---|
|
- Egy oldal
- R-oldal
- E-oldal
- Az mRNS csatornája
- Polipeptid kimeneti csatorna
- GTPase Center
|
|
30S alegység | |
---|
50S alegység | |
---|
Megindítás, inicializálás |
- start kodon
- iniciátor tRNS
- Shine-Dalgarno
- IF-1
- IF-2
- IF-3
- Peptidil-tRNS kiesés
|
|
---|
Megnyúlás |
- Genetikai kód
- EF Tu
- EF-Ts
- EF-G
- LepA(EF4)
- EF-P
- Dekódolás
- Hibrid oldalak
- Peptidil-transzferáz reakció
- Transzlokáció
|
|
---|
Felmondás | |
---|
Újrafeldolgozás | |
---|
Antibiotikumok | |
---|