RNS interferencia

Az RNS interferencia ( eng.  RNA interferencia, RNAi ) a génexpresszió elnyomásának folyamata az mRNS transzkripciója , transzlációja , deadenilációja vagy lebontása szakaszában kis RNS-molekulák segítségével.

RNS interferencia folyamatokat számos eukarióta sejtjében találtak : állatokban , növényekben és gombákban . Az RNS interferencia rendszer fontos szerepet játszik a sejtek vírusokkal , parazita génekkel  ( transzpozonokkal ) szembeni védelmében, valamint a szervezet génjeinek fejlődésének , differenciálódásának és expressziójának szabályozásában .

Az RNS-interferencia folyamata a Dicer enzim működésével kezdődik , amely a hosszú kettős szálú RNS-molekulákat (dsRNS) 21-25 nukleotidból álló, siRNS - nek nevezett rövid fragmentumokra vágja . Mindegyik fragmens két szála közül az egyiket "irányítónak" nevezik, ez az egyszálú RNS tovább szerepel a RISC RNS-protein komplexben . A RISC aktivitás eredményeként egy egyszálú RNS-fragmens az mRNS-molekula komplementer szekvenciájához kötődik, és az Argonaute -fehérje az mRNS-t elvágja, vagy a transzlációt és/vagy az mRNS deadenilációt gátolja . Ezek az események a megfelelő gén expressziójának elnyomásához (csendesítéséhez) vezetnek, amelynek hatékonyságát a kis RNS-molekulák - siRNS és mikroRNS - koncentrációja korlátozza .

Az RNS-interferencia génexpresszióra gyakorolt ​​szelektív hatása az RNSi-t hasznos eszközzé teszi a sejtkultúrák és élő szervezetek felhasználásával végzett vizsgálatokban, mivel a sejtekbe bejuttatva szintetikus kettős szálú RNS-ek specifikus gének elnyomását okozzák. Az RNAi-t a molekuláris biológia , a biokémia , a biotechnológia és az orvostudomány nagyszabású kutatására használják . Például az RNS-interferenciát arra használják, hogy szisztematikusan „kikapcsolják” a géneket a sejtekben, és meghatározzák a gének funkcióit a sejtosztódás tanulmányozása során .

Történelmileg az RNS-interferenciát poszt-transzkripciós géncsendesítésként ismerték . Egészen addig, amíg ezeket az állítólagosan nem kapcsolódó folyamatokat megvizsgálták, világossá vált, hogy mindegyik az RNSi megnyilvánulásait írja le. 2006- ban Andrew Fire és Craig Mello amerikai tudósok fiziológiai és orvosi Nobel-díjat kaptak a Caenorhabditis elegans [1] fonálféreg RNS-interferenciájának vizsgálatával kapcsolatos , 1998 -ban publikált munkájukért [2] .

Történelem

Mielőtt felfedezték volna az RNS-interferenciát növényekben, leírták az antiszensz RNS -ek transzkripciós gátlását [4] . 1990 -ben a petúnia ( Petunia hybrida ) virágainak színének megváltoztatása érdekében a rózsaszín és lila pigmentek szintéziséhez szükséges enzim, a kalkon-szintáz gén további másolatait juttatták a növényekbe. A szintáz gén fokozott expressziója azonban nem eredményezte a perianth sötétebb színét , éppen ellenkezőleg, a virágok világosabbak, sőt részben fehérek lettek. A kapott eredmények azt mutatták, hogy az enzim aktivitása nem nőtt, hanem csökkent. A kalkon szintáz gének alacsonyabb szinten expresszálódnak, mint a transzgén bevezetése előtt . [5] [6] Nem sokkal később leírták a "géncsendesítést" a Neurospora crassa gombában , de ezt a folyamatot nem hozták összefüggésbe a növényeknél leírt folyamatokkal [7] . További vizsgálatok kimutatták, hogy a növényekben az mRNS lebomlása a génaktivitás csökkenéséhez vezet a poszttranszkripciós gátlás mechanizmusán keresztül [8] . Ezt a jelenséget "génexpresszió koszuppressziójának" nevezték, azonban ennek a folyamatnak a mechanizmusa nem volt ismert [9] .

Hasonló váratlan hatást írtak le a növények vírusokkal szembeni rezisztenciájának növelésére tett kísérlet során . Köztudott, hogy a vírusfehérjéket expresszáló növények fokozott rezisztenciát mutatnak a vírusfertőzéssel szemben, de további vizsgálatok kimutatták, hogy más vírusok fertőzésével szembeni rezisztenciát csak a nem kódoló vírus RNS rövid szakaszai biztosítják. A kutatók azt is hitték, hogy a transzgenikus vírus RNS-ek gátolhatják a vírus replikációját is [10] . Egy fordított kísérlet, amelyben a növényi gének rövid szekvenciáit vitték be a vírus genomjába , azt mutatta, hogy a célgének elnyomták a fertőzött növényeket. Ezt a jelenséget " vírus-indukált géncsendesítésnek, VIGS- nek " nevezték, az ilyen jelenségek kombinációját pedig poszt-transzkripciós géncsendesítésnek ( eng  . post transcriptional gene silenceing ) [11] .  

A növényeken végzett megfigyelések után világszerte számos laboratórium próbált hasonló jelenséget kimutatni más szervezetekben is [12] [13] . Craig Mello és Andrew Fire egy 1998 -as Nature tanulmányban leírták a géncsendesítés hatását, miután kétszálú RNS-t juttattak be a Caenorhabditis elegans orsóféreg testébe [2] . Az izomfehérje szintézis szabályozására vonatkozó tanulmányokban Mello és Fire kimutatta, hogy az mRNS vagy az antiszensz RNS-ek beadása nem befolyásolta a fehérjeszintézist , míg a kettős szálú RNS-ek beadása sikeresen csökkentette a célgén expresszióját. E munkák eredményeként megszületett az RNS interferencia kifejezés . Fire és Mello tanulmányai abból a szempontból figyelemre méltóak, hogy munkájuk során feltárult a poszt-transzkripciós géncsendesítés rendszerének aktív elve. 2006- ban Fire and Mello megkapta az élettani és orvosi Nobel-díjat az RNS-interferencia területén végzett kutatásaiért [1] .

Összetevők

Az RNS interferenciarendszer ribonukleinsav komponense kétféle endogén és exogén rövid kettős szálú oligonukleotidokkal – mikroRNS -sel és kis interferáló RNS -sel ( siRNS ) – képviselhető . 

Kis interferáló RNS-ek

A kis interferáló RNS-ek 21-25 nukleotid hosszúságú, kétszálú RNS-ek, amelyeknek a 3'-végein két párosítatlan túlnyúló nukleotid található. Mindegyik nukleotidláncnak van egy foszfátcsoportja az 5' végén és egy hidroxilcsoport a 3' végén. Ezt az siRNS-struktúrát a Dicer enzim aktivitása alakítja ki , amelynek szubsztrátja hosszú, kétszálú RNS-ek vagy rövid hajtűt tartalmazó RNS-ek . [14] A kis interferáló RNS-ek duplexei ezután belépnek a RISC katalitikus komplexbe , ahol az Argonaute fehérje részvételével a duplex felcsavarodik, és rövid antiszensz RNS-ből egy komplementer komplex jön létre az mRNS kódoló régiójában meghatározott szekvenciával. ami az utóbbi további degradációjához vezet. A miRNS-ekkel ellentétben a kis interferáló RNS-ek általában pontosan párosulnak a célponttal, és egyetlen specifikus mRNS endonukleolitikus hasításához vezetnek [15].

microRNS

A mikroRNS -ek ( eng.  MicroRNA, miRNS ) 21-22 nukleotid hosszúságú, nem kódoló RNS-ek , amelyek a génexpresszió szabályozásában vesznek részt . A mikroRNS-ek specifikus mRNS -szekvenciákhoz kötődnek a 3'-nem transzlálódó régióban, és vagy transzlációs gátlást, vagy poli(A) farok deléciót okoznak . A mikroRNS-molekulák a mikroRNS-prekurzorokat ( pri -miRNS, primordiális miRNS ) kódoló hosszú gének elsődleges transzkriptumaiként fejeződnek ki , és a sejtmagban történő feldolgozás után körülbelül 70 nukleotid hosszúságú pre-miRNS-szár-hurok struktúrák . A pri-miRNS-t pre-miRNS feldolgozó komplexum egy Drosha nevű RNáz III enzimet és egy kettős szálú RNS-kötő fehérjét, a Pasha -t tartalmaz . A pre-miRNS kettős szálú részét a Dicer fehérje köti meg és vágja el (a Drosophila melanogasterben a miRNS-eket és a kis interferáló RNS-eket a Dicer enzim különböző izoformái dolgozzák fel [16] ); ilyenkor érett mikroRNS-molekula keletkezik, amely azután bejuthat a RISC -be [17] [18] [19] . A miRNS-képződéshez a Dicertől független útvonal is létezik. A mikroRNS prekurzor feldolgozását ebben az esetben az Argonaute 2 fehérje végzi [20] [21] .  

Állatokban a miRNS-ek jellemzően nem illeszkednek a cél-mRNS-hez, és sok hasonló szekvenciájú mRNS transzlációját gátolhatják. A növényekben a párzás sok esetben teljes lehet.

RISC

A RISC ( RNS - induced silenceing complex ) katalitikus része az Argonaute családba tartozó endonukleáz fehérjék , amelyek a kapcsolódó kis interferáló RNS -sel komplementer mRNS -t hasítanak [1] . Mivel a Dicer fehérjével történő vágás után keletkező fragmensek kétszálúak, potenciálisan mindegyik szál egy kis interferáló RNS ( eng. siRNA ) lehet. Azonban a két szál közül csak az egyik, az úgynevezett vezető szál , kötődik az Argonaute fehérjéhez, és elnyomja a génexpressziót . Egy másik szál, az utasszál , az anti-guide szál , degradáción megy keresztül a RISC aktiválása során [22] . Bár korábban azt hitték, hogy a láncokat egy ATP - függő helikáz választja el [23] , mostanra kimutatták, hogy ez a folyamat ATP-független, és közvetlenül a RISC-t alkotó fehérjék hajtják végre [24] [25 ] ] . A vezetőszál megválasztása független attól, hogy Dicer milyen irányban vágja el a kétszálú RNS-t a RISC-be való belépés előtt [26] [27] . Az R2D2 fehérje olyan faktor lehet, amely megkülönbözteti a társlánc stabilabb 5'-végét a kötődés során [28] .     

Az RNS-molekulák kötődését az Argonaute családba tartozó fehérje RNS-kötő doménjéhez röntgendiffrakciós analízissel vizsgálták . Ebben az esetben az egyszálú RNS foszforilált 5'-vége a fehérje konzervatív zsebébe kerül, ahol az 5'-terminális foszfát koordinációs kötések révén megmarad a Mg 2+ ion és az adenin maradék részvételével. halmozási kölcsönhatásba lép a konzervatív tirozin -maradékkal . A fehérjének ez a régiója láthatóan serkenti a kis interferáló RNS-ek kötődését a cél-mRNS-hez [29] .

A mai napig nem teljesen ismert az a mechanizmus, amellyel a RISC komplementer mRNS-t talál a sejtben. Kimutatták, hogy a siRISC komplex általi sikeres mRNS degradációhoz nincs szükség transzlációra [30] . Ezenkívül kimutatták, hogy az RNS interferencia útvonal hatékonyabb lehet a jelenleg nem transzlálódó cél-mRNS-ekkel szemben [31] . Az Argonaute család fehérjéi a RISC katalitikus komponensei, és a citoplazma specifikus régióiban találhatók, amelyeket P -testekként ismerünk [ 32 • ] ; Kimutatták, hogy a kis interferáló RNS-ek aktivitása és az mRNS degradációja pontosan a P-testekben maximális [33] . A P-testek az RNS interferenciarendszer fontos részét képezik. Megsemmisülésük ennek a folyamatnak a hatékonyságának csökkenéséhez vezet. [34] .  

Mechanizmus

Az RNS interferencia egy RNS-függő géncsendesítési folyamat , amelyet a RISC szabályoz. A RISC a sejt citoplazmájában aktiválódik , ahol a rövid, kétszálú RNS-molekulák kölcsönhatásba lépnek a RISC katalitikus komponensével, az Argonaute fehérjével [1] . Abban az esetben, ha a kettős szálú RNS exogén (laboratóriumi manipulációk vagy RNS-tartalmú vírusfertőzés eredményeként jelenik meg), az RNS közvetlenül a citoplazmában van, ahol a Dicer fehérje rövid fragmensekre (siRNS) vágja. , és az így létrejövő siRNS-t tartalmazó funkcionális komplexet siRISC-nek nevezzük. A nem kódoló RNS - génekből expresszált pre- miRNS -ek esetében az RNSi-t endogén kettős szálú RNS váltja ki. Az ilyen gének elsődleges transzkriptumait először a sejtmagban dolgozzák fel, hogy specifikus szárhurok-struktúrákat tartalmazó premiRNS -eket képezzenek . A pre - miRNS -eket ezután a citoplazmába exportálják, és a Dicer fehérje hasítja miRNS-ekké, amelyek beépülnek a miRISC nevű mikroRNS-t tartalmazó komplexbe. Így a RISC az a hely, ahol az exogén és endogén kettős szálú RNS-ek által kiváltott két RNS interferencia útvonal keresztezi egymást [36] .

Kétszálú RNS vágása

Az exogén kétszálú RNS a ribonukleáz Dicer [14] enzim aktiválásával váltja ki az RNS-interferencia rendszert , amely megköti és elvágja az RNS duplexeket, így 21-25 bp hosszúságú, kétszálú siRNS fragmentumok képződnek, mindkét végén több párosítatlan bázissal. [38] [39] [40] [41] . Számos organizmus genomjának bioinformatikai elemzése arra utal, hogy az siRNS ilyen hosszúsága növeli a célgénnel szembeni specifitását, és csökkenti a nem specifikus kötődés valószínűségét [42] . Ezenkívül az siRNS-ek külön láncokra vannak osztva, és részt vesznek a RISC -ben (siRISC). Miután beépültek a RISC-be, az siRNS- ek komplementer módon kötődnek a cél-mRNS-hez, és az mRNS hasadását okozzák , így megakadályozzák annak transzlációját [43] .

Az exogén kettős szálú RNS-t speciális effektor fehérjék ismerik fel és kötik meg (például az RDE-4 Caenorhabditis elegansban és R2D2 a Drosophilában ), amelyek fokozzák a Dicer fehérje aktivitását [44] . Ezek az effektor fehérjék csak hosszú, kétszálú RNS-ekhez kötődnek, de az ilyen szubsztrátokhoz való affinitás mechanizmusa nem ismert [44] . Az ilyen RNS-kötő fehérjék megkönnyítik a vágott siRNS -ek átvitelét a RISC komplexbe [45] .

Caenorhabditis elegansban az RNS interferencia iniciációs útvonala a sejtben fokozható az „elsődleges” kis interferáló RNS-ek templátján „másodlagos” siRNS - ek szintézise eredményeként [46] . A „másodlagos” siRNS-ek szerkezetükben különböznek a Dicer fehérje aktivitásának eredményeként létrejövőktől, és nyilvánvalóan RNS-függő RNS-polimeráz (RNS-dependens RNA Polymerase  , RdRP ) szintetizálja őket [47] [48] .

Átírás elnémítása

Sok eukarióta az RNS-interferencia rendszert használja a genomszerkezet fenntartására . A hisztonok kémiai módosítása és a kromoszóma megfelelő szakaszainak heterokromatin állapotba való átmenete a megfelelő gének transzkripciójának csökkenéséhez vezet [49] ; ez a folyamat az RNS - indukált transzkripciós elnémításra (RITS ) utal, és fehérjék komplex halmaza hajtja végre .  A hasadó élesztőben ez a komplex Argonaute -t, egy Chp1 kromodoménnel rendelkező fehérjét és egy ismeretlen funkciójú Tas3 nevű fehérjét tartalmaz [50] . Következésképpen a heterokromatin régiók indukciójához és kiterjesztéséhez Argonaute fehérjék és RNS-függő RNS polimeráz jelenléte szükséges [51] . Valójában ezeknek a géneknek a deléciója a Schizosaccharomyces pombe hasadó élesztőben rontja a hiszton metilációt és a centromer képződést [52] , és az anafázis lelassulását vagy leállását okozza a sejtosztódás során [53] . Egyes esetekben az ilyen folyamatok hisztonmódosítással járnak, és kimutatták, hogy növelik a megfelelő gének transzkripcióját [54] .

A mechanizmus, amellyel a RITS komplex heterokromatin képződést indukál , nem teljesen ismert. A kutatás jelentős része az élesztő genom párosodási  típusú régiót szabályozó régiójának vizsgálatára irányul , azonban ez a régió nem feltétlenül reprezentatív más élőlények genomjai esetében. A heterokromatin meglévő régióinak megőrzése érdekében a RITS komplexeket képez kis interferáló RNS-ekkel, amelyek komplementerek a megfelelő génekkel, és erősen kötődik a metilált hisztonokhoz. A RITS ezután a transzkripció idején lebontja az RNS-polimeráz által szintetizált pre-mRNS-eket. Az ilyen heterokromatin régiók kialakításához a Dicer enzimre van szükség, amely a transzkriptum lebontásában szerepet játszó primer komplementer siRNS-eket szintetizál [55] . A kromoszóma régiók heterokromatin állapotban tartása a pozitív visszacsatolás egyik példája , mivel a RITS részét képező kis interferáló RNS-ek RNS-függő RNS-polimeráz által szintetizált véletlenszerű transzkriptumokból jönnek létre [56] . Az élesztő kromoszómák centromer régióinak vizsgálata során nyert adatok valószínűleg nem terjeszthetők ki emlősökre , mivel ez utóbbiakban a heterokromatin régiók fenntartása nem mindig függ az RNS interferenciarendszertől [57] .

Link az RNA szerkesztéshez

A magasabb rendű eukariótákban az RNS-szerkesztés leggyakoribb formája az adenozin inozinná történő átalakulása a kettős szálú RNS - ben, amelyet az adenozin-deamináz enzim hajt végre [58] . 2000 - ben felmerült, hogy az RNS interferencia útvonal és az A→I RNS szerkesztő útvonal versenghet egy közös kétszálú RNS szubsztrátért [59] . Valójában egyes kis interferáló RNS-prekurzorok alávethetők A→I szerkesztésnek [60] [61] , és ez a mechanizmus szabályozhatja az érett kis interferáló RNS-molekulák feldolgozását és expresszióját [ 61] [62] . A Caenorhabditis elegans orsóféreg A→I RNS-szerkesztő enzimet nem tartalmazó vonalainak vizsgálata kimutatta, hogy az RNS-szerkesztés megakadályozhatja az endogén gének és transzgének elnémítását az RNS-interferencia útvonalon keresztül [63] .

Az élőlények közötti különbségek

Az élőlények abban különböznek egymástól, hogy képesek érzékelni az idegen kettős szálú RNS-t, és felhasználni az RNS-interferencia folyamatában. Az RNSi hatása növényekben és Caenorhabditis elegansban (de Drosophilában és emlősökben nem ) öröklődő vagy szisztémás lehet. A növényekben az RNS-interferenciarendszer kis interferáló RNS-eket terjeszthet a plazmodezmák (a sejtfalban lévő kommunikációt és szállítást végző csatornák) mentén [23] . Az öröklődést a promóterek metilációja biztosítja , a megváltozott metilációs mintázat az osztódás eredményeként a leánysejtekbe kerül [65] . A kisméretű interferáló RNS-ek célpontjai között a növények és állatok közötti jelentős különbségek abból adódnak, hogy a növényekben a mikroRNS -ek nagymértékben komplementerek a ribonukleinsav célpontjaival, és mRNS degradációt okoznak a RISC-ben, míg állatokban a kis interferáló RNS-ek nukleotidszekvenciájában erősen különböznek és a sejtek elnyomását okozzák . fordítás [64] . A mikroRNS-ek befolyásolhatják a transzláció iniciációját azáltal, hogy kölcsönhatásba lépnek a transzlációs iniciációs faktorokkal és az mRNS poli(A) traktussal [66] .

Egyes protozoonok, mint például a Leishmania major és a Trypanosoma cruzi , nem tartalmazzák az RNS-interferenciaút egyetlen komponensét sem [67] [68] . Az RNS-interferenciarendszer legtöbb komponense hiányzik néhány gombából, például a Saccharomyces cerevisiae modellszervezetből [69] . Kimutatták az RNS-interferenciarendszer komponenseinek jelenlétét más hasadásos élesztőgombákban, mint például a Saccharomyces castellii és a Candida albicans . A Saccharomyces castellii - ből származó RNS-interferenciarendszer két fehérjéjének indukálása elősegíti ezt a folyamatot Saccharomyces cerevisiae -ben [70] . Az a tény, hogy egyes ascomycetes és bazidiomycetes nem rendelkeznek RNS-interferencia útvonallal, azt jelzi, hogy az ehhez a folyamathoz szükséges fehérjéket kódoló gének egymástól függetlenül elvesztek számos gombavonalban, valószínűleg egy új, hasonló funkciójú útvonal kifejlődése miatt, vagy az adaptív előnyök elvesztése ezekben az ökológiai résekben [71] .

RNSi analógok prokariótákban

A prokariótákban a génexpressziót egy RNS-alapú rendszer szabályozza, amely bizonyos tekintetben hasonlít az RNS-interferencia rendszerhez. Prokariótákban olyan géneket írtak le, amelyek speciális RNS-eket kódolnak, amelyek komplementer szekvenciákkal párosítva szabályozzák az mRNS terjedését és transzlációját . Ezek a szabályozó RNS-ek azonban nem teljes analógjai a kis interferáló RNS -eknek , mivel a Dicer enzim nem vesz részt ebben a folyamatban [72] . Kimutatták, hogy prokariótákban a rendszeresen csoportokba rendezett rövid palindrom ismétlődések rendszere ( CRISPR ) hasonló az eukarióták RNS-interferenciájának rendszeréhez, bár homológ eukarióta fehérjék nem ismertek a prokarióta rendszer egyik összetevőjéről sem [73]. .

Biológiai funkciók

Immunity

Az RNS-interferenciarendszer fontos része a vírusokkal és más idegen genetikai anyagokkal szembeni immunválasznak . A növényekben az RNS interferenciarendszer megakadályozza a transzpozonok terjedését [74] . A növényeknek számos homológja van a Dicer proteinnek , amelyek különböző típusú vírusok ellen irányulnak [75] . Kimutatták, hogy a növényekben az indukált géncsendesítés átvihető az alanyról az oltott növényre [76] . A növények adaptív immunrendszerének ez a tulajdonsága lehetővé teszi, hogy a vírus kezdeti lokális behatolása után reagáljon a vírus ismételt behatolására a szervezetben [77] . Válaszul sok vírus olyan mechanizmusokat fejlesztett ki, amelyek elnyomják az RNS-interferencia rendszert a növényi sejtekben [78] . Leírtak olyan vírusfehérjéket, amelyek a Dicer fehérje aktivitásából származó egyszálú kiemelkedésekkel kötik meg a rövid, kétszálú RNS-fragmenseket [79] . Egyes növények endogén kis interferáló RNS -eket expresszálnak bizonyos baktériumokkal való fertőzés hatására [80] . Ezek a hatások a kórokozókra adott általános válasz részét képezhetik , amelyben a fertőzés hatására a gazdaszervezetben számos anyagcsere -folyamat lelassul [81] .

Bár az állati sejtek hajlamosak a Dicer enzim kevesebb változatát expresszálni , mint a növények, az állatok RNS-zavaró rendszere bizonyos esetekben szerepet játszik a vírusellenes válaszban. A fiatalkori és felnőtt Drosophila RNS-interferenciája fontos szerepet játszik a veleszületett vírusellenes immunitásban , és részt vesz a kórokozók, például a Drosophila X vírus elleni védekezésben[82] [83] . A Caenorhabditis elegans -ban az RNS-interferencia rendszer hasonló szerepet játszik az immunitásban : az Argonaute fehérjékmegnövekszik a vírusfertőzés során, míg azok a férgek, amelyekben az RNS interferencia útvonal gének expressziója fokozódik, rezisztenssé válnak a vírusfertőzéssel szemben [84] [85] .

Az RNS-interferenciarendszer szerepe az emlősök veleszületett immunitásában nem teljesen ismert. Azonban az a tény, hogy egyes vírusok olyan géneket tartalmaznak, amelyek csökkentik az RNSi-rendszer válaszát az emlőssejtekben, az RNSi-rendszer által okozott immunválasz jelenlétére utal [86] [87] . Az emlősökben az RNS-interferenciarendszer által közvetített immunitás hipotézise azonban nem igazolt kellőképpen [88] . Bár a közelmúltban Maillard et al. [89] és Lee et al. [90] új bizonyítékot mutatott be egy funkcionális antivirális RNS-interferencia útvonal létezésére emlőssejtekben. A herpeszvírus által expresszált kis interferáló RNS -ek heterokromatin képződését idézhetik elő, és a vírus látens állapotba való átmenetéhez vezethetnek [91] .

Kimutatták, hogy a Dicer1 gén egy példányának törlése egerekben több daganat megjelenéséhez vezetett, mint a kontrollcsoportban, valamint csökkent a miRNS szintje és a túlélés. A Dicer1 gén teljes deléciója gátolta a tumorképződést, valószínűleg azért is, mert a sejtnövekedéshez a Dicer1 géntermék bizonyos szintű expressziójára van szükség. [92]

A 2013 -as munkák kimutatták, hogy az emlőssejtek olyan RNS-interferencia rendszerrel rendelkeznek, amely vírusellenes aktivitást mutat. [93] [94] Az emlős RNSi-rendszer további funkciói a herpes simplex vírus mikroRNS-ei, amelyek a heterokromatin szervezőiként működnek, és a vírus látenciájához vezetnek . [95]

Génexpresszió

Amikor a transzlációt elnyomják [64] , az élő szervezetek fejlődésének egyes szakaszaiban , különösen a morfogenezis és a sejtek differenciálatlan állapotban tartásának szakaszában (például őssejtek esetében ) endogén expressziós miRNS -ek , amelyek Az intron és intergén régiók termékei nagy jelentőséggel bírnak [96] . Az ilyen endogénen expresszált mikroRNS-ek szerepét a génexpresszió gátlásában először a Caenorhabditis elegans fonálférgében írták le 1993 -ban [97] . Növényekben ilyen miRNS -funkciót először az Arabidopsis thaliana modellnövényben írtak le , amelynél kimutatták a "JAW miRNS" hatását számos, a megjelenést szabályozó gén szabályozására [98] . A növényekben a mikroRNS által szabályozott gének általában transzkripciós faktorok [99] , így a mikroRNS-ek teljes génhálózatot szabályoznak azáltal, hogy megváltoztatják a kulcsgének (beleértve a transzkripciós faktorokat és az F-box fehérjéket ) expresszióját az embrionális fejlődés során [100] . Számos szervezetben, beleértve az embert is, a mikroRNS-ek részt vesznek a tumorképződésben és a sejtciklus szabályozási zavarában . Ebben az esetben a miRNS-ek egyszerre lehetnek onkogének és tumorszuppresszorok [101] .

A kis interferáló RNS-ek és miRNS-ek szekvenciái komplementerek a promoter régiók nukleotidszekvenciájával. Az siRNS és a miRNS kötődése ezekhez a régiókhoz a géntranszkripció és az RNS aktiváció növekedéséhez vezethet . E gének expressziójának növekedése következik be a Dicer és Argonaute fehérjék részvételével, és a hiszton demetiláció is bekövetkezik [102] [103] .

Evolúció

A számítógépes filogenetikai analízis módszerei azt mutatják, hogy az összes eukarióta legutóbbi közös őse RNS-interferenciát mutatott, míg egyes eukariótákban az RNS-interferenciarendszer hiánya szerzett tulajdonság [104] . Úgy tűnik, hogy egy evolúciósan ősi RNS-interferencia útvonal a Dicer-hez, az Argonaute-hoz, a PIWI - hez hasonló enzimeket , valamint az RNS-függő RNS-polimerázt tartalmazott. Valószínűleg az RNS-interferenciával együtt ezek az enzimek más szerepet is játszottak a sejtben. Az összehasonlító genomika területén végzett nagyszabású vizsgálatok azt mutatják, hogy egy kis csoport, amely az összes eukarióta ősévé vált, a DNS-lebontó rendszerekkel szorosan összefüggő komponensekkel is rendelkezett, például az exoszomális komplexekhez hasonló komponensekkel [105] . A sok eukarióta, valamint archaea és egyes baktériumok (pl . Aquifex aeolicus ) közös Argonaute fehérjecsaládja homológ és evolúciósan a transzlációs iniciációs rendszer összetevőiből származik [ 105] .

Az RNS-interferenciarendszer legősibb funkcióját általában az exogén genetikai elemek - a vírusok és transzpozonok genomjai - elleni védelemnek nevezik [104] [106] . Egyes kapcsolódó funkciók, mint például a hiszton módosítás , jelen lehettek a modern eukarióták őseiben, míg mások, mint például a miRNS-ek fejlődésének szabályozása, úgy tűnik, később jelentek meg [104] .

Sok eukarióta RNS-interferenciarendszerének génjei a veleszületett immunrendszer összetevői, amelyek ellenállnak a vírusoknak. Egyes növényi vírusok olyan mechanizmusokat sajátítottak el, amelyek elnyomják a gazdasejt RNS-interferenciarendszerének válaszát [78] . Az RNS interferencia útvonal gének változásának sebességét Drosophilában a pozitív szelekció irányítja . Az RNS interferenciarendszer génjei nagyon nagy sebességgel fejlődnek a Drosophila genom többi génjéhez képest [107] .

Alkalmazás

Gének kikapcsolása

Az RNS interferencia rendszert gyakran használják a kísérleti biológiában a gének működésének tanulmányozására sejttenyészetekben és modellszervezetekben in vivo [1] . Egy adott génnel komplementer szintetikus kettős szálú RNS-t juttatnak be egy sejtbe vagy szervezetbe, ahol egy idegen RNS molekula RNS interferencia rendszert vált ki. Ezzel a módszerrel a kutatók jelentősen csökkenthetik a megfelelő gén expressziós szintjét. Egy érdeklődésre számot tartó gén expressziójának csökkenésének következményeinek tanulmányozása lehetővé teszi e célgén termékének élettani szerepének tisztázását. Mivel az RNS-interferenciarendszer nem tudja teljesen kikapcsolni a génexpressziót, ezt a módszert " gén knockdown "-nak nevezik - ellentétben a gén teljes eltávolításával " gén knockout "-nak [108] .

A számítási biológia jelentős előrelépései lehetővé teszik olyan kétszálú RNS-ek kifejlesztését, amelyek maximálisan csökkentik a célgén-expressziót, és minimális mellékhatásokkal járnak. Mellékhatások léphetnek fel, ha az injektált RNS-molekula több génnel egyidejűleg komplementer szekvenciával rendelkezik, ami több gén expressziójának elégtelen csökkenéséhez vezet. Hasonló nehézségek gyakran felmerülnek, ha a kétszálú RNS ismétlődő szekvenciákat tartalmaz. A Homo sapiens , a Caenorhabditis elegans és a Schizosaccharomyces pombe genomjának tanulmányozása kimutatta, hogy a kis interferáló RNS-molekulák körülbelül 10%-a jelentős mellékhatásokhoz vezet [ 42 ] , beleértve az emlősökre [111] és vírusokra [112] specifikusakat is . A javasolt siRNS-szekvenciákat a rendszer automatikusan ellenőrzi keresztaktivitás szempontjából.

A szervezettől és a kísérleti rendszertől függően az exogén RNS-ek megtervezhetők úgy, hogy hosszúak legyenek, és a Dicer fehérje célpontjai legyenek, vagy rövidek, és kis interferáló RNS-ek szubsztrátjai legyenek. A legtöbb emlős sejt esetében a rövidebb RNS-ek előnyben részesítettek, mivel az emlősökben a hosszú kettős szálú RNS-ek interferonválaszt váltanak ki, a veleszületett immunitás egy formáját , nem specifikus választ idegen genetikai anyagra [113] . Az egér petesejtekre , valamint a fejlődés korai szakaszában lévő egérembriók sejtjére az exogén kétszálú RNS-re adott interferonválasz nem jellemző, ezért ezek a sejtek kényelmes rendszert jelentenek emlősökben a génkiütés vizsgálatára [114] . Az RNS interferenciarendszer laboratóriumi alkalmazásához speciális módszereket fejlesztettek ki, amelyek nem igényelnek kis interferáló RNS-ek közvetlen bejuttatását a sejtbe, ilyenek például az átírt siRNS-szekvenciákat kódoló plazmid transzfekciós rendszerek [115] , indukálást vagy inaktiválást lehetővé tevő lentivírus vektorok . átírás, más néven angol . feltételes RNAi [116] [117] .  

A mesterséges génszabályozás alternatív stratégiája az RNS-interferenciával szemben a CRISPRi módszerrel, amely a transzkripció be- és kikapcsolása szintjén működik [118].

Funkcionális genomika

Az RNSi rendszert használó funkcionális genomikai módszereket általában Caenorhabditis elegans [120] és Drosophila melanogaster [121] esetében alkalmazzák, mivel ezek az állatok a leggyakrabban használt modellek, és az RNSi rendszer ezekben a szervezetekben működik a leghatékonyabban. A Caenorhabditis elegans két okból is kényelmes célpont az RNS-interferencia-vizsgálatokhoz – egyrészt a fonálféreg géncsendesítésének hatásai öröklődnek, másrészt azért, mert a kettős szálú DNS eljuttatása a fonálférgához rendkívül egyszerű. A fonálférgeket a kívánt kettős szálú RNS-t tartalmazó baktériumsejtekkel, például Escherichia coli -val lehet táplálni, amelyek azután a belekben felszívódnak. Az RNS táplálékkal történő bejuttatásának ez a módszere hatékony a géncsendesítés hatékonysága szempontjából, ugyanakkor sokkal olcsóbb, egyszerűbb és gyorsabb, mint a férgeket kétszálú RNS-t tartalmazó oldatba mártani, vagy kettős szálú RNS-t bevinni. az ivarmirigyek [122] . A legtöbb más organizmusban a kettős szálú RNS szállítása sokkal munkaigényesebbnek tűnik, de emlőssejtkultúrákban nagy léptékű genomvizsgálatokat kísérelnek meg [123] .

A teljes genomokhoz tartozó RNS interferencia-könyvtárak létrehozásának megközelítései sokkal bonyolultabbak, mint egy adott kísérlethez egy adott kis interferáló RNS-készlet esetében. Mesterséges neurális hálózatokat gyakran használnak siRNS-könyvtárak létrehozására, valamint a génleütési hatékonyságuk előrejelzésére [ 124] [125] . A tömeges genom szűrések ígéretes technikák a genom annotációban, ami a DNS microarray technológián alapuló nagy áteresztőképességű szűrési módszerek kifejlesztéséhez vezetett [126] [127] . Továbbra is megkérdőjelezhető, hogy ezeket a módszereket más organizmusok, például élősködő orsóférgek tanulmányozására használják fel [128] [129] .

Az RNS-interferencia technikákkal végzett funkcionális genomikai kutatások vonzóak a genomtérképezéshez és a génannotációhoz növényekben, mivel sok növény poliploid , ami megnehezíti a hagyományos géntechnológiai módszerekkel történő tanulmányozást . Az RNS-interferenciát például sikeresen alkalmazták a funkcionális genomikában a Triticum aestivum (hexaploid) [130] , valamint más modellnövények, az Arabidopsis thaliana és a kukorica [131] esetében .

Orvostudomány

Lehetőség van RNS interferencia módszerek alkalmazására a terápiában , különösen az RNS-terápiában . Bár a hosszú kettős szálú RNS-ek emlőssejtekbe való bejuttatása az interferonválasz miatt nehéz, sikeresen alkalmaztak olyan molekulákat, mint a kis interferáló RNS-ek [132] . Klinikai vizsgálatokat végeztek a retina degradációs terápiájával és a légúti syncytialis vírus RNS-interferenciával történő kezelésével kapcsolatban [133] , és az RNSi rendszer hatékonyságát laboratóriumi egerek májkárosodásának kezelésében is kimutatták [134] .

Az RNS-interferencia másik lehetséges klinikai alkalmazása a 2-es típusú herpes simplex vírus kezelése (például a Harvard Egyetem Orvostudományi Karán ) és a vírus génexpressziójának gátlása tumorsejtekben [135] , a gazdaszervezet HIV -receptorainak és társreceptorainak leütése [136 ]. ] , a hepatitis A gének [137] és a hepatitis B [138] elnémítása, az influenzavírus géncsendesítése [139] , a kanyaróvírus replikációjának gátlása [140] . Lehetőség van a neurodegeneratív betegségek, például a Huntington-kór kezelésére is [141] . Az RNS-interferenciát gyakran ígéretes módszernek is tekintik a daganatok kezelésében a tumorsejtekben túlzottan expresszált gének vagy a sejtosztódásban részt vevő gének leállításával [142] [143] . A klinikai alkalmazások RNS-interferenciájának egyik fontos kutatási területe a kis RNS-ek biztonságos szállítására szolgáló módszerek kidolgozása, például a génterápiás vektorrendszerek kiválasztása [144] [145] .

Annak ellenére, hogy vannak új sejttenyészetekkel kapcsolatos tanulmányok, amelyek megerősítik az RNS-interferencia rendszer összetevőin alapuló gyógyszeres terápia lehetséges lehetőségét, továbbra is kérdések merülnek fel az ilyen kezelések biztonságosságát illetően, beleértve a hasonló nukleotiddal rendelkező gének elnyomásának mellékhatásait. sorozatok [146] . A számítógépes genomikai módszerek azt mutatják, hogy az ilyen félrekapcsolási mellékhatások akár 10%-át is elérhetik [42] . Az egereken végzett májbetegségek egyik nagy tanulmánya magasabb mortalitást mutatott ki a kísérleti állatok körében, amit a kutatók a kétszálú RNS-ek ( miRNS , shRNS ) „túlterhelésével” magyaráztak [147] , mivel a hajtűt tartalmazó kis RNS-ek a sejtmagban feldolgozzák és az aktív transzportmechanizmus . A fenti tényeket még mindig vizsgálják, ami korlátozza az RNS-interferencia módszerek lehetséges alkalmazását a terápiában.

Emellett az RNS-interferencia terápiák fejlesztésének jelentős akadálya, hogy a kis interferáló RNS-ek (siRNS-ek) szállítása még mindig rendkívül nem hatékony, és rendkívül nagy dózisú gyógyszer szükséges a célgén minimálisan jelentős leütéséhez. A közelmúltban kifejlesztett technológiák azonban reménykedhetnek abban, hogy ez a terápiás módszer hamarosan bekerül a klinikai gyakorlatba. Például azt találták, hogy a koleszterin-asszociált siRNS (chol-siRNS) és az ARC-520 endoszomolitikus polimer egyidejű injektálása lehetővé tette a hatékonyság több mint 500-szoros növekedését és a célgén expressziójának 90%-os csökkenését. egerekben in vivo. [148] .

Módszereket fejlesztenek ki az RNS-interferencia alkalmazására a tartós 1-es típusú HIV-fertőzés kezelésére. Az olyan vírusok, mint a HIV-1, nehéz célpontot jelentenek az RNSi-rendszer számára, mivel több RNSi-útvonal kombinációját igénylik. Ígéretesnek tűnnek az RNAi rendszert alkalmazó antivirális terápia lehetséges módjai, de rendkívül fontos a preklinikai vizsgálatok során számos kontrollkísérlet felállítása annak érdekében, hogy az RNSi rendszer szekvencia-specifikus hatását egyértelműen kimutathassuk [149] .

Biotechnológia

Az RNS-interferenciát a biotechnológiában használják , különösen olyan növények létrehozására, amelyek kisebb mennyiségben szintetizálják a természetes mérgező anyagokat . Módszereket dolgoztak ki olyan növények létrehozására, amelyek stabilan expresszálják az RNS interferenciarendszer komponenseit, például a gyapotmagok általában gazdagok emberi fogyasztásra alkalmas fehérjében, de tartalmazzák a toxikus terpenoid gosszipolt .  Az RNS-interferencia jelenségét alkalmazó módszerek lehetővé teszik olyan gyapotvonalak létrehozását, amelyekben a gosszipolszintézis kulcsenzimének, a (+)-δ-kadinén-szintáznak a szintje csökkent. Ugyanakkor a növény más részei a szokásos szinten expresszálják ezt az enzimet, mivel a gosszipol egy fontos vegyület, amely megvédi a növényeket a kártevőktől [150] . Hasonló kísérletek folynak a cianidszint csökkentésére a természetes linamarin termékben , amely maniókából ( Manihot esculenta ) származik [151] .

Módszereket dolgoztak ki az allergénszint csökkentésére paradicsomnövényekben [152] és módszereket a rákkeltő prekurzorok csökkentésére a dohánynövényekben [ 153] . A növények génmanipulált változásaira további példák a csökkentett kábítószer - tartalmú ópiummák létrehozása [154] , a növények vírusokkal szembeni rezisztenciájának növekedése [155] , valamint antioxidánsok hozzáadása a paradicsom gyümölcséhez [156] . Korábbi, kereskedelmi forgalomba hozott, génmanipulált növényeket, a paradicsomot és a papaját antiszensz RNS-ek felhasználásával fejlesztették ki, amelyek nyilvánvalóan RNS-interferenciával működnek [157] [158] . Üzbegisztán tudósok RNS-interferenciával elnyomták a fitokróm A gén működését a gyapotban. Ennek eredményeként olyan gyapotvonalakat kaptak, amelyekben több fontos tulajdonság egyidejűleg javult: a rosthossz és a minőség, a terméshozam, az érési idő, a vízhiánnyal és a sóstresszsel szembeni ellenállás. A kapott pamutvonalak alapján a Porlock sorozat új, kiváló minőségű pamutfajtái születtek, amelyeket jelenleg Üzbegisztán földjein vetnek. Ezeknek a fajtáknak a rostjait magasabb áron értékesítik, mint a közönséges pamutét, mivel minőségi jellemzőikben felülmúlják a közönséges pamut rostjait [159] .

Jegyzetek

  1. ↑ 1 2 3 4 5 Daneholt, Bertil Speciális információk: RNS interferencia . Élettani vagy orvosi Nobel-díj 2006 . Letöltve: 2007. január 25. Az eredetiből archiválva : 2011. augusztus 25..
  2. ↑ 1 2 Fire A., Xu S., Montgomery M., Kostas S., Driver S., Mello C. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans  (angol)  // Nature : Journal. - 1998. - 1. évf. 391. sz . 6669 . - P. 806-811 . - doi : 10.1038/35888 . — PMID 9486653 .
  3. ↑ Matzke MA, Matzke AJM. Planting the Seeds of a New Paradigm  (angol)  // PLoS Biol  : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 2 , sz. 5 . -P.e133 . _ - doi : 10.1371/journal.pbio.0020133 . — PMID 15138502 .
  4. ↑ Ecker JR, Davis RW A génexpresszió gátlása növényi sejtekben antiszensz RNS expressziójával  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 1986. - 1. évf. 83 , sz. 15 . - P. 5372-5376 . - doi : 10.1073/pnas.83.15.5372 . — PMID 16593734 .
  5. ↑ Napoli C., Lemieux C., Jorgensen R. Introduction of a Chimeric Chalcone Synthase Gene into Petunia Results in Reversible Co-Suppression of Homologous Genes in trans  // Plant Cell  : Journal  . - 1990. - 1. évf. 2 , sz. 4 . - 279-289 . o . - doi : 10.1105/tpc.2.4.279 . — PMID 12354959 .
  6. ↑ {{{title}}} .
  7. ↑ Romano N., Macino G.  Quelling : a génexpresszió átmeneti inaktiválása Neurospora crassa-ban homológ szekvenciákkal történő transzformációval  // Mikrobiológia : folyóirat. — Mikrobiológiai Társaság, 1992. - 1. évf. 6 , sz. 22 . - P. 3343-3353 . - doi : 10.1111/j.1365-2958.1992.tb02202.x . — PMID 1484489 .
  8. ↑ Van Blokland R., Van der Geest N., Mol JNM, Kooter JM szintáz expressziója Petunia hybrida -ban az RNS-forgalom növekedéséből ered]  //  Plant J : folyóirat. - 1994. - 1. évf. 6 . - P. 861-877 . - doi : 10.1046/j.1365-313X.1994.6060861.x/abs/ .  (nem elérhető link)
  9. ↑ Mol JNM, van der Krol AR Antiszensz nukleinsavak és fehérjék: alapok és alkalmazások  (neopr.) . — M. Dekker, 1991. - S.  4 , 136. - ISBN 0824785169 .
  10. ↑ Covey S., Al-Kaff N., Lángara A., Turner D. A növények a géncsendesítéssel küzdenek a fertőzés  ellen  // Nature . - 1997. - 1. évf. 385 . - P. 781-782 . - doi : 10.1038/385781a0 .
  11. ↑ Ratcliff F., Harrison B., Baulcombe D. A hasonlóság a vírusvédelem és a géncsillapítás között a növényekben  //  Science : Journal. - 1997. - 1. évf. 276 . - P. 1558-1560 . - doi : 10.1126/tudomány.276.5318.1558 .
  12. ↑ Guo S., Kemphues K. par-1, a C. elegans embriók polaritásának megállapításához szükséges gén, egy feltételezett Ser/Thr kinázt kódol, amely aszimmetrikus eloszlású  (angolul)  // Cell  : Journal. - Cell Press , 1995. - Vol. 81 , sz. 4 . - P. 611-620 . - doi : 10.1016/0092-8674(95)90082-9 . — PMID 7758115 .
  13. ↑ Pal-Bhadra M., Bhadra U., Birchler J. Cosuppression in Drosophila: gene silence of Alcohol dehydrogenase by white-Adh transgenes is Polycomb dependent  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 90 , sz. 3 . - P. 479-490 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80508-5 . — PMID 9267028 .
  14. ↑ 1 2 Bernstein E., Caudy A., Hammond S., Hannon G. Role for a bidentate ribonuclease in the iniciation step of RNA interference  //  Nature : Journal. - 2001. - Vol. 409 , sz. 6818 . - P. 363-366 . - doi : 10.1038/35053110 . — PMID 11201747 .
  15. ↑ Pillai RS, Bhattacharyya SN, Filipowicz W. Fehérjeszintézis visszaszorítása miRNS-ek által: hány mechanizmus? (eng.)  // Trends Cell Biol : folyóirat. — PMID 17197185 .
  16. ↑ Lee Y., Nakahara K., Pham J., Kim K., He Z., Sontheimer E., Carthew R. A Drosophila Dicer-1 és Dicer-2 megkülönböztető szerepei az siRNS / miRNS csendesítési útvonalakban   // Sejt  : folyóirat. - Cell Press , 2004. - Vol. 117. sz . 1 . - 69-81 . o . - doi : 10.1016/S0092-8674(04)00261-2 . — PMID 15066283 .
  17. ↑ Gregory R., Chendrimada T., Shiekhattar R. MikroRNS  biogenezis : a mikroprocesszor komplex izolálása és jellemzése  // Methods Mol Biol : folyóirat. - 2006. - Vol. 342 . - P. 33-47 . — PMID 16957365 .
  18. ↑ Wang QL, Li ZH  A mikroRNS-ek funkciói a növényekben  // Frontiers in Bioscience : folyóirat. — A biotudomány határai, 2007. - 20. évf. 12 . - P. 3975-3982 . — PMID 17485351 .
  19. ↑ Zhao Y., Srivastava D. A mikroRNS-funkció fejlődési képe  // Trends Biochem  . sci. : folyóirat. - 2007. - Vol. 32 , sz. 4 . - 189-197 . o . - doi : 10.1016/j.tibs.2007.02.006 . — PMID 17350266 .
  20. ↑ Cifuentes D, Xue H, Taylor DW, Patnode H, Mishima Y, Cheloufi S, Ma E, Mane S, Hannon GJ, Lawson N, Wolfe S, Giraldez AJ. (2010) "A Dicertől független új miRNS-feldolgozási útvonal Argonaute2 katalitikus aktivitást igényel." Science (Közzétéve online: 2010. május 6.) doi:10.1126/science.1190809
  21. ↑ Cheloufi S, Dos Santos CO, Chong MM, Hannon GJ. A kockáktól független miRNS biogenezis útvonal, amelyhez Ago katalízis szükséges   // Nature . - 2010. - Iss. doi:10.1038/nature09092 . - P. Megjelent online: 2010. április 27 .
  22. ↑ Gregory R., Chendrimada T., Cooch N., Shiekhattar R. A humán RISC párosítja a mikroRNS biogenezist és a poszttranszkripciós géncsendesítést  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2005. - Vol. 123. sz . 4 . - P. 631-640 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.10.022 . — PMID 16271387 .
  23. ↑ 1 2 Lodish H., Berk A., Matsudaira P., Kaiser CA, Krieger M., Scott MP, Zipurksy SL, Darnell J. Molecular Cell Biology  (meghatározatlan) . — 5. - W. H. Freeman: New York, NY, 2004. - ISBN 978-0716743668 .
  24. ↑ Matranga C., Tomari Y., Shin C., Bartel D., Zamore P. A Passenger-strand hasítás megkönnyíti az siRNS összeszerelését Ago2-t tartalmazó RNAi enzimkomplexekbe  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2005. - Vol. 123. sz . 4 . - P. 607-620 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.08.044 . — PMID 16271386 .
  25. ↑ Leuschner P., Ameres S., Kueng S., Martinez J. Az siRNA utasszál hasítása a RISC összeszerelés során emberi sejtekben  //  EMBO Rep : folyóirat. - 2006. - Vol. 7 , sz. 3 . - P. 314-320 . - doi : 10.1038/sj.embor.7400637 . — PMID 16439995 .
  26. ↑ Schwarz DS, Hutvágner G., Du T., Xu Z., Aronin N., Zamore PD Asymmetry in the assembly of the RNAi enzim complex  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2003. - Vol. 115 , sz. 2 . - P. 199-208 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00759-1 . — PMID 14567917 .
  27. ↑ Preall J., He Z., Gorra J., Sontheimer E. A rövid interferáló RNS-szál szelekció független a dsRNS-feldolgozás polaritásától az RNSi során Drosophilában  // Curr Biol  : Journal  . - 2006. - Vol. 16 , sz. 5 . - P. 530-535 . - doi : 10.1016/j.cub.2006.01.061 . — PMID 16527750 .
  28. ↑ Tomari Y., Matranga C., Haley B., Martinez N., Zamore P. A protein sensor for siRNA asymmetry   // Science . - 2004. - 20. évf. 306 , sz. 5700 . - P. 1377-1380 . - doi : 10.1126/tudomány.1102755 . — PMID 15550672 .
  29. ↑ Ma J., Yuan Y., Meister G., Pei Y., Tuschl T., Patel D. Strukturális alapok az A.  fulgidus Piwi //fehérje - 2005. - 20. évf. 434 , sz. 7033 . - P. 666-670 . - doi : 10.1038/nature03514 . — PMID 15800629 .
  30. ↑ Sen G., Wehrman T., Blau H. Az mRNS transzláció nem előfeltétele a kis interferáló RNS-közvetített mRNS hasításnak  //  Differenciation : Journal. - 2005. - 20. évf. 73 , sz. 6 . - P. 287-293 . - doi : 10.1111/j.1432-0436.2005.00029.x . — PMID 16138829 .
  31. ↑ Gu S., Rossi J. Uncoupling of RNAi from active translation in mammalian cells  //  RNS : Journal. - 2005. - 20. évf. 11 , sz. 1 . - P. 38-44 . - doi : 10.1261/rna.7158605 . — PMID 15574516 .
  32. ↑ Sen G., Blau H. Az Argonaute 2/RISC az emlősök mRNS-bomlási helyein, úgynevezett citoplazmatikus testeken található  // Nature Cell Biology  : folyóirat  . - 2005. - 20. évf. 7 , sz. 6 . - P. 633-636 . - doi : 10.1038/ncb1265 . — PMID 15908945 .
  33. ↑ Lian S., Jakymiw A., Eystathioy T., Hamel J., Fritzler M., Chan E. GW-testek, mikroRNS-ek és a sejtciklus  //  Cell Cycle : folyóirat. - 2006. - Vol. 5 , sz. 3 . - P. 242-245 . — PMID 16418578 .
  34. ↑ Jakymiw A., Lian S., Eystathioy T., Li S., Satoh M., Hamel J., Fritzler M., Chan E. A P testek megzavarása impairs mammalian RNA interference   :Nature Cell Biology// - 2005. - 20. évf. 7 , sz. 12 . - P. 1267-1274 . - doi : 10.1038/ncb1334 . — PMID 16284622 .
  35. ↑ Hammond S., Bernstein E., Beach D., Hannon G. An RNA-directed nuclease mediates post-transscriptional gene silenceing in Drosophila cells  // Nature  :  Journal. - 2000. - Vol. 404 , sz. 6775 . - P. 293-296 . - doi : 10.1038/35005107 . — PMID 10749213 .
  36. ↑ Bagasra O., Prilliman KR RNS interferencia: a molekuláris immunrendszer  (neopr.)  // J. Mol. Histol.. - 2004. - T. 35 , 6. sz . - S. 545-553 . - doi : 10.1007/s10735-004-2192-8 . — PMID 15614608 .
  37. ↑ Macrae I., Zhou K., Li F., Repic A., Brooks A., Cande W., Adams P., Doudna J. Structural basic for double-stranded RNA processing by dicer   // Science : Journal. - 2006. - Vol. 311 , sz. 5758 . - P. 195-198 . - doi : 10.1126/tudomány.1121638 . — PMID 16410517 .
  38. ↑ Siomi, Haruhiko; Siomi, Mikiko C. Úton az RNS-interferencia kód olvasásához  (angol)  // Nature  : Journal. - 2009. - január 22. ( 457. köt. , 7228. sz.). - P. 396-404 . - doi : 10.1038/nature07754 . — PMID 19158785 .
  39. ↑ Zamore P., Tuschl T., Sharp P., Bartel D. RNAi: kétszálú RNA irányítja az mRNS ATP-függő hasítását 21-23 nukleotid intervallumban  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2000. - Vol. 101 , sz. 1 . - P. 25-33 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80620-0 . — PMID 10778853 .
  40. ↑ Vermeulen A., Behlen L., Reynolds A., Wolfson A., Marshall W., Karpilow J., Khvorova A. A dsRNA szerkezet hozzájárulása a kockaspecifikussághoz és hatékonysághoz  //  RNA : Journal. - 2005. - 20. évf. 11 , sz. 5 . - P. 674-682 . - doi : 10.1261/rna.7272305 . — PMID 15811921 .
  41. ↑ Castanotto, Daniela; Rossi, John J. Az RNS-interferencia-alapú terápiák ígéretei és buktatói  // Nature  :  Journal. - 2009. - január 22. ( 457. köt. , 7228. sz.). - P. 426-433 . - doi : 10.1038/nature07758 . — PMID 19158789 .
  42. ↑ 1 2 3 Qiu S., Adema C., Lane T. Az RNS interferencia célon kívüli hatásainak számítógépes vizsgálata  //  Nucleic Acids Res : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 33 , sz. 6 . - P. 1834-1847 . doi : 10.1093 / nar/gki324 . — PMID 15800213 .
  43. ↑ Ahlquist P. RNS-függő RNS polimerázok, vírusok és RNS-csendesítés   // Tudomány . - 2002. - 20. évf. 296. sz . 5571 . - P. 1270-1273 . - doi : 10.1126/tudomány.1069132 . — PMID 12016304 .
  44. ↑ 1 2 Parker G., Eckert D., Bass B. Az RDE-4 preferenciálisan kötődik a hosszú dsRNS-hez, és dimerizációja szükséges a dsRNS siRNS-vé történő hasításához  //  RNS : Journal. - 2006. - Vol. 12 , sz. 5 . - P. 807-818 . - doi : 10.1261/rna.2338706 . — PMID 16603715 .
  45. ↑ Liu Q., Rand T., Kalidas S., Du F., Kim H., Smith D., Wang X. R2D2, a bridge between the iniciation and effektor step of the Drosophila RNAi pathway  //  Science : Journal. - 2003. - 1. évf. 301 , sz. 5641 . - P. 1921-1925 . - doi : 10.1126/tudomány.1088710 . — PMID 14512631 .
  46. ↑ Baulcombe D. Molekuláris biológia. Erősített elnémítás  (angol)  // Tudomány. - 2007. - Vol. 315. sz . 5809 . - P. 199-200 . - doi : 10.1126/tudomány.1138030 . — PMID 17218517 .
  47. ↑ Pak J., Fire A. Primer és szekunder effektorok megkülönböztető populációi az RNSi során C. elegansban  //  Science : Journal. - 2007. - Vol. 315. sz . 5809 . - P. 241-244 . - doi : 10.1126/tudomány.1132839 . — PMID 17124291 .
  48. ↑ Sijen T., Steiner F., Thijssen K., Plasterk R. A másodlagos siRNS-ek unprimed RNA synthesisből származnak, és külön osztályt alkotnak  //  Science : Journal. - 2007. - Vol. 315. sz . 5809 . - P. 244-247 . - doi : 10.1126/tudomány.1136699 . — PMID 17158288 .
  49. ↑ Holmquist G., Ashley T. Kromoszóma szerveződés és kromatin módosítás: hatása a genom működésére és evolúciójára  //  Citogenetikai és genomkutatás : folyóirat. — Karger Kiadó, 2006. - 20. évf. 114. sz . 2 . - P. 96-125 . - doi : 10.1159/000093326 . — PMID 16825762 .
  50. ↑ Verdel A., Jia S., Gerber S., Sugiyama T., Gygi S., Grewal S., Moazed D. RNAi-mediated targeting of heterochromatin by the RITS complex  //  Science : Journal. - 2004. - 20. évf. 303 , sz. 5658 . - P. 672-676 . - doi : 10.1126/tudomány.1093686 . — PMID 14704433 .
  51. ↑ Irvine D., Zaratiegui M., Tolia N., Goto D., Chitwood D., Vaughn M., Joshua-Tor L., Martienssen R. Argonaute slicing is required for heterochromatic silenceing and spreading  //  Science : Journal. - 2006. - Vol. 313. sz . 5790 . - P. 1134-1137 . - doi : 10.1126/tudomány.1128813 . — PMID 16931764 .
  52. ↑ Volpe T., Kidner C., Hall I., Teng G., Grewal S., Martienssen R. Heterokromatikus csendesítés és hiszton H3 lizin-9 metiláció szabályozása RNAi által  //  Science : Journal. - 2002. - 20. évf. 297. sz . 5588 . - P. 1833-1837 . - doi : 10.1126/tudomány.1074973 . — PMID 12193640 .
  53. ↑ Volpe T., Schramke V., Hamilton G., White S., Teng G., Martienssen R., Allshire R. RNS interferencia szükséges a hasadási élesztő normál centromer funkciójához  //  Chromosome Res : Journal. - 2003. - 1. évf. 11 , sz. 2 . - 137-146 . o . - doi : 10.1023/A:1022815931524 . — PMID 12733640 .
  54. ↑ Li LC, Okino ST, Zhao H, Pookot D, Place RF, Urakami S, Enokida H, Dahiya R. (2006). A kis dsRNS-ek transzkripciós aktivációt indukálnak az emberi sejtekben. Proc Natl Acad Sci USA 103(46):17337–42. PMID 17085592
  55. ↑ Noma K., Sugiyama T., Cam H., Verdel A., Zofall M., Jia S., Moazed D., Grewal S. A RITS ciszben hat, hogy elősegítse az RNS interferencia által közvetített transzkripciós és poszt-transzkripciós  elnémítást.)  // Természetgenetika  : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 36 , sz. 11 . - P. 1174-1180 . - doi : 10.1038/ng1452 . — PMID 15475954 .
  56. ↑ Sugiyama T., Cam H., Verdel A., Moazed D., Grewal S. Az RNS-függő RNS-polimeráz lényeges komponense a heterokromatint az siRNS-termeléshez kötődő önerős hurok-összeállításnak   // Proceedings of the National Academy of Sciences az Amerikai Egyesült Államok  : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 102 , sz. 1 . - 152-157 . o . - doi : 10.1073/pnas.0407641102 . — PMID 15615848 .
  57. ↑ Wang F., Koyama N., Nishida H., Haraguchi T., Reith W., Tsukamoto T.  A transzgén ismétlődések által kiváltott heterokromatin összeállítása és fenntartása független az emlőssejtek RNS interferencia útvonalától  // Mol Cell Biol : folyóirat. - 2006. - Vol. 26 , sz. 11 . - P. 4028-4040 . - doi : 10.1128/MCB.02189-05 . — PMID 16705157 .
  58. ↑ Bass B. RNS szerkesztése az RNS-re ható adenozin-deaminázokkal  //  Annu Rev Biochem : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 71 . - P. 817-846 . - doi : 10.1146/annurev.biochem.71.110601.135501 . — PMID 12045112 .
  59. ↑ Bass B. Kétszálú RNS mint templát a géncsendesítéshez  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2000. - Vol. 101 , sz. 3 . - P. 235-238 . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)71133-1 . — PMID 10847677 .
  60. ↑ Luciano D., Mirsky H., Vendetti N., Maas S. RNA editing of a miRNA precursor  (neopr.)  // RNA. - 2004. - T. 10 , 8. sz . - S. 1174-1177 . - doi : 10.1261/rna.7350304 . — PMID 15272117 .
  61. ↑ 1 2 Yang W., Chendrimada T., Wang Q., Higuchi M., Seeburg P., Shiekhattar R., Nishikura K. A mikroRNS-feldolgozás és -kifejezés modulálása RNA-szerkesztésen keresztül ADAR deaminázokkal   // Nature Structural & Molecular Biology  : folyóirat. - 2006. - Vol. 13 , sz. 1 . - P. 13-21 . doi : 10.1038 / nsmb1041 . — PMID 16369484 .
  62. ↑ Yang W., Wang Q., Howell K., Lee J., Cho D., Murray J., Nishikura K. ADAR1 RNS deaminase limits short interfering RNA efficacy in mammalian cells  // J Biol Chem  :  Journal. - 2005. - 20. évf. 280 , sz. 5 . - P. 3946-3953 . - doi : 10.1074/jbc.M407876200 . — PMID 15556947 .
  63. ↑ Nishikura K. A szerkesztő találkozik a hangtompítóval: az RNS-szerkesztés és az RNS-interferencia közötti áthallás  // Nature Reviews Molecular Cell Biology  : folyóirat  . - 2006. - Vol. 7 , sz. 12 . - P. 919-931 . - doi : 10.1038/nrm2061 . — PMID 17139332 .
  64. ↑ 1 2 3 Saumet A., Lecellier CH Vírusellenes RNS-csillapítás: úgy nézünk ki, mint a növények? (angol)  // BioMed Central. - 2006. - Vol. 3 , sz. 3 . — 3. o . - doi : 10.1186/1742-4690-3-3 . — PMID 16409629 .
  65. ↑ Jones L., Ratcliff F., Baulcombe DC A növényekben a RNS által irányított transzkripciós géncsendesítés az RNS-triggertől függetlenül örökölhető, és a karbantartáshoz Met1 szükséges  // Current Biology  : Journal  . - Cell Press , 2001. - Vol. 11 , sz. 10 . - P. 747-757 . - doi : 10.1016/S0960-9822(01)00226-3 .
  66. ↑ Humphreys DT, Westman BJ, Martin DI, Preiss T. A mikroRNS-ek a 4E/cap eukarióta iniciációs faktor és a poli(A) farokfunkció gátlásával szabályozzák a transzláció iniciációját  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - 2005. - 20. évf. 102 . - P. 16961-16966 . - doi : 10.1073/pnas.0506482102 . — PMID 16287976 .
  67. ↑ DaRocha W., Otsu K., Teixeira S., Donelson J. A citoplazmatikus RNS interferencia (RNAi) tesztjei és a tetraciklinnel indukálható T7 promoter rendszer felépítése Trypanosoma cruziban  //  Mol Biochem Parasitol : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 133. sz . 2 . - 175-186 . o . - doi : 10.1016/j.molbiopara.2003.10.005 . — PMID 14698430 .
  68. ↑ Robinson K., Beverley S. A transzfekció hatékonyságának javítása és az RNS-interferencia (RNAi) megközelítéseinek vizsgálata a Leishmania protozoa parazitában  //  Mol Biochem Parasitol : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 128. sz . 2 . - P. 217-228 . - doi : 10.1016/S0166-6851(03)00079-3 . — PMID 12742588 .
  69. ↑ L. Aravind, Hidemi Watanabe, David J. Lipman és Eugene V. Koonin. Lineage-specific loss and divergence of funkcionálisan kapcsolt gének eukariótákban  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences  : folyóirat. - 2000. - Vol. 97 , sz. 21 . - P. 11319-11324 . - doi : 10.1073/pnas.200346997 . — PMID 11016957 .
  70. ↑ Drinnenberg IA, Weinberg DE, Xie KT, Nower JP, Wolfe KH, Fink GR, Bartel DP RNAi in Budding Yeast   // Science . - 2009. - doi : 10.1126/tudomány.1176945 . — PMID 19745116 .
  71. ↑  Nakayashiki H., Kadotani N., Mayama S. Az RNS-csillapító fehérjék evolúciója és diverzifikációja gombákban  // J Mol Evol : folyóirat. - 2006. - Vol. 63 , sz. 1 . - 127-135 . o . - doi : 10.1007/s00239-005-0257-2 . — PMID 16786437 .
  72. ↑ Morita T., Mochizuki Y., Aiba H. A transzlációs represszió elegendő a bakteriális kisméretű, nem kódoló RNS-ek géncsendesítéséhez mRNS-megsemmisítés hiányában  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of  America  : - 2006. - Vol. 103 , sz. 13 . - P. 4858-4863 . - doi : 10.1073/pnas.0509638103 . — PMID 16549791 .
  73. ↑ Makarova K., Grishin N., Shabalina S., Wolf Y., Koonin E. Egy feltételezett RNS-interferencia-alapú immunrendszer prokariótákban: a megjósolt enzimatikus gépezet számítási elemzése, funkcionális analógiák az eukarióta RNSi-vel és az eukarióta RNSi hipotetikus mechanizmusai akció  //  Biol Direct : folyóirat. - 2006. - Vol. 1 . — 7. o . - doi : 10.1186/1745-6150-1-7 . — PMID 16545108 .
  74. ↑ Stram Y., Kuzntzova L. Vírusok gátlása RNS-interferenciával  (undefined)  // Vírusgének. - 2006. - T. 32 , 3. sz . - S. 299-306 . - doi : 10.1007/s11262-005-6914-0 . — PMID 16732482 .
  75. ↑ Blevins T., Rajeswaran R., Shivaprasad P., Beknazariants D., Si-Ammour A., ​​​​Park H., Vazquez F., Robertson D., Meins F., Hohn T., Pooggin M. Négy növény A kockák közvetítik a vírus kis RNS biogenezisét és a DNS-vírus által kiváltott elnémítást  //  Nucleic Acids Res : folyóirat. - 2006. - Vol. 34 , sz. 21 . - P. 6233-6246 . - doi : 10.1093/nar/gkl886 . — PMID 17090584 .
  76. ↑ Palauqui J., Elmayan T., Pollien J., Vaucheret H. A szisztémás szerzett elnémítás: a transzgénspecifikus poszt-transzkripciós elnémítást oltással továbbítják a csendesített törzsekből nem csendesített szárba   // EMBO J : folyóirat. - 1997. - 1. évf. 16 , sz. 15 . - P. 4738-4745 . - doi : 10.1093/emboj/16.15.4738 . — PMID 9303318 .
  77. ↑ Voinnet O. RNS-csendesítés mint növényi immunrendszer a vírusok ellen  (fr.)  // Trends Genet :magazin. - 2001. - Vol. 17 , 8. sz . _ - P. 449-459 . - doi : 10.1016/S0168-9525(01)02367-8 . — PMID 11485817 .
  78. ↑ 1 2 Lucy A., Guo H., Li W., Ding S. A poszt-transzkripciós géncsendesítés elnyomása a sejtmagban lokalizált növényi vírusfehérje által  //  EMBO J : folyóirat. - 2000. - Vol. 19 , sz. 7 . - P. 1672-1680 . - doi : 10.1093/emboj/19.7.1672 . — PMID 10747034 .
  79. ↑ Mérai Z., Kerényi Z., Kertész S., Magna M., Lakatos L., Silhavy D. A kettős szálú RNA kötés lehet általános növényi RNA virális stratégia az RNA csendesítés elnyomására  // J  Virol : folyóirat. - 2006. - Vol. 80 , sz. 12 . - P. 5747-5756 . - doi : 10.1128/JVI.01963-05 . — PMID 16731914 .
  80. ↑ Katiyar-Agarwal S., Morgan R., Dahlbeck D., Borsani O., Villegas A., Zhu J., Staskawicz B., Jin H.  A pathogen-inducible endogén siRNA in plant immunity  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : folyóirat. - 2006. - Vol. 103 , sz. 47 . - P. 18002-18007 . - doi : 10.1073/pnas.0608258103 . — PMID 17071740 .
  81. ↑ Fritz J., Girardin S., Philpott D. Veleszületett immunvédelem RNS-interferencián keresztül  // Sci  STKE : folyóirat. - 2006. - Vol. 2006 , sz. 339 . — P. pe27 . - doi : 10.1126/stke.3392006pe27 . — PMID 16772641 .
  82. ↑ Zambon R., Vakharia V., Wu L. Az RNAi egy antivirális immunválasz egy dsRNS vírus ellen Drosophila melanogasterben  (neopr.)  // Cell Microbiol. - 2006. - T. 8 , 5. sz . - S. 880-889 . - doi : 10.1111/j.1462-5822.2006.00688.x . — PMID 16611236 .
  83. ↑ Wang X., Aliyari R., Li W., Li H., Kim K., Carthew R., Atkinson P., Ding S. Az RNS interferencia irányítja a veleszületett immunitást a vírusok ellen felnőtt Drosophilában  //  Science : Journal. - 2006. - Vol. 312 , sz. 5772 . - P. 452-454 . - doi : 10.1126/tudomány.1125694 . — PMID 16556799 .
  84. ↑ Lu R., Maduro M., Li F., Li H., Broitman-Maduro G., Li W., Ding S. Animal virus replikáció és RNAi-mediált antivirális elnémítás a Caenorhabditis elegansban  //  Nature : Journal. - 2005. - 20. évf. 436 , sz. 7053 . - P. 1040-1043 . - doi : 10.1038/nature03870 . — PMID 16107851 .
  85. ↑ Wilkins C., Dishongh R., Moore S., Whitt M., Chow M., Machaca K. Az RNS interferencia egy antivirális védelmi mechanizmus a Caenorhabditis elegansban  //  Nature: Journal. - 2005. - 20. évf. 436 , sz. 7053 . - P. 1044-1047 . - doi : 10.1038/nature03957 . — PMID 16107852 .
  86. ↑ Berkhout B., Haasnoot J. A vírusfertőzés és a celluláris RNS interferencia gépezet közötti kölcsönhatás  //  FEBS Lett : folyóirat. - 2006. - Vol. 580 , sz. 12 . - P. 2896-2902 . - doi : 10.1016/j.febslet.2006.02.070 . — PMID 16563388 .
  87. ↑ Schütz S., Sarnow P. Vírusok interakciója az emlős RNS interferencia útvonalával  (angol)  // Virology : Journal. - 2006. - Vol. 344. sz . 1 . - 151-157 . o . - doi : 10.1016/j.virol.2005.09.034 . — PMID 16364746 .
  88. ↑ Cullen B. Az RNS-interferencia szerepet játszik az emlősök belső vírusellenes immunitásában? (angol)  // Nature Immunology  : Journal. - 2006. - Vol. 7 , sz. 6 . - P. 563-567 . - doi : 10.1038/ni1352 . — PMID 16715068 .
  89. ↑ PV Maillard, C. Ciaudo, A. Marchais, Y. Li, F. Jay, SW Ding és Olivier Voinnet (2013): Antiviral RNA Interference in Mammalian Cells. Science, 342(6155), 235-238 DOI: 10.1126/science.1241930
  90. ↑ Yang Li, Jinfeng Lu, Yanhong Han, Xiaoxu Fan és Shou-Wei Ding (2013) Az RNS interferencia funkciója vírusellenes immunitási mechanizmusként emlősökben. Science, 342(6155), 231-234 DOI: 10.1126/science.1241911
  91. ↑ Li H., Ding S. Antiviral silenceing in animals  //  FEBS Lett : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 579 , sz. 26 . - P. 5965-5973 . - doi : 10.1016/j.febslet.2005.08.034 . — PMID 16154568 .
  92. ↑ Madhu S. Kumar, Ryan E. Pester, Cindy Y. Chen, Keara Lane, Christine Chin, Jun Lu, David G. Kirsch, Todd R. Golub, Tyler Jacks. A Dicer1 haploinsufficient tumorszuppresszorként működik  // Genes & Dev. - 2009. - T. 23 . - S. 2700-2704 .
  93. ↑ PV Maillard, C. Ciaudo, A. Marchais, Y. Li, F. Jay, SW Ding és Olivier Voinnet (2013): Antiviral RNA Interference in Mammalian Cells. Science, 342(6155), 235-238 doi : 10.1126/science.1241930
  94. ↑ Yang Li, Jinfeng Lu, Yanhong Han, Xiaoxu Fan és Shou-Wei Ding (2013): RNS interferencia funkciója vírusellenes immunitási mechanizmusként emlősökben" Science 342 (6155), 231-234 doi : 10.1121241912121
  95. ↑ Li H., Ding S. Antiviral silenceing in animals  //  FEBS Lett : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 579 , sz. 26 . - P. 5965-5973 . - doi : 10.1016/j.febslet.2005.08.034 . — PMID 16154568 .
  96. ↑ Carrington J., Ambros V. MikroRNS-ek szerepe a növények és állatok fejlődésében   // Science . - 2003. - 1. évf. 301 , sz. 5631 . - P. 336-338 . - doi : 10.1126/tudomány.1085242 . — PMID 12869753 .
  97. ↑ Lee R., Feinbaum R., Ambros V. A C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNSs with antisense komplementarity to lin-14  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 1993. - Vol. 75 , sz. 5 . - P. 843-854 . - doi : 10.1016/0092-8674(93)90529-Y . — PMID 8252621 .
  98. ↑ Palatnik J., Allen E., Wu X., Schommer C., Schwab R., Carrington J., Weigel D. Control of leaf morphogenesis by microRNAs   // Nature . - 2003. - 1. évf. 425 , sz. 6955 . - 257-263 . o . - doi : 10.1038/nature01958 . — PMID 12931144 .
  99. ↑ Zhang B., Pan X., Cobb G., Anderson T. Növényi mikroRNS: kis szabályozó molekula nagy hatással  //  Dev Biol : folyóirat. - 2006. - Vol. 289. sz . 1 . - P. 3-16 . - doi : 10.1016/j.ydbio.2005.10.036 . — PMID 16325172 .
  100. ↑ Jones-Rhoades M., Bartel D., Bartel B. MicroRNAS and their regulatory roles in plants  // Annu Rev Plant Biol  : Journal  . - 2006. - Vol. 57 . - P. 19-53 . - doi : 10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218 . — PMID 16669754 .
  101. ↑ Zhang B., Pan X., Cobb G., Anderson T. mikroRNS-ek mint onkogének és tumorszuppresszorok  //  Dev Biol : folyóirat. - 2007. - Vol. 302 , sz. 1 . - P. 1-12 . - doi : 10.1016/j.ydbio.2006.08.028 . — PMID 16989803 .
  102. ↑ Ellenőrizze az E. RNS interferencia: a bekapcsoló gomb megnyomása   // Természet . - 2007. - Vol. 448 , sz. 7156 . - P. 855-858 . - doi : 10.1038/448855a . — PMID 17713502 .
  103. ↑ Li LC, Okino ST, Zhao H. et al. A kis dsRNS-ek transzkripciós aktiválást indukálnak az emberi sejtekben  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States  : Journal. - 2006. - Vol. 103 , sz. 46 . - P. 17337-17342 . - doi : 10.1073/pnas.0607015103 . — PMID 17085592 .
  104. ↑ 1 2 3 Cerutti H., Casas-Mollano J. Az RNS-közvetített elnémítás eredetéről és funkcióiról: protistáktól az emberig  //  Curr Genet : folyóirat. - 2006. - Vol. 50 , sz. 2 . - 81-99 . o . - doi : 10.1007/s00294-006-0078-x . — PMID 16691418 .
  105. ↑ 1 2 Anantharaman V., Koonin E., Aravind L. Az RNS-anyagcserében részt vevő fehérjék összehasonlító genomikája és evolúciója  //  Nucleic Acids Res : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 30 , sz. 7 . - P. 1427-1464 . doi : 10.1093 / nar/30.7.1427 . — PMID 11917006 .
  106. ↑ Buchon N., Vaury C. RNAi: defensive RNA-silencing against viruses and transposable elements  (fr.)  // Heredity : magazin. - 2006. - Vol. 96 , n o 2 . - P. 195-202 . - doi : 10.1038/sj.hdy.6800789 . — PMID 16369574 .
  107. ↑ Obbard D., Jiggins F., Halligan D., Little T. A természetes szelekció rendkívül gyors evolúciót eredményez az antivirális RNSi génekben  // Curr Biol  : Journal  . - 2006. - Vol. 16 , sz. 6 . - P. 580-585 . - doi : 10.1016/j.cub.2006.01.065 . — PMID 16546082 .
  108. ↑ Voorhoeve PM, Agami R. A Knockdown feláll  // Trends Biotechnol  . : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 21 , sz. 1 . - P. 2-4 . - doi : 10.1016/S0167-7799(02)00002-1 . — PMID 12480342 .
  109. ↑ Naito Y., Yamada T., Matsumiya T., Ui-Tei K., Saigo K., Morishita S.  dsCheck : nagyon érzékeny off-target keresőszoftver kétszálú RNS-közvetített RNS interferenciához  // Nucleic Acids Res : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 33 , sz. Webszerver probléma . —P.W589-91 . _ doi : 10.1093 / nar/gki419 . — PMID 15980542 .
  110. ↑ Henschel A., Buchholz F., Habermann B. DEQOR: web-alapú eszköz siRNS-ek tervezésére és minőségellenőrzésére   // Nucleic Acids Res : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 32 , sz. Webszerver probléma . —P.W113—20._ _ _ doi : 10.1093 / nar/gkh408 . — PMID 15215362 .
  111. ↑ Naito Y., Yamada T., Ui-Tei K., Morishita S., Saigo K. siDirect: rendkívül hatékony, célspecifikus siRNS-tervező szoftver emlősök RNS-interferenciájához  //  Nucleic Acids Res : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 32 , sz. Webszerver probléma . —P.W124—9 ._ _ doi : 10.1093 / nar/gkh442 . — PMID 15215364 .
  112. ↑ Naito Y., Ui-Tei K., Nishikawa T., Takebe Y., Saigo K. siVirus: web-alapú antivirális siRNS tervezőszoftver erősen eltérő vírusszekvenciákhoz  //  Nucleic Acids Res : folyóirat. - 2006. - Vol. 34 , sz. Webszerver probléma . —P.W448-50 . _ doi : 10.1093 / nar/gkl214 . — PMID 16845046 .
  113. ↑ Reynolds A., Anderson E., Vermeulen A., Fedorov Y., Robinson K., Leake D., Karpilow J., Marshall W., Khvorova A. Induction of the interferon response by siRNS is cell type- and duplex long -függő  (angol)  // RNS : napló. - 2006. - Vol. 12 , sz. 6 . - P. 988-993 . - doi : 10.1261/rna.2340906 . — PMID 16611941 .
  114. ↑ Stein P., Zeng F., Pan H., Schultz R. A hosszú kettős szálú RNS által kiváltott RNS interferencia nem specifikus hatásainak hiánya egér oocitákban  //  Dev Biol : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 286. sz . 2 . - P. 464-471 . - doi : 10.1016/j.ydbio.2005.08.015 . — PMID 16154556 .
  115. ↑ Brummelkamp T., Bernards R., Agami R. A rendszer a rövid interferáló RNS-ek stabil expressziójához emlőssejtekben  //  Science : Journal. - 2002. - 20. évf. 296. sz . 5567 . - P. 550-553 . - doi : 10.1126/science.1068999 . — PMID 11910072 .
  116. ↑ Tiscornia G., Tergaonkar V., Galimi F., Verma I. CRE rekombinázzal indukálható RNS interferencia  lentivírus vektorok  által közvetített // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - 2004. - 20. évf. 101 , sz. 19 . - P. 7347-7351 . - doi : 10.1073/pnas.0402107101 . — PMID 15123829 .
  117. ↑ Ventura A., Meissner A., ​​​​Dillon C., McManus M., Sharp P., Van Parijs L., Jaenisch R , Jacks T. Cre-lox-regulated feltételes RNS interferencia a transzgénekből  //  Proceedings of the National Az Amerikai Egyesült Államok Tudományos Akadémiája  : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 101 , sz. 28 . - P. 10380-10385 . - doi : 10.1073/pnas.0403954101 . — PMID 15240889 .
  118. ↑ Gilbert, LA, Larson, MH, Morsut, L., et al. & Qi, LS (2013) CRISPR-mediált moduláris RNS-vezérelt transzkripció szabályozása eukariótákban . Cell, 154(2), 442-451 doi: 10.1016/j.cell.2013.06.044
  119. ↑ Brock T., Browse J., Watts J. A C. elegans telítetlen zsírsav-összetételének genetikai szabályozása  //  PLoS Genet : folyóirat. - 2006. - Vol. 2 , sz. 7 . — P.e108 . - doi : 10.1371/journal.pgen.0020108 . — PMID 16839188 . Az eredetiből archiválva : 2008. február 22.
  120. ↑ Kamath R., Ahringer J. Genome-wide RNAi screening in Caenorhabditis elegans  (neopr.)  // Methods. - 2003. - T. 30 , 4. sz . - S. 313-321 . - doi : 10.1016/S1046-2023(03)00050-1 . — PMID 12828945 .
  121. ↑ Boutros M., Kiger A., ​​Armknecht S., Kerr K., Hild M., Koch B., Haas S., Paro R., Perrimon N. Genome-wide RNAi analysis of growth and viability in Drosophila cells  .)  // Tudomány: folyóirat. - 2004. - 20. évf. 303 , sz. 5659 . - P. 832-835 . - doi : 10.1126/tudomány.1091266 . — PMID 14764878 .
  122. ↑ Fortunato A., Fraser A. A Caenorhabditis elegans genetikai kölcsönhatásainak feltárása RNS-interferenciával  //  Biosci Rep: folyóirat. - 2005. - 20. évf. 25 , sz. 5-6 . - P. 299-307 . - doi : 10.1007/s10540-005-2892-7 . — PMID 16307378 .
  123. ↑ Cullen L., Arndt G. A génfunkciók genomra kiterjedő szűrése RNSi segítségével emlőssejtekben  //  Immunol Cell Biol : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 83 , sz. 3 . - P. 217-223 . - doi : 10.1111/j.1440-1711.2005.01332.x . — PMID 15877598 .
  124. ↑ Huesken D., Lange J., Mickanin C., Weiler J., Asselbergs F., Warner J., Meloon B., Engel S., Rosenberg A., Cohen D., Labow M., Reinhardt M., Natt F., Hall J. Egy genomra kiterjedő siRNS-könyvtár tervezése mesterséges neurális hálózat segítségével  // Nature Biotechnology  : Journal  . - Nature Publishing Group , 2005. - Vol. 23 , sz. 8 . - P. 995-1001 . - doi : 10.1038/nbt1118 . — PMID 16025102 .
  125. ↑ Ge G., Wong G., Luo B. Az siRNS leütési hatékonyságának előrejelzése mesterséges neurális hálózati modellek segítségével  // Biochem  Biophys Res Commun : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 336. sz . 2 . - P. 723-728 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2005.08.147 . — PMID 16153609 .
  126. ↑ Janitz M., Vanhecke D., Lehrach H. High-throughput RNA interference  infunctional genomics //  Handb Exp Pharmacol : Journal. - 2006. - Vol. 173 . - P. 97-104 . - doi : 10.1007/3-540-27262-3_5 . — PMID 16594612 .
  127. ↑ Vanhecke D., Janitz M. Funkcionális genomika nagy áteresztőképességű RNS-interferenciával  // Drug Discov  Today : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 10 , sz. 3 . - P. 205-212 . - doi : 10.1016/S1359-6446(04)03352-5 . — PMID 15708535 .
  128. ↑ Geldhof P., Murray L., Couthier A., ​​Gilleard J., McLauchlan G., Knox D., Britton C. Az RNS interferencia hatékonyságának tesztelése Haemonchus contortusban  // International  Journal for Parasitology : folyóirat. - Elsevier , 2006. - Vol. 36 , sz. 7 . - P. 801-810 . - doi : 10.1016/j.ijpara.2005.12.004 . — PMID 16469321 .
  129. ↑ Geldhof P., Visser A., ​​​​Clark D., Saunders G., Britton C., Gilleard J., Berriman M., Knox D. RNS interferencia parazita helmintákban: jelenlegi helyzet , lehetséges buktatók és jövőbeli kilátások   // Parazitológia: folyóirat. - 2007. - Vol. 134 . - P. 1-11 . - doi : 10.1017/S0031182006002071 . — PMID 17201997 .
  130. ↑ Travella S., Klimm T., Keller B. Az RNS-interferencia-alapú géncsendesítés mint hatékony eszköz a funkcionális genomikához hexaploid kenyérbúzában  // Plant Physiology  : Journal  . - American Society of Plant Biologists , 2006. - Vol. 142. sz . 1 . - P. 6-20 . - doi : 10.1104/pp.106.084517 . — PMID 16861570 .
  131. ↑ McGinnis K., Chandler V., Cone K., Kaeppler H., Kaeppler S., Kerschen A., Pikaard C., Richards E., Sidorenko L., Smith T., Springer N., Wulan T. Transgene- indukált RNS interferencia, mint a növényi funkcionális genomika eszköze  // Methods Enzymol  :  Journal. - 2005. - 20. évf. 392 . - P. 1-24 . - doi : 10.1016/S0076-6879(04)92001-0 . — PMID 15644172 .
  132. ↑ Paddison P., Caudy A., Hannon G. A génexpresszió stabil elnyomása RNSi által emlőssejtekben  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 2002. - 20. évf. 99 , sz. 3 . - P. 1443-1448 . - doi : 10.1073/pnas.032652399 . — PMID 11818553 .
  133. ↑ Sah D. Az RNS interferencia terápiás lehetősége neurológiai rendellenességek esetén  // Life  Sci : folyóirat. - 2006. - Vol. 79 , sz. 19 . - P. 1773-1780 . - doi : 10.1016/j.lfs.2006.06.011 . — PMID 16815477 .
  134. ↑ Zender L., Hutker S., Liedtke C., Tillmann H., Zender S., Mundt B., Waltemathe M., Gosling T., Flemming P., Malek N., Trautwein C., Manns M., Kuhnel F., Kubicka S. A kaszpáz 8 kis interferáló RNS megakadályozza az akut májelégtelenséget egereknél  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - 2003. - 1. évf. 100 , nem. 13 . - P. 7797-7802 . - doi : 10.1073/pnas.1330920100 . — PMID 12810955 .
  135. ↑ Jiang M., Milner J. A virális génexpresszió szelektív elnémítása siRNS-sel, az RNS-  interferencia primerével kezelt HPV-pozitív humán cervicalis carcinoma sejtekben //  Onkogén : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 21 , sz. 39 . - P. 6041-6048 . - doi : 10.1038/sj.onc.1205878 . — PMID 12203116 .
  136. ↑ Crowe S. A kemokin receptor expressziójának RNS-interferenciával történő elnyomása lehetővé teszi a HIV-1 replikáció gátlását, Martínez és munkatársai  //  AIDS : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 17 4. melléklet . - P.S103-5 . — PMID 15080188 .
  137. ↑ Kusov Y., Kanda T., Palmenberg A., Sgro J., Gauss-Müller V. Hepatitis A vírus fertőzésének elhallgatása kis interferáló RNS  -ekkel // J  Virol : folyóirat. - 2006. - Vol. 80 , sz. 11 . - P. 5599-5610 . - doi : 10.1128/JVI.01773-05 . — PMID 16699041 .
  138. ↑ Jia F., Zhang Y., Liu C. Retrovírus-alapú rendszer a hepatitis B vírus génjeinek stabil elhallgatására RNS-interferenciával  // Biotechnol  Lett : folyóirat. - 2006. - Vol. 28 , sz. 20 . - P. 1679-1685 . - doi : 10.1007/s10529-006-9138-z . — PMID 16900331 .
  139. ↑ Li Y., Kong L., Cheng B., Li K. Influenza vírus siRNS expressziós vektorok építése és gátló hatásaik az influenzavírus szaporodására  //  Avian Dis : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 49 , sz. 4 . - P. 562-573 . - doi : 10.1637/7365-041205R2.1 . — PMID 16405000 .
  140. ↑ Hu L., Wang Z., Hu C., Liu X., Yao L., Li W., Qi Y. Inhibition of Measles virus multiplication in cell culture by RNA interference  //  Acta Virol : Journal. - 2005. - 20. évf. 49 , sz. 4 . - P. 227-234 . — PMID 16402679 .
  141. ↑ Raoul C., Barker S., Aebischer P. A neurodegeneratív betegségek vírusalapú modellezése és korrekciója RNS-interferenciával  //  Gene Ther : folyóirat. - 2006. - Vol. 13 , sz. 6 . - P. 487-495 . - doi : 10.1038/sj.gt.3302690 . — PMID 16319945 .
  142. ↑ Putral L., Gu W., McMillan N. RNS interferencia a rák kezelésére  (neopr.)  // Drug News Perspect. - 2006. - T. 19 , 6. sz . - S. 317-324 . - doi : 10.1358/dnp.2006.19.6.985937 . — PMID 16971967 .
  143. ↑ Izquierdo M. Rövid interferáló RNS-ek, mint a rák génterápiájának eszköze  //  Cancer Gene Ther : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 12 , sz. 3 . - 217-227 . o . - doi : 10.1038/sj.cgt.7700791 . — PMID 15550938 .
  144. ↑ Li C., Parker A., ​​​​Menocal E., Xiang S., Borodyansky L., Fruehauf J. RNS interferencia   szállítása // Cell Cycle : folyóirat. - 2006. - Vol. 5 , sz. 18 . - P. 2103-2109 . — PMID 16940756 .
  145. ↑ Takeshita F., Ochiya T. Az RNS interferencia terápiás lehetősége a rák ellen  //  Cancer Sci : folyóirat. - 2006. - Vol. 97 , sz. 8 . - 689-696 . o . - doi : 10.1111/j.1349-7006.2006.00234.x . — PMID 16863503 .
  146. ↑ Tong A., Zhang Y., Nemunaitis J. Small interfering RNA for experimental cancer therapy  (angol)  // Current Opinion in Molecular Therapeutics  : Journal. - 2005. - 20. évf. 7 , sz. 2 . - 114-124 . o . — PMID 15844618 .
  147. ↑ Grimm D., Streetz K., Jopling C., Storm T., Pandey K., Davis C., Marion P., Salazar F., Kay M. Egerek halálozása a celluláris mikroRNS/short hairpin RNA pathways túltelítettsége miatt  (angol)  // Természet  : folyóirat. - 2006. - Vol. 441 , sz. 7092 . - P. 537-541 . - doi : 10.1038/nature04791 . — PMID 16724069 .
  148. ↑ Tehát C. Wong, Jason J. Klein, Holly L. Hamilton et al. és David L. Lewis (2012) Egy célzott, reverzibilisen maszkolt endoszomolitikus polimer együttes injektálása drámaian javítja a koleszterinnel konjugált kis interferáló RNS-ek hatékonyságát in vivo. Nucleic Acid Therapeutics., 22(6): 380-390. doi:10.1089/nat.2012.0389
  149. ↑ Berkhout, B; ter Brake, O. RNAi génterápia a HIV-1 fertőzés ellenőrzésére // RNS interferencia és vírusok : Jelenlegi innovációk és jövőbeli trendek  . – Caister Academic Press, 2010. - ISBN 978-1-904455-56-1 .
  150. ↑ Sunilkumar G., Campbell L., Puckhaber L., Stipanovic R., Rathore K. Gyapotmag tervezése emberi táplálkozásban a toxikus gosszipol szövetspecifikus csökkentésével   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : folyóirat. - 2006. - Vol. 103 , sz. 48 . - P. 18054-18059 . - doi : 10.1073/pnas.0605389103 . — PMID 17110445 .
  151. ↑ Siritunga D., Sayre R. Ciánmentes transzgenikus manióka  (neopr.) generálása  // Planta. - 2003. - T. 217 , 3. sz . - S. 367-373 . - doi : 10.1007/s00425-003-1005-8 . — PMID 14520563 .
  152. ↑ Le L., Lorenz Y., Scheurer S., Fötisch K., Enrique E., Bartra J., Biemelt S., Vieths S., Sonnewald U. Design of tomato fruits withduced allergenity by dsRNAi-mediated inhibition of ns -LTP (Lyc e 3) kifejezés  (angol)  // Plant Biotechnol J : folyóirat. - 2006. - Vol. 4 , sz. 2 . - P. 231-242 . - doi : 10.1111/j.1467-7652.2005.00175.x . — PMID 17177799 .
  153. ↑ Gavilano L., Coleman N., Burnley L., Bowman M., Kalengamaliro N., Hayes A., Bush L., Siminszky B. A Nicotiana tabacum géntechnológiája csökkentett nornikotintartalomért  // J Agric  Food : folyóirat. - 2006. - Vol. 54 , sz. 24 . - P. 9071-9078 . - doi : 10.1021/jf0610458 . — PMID 17117792 .
  154. ↑ Allen R., Millgate A., Chitty J., Thisleton J., Miller J., Fist A., Gerlach W., Larkin P. A morfium RNAi által közvetített helyettesítése a nonnarcotic alkaloid reticuline-nal ópiummákban   // Nature Biotechnology  : folyóirat. - Nature Publishing Group , 2004. - Vol. 22 , sz. 12 . - P. 1559-1566 . - doi : 10.1038/nbt1033 . — PMID 15543134 .
  155. ↑ Zadeh A., Foster G. Transzgénikus rezisztencia a dohánygyűrűs  foltvírussal szemben (neopr.)  // Acta Virol. - 2004. - T. 48 , 3. sz . - S. 145-152 . — PMID 15595207 .
  156. ↑ Niggeweg R., Michael A., Martin C. Mérnöki üzemek megnövekedett antioxidáns klorogénsavszinttel  // Nature Biotechnology  : Journal  . - Nature Publishing Group , 2004. - Vol. 22 , sz. 6 . - P. 746-754 . - doi : 10.1038/nbt966 . — PMID 15107863 .
  157. ↑ Sanders R., Hiatt W. A paradicsom transzgén szerkezete és elnémítása  // Nature Biotechnology  : Journal  . - Nature Publishing Group , 2005. - Vol. 23 , sz. 3 . - 287-289 . o . - doi : 10.1038/nbt0305-287b . — PMID 15765076 .
  158. ↑ Chiang C., Wang J., Jan F., Yeh S., Gonsalves D. Rekombináns papaya ringspot vírusok összehasonlító reakciói kiméra köpenyfehérje (CP) génekkel és vad típusú vírusokkal CP-transzgénikus   papayán // Journal of General Virológia : folyóirat. — Mikrobiológiai Társaság, 2001. - 20. évf. 82 , sz. Pt 11 . - P. 2827-2836 . — PMID 11602796 .
  159. ↑ Abdurakhmonov IY, Buriev ZT, Saha S, Jenkins JN, Abdukarimov A, Pepper AE. 2014. A pamut PHYA1 RNAi javítja a gyapot (Gossypium hirsutum L) fő rostminőségét és agronómiai tulajdonságait. Nature Communications 4:3062; DOI:10. 1038/ncomms4062

Irodalom

Linkek

  Ugrás a Wikidata elemre  Szótárak és enciklopédiák
Bibliográfiai katalógusokban