Shikimatkináz

Shikimatkináz

Shikimatkinase az "Erwinia chrysanthemi"-ből.
Azonosítók
Szimbólum
Pfam PF01202
Pfam klán CL0023
PROZIT PDOC00868
SCOP 2shk
SZUPERCSALÁD 2shk
OPM szupercsalád 124
OPM fehérje 1e6c
Elérhető fehérjeszerkezetek
Pfam szerkezetek
EKT RCSB EKT ; PDBe ; EKTj
EKT-összeg 3D modell
 Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon
Shikimatkináz

Rajzfilm a Mycobacterium tuberculosisból származó shikimate kinázról . Az α-géleket pirossal, a központi β-lapot sárgával, a hurkokat zölddel jelöltük.
Azonosítók
KF kód 2.7.1.71
CAS szám 9031-51-0
Enzim adatbázisok
IntEnz IntEnz nézet
BRENDA BRENDA bejegyzés
ExPASy NiceZyme nézet
MetaCyc anyagcsere út
KEGG KEGG bejegyzés
PRIAM profil
EKT struktúrák RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Gén-ontológia AmiGO  • EGO
Keresés
PMC cikkeket
PubMed cikkeket
NCBI NCBI fehérjék
CAS 9031-51-0
 Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon

A shikimatkináz ( EC kód 2.7.1.71 ) egy olyan enzim, amely a sikimát ATP - függő foszforilációját katalizálja sikimát -3-foszfát képződésével [1] . Ez a reakció az ötödik lépés a shikimát útvonalban [2] , amelyet növények és baktériumok használnak egy közös aromás aminosav prekurzor és másodlagos metabolitok szintetizálására. Ennek az enzimosztálynak a szisztematikus neve ATP: shikimate-3-phosphotransferase . Egyéb gyakran használt nevek közé tartozik a shikimate kinase (foszforiláció) és a shikimate kinase II .

Általános leírás

A shikimát út hét enzimatikus reakcióból áll, amelyek során a foszfoenolpiruvát és az eritróz-4-foszfát chorizmáttá alakul , amely a fenilalanin , tirozin és triptofán aromás aminosavak közös prekurzora . Az aromás aminosavakat a fehérjeszintézisben használják, és a növényekben, gombákban és baktériumokban számos más speciális metabolit keletkezik, például fenilpropanoidok és alkaloidok . A Horismat és ennek az útvonalnak számos más köztiterméke számos más metabolit, például folátok, kinátok és kinonok prekurzoraiként szolgál. A négy enzim, amely megelőzi a sikimát-kinázt ebben az útvonalban, a DAHP-szintáz, 3-dehidrokinát-szintáz, 3-dehidrokinát-dehidratáz és sikimát-dehidrogenáz, az ezt követő kettő pedig az EPSP-szintáz és a korizmát-szintáz. Gombákban és protozoonokban az AROM komplex része, amely a shikimate útvonal öt központi lépését kolokalizálja [3] . Ez az útvonal nem található meg emberekben és más állatokban, amelyeknek élelmiszerből kell aromás aminosavakat beszerezniük.

Tevékenység

A shikimate kináz által katalizált reakció az alábbiakban látható:

Ez a reakció magában foglalja egy foszfátcsoport átvitelét az ATP-ről a sikimát 3-hidroxilcsoportjára. Így a shikimát kináznak két szubsztrátja van , a shikimát és az ATP , valamint két terméke, a shikimát-3-foszfát és az ADP [4] .

Példák

Az ezt a domént tartalmazó humán fehérjék a következők: MAPK7 és THNSL1.

Hivatkozások

  1. "Shikimate kinase izoenzimek a Salmonella typhimuriumban". The Journal of Biological Chemistry . 243 (3): 676-7. 1968. február. PMID  4866525 .
  2. "A Shikimate Pathway". Növényélettani és növényi molekuláris biológia éves áttekintése . 50 , 473-503. 1999. június. doi : 10.1146/annurev.arplant.50.1.473 . PMID  15012217 .
  3. "A pentafunkcionális AROM komplexum felépítése és funkcionális dinamikája". Természet kémiai biológia . 16 (9): 973-978. 2020. július . doi : 10.1038/ s41589-020-0587-9 . PMID 32632294 . 
  4. "A Mycobacterium tuberculosisból származó shikim kináz által katalizált foszforil-transzfer mechanizmusa". Journal of Molecular Biology . 364 (3): 411-23. 2006. december. doi : 10.1016/j.jmb.2006.09.001 . PMID  17020768 .