Toxin-antitoxin rendszer

A toxin-antitoxin rendszer két vagy több,  egymással szorosan összefüggő gén összessége, amelyek együtt kódolnak egy „méreg” fehérjét és a megfelelő „ellenszert”. Ha egy ilyen rendszert egy plazmidon (egy autonóm genetikai elemen) lokalizálunk, akkor a plazmidot tartalmazó eredeti sejt osztódása következtében a leánysejt csak akkor marad életben, ha örökli a plazmidot. Ha a leánysejtből hiányzik a plazmid , akkor az instabil antitoxin a citoplazmából öröklődikanya, elpusztul, és egy stabil toxikus fehérje megöli a sejtet; ezt a jelenséget "post-segregational killing"-nek ( angolul  post-segregational killing, PSK ) nevezték el [2] [3] . A toxin-antitoxin rendszerek széles körben elterjedtek a prokarióták között , és gyakran egy prokarióta szervezet számos másolatot tartalmaz ilyen rendszerekről [4] [5] .

A toxin-antitoxin rendszereket általában aszerint osztályozzák, hogy az antitoxin hogyan semlegesíti a toxint . Az I. típusú toxin-antitoxin rendszerek esetében a toxint kódoló mRNS transzlációját elnyomja egy kis nem kódoló RNS kötődése, amely antitoxinként szolgál. A II-es típusú rendszerek esetében a toxin fehérje poszttranszlációsan gátolt egy másik fehérjéhez, az antitoxinhoz való kötődés révén. A III-as típusú rendszerek egyik példája ismert, amelyekben a toxin fehérje közvetlenül kötődik az antitoxin RNS -hez [6] . A toxin-antitoxint kódoló gének gyakran horizontális géntranszferrel kerülnek át szervezetről szervezetre [7] . Gyakran társulnak patogén baktériumokkal , és gyakran olyan plazmidokon lokalizálódnak, amelyek virulencia és antibiotikum-rezisztencia géneket hordoznak [1] .

Vannak kromoszómális toxin-antitoxin rendszerek is, amelyek egy része olyan sejtfolyamatokban vesz részt, mint a stresszválasz, a sejtciklus leállása és a programozott sejthalál [1] [8] . Az evolúció szempontjából a toxin-antitoxin rendszerek önző DNS -nek tekinthetők , vagyis ezeknek a rendszereknek a célja saját számuk növelése, függetlenül attól, hogy hasznot vagy kárt hoznak-e a gazdaszervezetnek. Adaptív elméleteket javasoltak a toxin-antitoxin rendszerek evolúciójának magyarázatára; például lehetséges, hogy kromoszómális toxin-antitoxin rendszerek fejlődtek ki, hogy megakadályozzák a nagy deléciók öröklődését a gazda genomjában [9] . A toxin-antitoxin rendszerek alkalmazásra találtak a biotechnológiában , például a plazmidok sejtvonalakban való fenntartásának módszerében . Antibiotikumok célpontjaként szolgálhatnak, és vektorként használhatók a pozitív szelekcióhoz [10] .

Evolúciós előnyök

A toxin-antitoxin rendszereket tartalmazó plazmidokat az önző DNS példájának tekintik az evolúció génközpontú nézetében ( eng.  Gene-centered view of evolution ). Úgy gondolják, hogy a toxin-antitoxin rendszerek csak a saját DNS-üket képesek fenntartani, még a gazdaszervezet kárára is [1] . Más elméletek szerint ezek a rendszerek növelik az őket hordozó plazmidok alkalmasságát a hagyományos plazmidokhoz képest [11] . Ebben az esetben a toxin-antitoxin rendszerek segítik a gazda DNS-ét, megszabadítva a sejt utódjait más plazmidoktól (a plazmidon lokalizált toxin-antitoxin rendszer olyan sejtek pusztulásához vezet, amelyek az osztódás során nem örökölték ezt a plazmidot, ezért ha a sejt elpusztul, akkor a benne lévő sejtek plazmidok eliminálódnak). Ezt a nézetet számítógépes szimulációs adatok támogatják [12] . Ez azonban nem magyarázza meg a toxin-antitoxin rendszerek jelenlétét a kromoszómákon .

Számos adaptív elmélet létezik, amelyek megmagyarázzák a kromoszómális toxin-antitoxin rendszerek evolúciós előnyét a természetes szelekcióval szemben . Az ilyen rendszerek kromoszómákon való létezésének legegyszerűbb magyarázata az, hogy megakadályozzák a veszélyes nagy deléciók megjelenését a sejtgenomban [9] . Az Escherichia coli és más baktériumok MazEF toxin-antitoxin lókusza a hosszan tartó éhezésre , különösen az aminosavak hiányára válaszul programozott sejthalált indukál [15] . Az elhalt sejt tartalmát a szomszédos sejtek felszívják, azaz megakadályozhatja az elhalt sejt közeli hozzátartozóinak elhalását, és ezáltal növelheti az sejt kumulatív fittségét . Az altruizmus ezen példája közelebb hozza a baktériumkolóniákat a többsejtű élőlényekhez [12] .

Egy másik elmélet szerint a toxin-antitoxin kromoszómarendszerek bakteriosztatikusak , de nem baktériumölőek [16] . Például a RelE globálisan gátolja a transzlációt tápanyaghiányos körülmények között , és expressziója csökkenti az éhezés kockázatát azáltal, hogy csökkenti a sejt tápanyagszükségletét [17] . A mazF toxin homológja , a mazF-mx szükséges a Myxococcus xanthus termőtesteinek kialakulásához [18] . Ezek a baktériumok sűrű csomókat képeznek, és tápanyaghiány esetén egy 50 000 sejtből álló csoport termőtestté gyűlik össze [19] . A maxF-mx toxin a táplálkozási stresszreakció egyik összetevője, és lehetővé teszi a termőtest egyes sejtjeinek, hogy myxospórákot képezzenek. Feltételezték, hogy a M. xanthus "rabszolgasorba ejtette" a toxin-antitoxin rendszert, és az antitoxint saját molekuláris kontrollja alá vette, hogy szabályozza életciklusát [18] .

Feltételezték, hogy a toxin-antitoxin rendszerek kromoszómális másolatai anti -addikciót biztosíthatnak , azaz segíthetnek a plazmid eltávolításában a sejt utódjaiból anélkül, hogy azt a toxinnak tennék ki. Például az Erwinia chrysanthemi genomja egy antitoxint kódol, amely ellensúlyozza az F-plazmid által kódolt toxint [20] .

A toxin-antitoxin rendszerek kilenc lehetséges funkcióját javasolták [21] :

  1. Sejtes "szemét": A toxin-antitoxin rendszereket plazmidokból kölcsönözték, és a toxinoktól való függőség kialakulása miatt a sejtekben hagyták.
  2. Genomi paraziták ( transzpozonok és bakteriofágok maradványai ) stabilizálása. A toxin-antitoxin rendszerek jelenléte ezeken az elemeken előnyös lehet számukra, mivel csökkenti delécióik lehetőségét. Sok kromoszómális toxin-antitoxin rendszer közelebbről megvizsgálva valóban a genomba beágyazott parazita elemekhez vagy azok maradékaihoz tartozhat.
  3. Önző allélek : A rekombináció során a nem addiktív allélok nem helyettesíthetik az addiktív allélokat, azonban lehetséges az ellenkezője is.
  4. Génszabályozás: Egyes toxinok a génexpresszió általános represszoraiként működnek [22] , míg mások specifikusabbak [23] .
  5. Növekedés szabályozása: a bakteriosztatikus toxinok nem pusztítják el a gazdasejtet, de korlátozzák növekedését [16] .
  6. Rezisztens sejtek : Egyes baktériumpopulációknak van egy olyan alpopulációja , amely több antibiotikummal szemben rezisztens , toxin-antitoxin rendszerekkel szabályozva. Ezek a lassan növekvő szívós sejtek biztosítják a populációt a teljes kihalás ellen [24] .
  7. Programozott sejthalál és közeli rokonainak túlélése, mint a MazEF által közvetített altruizmus fent leírt példájában (lásd fent).
  8. Egy populáció sejtjeinek különböző szintű ellenállása a stresszes körülményekkel szemben, egyes sejtek programozott halálát okozva, ami megakadályozza a teljes populáció kihalását.
  9. Bakteriofágok elleni küzdelem : Ha a bakteriofág megzavarja a sejtfehérjék transzkripcióját és transzlációját, a toxin-antitoxin rendszerek aktiválása korlátozza a fág replikációját [25] [26] .

Egy kísérlet azonban, amelyben öt toxin-antitoxin rendszert távolítottak el E. coli sejtekből , nem szolgáltatott bizonyítékot a toxin-antitoxin rendszerek által a gazdasejtre gyakorolt ​​előnyökre. Ezek az eredmények megkérdőjelezik a növekedésszabályozás és a programozott sejthalál hipotéziseit [27] .

Osztályozás

I. típus

Az I-es típusú toxin-antitoxin rendszerek működése az antitoxin RNS és a toxinfehérjét kódoló mRNS komplementer bázispárosításának köszönhető. Ennek az mRNS-nek a transzlációja vagy az RNáz III általi elpusztítása vagy a Shine-Dalgarno szekvencia vagy a riboszóma kötőhely csökkent elérhetősége miatt elnyomott . Ezekben az esetekben a toxint és az antitoxint gyakran ellentétes DNS-szálak kódolják. E két gén átfedő régiója (általában 19-23 nukleotid hosszú ) határozza meg komplementer párosításukat [28] .

Az I. típusú rendszerekben a toxinokat kisméretű hidrofób fehérjék képviselik, amelyek toxicitása a sejtmembránok elpusztító képességének köszönhető [1] . Csak néhány I. típusú rendszertoxint azonosítottak intracelluláris célpontként, valószínűleg az azokat tartalmazó sejtekre mérgező fehérjék tanulmányozásával kapcsolatos nehézségek miatt [8] .

Néha az I. típusú rendszerek egy harmadik komponenst is tartalmaznak. A jól tanulmányozott hok/sok rendszer esetében a hok toxin és sok antitoxin mellett létezik egy harmadik gén, a mok . Szinte teljes egészében átfedésben van a toxint kódoló génnel, és a toxin transzlációja ennek a harmadik komponensnek a transzlációjától függ [3] . Emiatt a toxin antitoxinhoz való kötődése bizonyos esetekben leegyszerűsítés, és az antitoxin tulajdonképpen egy harmadik RNS-hez kötődik, amely aztán a toxin transzlációjára hat [28] .

Példák rendszerekre
Toxin Antitoxin Megjegyzés Forrás
hok sok Az első ismert és legjobban tanulmányozott I. típusú rendszer, amely számos Gram-negatív baktériumban stabilizálja a plazmidokat [28]
fst RNAII Az Enterococcusban talált Gram-pozitív baktériumban azonosított első I. típusú rendszer [29]
TisB IstR DNS-károsodásra reagál [harminc]
LdrD Rdld Az Enterobacteriaceae -ben található kromoszómarendszer [31]
FlmA FlmB Hok/sok homológ, amely az F-plazmidot is stabilizálja [32]
ibs Sib Eredeti elnevezése QUAD-RNA. Intergenikus régiókban fedezték fel E. coli [33]
TxpA/BrnT RatA Biztosítja a bőrelemek öröklődését a Bacillus subtilis sporulációja során [34]
SymE SymR SOS válasz által indukált kromoszómarendszer [5]
XCV2162 ptaRNA1 A Xanthomonas campestris -ben azonosították, és filogenetikailag heterogén szervezetekben fordul elő . [35]

II típusú

A II. típusú rendszerek jobban tanulmányozhatók, mint az I. típusú rendszerek [28] . Ezekben a rendszerekben az instabil antitoxin fehérje erősen kötődik a stabil toxinhoz, és gátolja annak aktivitását [8] . Az ilyen típusú rendszerek legnagyobb családja a vapBC [36] , és a bioinformatikai módszerek kimutatták, hogy a II-es típusú rendszerek 37-42%-a ebbe a családba tartozik [13] [14] .

A II-es típusú rendszerek általában operonokba szerveződnek , és az antitoxint kódoló gén általában a toxint kódoló gén előtt helyezkedik el. Az antitoxin elnyomja a toxint azáltal, hogy negatívan szabályozza annak expresszióját. A toxin és az antitoxin jellemzően körülbelül 100 aminosav hosszúságú [28] . Egy toxin ártalmassága több tulajdonságnak is köszönhető. A CcdB fehérje például megzavarja a DNS topoizomeráz II és a DNS giráz [37] munkáját , míg a MazF fehérje egy veszélyes endoribonukleáz , amely meghatározott motívumok szerint vágja a sejt mRNS-eit [38] . A leggyakoribb toxinok az endonukleázok, amelyeket interferázoknak is neveznek [39] [40] .

Néha egy harmadik fehérje is megjelenik a II-es típusú toxin-antitoxin rendszerekben [41] . A fent említett MazEF rendszer esetében van egy további szabályozó fehérje, a MazG. Kölcsönhatásba lép az Era E. coli GTPázzal , és nukleozid-trifoszfát-pirofoszfát-hidrolázként jellemzi [42] , amely a nukleozid-trifoszfátokat monofoszfáttá hidrolizálja . További vizsgálatok kimutatták, hogy a MazG ugyanabba a policisztronikus RNS -be íródik át , mint a MazE és a MazF, és a MazG a MazF toxinhoz kötődik, tovább gátolva annak aktivitását [43] .

Példák rendszerekre
Toxin Antitoxin Megjegyzés Forrás
CcdB CcdA Az E. coli F-plazmidjában található [37]
ParE Leopárd Sok példánya van Caulobacter crescentusban ] [44]
MazF Labirintus Az E. coli és más baktériumok kromoszómáján található [25]
yafO yafN A rendszert az E. coli DNS-károsodására adott SOS válasz indukálja [41]
HicA hicb Archaeában és baktériumokban található [45]
kölyök Kis Stabilizálja az R1 plazmidot ; CCdB/A rendszerhez kapcsolódik [16]

III. típus

Toxin ToxN
Azonosítók
Szimbólum ToxN, III-as típusú toxin-antitoxin rendszerek
Pfam PF13958
Elérhető fehérjeszerkezetek
Pfam szerkezetek
EKT RCSB EKT ; PDBe ; EKTj
EKT-összeg 3D modell

A III-as típusú toxin-antitoxin rendszerek a fehérje-toxin és az RNS-antitoxin közvetlen kölcsönhatásán alapulnak. A fehérje toxikus hatásait az RNS közvetlenül semlegesíti [6] . Az egyetlen jelenleg ismert példa a ToxIN rendszer, amely a Pectobacterium carotovorum növénypatogén baktériumban található . A ToxN toxin fehérje körülbelül 170 aminosavból áll, és toxikus az E. colira . Toxicitását a ToxI RNS gátolja , amely 5,5 tandem ismétlődést tartalmaz egy 36 nukleotidból álló motívumból (AGGTGATTTGCTACCTTTAAGTGCAGCTAGAAATTC) [46] [47] . A ToxIN kristályos analízise kimutatta, hogy a ToxN gátlásához egy trimer ToxIN komplex kialakítása szükséges, amelyben három monomer három ToxN monomerhez kötődik . A komplexet többszörös RNS-fehérje kölcsönhatás tartja össze [48] .

Biotech alkalmazások

A toxin-antitoxin rendszerek biotechnológiai alkalmazásait több biotechnológiai cég is elkezdte [10] [16] . A toxin-antitoxin rendszereket főként a plazmidok fenntartására használják nagy baktériumsejtkultúrákban. A hok/sok lókusz hatékonyságát vizsgáló kísérletben kimutatták, hogy a beépített béta-galaktozidázt expresszáló plazmid 8-22-szer stabilabb a sejtosztódás során, mint a toxin-antitoxin rendszertől mentes kontrolltenyészetben [49] [ 49] 50] . A széles körben alkalmazott mikrobiológiai eljárásokban, például a fermentációban , azok a leánysejtek, amelyek nem örököltek plazmidot, nagyobb fittséggel rendelkeznek, mint a plazmidot tartalmazó sejtek, és végül a plazmidokat nem tartalmazó sejtek teljesen kiszoríthatják az értékes ipari mikroorganizmusokat. Így a fontos plazmidok fenntartását segítő toxin-antitoxin rendszerek segítenek fenntartani az ipari folyamatok hatékonyságát [10] .

Ezenkívül a toxin-antitoxin rendszerek az antibiotikumok célpontjaivá válhatnak a jövőben. A kórokozót elpusztító molekulák indukciója segíthet leküzdeni a multidrog rezisztencia növekvő problémáját [51] .

inszertet tartalmazó plazmidok kiválasztása gyakori probléma a DNS klónozásban . Toxin-antitoxin rendszerekkel csak azokat a sejteket lehet pozitívan szelektálni, amelyek a kutató számára érdekes inszerttel rendelkező plazmidot tartalmazzák, míg azokat a sejteket, amelyek nem tartalmazzák a beillesztett gént, el kell dobni. Például a toxint kódoló CcdB gént plazmidvektorokba inszertálják [52] . A kérdéses gén ezután rekombinációba lép a CcdB génnel , inaktiválva a toxikus fehérje transzkripcióját. Ezért azok a transzformált sejtek, amelyek a plazmidot tartalmazzák, de az inszertet nem, a CcdB fehérje toxikus tulajdonságai miatt elpusztulnak , és csak azok a sejtek maradnak életben, amelyekben az inszertet tartalmazó plazmid is található [10] .

CcdB toxin és CcdA antitoxin is használható. A CcdB megtalálható a rekombináns bakteriális genomban, és a CcdA inaktivált változatát egy lineáris plazmidvektorba inszertáljuk. Egy rövid szekvenciát fuzionálnak a kérdéses génnel, amely aktiválja az antitoxin gént, ha beépítik az adott helyre. Ezzel a módszerrel lehetséges egy irányspecifikus géninszert előállítása [52] .

Jegyzetek

  1. ↑ 1 2 3 4 5 Van Melderen L. , Saavedra De Bast M. Bakteriális toxin-antitoxin rendszerek: több mint önző entitás?  (angol)  // PLoS genetika. - 2009. - Vol. 5, sz. 3 . — P. e1000437. - doi : 10.1371/journal.pgen.1000437 . — PMID 19325885 .
  2. ↑ Gerdes K. A toxin-antitoxin modulok szabályozhatják a makromolekulák szintézisét táplálkozási stressz során.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2000. - Vol. 182. sz. 3 . - P. 561-572. — PMID 10633087 .
  3. ↑ 1 2 Faridani OR , Nikravesh A. , Pandey DP , Gerdes K. , Good L. A természetes antiszensz Sok-RNS interakciók kompetitív gátlása aktiválja a Hok által közvetített sejtpusztulást Escherichia coliban.  (angol)  // Nukleinsavak kutatása. - 2006. - Vol. 34, sz. 20 . - P. 5915-5922. doi : 10.1093 / nar/gkl750 . — PMID 17065468 .
  4. ↑ Fozo EM , Makarova KS , Shabalina SA , Yutin N. , Koonin EV , Storz G. I. típusú toxin-antitoxin rendszerek bősége baktériumokban: új jelöltek keresése és új családok felfedezése.  (angol)  // Nukleinsavak kutatása. - 2010. - 20. évf. 38. sz. 11 . - P. 3743-3759. - doi : 10.1093/nar/gkq054 . — PMID 20156992 .
  5. ↑ 1 2 Gerdes K. , Wagner EG RNS antitoxinok.  (angol)  // Jelenlegi vélemény a mikrobiológiában. - 2007. - Vol. 10, sz. 2 . - P. 117-124. - doi : 10.1016/j.mib.2007.03.003 . — PMID 17376733 .
  6. ↑ 1 2 Labrie SJ , Samson JE , Moineau S. Bakteriofág rezisztencia mechanizmusok.  (angol)  // Természetismertetők. mikrobiológia. - 2010. - 20. évf. 8, sz. 5 . - P. 317-327. - doi : 10.1038/nrmicro2315 . — PMID 20348932 .
  7. ↑ Mine N. , Guglielmini J. , Wilbaux M. , Van Melderen L. A kromoszómálisan kódolt ccdO157 toxin-antitoxin rendszer bomlása az Escherichia coli fajokban.  (angol)  // Genetika. - 2009. - Vol. 181. sz. 4 . - P. 1557-1566. - doi : 10.1534/genetika.108.095190 . — PMID 19189956 .
  8. ↑ 1 2 3 Hayes F. Toxinok-antitoxinok: plazmid fenntartás, programozott sejthalál és sejtciklus leállítás.  (angol)  // Tudomány (New York, NY). - 2003. - 1. évf. 301. sz. 5639 . - P. 1496-1499. - doi : 10.1126/tudomány.1088157 . — PMID 12970556 .
  9. ↑ 1 2 Rowe-Magnus DA , Guerout AM , Biskri L. , Bouige P. , Mazel D. Szuperintegronok összehasonlító elemzése: kiterjedt genetikai sokféleség tervezése a Vibrionaceae-ben.  (angol)  // Genomkutatás. - 2003. - 1. évf. 13. sz. 3 . - P. 428-442. - doi : 10.1101/gr.617103 . — PMID 12618374 .
  10. ↑ 1 2 3 4 Stieber D. , Gabant P. , Szpirer C. A szelektív irtás művészete: plazmid toxin/antitoxin rendszerek és technológiai alkalmazásaik.  (angol)  // BioTechniques. - 2008. - Vol. 45, sz. 3 . - P. 344-346. - doi : 10.2144/000112955 . — PMID 18778262 .
  11. ↑ Cooper TF , Heinemann JA A posztszegregációs ölés nem növeli a plazmid stabilitását, hanem a versengő plazmidok kizárását közvetíti.  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2000. - Vol. 97, sz. 23 . - P. 12643-12648. - doi : 10.1073/pnas.220077897 . — PMID 11058151 .
  12. ↑ 1 2 Mochizuki A. , Yahara K. , Kobayashi I. , Iwasa Y. Genetikai függőség: önző gén stratégiája a genom szimbiózisára.  (angol)  // Genetika. - 2006. - Vol. 172. sz. 2 . - P. 1309-1323. - doi : 10.1534/genetika.105.042895 . — PMID 16299387 .
  13. ↑ 1 2 Pandey DP , Gerdes K. A toxin-antitoxin lókuszok nagy mennyiségben fordulnak elő a szabadon élő, de a gazdaszervezethez kapcsolódó prokariótákban.  (angol)  // Nukleinsavak kutatása. - 2005. - 20. évf. 33. sz. 3 . - P. 966-976. - doi : 10.1093/nar/gki201 . — PMID 15718296 .
  14. ↑ 1 2 3 Sevin EW , Barloy-Hubler F. RASTA-Bacteria: web-alapú eszköz toxin-antitoxin lókuszok azonosítására prokariótákban.  (angol)  // Genombiológia. - 2007. - Vol. 8, sz. 8 . - P. 155. - doi : 10.1186/gb-2007-8-8-r155 . — PMID 17678530 .
  15. ↑ Aizenman E. , Engelberg-Kulka H. , Glaser G. Egy Escherichia coli kromoszómális "addikciós modul", amelyet guanozin szabályoz [korrigált 3',5'-biszpirofoszfát: a programozott bakteriális sejthalál modellje.]  (angol)  // Proceedings az Amerikai Egyesült Államok Nemzeti Tudományos Akadémiájának tagja. - 1996. - 1. évf. 93. sz. 12 . - P. 6059-6063. — PMID 8650219 .
  16. ↑ 1 2 3 4 Diago-Navarro E. , Hernandez-Arriaga AM , López-Villarejo J. , Muñoz-Gómez AJ , Kamphuis MB , Boelens R. , Lemonnier M. , Díaz-Orejas R. parD toxin-antitoxin system of plasmid-antitoxin system R1 – alapvető hozzájárulások, biotechnológiai alkalmazások és kapcsolatok a szorosan kapcsolódó toxin-antitoxin rendszerekkel.  (angol)  // A FEBS folyóirat. - 2010. - 20. évf. 277. sz. 15 . - P. 3097-3117. - doi : 10.1111/j.1742-4658.2010.07722.x . — PMID 20569269 .
  17. ↑ Christensen SK , Mikkelsen M. , Pedersen K. , Gerdes K. A RelE, a transláció globális gátlója táplálkozási stressz során aktiválódik.  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2001. - 20. évf. 98, sz. 25 . - P. 14328-14333. - doi : 10.1073/pnas.251327898 . — PMID 11717402 .
  18. ↑ 1 2 Nariya H. , Inouye M. A MazF, egy mRNS-interferáz, programozott sejthalált közvetít a többsejtű Myxococcus fejlődése során.  (angol)  // Cell. - 2008. - Vol. 132. sz. 1 . - P. 55-66. - doi : 10.1016/j.cell.2007.11.044 . — PMID 18191220 .
  19. ↑ Curtis PD , Taylor RG , Welch RD , Shimkets LJ A Myxococcus xanthus térbeli szerveződése a termőtest kialakulása során.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2007. - Vol. 189. sz. 24 . - P. 9126-9130. - doi : 10.1128/JB.01008-07 . — PMID 17921303 .
  20. ↑ Saavedra De Bast M. , Mine N. , Van Melderen L. A kromoszómális toxin-antitoxin rendszerek függőség elleni modulként működhetnek.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2008. - Vol. 190, sz. 13 . - P. 4603-4609. - doi : 10.1128/JB.00357-08 . — PMID 18441063 .
  21. ↑ Magnuson RD A toxin-antitoxin rendszerek hipotetikus funkciói.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2007. - Vol. 189. sz. 17 . - P. 6089-6092. - doi : 10.1128/JB.00958-07 . — PMID 17616596 .
  22. ↑ Engelberg-Kulka H. , Amitai S. , Kolodkin-Gal I. , Hazan R. Bakteriális programozott sejthalál és többsejtű viselkedés baktériumokban.  (angol)  // PLoS genetika. - 2006. - Vol. 2, sz. 10 . — P. e135. - doi : 10.1371/journal.pgen.0020135 . — PMID 17069462 .
  23. ↑ Pimentel B. , Madine MA , de la Cueva-Méndez G. Kid specifikus mRNS-eket hasít az UUACU helyeken, hogy megmentse az R1 plazmid kópiaszámát.  (angol)  // Az EMBO folyóirat. - 2005. - 20. évf. 24, sz. 19 . - P. 3459-3469. - doi : 10.1038/sj.emboj.7600815 . — PMID 16163387 .
  24. ↑ Kussell E. , Kishony R. , Balaban NQ , Leibler S. Bakteriális perzisztencia: a túlélés modellje változó környezetben.  (angol)  // Genetika. - 2005. - 20. évf. 169. sz. 4 . - P. 1807-1814. - doi : 10.1534/genetika.104.035352 . — PMID 15687275 .
  25. ↑ 1 2 Hazan R. , Engelberg-Kulka H. Escherichia coli mazEF által közvetített sejthalál, mint védekezési mechanizmus, amely gátolja a P1 fág terjedését.  (angol)  // Molekuláris genetika és genomika : MGG. - 2004. - 20. évf. 272. sz. 2 . - P. 227-234. - doi : 10.1007/s00438-004-1048-y . — PMID 15316771 .
  26. ↑ Pecota DC , Wood TK A T4 fág kizárása a hok/sok killer lókusz által az R1 plazmidból.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 1996. - 1. évf. 178. sz. 7 . - P. 2044-2050. — PMID 8606182 .
  27. ↑ Tsilibaris V. , Maenhaut-Michel G. , Mine N. , Van Melderen L. Milyen előnyökkel jár az Escherichia coli számára, ha több toxin-antitoxin rendszer van a genomjában?  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2007. - Vol. 189. sz. 17 . - P. 6101-6108. - doi : 10.1128/JB.00527-07 . — PMID 17513477 .
  28. ↑ 1 2 3 4 5 Fozo EM , Hemm MR , Storz G. Kis toxikus fehérjék és az ezeket elnyomó antiszensz RNS-ek.  (angol)  // Mikrobiológiai és molekuláris biológiai áttekintések : MMBR. - 2008. - Vol. 72. sz. 4 . - P. 579-589. - doi : 10.1128/MMBR.00025-08 . — PMID 19052321 .
  29. ↑ Greenfield TJ , Ehli E. , Kirshenmann T. , Franch T. , Gerdes K. , Weaver KE A pAD1 par locusának antiszensz RNS-e szokatlan mechanizmussal szabályozza egy 33 aminosavból álló toxikus peptid expresszióját.  (angol)  // Molekuláris mikrobiológia. - 2000. - Vol. 37. sz. 3 . - P. 652-660. — PMID 10931358 .
  30. ↑ Vogel J. , Argaman L. , Wagner EG , Altuvia S. A kis RNS IstR gátolja egy SOS-indukált toxikus peptid szintézisét.  (angol)  // Jelenlegi biológia : CB. - 2004. - 20. évf. 14. sz. 24 . - P. 2271-2276. - doi : 10.1016/j.cub.2004.12.003 . — PMID 15620655 .
  31. ↑ Kawano M. , Oshima T. , Kasai H. , Mori H. 35 aminosavból álló sejtpusztító peptidet és cisz-kódolt kis antiszensz RNS-t kódoló stabil mRNS-t expresszáló long direct repeat (LDR) szekvenciák molekuláris jellemzése Escherichia coliban.  (angol)  // Molekuláris mikrobiológia. - 2002. - 20. évf. 45, sz. 2 . - P. 333-349. — PMID 12123448 .
  32. ↑ Loh SM , Cram DS , Skurray RA Az F-plazmid fenntartásában szerepet játszó harmadik funkció (Flm) nukleotidszekvenciája és transzkripciós elemzése.  (angol)  // Gene. - 1988. - 1. évf. 66. sz. 2 . - P. 259-268. — PMID 3049248 .
  33. ↑ Fozo EM , Kawano M. , Fontaine F. , Kaya Y. , Mendieta KS , Jones KL , Ocampo A. , Rudd KE , Storz G. Kis toxicitású fehérjeszintézis visszaszorítása a Sib és OhsC kis RNS-ek által.  (angol)  // Molekuláris mikrobiológia. - 2008. - Vol. 70, sz. 5 . - P. 1076-1093. - doi : 10.1111/j.1365-2958.2008.06394.x . — PMID 18710431 .
  34. ↑ Silvaggi JM , Perkins JB , Losick R. Kis, nem lefordított RNS antitoxin a Bacillus subtilisben.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2005. - 20. évf. 187. sz. 19 . - P. 6641-6650. - doi : 10.1128/JB.187.19.6641-6650.2005 . — PMID 16166525 .
  35. ↑ Findeiss S. , Schmidtke C. , Stadler PF , Bonas U. Plazmid-transzferált anti-szensz ncRNS-ek új családja.  (angol)  // RNS biológia. - 2010. - 20. évf. 7, sz. 2 . - P. 120-124. — PMID 20220307 .
  36. ↑ Robson J. , McKenzie JL , Cursons R. , Cook GM , Arcus VL A Mycobacterium smegmatis vapBC operonja egy autoregulált toxin-antitoxin modul, amely a transzláció gátlásán keresztül szabályozza a növekedést.  (angol)  // Journal of Molecular Biology. - 2009. - Vol. 390, sz. 3 . - P. 353-367. - doi : 10.1016/j.jmb.2009.05.006 . — PMID 19445953 .
  37. ↑ 1 2 Bernard P. , Couturier M. Az F plazmid CcdB fehérje általi sejtölés magában foglalja a DNS-topoizomeráz II komplexek mérgezését.  (angol)  // Journal of Molecular Biology. - 1992. - 1. évf. 226. sz. 3 . - P. 735-745. — PMID 1324324 .
  38. ↑ Zhang Y. , Zhang J. , Hoeflich KP , Ikura M. , Qing G. , Inouye M. A MazF specifikusan ACA-nál hasítja a celluláris mRNS-eket, hogy blokkolja a fehérjeszintézist Escherichia coliban.  (angol)  // Molekuláris sejt. - 2003. - 1. évf. 12, sz. 4 . - P. 913-923. — PMID 14580342 .
  39. ↑ Christensen-Dalsgaard M. , Overgaard M. , Winther KS , Gerdes K. RNS decay by messenger RNA interferasees.  (angol)  // Enzimológiai módszerek. - 2008. - Vol. 447.-P. 521-535. - doi : 10.1016/S0076-6879(08)02225-8 . — PMID 19161859 .
  40. ↑ Yamaguchi Y. , Inouye M. mRNS interferázok, szekvencia-specifikus endoribonukleázok a toxin-antitoxin rendszerből.  (angol)  // Haladás a molekuláris biológiában és a transzlációs tudományban. - 2009. - Vol. 85. - P. 467-500. - doi : 10.1016/S0079-6603(08)00812-X . — PMID 19215780 .
  41. ↑ 1 2 Singletary LA , Gibson JL , Tanner EJ , McKenzie GJ , Lee PL , Gonzalez C. , Rosenberg SM Egy SOS-szabályozott 2-es típusú toxin-antitoxin rendszer.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2009. - Vol. 191. sz. 24 . - P. 7456-7465. - doi : 10.1128/JB.00963-09 . — PMID 19837801 .
  42. ↑ Zhang J. , Inouye M. A MazG, egy nukleozid-trifoszfát-pirofoszfohidroláz, kölcsönhatásba lép az Era-val, amely az Escherichia coli esszenciális GTPáza.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2002. - 20. évf. 184. sz. 19 . - P. 5323-5329. — PMID 12218018 .
  43. ↑ Gross M. , Marianovsky I. , Glaser G. MazG – a programozott sejthalál szabályozója Escherichia coliban.  (angol)  // Molekuláris mikrobiológia. - 2006. - Vol. 59. sz. 2 . - P. 590-601. - doi : 10.1111/j.1365-2958.2005.04956.x . — PMID 16390452 .
  44. ↑ Fiebig A. , Castro Rojas CM , Siegal-Gaskins D. , Crosson S. Interaction specificity, toxicity and Regulation of a paralogous set of ParE/RelE-family toxin-antitoxin systems.  (angol)  // Molekuláris mikrobiológia. - 2010. - 20. évf. 77. sz. 1 . - P. 236-251. - doi : 10.1111/j.1365-2958.2010.07207.x . — PMID 20487277 .
  45. ↑ Jørgensen MG , Pandey DP , Jaskolska M. , Gerdes K. Az Escherichia coli HicA transzlációtól független mRNS-interferázok új családját határozza meg baktériumokban és archaeákban.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2009. - Vol. 191. sz. 4 . - P. 1191-1199. - doi : 10.1128/JB.01013-08 . — PMID 19060138 .
  46. ↑ Fineran PC , Blower TR , Foulds IJ , Humphreys DP , Lilley KS , Salmond GP A fág abortív fertőzési rendszer, a ToxIN, fehérje-RNS toxin-antitoxin párként működik.  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2009. - Vol. 106. sz. 3 . - P. 894-899. - doi : 10.1073/pnas.0808832106 . — PMID 19124776 .
  47. ↑ Blower TR , Fineran PC , Johnson MJ , Toth IK , Humphreys DP , Salmond GP Az Erwinia toxIN abortív fertőzésének és toxin-antitoxin lókuszának RNS- és fehérjekomponenseinek mutagenezise és funkcionális jellemzése.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2009. - Vol. 191. sz. 19 . - P. 6029-6039. - doi : 10.1128/JB.00720-09 . — PMID 19633081 .
  48. ↑ Blower TR , Pei XY , Short FL , Fineran PC , Humphreys DP , Luisi BF , Salmond GP A feldolgozott nem kódoló RNS egy altruista bakteriális antivirális rendszert szabályoz.  (angol)  // Természeti strukturális és molekuláris biológia. - 2011. - 20. évf. 18, sz. 2 . - P. 185-190. - doi : 10.1038/nsmb.1981 . — PMID 21240270 .
  49. ↑ Wu K. , Jahng D. , Wood TK A hőmérséklet és a növekedési sebesség hatásai a hok/sok killer lókuszra a fokozott plazmid stabilitás érdekében.  (angol)  // Biotechnológia fejlődése. - 1994. - 1. évf. 10, sz. 6 . - P. 621-629. - doi : 10.1021/bp00030a600 . — PMID 7765697 .
  50. ↑ Pecota DC , Kim CS , Wu K. , Gerdes K. , Wood TK A hok/sok, parDE és pnd posztszegregációs gyilkos lókuszok kombinálása a plazmid stabilitásának fokozására.  (angol)  // Alkalmazott és környezeti mikrobiológia. - 1997. - 1. évf. 63. sz. 5 . - P. 1917-1924. — PMID 9143123 .
  51. ↑ Gerdes K. , Christensen SK , Løbner-Olesen A. Prokarióta toxin-antitoxin stresszválasz lókuszok.  (angol)  // Természetismertetők. mikrobiológia. - 2005. - 20. évf. 3, sz. 5 . - P. 371-382. - doi : 10.1038/nrmicro1147 . — PMID 15864262 .
  52. ↑ 1 2 Bernard P. , Gabant P. , Bahassi EM , Couturier M. Pozitív szelekciós vektorok az F plazmid ccdB killer gén használatával.  (angol)  // Gene. - 1994. - 1. évf. 148. sz. 1 . - P. 71-74. — PMID 7926841 .

Irodalom

Linkek