Dihidrouridin

Dihidrouridin
Tábornok
Szisztematikus
név
1-[( 2R , 3R , 4S , 5R )-3,4-dihidroxi-5-(hidroxi-metil)-oxolan-2-il]-1,3 -diazinán-2,4-dion
Hagyományos nevek 3,4-dihidrouridin
3,4,5,6-tetrahidrouridin
5,6-dihidrouridin
Chem. képlet C9H14N2O6 _ _ _ _ _ _ _
Fizikai tulajdonságok
Moláris tömeg 246,217 g/ mol
Osztályozás
Reg. CAS szám 5627-05-4
PubChem
Reg. EINECS szám 822-987-4
MOSOLYOK   C1CN(C(=O)NC1=O)[CH]2[CH]([CH]([CH](O2)CO)O)O
InChI   InChI=1S/C9H14N2O6/c12-3-4-6(14)7(15)8(17-4)11-2-1-5(13)10-9(11)16/h4,6-8, 12,14-15H,1-3H2,(H,10,13,16)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1ZPTBLXKRQACLCR-XVFCMESISA-N
CHEBI 23774
ChemSpider
Az adatok standard körülményeken (25 °C, 100 kPa) alapulnak, hacsak nincs másképp jelezve.
 Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon

A dihidrouridin (a továbbiakban D , DHU vagy UH 2 ) egy pirimidin , amely két hidrogénatom uridinhez való hozzáadásával keletkezik, és az uridinhez teljesen telített, kettős kötések nélküli vegyületté alakul. A dihidrouridin a tRNS- és rRNS - molekulákban nukleozidként fordul elő ; a megfelelő nitrogénbázist 5,6-dihidrouracilnak nevezik .

Nem síkbeli szerkezete miatt a dihidrouridin megzavarja az RNS-hélixben a halmozott kölcsönhatásokat és destabilizálja azt. Ezenkívül a dihidrouridin stabilizálja a C2'- endo cukorkonformációt, amely mobilabb, mint a C3'- endo konformáció, és ez a hatás a szomszédos 5'-maradékra is kiterjed. Így, míg a pszeudouridin és a 2'-O-metiláció stabilizálja a helyi RNS -struktúrát , a dihidrouridin ennek éppen az ellenkezőjét fejti ki [1] .

Az alacsony hőmérsékleten tenyésző szervezetek ( pszikrofilek ) tRNS -ében megnövekedett 5,6-dihidrouridin-tartalom (40-70%-kal több az átlagosnál), ami biztosítja a tRNS szükséges lokális mobilitását fagyponthoz közeli és alatti hőmérsékleten [2] .

Jegyzetek

  1. Dalluge JJ, Hashizume T., Sopchik AE, McCloskey JA, Davis DR. Konformációs rugalmasság az RNS-ben: a dihidrouridin szerepe   // Nucleic Acids Res : folyóirat. - 1996. - március 15. ( 24. évf. , 6. sz.). - P. 1073-1079 . doi : 10.1093 / nar/24.6.1073 . — PMID 8604341 .
  2. Dalluge JJ, Hamamoto T., Horikoshi K., Morita RY, Stetter KO, McCloskey JA, J Bacteriol. A tRNS poszttranszkripciós módosítása pszichrofil baktériumokban  (angolul)  : folyóirat. - 1997. - március 1. ( 179. évf. , 6. sz.). - P. 1918-1923 . — PMID 9068636 .