aktin | |
---|---|
G-aktin. A kapcsolódó ADP-molekula és a kétértékű kation látható. | |
Azonosítók | |
Szimbólum | aktin |
Pfam | PF00022 |
InterPro | IPR004000 |
PROZIT | PDOC00340 |
SCOP | 2btf |
SZUPERCSALÁD | 2btf |
Elérhető fehérjeszerkezetek | |
Pfam | szerkezetek |
EKT | RCSB EKT ; PDBe ; EKTj |
EKT-összeg | 3D modell |
Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon |
Az aktin egy gömbölyű fehérje , amelyből mikrofilamentumok képződnek – az eukarióta sejtek citoszkeletonjának egyik fő alkotóeleme . Az aktin 376 aminosavból áll, molekulatömege körülbelül 42 kDa és átmérője 4-9 nm. 2 formája van: monomer G-aktin és polimerizált forma (F-aktin). A miozin fehérjével együtt az izmok fő összehúzó elemeit alkotja - szarkomerek aktomiozin komplexei . Főleg a citoplazmában van jelen, de kis mennyiségben a sejtmagban is megtalálható [1] [2] .
Az elektronmikroszkópos felvételek azt mutatták, hogy a G-aktin gömb alakú szerkezetű; a röntgenkrisztallográfia azonban kimutatta, hogy ezek a gömbök mindegyike két lebenyből áll, amelyeket egy barázda választ el. Ez a szerkezet egy "ATPáz redő", amely egy enzimatikus katalízis helyszíne, amely megköti az ATP-t és a Mg 2+ -t, és az előbbit ADP-vé és szerves foszfáttá hidrolizálja. Ez a redő egy konzervált szerkezet, amely más fehérjékben is előfordul [3] . A G-aktin csak akkor működik, ha barázdájában ADP-t vagy ATP-t tartalmaz, de az ATP-kötött forma dominál a sejtekben, ha az aktin monomer formájában van jelen [4] .
374 aminosavat tartalmaz. N-terminálisa erősen savas, és aminocsoportjában acetilezett aszpartáttal kezdődik . Bár C-terminálisa lúgos, és fenilalaninból áll, amelyet cisztein előz meg [5] .
A harmadlagos szerkezetet két nagy és kicsi tartomány alkotja, amelyeket egy horony választ el egymástól. Ez alatt van egy mélyebb bevágás, az úgynevezett "barázda". Mindkét szerkezet hasonló mélységű [6] .
Topológiai vizsgálatok kimutatták, hogy a fehérje a legnagyobb doménnel a bal oldalon és a legkisebb doménnel a jobb oldalon. Ebben a pozícióban a kisebb domén két részre oszlik: I. aldoménre (alsó pozíció, 1-32., 70-144. és 338-374. aminosavak) és II. aldoménre (felső pozíció, 33-69. aminosavak). A nagyobb tartomány szintén két részre oszlik: a III. aldoménre (alsó, 145–180. és 270–337. oldalláncok) és IV. aldoménre (felső, 181–269. oldalláncok). Az I. és III. aldomén kitett területeit „fogazott” végeknek, míg a II. és IV. tartományok szabad területeit „hegyes” végeknek nevezzük.
Az F-aktin klasszikus leírása szerint fonalas szerkezetű, amely vagy egyszálú, a spirális tengely körül 166°-os elfordulással és 27,5 Å tengelyirányú eltolódással rendelkező baloldali spirálnak, vagy egy szálas spirálnak tekinthető. egyszálú jobbkezes hélix 350-380 Å kereszttávolsággal, és minden aktin molekulát 4 másik vesz körül. Az aktin polimer szimmetriája 2,17 alegység/fordulatnál nem kompatibilis a kristályok képződésével, ami csak menetenként pontosan 2, 3, 4 vagy 6 alegység szimmetria esetén lehetséges [7] [8] .
Úgy gondolják, hogy az F-aktin polimer szerkezeti polaritással rendelkezik, mivel minden mikrofilament alegység ugyanarra a végre mutat. Ez egy elnevezési konvencióhoz vezet: az ATP-kötő hellyel rendelkező aktin alegységet tartalmazó végét „(-) végnek”, míg a másik végét, ahol a hasadék egy másik közeli monomerre irányul, „( +) vége A mikrofilamentumok két végére utaló "hegyes" és "fogazott" kifejezések transzmissziós elektronmikroszkópos megjelenésükből származnak, amikor a mintákat a "dekorációnak" nevezett preparációs technikával vizsgálják. Ez a miozin poláris kötéseket képez aktin monomerek, ami olyan konfigurációt eredményez, amely úgy néz ki, mint egy nyíl, amelynek tengelye mentén perforációk vannak, ahol a nyél aktin, a lapítás pedig miozin. Ezt a logikát követve a mikroszál végét, amelyben nincs kiálló miozin, a pontnak nevezzük. a nyilat (- vége), a másik végét tüskés végnek (+vég) [9] .Az S1 fragmens a miozin II fej és nyak doménjéből áll Fiziológiás körülmények között a G-aktin (monomer forma) átalakul F-aktinba ( polimer forma) ATP segítségével, ahol az ATP szerepe elengedhetetlen.
A polimer aktin, az úgynevezett F-aktin képződése magában foglalja a monomer G-aktin ATP-molekulához való kötését Mg 2+ , Ca 2+ ionok jelenlétében , stabil aktin oligomerek és gömböcskék képződését, egyedi aktin polimer filamentumok és elágazásaik. Ennek eredményeként szerves foszfát és ADP molekulák képződnek. Az aktin mikrofilamentumok 2 F-aktin filamentum spirális csavarásával jönnek létre, amelyekben az aktinmolekulák nem kovalens kötésekkel kapcsolódnak egymáshoz [10]
Minden ilyen mikrofilamentumnak két vége van, amelyek tulajdonságaikban különböznek egymástól: az aktin monomerek az egyikhez kapcsolódnak (ezt hívják plusz végnek), és disszociálnak a másiktól (mínusz vég). Az aktin monomerek kapcsolódási és disszociációs sebességének aránya határozza meg, hogy a filamentum meghosszabbodik vagy rövidül [10] .
Biológiai motorok | |
---|---|
motoros fehérjék | |
Lásd még: Molekuláris motorok |
![]() |
---|