Ligázok

Ligáz ( lat.  Ligāre  - keresztkötés, összekapcsolás) - egy enzim , amely katalizálja két molekula kapcsolatát egy új kémiai kötés kialakulásával - ligáció . Ez általában egy kis kémiai csoport eltávolítását ( hidrolízisét ) foglalja magában az egyik molekulából.

A ligázok az EC 6 enzimosztályba tartoznak .

A molekuláris biológiában a 6.5 alosztályba tartozó ligázokat RNS-ligázokra és DNS-ligázokra osztják.

Osztályozás

• Az EC 6.1 olyan ligázokat tartalmaz, amelyek kötéseket hoznak létre oxigén és szén között
• Az EC 6.2 olyan ligázokat tartalmaz, amelyek kötést képeznek a kén és a szén között
• Az EC 6.3 olyan ligázokat tartalmaz, amelyek kötéseket képeznek a nitrogén és a szén között
• Az EC 6.4 olyan ligázokat tartalmaz, amelyek kötéseket képeznek a szén és a szén között
• Az EC 6.5 foszfodiészter kötéseket képző ligázokat tartalmaz
• Az EC 6.6 olyan ligázokat tartalmaz, amelyek kötéseket képeznek a nitrogén és a fémek között

DNS ligázok

A DNS-ligázok  olyan enzimek (EC 6.5.1.1), amelyek katalizálják a DNS - szálak kovalens fúzióját egy duplexben a replikáció , a javítás és a rekombináció során . Foszfodiészter hidakat képeznek a szomszédos dezoxinukleotidok 5'-foszforil- és 3'-hidroxilcsoportjai között DNS-töréseknél vagy két DNS-molekula között. E hidak kialakításához a ligázok az ATP pirofoszforil kötés hidrolízisének energiáját használják fel . Az egyik leggyakoribb kereskedelmi forgalomban kapható enzim a bakteriofág T4 DNS-ligáz .

Emlős DNS ligázok

Az emlősökben a DNS-ligázok három fő típusát osztályozzák.

• A DNS-ligáz I ligálja az Okazaki-fragmenseket a lemaradó DNS-szál replikációja során , és részt vesz a kivágás javításában [1] .
• A DNS ligáz III az XRCC1 fehérjével komplexben részt vesz a kivágás javításában és rekombinációjában.
• A DNS-ligáz IV az XRCC4 -gyel komplexben katalizálja a DNS kettősszál-szakadások végső nem homológ végcsatlakozási (NHEJ) lépését. Szükséges az immunglobulin gének V(D)J rekombinációjához is .

Korábban egy másik típusú ligázt izoláltak - a DNS-ligáz II-t, amelyet később a fehérjeizolálás műtermékeként ismertek fel, nevezetesen a DNS-ligáz III proteolízis termékét [2] .

Jegyzetek

1. ↑ Mortusewicz, O., Rothbauer, U., Cardoso, MC, Leonhardt, H. Differential recruitment of DNA Ligase I and III to DNS javítási helyekre. Nukleinsav-kutatás, 2006; 34(12), 3523-32. PMID 16855289
2. ↑ Tomkinson, AE és Mackey, ZB Emlős DNS-ligázok szerkezete és funkciója. Mutációkutatás/DNS-javítás; 1998; 407. (1), 1-9. PMID 9539976