Lipidhez rögzített fehérjék

Az oldal jelenlegi verzióját még nem ellenőrizték tapasztalt közreműködők, és jelentősen eltérhet a 2021. június 13-án felülvizsgált verziótól ; az ellenőrzések 4 szerkesztést igényelnek .

A lipidhez lehorgonyzott vagy lipidhez kötött fehérjék olyan sejtmembránfehérjék , amelyek kovalensen kötődnek a sejtmembrán lipidjeihez .  Ezek a lipidek zsírsavfarokkal egymás mellett kerülnek a membránba . A lipidekhez lehorgonyzott fehérjék a sejtmembrán mindkét oldalán elhelyezkedhetnek. Így a lipid egyfajta horgonyként szolgál, amely a fehérjét a sejtmembrán közelében rögzíti [1] [2] .

A fehérjékhez kapcsolódó lipidcsoportok részt vehetnek a fehérje-fehérje kölcsönhatásokban , és befolyásolhatják a hozzájuk kapcsolódó fehérjék működését [2] [3] . Például a lipidcsoportok fontos szerepet játszhatnak egy molekula hidrofóbságának növelésében . Ez biztosítja a lehorgonyzott fehérjék azon képességét, hogy kölcsönhatásba lépjenek a sejtmembránnal és a fehérjedoménekkel [ 4] .

A lipidhez rögzített fehérjék három típusa létezik:

Számos lipidcsoport kapcsolódhat kovalensen egy fehérjéhez, de a fehérje lipidhez való kötésének helye a lipidtől és magától a fehérjétől is függ [2] .

Prenilált fehérjék

Ahogy a neve is sugallja, a prenilált fehérjék kovalensen kapcsolódnak izoprén hidrofób polimereihez (azaz egy elágazó láncú öt szénhidrogénhez [5] ) cisztein aminosav- maradékokon [2] [3] keresztül . Az izoprenoid csoportok, általában a farnezil (15 szénatom) és a geranilgeranil (20 szénatom ), tioéter kötéseken keresztül a fehérje C -terminálisához közeli cisztein -maradékokhoz kapcsolódnak [3] [4] . A fehérjék prenilációja megkönnyíti a sejtmembránnal való kölcsönhatásukat [1] .

A CAAX box néven ismert prenilációs motívum a legnépszerűbb fehérje prenilációs hely, vagyis az a hely, amelyhez a farnezil vagy geranilgeranil kovalensen kötődik [2] [3] . A CAAX mezőben C a prenilált cisztein, A az alifás aminosav, X pedig meghatározza, hogy milyen típusú preniláció fog végbemenni. Ha X jelentése Ala , Met , Ser vagy Gln , akkor a fehérjét a farneziltranszferáz enzim farnezilálja , ha pedig X jelentése Leu , akkor a fehérje geranilgeraniltranszferáz I [3] [4] . Ezek az enzimek hasonlóak, és mindkettő két alegységből áll [6] .

A prenilált fehérjék nagyon fontosak az eukarióta sejtek növekedésében , differenciálódásában és morfológiájában [6] . Ezenkívül a preniláció egy reverzibilis poszttranszlációs módosulás . A prenilált fehérjék és a sejtmembrán dinamikus kölcsönhatása elengedhetetlen a jelátvitelben való részvételükhöz, és gyakran megzavarodik olyan betegségekben, mint a rák [7] . Például a Ras egy olyan fehérje, amely a farnezil-transzferáz által preniláción megy keresztül, és amikor aktív állapotban van, bekapcsolhatja a sejtnövekedésben és -differenciálódásban részt vevő géneket . Ezért a túlzott Ras-aktivitás rákhoz vezethet [8] . A prenilált fehérjék hatásmechanizmusának vizsgálata fontos a rákellenes gyógyszerek kifejlesztése szempontjából [9] . A prenilált fehérjék közé tartoznak a Rab és Rho fehérjecsalád tagjai, valamint a laminok [6] .

A HGM-CoA reduktáz útvonalban [1] részt vevő néhány prenilcsoport - geranilgeraniol , farnezol és dolichol - pirofoszfát formájában részt vesz az olyan enzimek által felgyorsított kondenzációs reakciókban, mint a preniltranszferáz , és végül ciklusokat alkotnak a koleszterin képződése [2] .

Zsírsavakkal acilezett fehérjék

A zsírsavakkal acilezett fehérjék olyan fehérjék, amelyek poszttranszlációs módosulásokon mentek keresztül, és bizonyos aminosavmaradékokon kovalensen kötődnek zsírsavakhoz [10] [11] . A fehérjékhez leggyakrabban kapcsolódó zsírsavak a 14 szénatomos telített mirisztinsav és a 16 szénatomos palmitinsav . A fehérjék e zsírsavak egyikéhez vagy kettőhöz kapcsolhatók [10] .

N -mirisztoilezés

Az N -mirisztoilezés (azaz mirisztinsav hozzáadása) egy általában irreverzibilis fehérjemódosítás, amely általában a fehérjeszintézis során megy végbe [10] [12] , és mirisztinsav hozzáadása a glicin terminális aminosavának α- aminocsoportjához egy peptiden keresztül . kötvény [ 2] [11] . Ezt a reakciót az N-mirisztoil-transzferáz enzim gyorsítja . Az N -mirisztoiláción átmenő fehérjék a Met - Gly -vel kezdődnek, és az 5-ös pozícióban szerint vagy treonint tartalmaznak [10] . A mirisztoilezett fehérjék részt vesznek a jelátvitelben, a fehérje-fehérje kölcsönhatásokban, és olyan mechanizmusokban, amelyek szabályozzák más fehérjék célzását és működését [12] . Például a Bid fehérje mirisztoilezése fontos az apoptózis szabályozásában : a mirisztoilezett Bid a mitokondriumokba irányul, és onnan citokróm c felszabadulását idézi elő , ami végül apoptózishoz vezet. Az apoptózis szabályozásában részt vevő további mirisztoilezett fehérjék az aktin és a gelsolin [13] .

S -palmitoiláció

Az S -palmitoiláció (azaz palmitinsav hozzáadása) egy reverzibilis fehérjemódosítás, amelyben a palmitinsav tioéterkötésen keresztül egy specifikus cisztein-maradékhoz kapcsolódik [2] [10] . Amikor közepes vagy hosszú zsírsavak kapcsolódnak palmitoilezett fehérjékhez, az S -acilezés kifejezés használható. A palmitoilezésre vonatkozóan nem határoztak meg konszenzusos szekvenciát [10] . A palmitolált fehérjék főként a sejtmembrán citoplazmatikus oldalán találhatók, ahol a jelátvitelben vesznek részt [2] . A palmitoil-csoport palmitoil-tioészteráz enzimekkel távolítható el. Feltételezhető, hogy a reverzibilis palmitoiláció szabályozhatja a fehérje kölcsönhatását a sejtmembránnal, és így részt vehet a jelátvitelben. Emellett felhasználható az intracelluláris fehérje lokalizáció, stabilitás és forgalom szabályozására [14] . Például a szinapszisban a fehérje-palmitoiláció kulcsszerepet játszik a jelátvitelben a fehérje klaszterezés szabályozásával. Amikor a PSD-95 fehérje palmitoilezett, membránhoz kötődik, és ioncsatornákat köthet és csoportosíthat a posztszinaptikus membránon . Így a palmitoiláció szerepet játszhat a neurotranszmitterek felszabadulásának szabályozásában [15] .

GPI fehérjék

A GPI fehérjék a fehérje C -terminális karboxilcsoportjának peptidkötésén keresztül kapcsolódnak a GPI komplexhez [16] . A GPI fehérje több rokon komponensből áll: foszfoetanolamin , egy lineáris tetraszacharid (három mannóz maradékból és egy glükózaminilből áll) és foszfatidil-inozitol [17] . A foszfatidil-inozit glikozidos kötéssel kapcsolódik a nem N-acetilezett glükózamin - tetraszacharidhoz. A tetraszacharid nem redukáló végén lévő mannóz és a foszfo-etanol-amin között foszfodiészter kötés jön létre . A foszfoetanol-amin továbbá peptidkötéssel kapcsolódik a megfelelő fehérje C-terminálisához [2] . A GPI komplexhez való fehérje kötődését a GPI-transzamidáz enzimkomplex közvetíti [17] . A foszfatidil-inozitol zsírsavak beépülnek a membránba, és rögzítik a fehérjét [16] . A GPI fehérjék csak a sejtmembrán külső oldalán helyezkednek el [2] .

A tetraszacharid cukormaradékai és a foszfatidil-inozitol zsírsavmaradékai fehérjéről-fehérjére változnak [2] . Ennek a sokféleségnek köszönhetően a GPI fehérjék sokféle funkciót elláthatnak: hidrolitikus enzimekként , adhéziós molekulákként , receptorokként , proteáz inhibitorokként működhetnek [18] . Ezenkívül a GPI fehérjék fontos szerepet játszanak az embriogenezisben , a fejlődésben, a neurogenezisben , az immunrendszer működésében és a megtermékenyítésben [16] . Például az ókori római termékenységistennőről elnevezett IZUMO1R/JUNO GPI fehérje, amely a tojás membránján található , szükséges a tojás és a spermium fúziójához . E fehérje nélkül a petesejt és a spermium nem tud egyesülni, így a megtermékenyítés utáni eltűnése lehet az egyik olyan mechanizmus, amely megvédi a polispermiát [19] . Más GPI fehérjék részt vesznek a membrán mikrodomén asszociációjában , a tranziens homodimerizációban és a polarizált sejtekben az apikális válogatásban [16] .

Jegyzetek

  1. 1 2 3 Gerald Karp. Sejt- és molekuláris biológia : fogalmak és kísérletek  . — John Wiley and Sons , 2009. — 128. o. - ISBN 978-0-470-48337-4 .
  2. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 Voet Judith G., Pratt Charlotte W. A biokémia alapjai : Élet molekuláris szinten  . — 4. – John Wiley & Sons, Inc. , 2013. -  263. o . — ISBN 978-0470-54784-7 .
  3. ↑ 1 2 3 4 5 Casey PJ , Seabra MC Protein preniltranszferázok.  (angol)  // The Journal of Biological Chemistry. - 1996. - 1. évf. 271. sz. 10 . - P. 5289-5292. — PMID 8621375 .
  4. ↑ 1 2 3 Novelli Giuseppe , D'Apice Maria Rosaria. Fehérje farneziláció és betegség  // Journal of Herited Metabolic Disease. - 2012. - február 4. ( 35. évf. , 5. szám ). - S. 917-926 . — ISSN 0141-8955 . - doi : 10.1007/s10545-011-9445-y .
  5. izoprén Miller-Keane Encyclopedia and Dictionary of Medicine, Nursing and Allied Health, hetedik kiadás (2003). Letöltve: 2015. november 28. Az eredetiből archiválva : 2015. december 8..
  6. ↑ 1 2 3 Lane KT , Beese LS Tematikus áttekintés sorozat: lipid poszttranszlációs módosítások. A protein farneziltranszferáz és geranilgeraniltranszferáz I. típusú szerkezetbiológiája.  (angol)  // Journal of lipid research. - 2006. - Vol. 47. sz. 4 . - P. 681-699. - doi : 10.1194/jlr.R600002-JLR200 . — PMID 16477080 .
  7. Stein V. , Kubala MH , Steen J. , Grimmond SM , Alexandrov K. Towards the systematic mapping and engineering of the protein prenylation machinery in Saccharomyces cerevisiae.  (angol)  // Public Library of Science ONE. - 2015. - Kt. 10, sz. 3 . — P.e0120716. - doi : 10.1371/journal.pone.0120716 . — PMID 25768003 .
  8. Goodsell DS A molekuláris perspektíva: a ras onkogén.  (angol)  // Az onkológus. - 1999. - 1. évf. 4, sz. 3 . - P. 263-264. — PMID 10394594 .
  9. Reuter CW , Morgan MA , Bergmann L. A Ras jelátviteli útvonal megcélzása: racionális, mechanizmuson alapuló kezelés hematológiai rosszindulatú daganatok számára?  (angol)  // Blood. - 2000. - Vol. 96, sz. 5 . - P. 1655-1669. — PMID 10961860 .
  10. ↑ 1 2 3 4 5 6 Resh Marilyn D. Trafficking and signaling by fattyacilated and prenylated proteins  // Nature Chemical Biology. - 2006. - november ( 2. köt. , 11. szám ). - S. 584-590 . — ISSN 1552-4450 . - doi : 10.1038/nchembio834 .
  11. ↑ 1 2 Wilson JP , Raghavan AS , Yang YY , Charron G. , Hang HC A zsír-acilezett fehérjék proteomikai elemzése emlőssejtekben kémiai riporterekkel a hiszton H3 variánsok S-acilezését tárja fel.  (eng.)  // Molekuláris és celluláris proteomika : MCP. - 2011. - 20. évf. 10, sz. 3 . - P. 110-001198. - doi : 10.1074/mcp.M110.001198 . — PMID 21076176 .
  12. ↑ 1 2 Farazi TA , Waksman G. , Gordon JI A protein N-mirisztoiláció biológiája és enzimológiája.  (angol)  // The Journal of Biological Chemistry. - 2001. - 20. évf. 276. sz. 43 . - P. 39501-39504. - doi : 10.1074/jbc.R100042200 . — PMID 11527981 .
  13. Martin Dale DO , Beauchamp Erwan , Berthiaume Luc G. Post-translational myristoylation: Fat matters in cellular life and death  // Biochimie. - 2011. - január ( 93. évf. , 1. szám ). - S. 18-31 . — ISSN 0300-9084 . - doi : 10.1016/j.biochi.2010.10.018 .
  14. Aicart-Ramos Clara , Valero Ruth Ana , Rodriguez-Crespo Ignacio. Protein palmitoiláció és szubcelluláris kereskedelem  // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. - 2011. - December ( 1808. évf. , 12. szám ). - S. 2981-2994 . — ISSN 0005-2736 . - doi : 10.1016/j.bbamem.2011.07.009 .
  15. Dityatev Alexander. A szinaptogenezis molekuláris mechanizmusai  (angol) / El-Husseini, Alaa. - New York: Springer, 2006. - P. 72-75.
  16. ↑ 1 2 3 4 Kinoshita T. , Fujita M. GPI-horgonyzott fehérjék bioszintézise: különös hangsúlyt fektetve a GPI lipidek remodellingjére.  (angol)  // Journal of Lipid Research. - 2016. - Kt. 57. sz. 1 . - P. 6-24. - doi : 10.1194/jlr.R063313 . — PMID 26563290 .
  17. ↑ 1 2 Ikezawa Hiroh. Glikozil-foszfatidil-inozitol (GPI) által rögzített fehérjék  // Biológiai és Gyógyszerészeti Értesítő. - 2002. - T. 25 , 4. sz . - S. 409-417 . — ISSN 0918-6158 . - doi : 10.1248/bpb.25.409 .
  18. Kinoshita T. A glikozil-foszfatidil-inozitol bioszintézise és hiányosságai.  (angol)  // Proceedings of the Japan Academy. B sorozat, Fizikai és biológiai tudományok. - 2014. - Kt. 90, sz. 4 . - P. 130-143. — PMID 24727937 .
  19. Coonrod SA , Naaby-Hansen S. , Shetty J. , Shibahara H. , Chen M. , White JM , Herr JC Az egér petesejtek kezelése PI-PLC-vel 70 kDa (pI 5) és 35-45 kDa szabadul fel (pI 5,5) fehérje klaszterek a tojás felszínéről, és gátolja a spermium-oolemma kötődést és fúziót.  (angol)  // Fejlődésbiológia. - 1999. - 1. évf. 207. sz. 2 . - P. 334-349. - doi : 10.1006/dbio.1998.9161 . — PMID 10068467 .

Linkek