Haplocsoport R (mtDNS)

Az R haplocsoport  egy humán mitokondriális DNS haplocsoport .

Eredet

Az R haplocsoport az N makrocsoport leszármazottja, és ősisége, elterjedési szélessége és leszármazott csoportjainak száma alapján maga is makrocsoportnak nevezhető. Valószínűleg a Közel-Keletről származik, röviddel (csak néhány ezer évvel) azután, hogy az emberek betelepítették (kb. 55 ezer évvel ezelőtt). Később ebből a vidékről terjeszkedés történt, így az R csoport hordozói (gyakran az N csoport más alkládjaival együtt) elterjedtek: délre Arábiába és Északkelet-Afrikába , keletre az Iráni-fennsík mentén , tovább Közép-Ázsiába Altajig . és Hindusztán , északon Anatóliába , a Kaukázusba és tovább Kelet - Európába .

Az R5, R6 , R7 , R8, R30, R31 alkládok őshonos haplocsoportok Indiában. A Közép-Ázsiára vonatkozó adathalmazban (Comas et al. 2004) a 232 leszármazási vonalból csak 2 tartozik az R5-höz [1] .

Ennek a csoportnak a leszármazottai közé tartozik B , UK (és leszármazottai U és K ), F , R0 (és leszármazottai HV , H és V ), valamint pre-JT (és leszármazottai JT , J és T ).

Paleogenetika

Az R* mitokondriális haplocsoportot egy 45 ezer évvel ezelőtt élt Ust-Ishimből ( Ust-Ishim man ) származó paleoszibériai emberben fedezték fel [2] , de 2016-ban Poznik csapata Ust-Ishimben osztályozta az U* mitokondriális haplocsoportot [3] ] .

Az R haplocsoportot a bulgáriai Bacho Kiro barlangból származó késő paleolit ​​CC7-2289 mintában (kb. 44 ezer évvel ezelőtt) határozták meg [4]

Az R* haplocsoport a Fumane-barlangból ( ez: Grotta di Fumane ) származó tejfog mitokondriális genomját tartalmazza , amely egy 41 110-38 500 éves rétegben (proto-aurignacián) található [5] .

Az olaszországi Paglichci barlangból származó , mintegy 28 ezer éves Paglichci 23 ( en: Paglicci 23 ) lány maradványainál megtalálták a Cambridge-i referenciaszekvenciát ( en: Cambridge Reference Sequence ) HVR1, ami azt jelzi, hogy az egyén vagy a mitokondriális haplocsoport R vagy mitokondriális haplocsoport H [6] . A mintegy 24 ezer évvel ezelőtt élt Cro-Magnon Paglicci-12 DNS-ének elemzése kimutatta, hogy az R mitokondriális haplocsoporthoz tartozik [7] .

Az R1b alkládot az Afontova-hegy AG-3 lakójánál találták meg, aki 16 930–16 490 évvel ezelőtt élt.

Az R1-et a Khaiyrgas-barlangból (Khaiyrgas Cave, Dyuktai kultúra) származó yak025 (Kr.e. 14865-14590) mintában határozták meg [ 8 ] . A jakutföldi Khaiyrgas-1 mintában (16,9 ezer évvel ezelőtt) R1b-t határoztak meg [9] .

Az R9c1b-t egy Qihe3 mintában (11 747–11 356 évvel ezelőtt ) azonosították a kínai Fujian tartományból [10] .

Az R2-a*-t az iráni Tepe Abdul Hosein (Shahrestan Nurabad ) AH2 mintájában (Kr. e. 8205-7756) azonosították [11] .

Az R11 -et [12] az Amur régióból ( Kína ) származó NE35 mintában (AR8.9K, ARpost9K, 9131-8770 évvel ezelőtt ) határozták meg [13] .

Az R3 a magyarországi neolitikum egy képviselőjében található , aki kb. 7500 évvel ezelőtt [14] .

Az R1b-t a Déli Szarvas-sziget egy mezolitikus lakosánál azonosították [15] .

Az R1a-t az I2055 (Unakozovskaya, 6533 évvel ezelőtt) és az I2056 (Unakozovskaya, 6477,5 éve) eneolitikus példányokon határozták meg az Észak-Kaukázusból (Unakozovsky-barlang a Meshoko-pataknál) [16] .

Az R1b1-et az észt harci fejsze kultúra SOP002 (Kr. e. 2864–2495) képviselőjétől azonosították az Ida-Viru megyei Sope temetőből [17] .

Az R1a-t az adygeai Klady traktusból származó I6268 Maikop-kultúra Novosvobodnensky szakaszának (5564 évvel ezelőtt) egy képviselőjében azonosították [16] .

Az R1a1a-t az Észak-Kaukázusból (Marinskaya 5, 4710 évvel ezelőtt) származó MK5009.A0101 példányban határozták meg [16] .

Az R1b1-et a glazkovói (Glazkovskoe predmestie) GLZ003 mintában határozták meg, 4519–4417 évvel ezelőtt. n. (A Bajkál kora bronzkora) [18] .

Az R1a-t a késő eneolitikum Darkveti-Meshokovskaya kultúra (gyöngykerámia) képviselői között azonosították [19] .

Az R1b-t a transzbaikáliai Anosovo-1 bronzkori példányból határozták meg (kb. 4 ezer évvel ezelőtt) [9] .

Az R1b-t a katakomba utáni Lolin kultúra NV3001 (Nevinnomiskiy 3, 3970,5 évvel ezelőtt) képviselőjében azonosították Kalmykiában ( Lola ) [16] .

Az R1b1-et a BIY002.A0101 mintában (Kr. e. 3–2. század, Sargat horizont) azonosították az Isim folyó Gornaja Bitija traktusából, Nyizsnyaja Iljinka (Omszki régió) falutól 8 km-re délnyugatra [20] .

Az R1b1-et a Tarim L5213 múmiában azonosították (2000–1800 évvel ezelőtt) [21] .

Az R11 -et [12] a KHI001 (közép-késő bronzkor) besorolatlan példányban találták meg a kelet-eurázsiai sztyeppéről Altájból [22] .

Az R1a-t a Tell-Atchan ( Alalakh , Törökország) ALA135 (Kr.e. 1876-1636) mintájában határozták meg [23] .

Az R1b1-et a Cseh Köztársaságból származó Unetice kultúra képviselőinél azonosították I14191 (Czech_EBA_Unetice, 3850 évvel ezelőtt) [24] .

Az R1b1-et a kazahsztáni közép-késő bronzkori (Oy_Dzhaylau_MLBA_o) I3860-as példányban (Oy-Dzhaylau III, 3626 éve) találták [25] .

Az R9b1a3-at a LayiKD01 mintában (1532–1403 évvel ezelőtt), az R9b1b-t a Kínából (Guangxi Zhuang Autonóm Régió) származó QinchangKD14 mintában (1545–1407 évvel ezelőtt) azonosították [10] .

Az R1a1a-t a Kanagegh temetőből (Kanagegh, Örményország) származó mintában találták meg, amely időszámításunk előtt 1500-1300 között volt [26] .

Az R1b1-et Nerkin Getashen (Nerqin Getashen, Örményország) lakójában találták meg, aki ie 1400-1200 között élt [26] .

Az R2 és R5 mitokondriális haplocsoportokat a középső Elam időszak Haft-Tape régiójából származó mintákban azonosították [27] .

Az R6-ot a kobani kultúra egy képviselőjében azonosították a Zayukovo-3 temetkezési helyről, Zayukovo falu közelében , a Kabard-Balkár Köztársaság Baksan régiójában (Kr. e. VIII-VI. század) [28] .

Az R9-et Yunnanból származó függő koporsók mintájából határozták meg [29] .

Az R30-at egy 40-50%-os dél-ázsiai adalékanyaggal rendelkező személyben határozták meg az Angkor Borei-i ( Kambodzsa ) Wat Komnou (Vat Komnou) temetőjéből, aki az 1. évezred elején élt (95%-os konfidencia intervallum - 78- 234, kalibrált dátum) [30] .

Az R0a1-et az észak-szudáni Kulubnarti szigetén található R keresztény temető (~650-1000) példányaiban határozták meg [31] .

Az R11a-t a Mongóliából származó késő középkori DEC01/SHR001 példányban találták meg [22] .

Az R1a1a-t a trondheimi VK114 norvég példányban találták meg (XII-XIII. század) [32] .

Az R9b1b-t a HuatuyanNL18 mintában (500 évvel ezelőtt), az R+16189-et a HuatuyanNL19 mintában (455–294 évvel ezelőtt) határozták meg Kínából (Guangxi Zhuang Autonóm Region) [10] .

Jegyzetek

1. ↑ Malliya gounder Palanichamy et al. Az indiai mitokondriális DNS makrohaplocsoport N törzsfejlődése, teljes szekvenálás alapján: implikációk Dél-Ázsia népére Archiválva : 2021. május 5., a Wayback Machine , 2004. december
2. ↑ KIEGÉSZÍTŐ INFORMÁCIÓK 8. MITOKONDRIÁLIS GENOM ELEMZÉS . Letöltve: 2014. október 23. Az eredetiből archiválva : 2016. március 24.. (határozatlan)
3. ↑ Posnik GD et al. (2016) Punctuated bursts in human male demographer 1244 világméretű Y-kromoszóma szekvenciából következtetve Archiválva : 2017. május 28., a Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593–599 (Poznik supp. 15. ábra).
4. ↑ Jean-Jacques Hublin et al. Kezdeti felső paleolit ​​Homo sapiens a Bacho Kiro-barlangból, Bulgáriából Archiválva 2020. június 19-én a Wayback Machine -nél , 2020. május 11.
5. ↑ Paleogenetikai adatok megerősítették, hogy a proto-aurignaci kultúra alkotói modern emberek voltak Archiválva : 2015. április 29., a Wayback Machine , 2015.04.27.
6. ↑ Egy 28 000 éves Cro-Magnon mtDNS szekvencia különbözik az összes potenciálisan szennyező modern szekvenciától
7. ↑ Ősi DNS . Hozzáférés dátuma: 2015. február 1. Az eredetiből archiválva : 2015. április 23. (határozatlan)
8. ↑ Gülşah Merve Kılınç et al. A holocén emberi populáció történetének vizsgálata Észak-Ázsiában ősi mitogenomok segítségével Archiválva : 2020. július 31., a Wayback Machine , 2018. június 12. // 1. adatkészlet / S4 táblázat
9. ↑ 1 2 Gülşah Merve Kılınç et al. Az emberi populáció dinamikája és a Yersinia pestis az ősi Északkelet-Ázsiában Archiválva : 2021. június 17., a Wayback Machine , 2021
10. ↑ 1 2 3 Tianyi Wang et al. Az emberi populáció története Kelet- és Délkelet-Ázsia találkozásánál 11 000 évvel ezelőtt // Cell, 2021. június 24.
11. ↑ Broushaki F. et al. (2016 július). "Korai neolitikus genomok a keleti termékeny félholdról" . tudomány . 353 (6298). doi : 10.1126/science.aaf7943 . PMC  5113750 . PMID  27417496 . Archiválva az eredetiből, ekkor: 2020-02-22 . Letöltve: 2021-05-30 . Elavult használt paraméter |deadlink=( help );Ellenőrizze a dátumot itt: |date=( súgó angolul )
12. ↑ 12 R11 MTfa
13. ↑ Xiaowei Mao et al. Észak-Kelet-Ázsia mély népesedéstörténete a késő pleisztocéntől a holocénig Archiválva : 2021. június 28., a Wayback Machine , 2021. május 27.
14. ↑ Fu. Q. et al. Az Ice Age Europe genetikai története , Nature, 2016. május 2-án, online.
15. ↑ Alissa Mittnik et al. Észak-Európa genetikai története archiválva : 2017. április 25. a Wayback Machine -nél , 2017.03.03.
16. ↑ 1 2 3 4 Chuan-Chao Wang et al. A Nagy-Kaukázus genetikai előtörténete archiválva : 2020. május 9., a Wayback Machine , 2018. május 16.
17. ↑ Lehti Saag, Szergej V. Vasziljev, Szvetlana V. Osibkina és társai. Genetikai ősi változások a kő-bronzkor átmenetben a kelet-európai síkságon Archivált 2021. január 23-án a Wayback Machine -nél (1. táblázat), 2020. július 03-án ( bioRxiv archiválva 2021. január 30 -án a Wayback Machine - nél
18. ↑ He Yu et al. A paleolitikumtól a bronzkorig terjedő szibériai kapcsolatok felfedik az első amerikaiakkal és Eurázsia-szerte fennálló kapcsolatokat Archiválva 2020. július 2-án a Wayback Machine -nél , 2020. május 20.
19. ↑ Chuan-Chao Wang et al. A Nagy-Kaukázus genetikai őstörténete Archiválva : 2018. május 18., a Wayback Machine , 2018. május 16.
20. ↑ Guido Alberto Gnecchi-Ruscone et al. A közép-ázsiai sztyeppről származó ősi genomiális időtranszect feltárja a szkíták történetét Archiválva 2021. augusztus 18-án a Wayback Machine -nél // Science Advances. Vol. 7. szám, 13. szám, 2021. május 26
21. ↑ Kibővített adatok 1. táblázat A tanulmányban közölt bronzkori hszincsiangi személyek összefoglalása Archiválva : 2021. október 29. a Wayback Machine -nél . Feladó: Fan Zhang et al. A bronzkori Tarim-medencei múmiák genomi eredete Archiválva : 2021. október 30. a Wayback Machine -nél // Nature, 2021
22. ↑ 1 2 Choongwon Jeong et al. Eurázsia keleti sztyeppének dinamikus, 6000 éves genetikai története archiválva 2020. november 3-án a Wayback Machine -nél , 2020
23. ↑ Tara Ingman et al. Emberi mobilitás Tell Atchanában (Alalakh), Hatay, Törökország a Kr.e. 2. évezredben: Izotópos és genomikai bizonyítékok integrációja Archiválva 2022. május 24-én a Wayback Machine -nél // Plos One, 2021. június 30.
24. ↑ Nick Patterson et al. Nagy léptékű migráció Nagy-Britanniába a középső és késő bronzkor során Archiválva 2022. január 1-én a Wayback Machine -nél // Nature, 2021. december 22.
25. ↑ Vagheesh M. Narasimhan et al. Az emberi populációk kialakulása Dél- és Közép-Ázsiában  (angol)  // Tudomány. — 2019-09-06. — Vol. 365 , iss. 6457 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.aat7487 . Archiválva az eredetiből 2021. április 4-én. ( The Genomic Formation of South and Central Asia, bioRxiv archiválva 2021. március 17-én a Wayback Machine -nél )
26. ↑ 1 2 Margaryan, Derenko et al. Nyolc évezredes matrilineális genetikai folytonosság a Dél- Kaukázusban
27. ↑ ت lf توالی dna میوکوک icles (mtDNA) وقای ا icles ی دوره‌ی ایلام inct محوه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی hef تالی & ‌ ‌ ‌ ‌ ‌ ‌ ‌ ‌ ‌ ‌ ‌ ‌. Letöltve: 2020. március 21. Az eredetiből archiválva : 2020. március 21. (határozatlan)
28. ↑ Eugenia Boulygina et al. Az észak-kaukázusi történelem előtti kobani kultúra mitokondriális és Y-kromoszóma sokfélesége , 2020
29. ↑ Xiaoming Zhang et al. Egy függő koporsó matrilineális genetikai perspektívája Dél-Kínában és Észak-Thaiföldön , április 24., 20.
30. ↑ Piya Changmai et al. A Kambodzsa prototörténeti korszakából származó ősi DNS azt jelzi, hogy a dél-ázsiaiak már az i.sz. 1-3. században keveredtek a helyi lakossággal , 2022. július 5.
31. ↑ Kendra A. Sirak et al. Társadalmi rétegződés genetikai differenciálódás nélkül Kulubnarti helyén a keresztény periódusban Núbiában Archiválva 2021. március 6-án a Wayback Machine -nél , 2021. február 17-én ( kiegészítő 5., 6. ábra Archivált 2021. október 23-án a Wayback Machine -nél )
32. ↑ Ashot Margaryan et al. A viking világ populációs genomikája archiválva 2020. február 12-én a Wayback Machine -nél , 2019

Lásd még

Linkek

Általános információk

• Ian Logan mitokondriális DNS -helye
• PhyloTree.org – mtDNS-fa 17. Build (2016. február 18.): részfa R
• R YFull MTree 1.02.00 (építés alatt)

Haplogroup R

• • A Haplogroup R terjedése a National Geographic -tól