Szelenocisztein

Az oldal jelenlegi verzióját még nem ellenőrizték tapasztalt közreműködők, és jelentősen eltérhet a 2020. október 29-én felülvizsgált verziótól ; az ellenőrzések 4 szerkesztést igényelnek .
szelenocisztein
Tábornok
Rövidítések mp
Chem. képlet C 3 H 7 NO 2 Se
Fizikai tulajdonságok
Moláris tömeg 168,053 g/mol g/ mol
Osztályozás
Reg. CAS szám 10236-58-5
PubChem
Reg. EINECS szám 808-428-7
MOSOLYOK   N[CH](C[SeH])C(O)=O
InChI   InChI=1S/C3H7NO2Se/c4-2(1-7)3(5)6/h2,7H, 1,4H2, (H.5,6)/t2-/m0/s1ZKZBPNGNEQAJSX-REOHCLBHSA-N
CHEBI 16633
ChemSpider
Az adatok standard körülményeken (25 °C, 100 kPa) alapulnak, hacsak nincs másképp jelezve.
 Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon

A szelenocisztein (rövidítve Sec vagy U , a régi publikációkban Se-Cys [1] is) a 21. proteinogén aminosav , a cisztein analógja a kénatom szelénatommal (vagyis a kénnel) való helyettesítésével . -tartalmú tiolcsoportot szeléntartalmú szelenolcsoport helyettesíti). A glutation-peroxidáz enzim aktív központjában , valamint a szelenoproteinek [2] , a deiodáz és néhány más fehérje összetételében szerepel . Az mRNS -en a szelenociszteint az UGA terminációs kodon kódolja , feltéve, hogy ezt egy specifikus stimuláló nukleotid szekvencia követi .

A szelenociszteint először 1972-ben fedezte fel a Clostridium baktériumokban Thressa Stadtman biokémikus , az Egyesült Államok Nemzeti Szív-, Tüdő- és Vérintézete (US National Institutes of Health ) [3 . Később ő és munkatársai megmutatták a szelenocisztein fontos szerepét számos más enzim képződésében és az emberi anyagcserében való részvételében.  

Szerkezet

A szelenocisztein szerkezete hasonló a ciszteinéhez, azzal a különbséggel, hogy benne a kénatomot szelénatom váltja fel, és fiziológiás pH -értékeken deprotonált szelenolcsoportot képez . Az egy vagy több szelenociszteint tartalmazó fehérjéket szelenoproteineknek nevezzük . A szelenocisztein biokémiai aktivitása miatt katalitikus aktivitással rendelkeznek, ezért szelenoenzimeknek nevezik őket . A leírt szelenoenzimekben katalitikus aktivitású aminosavhármasokat találtak , amelyek meghatározzák a szelenocisztein aktív helyének nukleofilségét .

Biológia

A szelenocisztein disszociációs állandója alacsonyabb, mint a ciszteiné (5,47), és nagyobb a redukciós potenciálja . Ezeknek a tulajdonságoknak köszönhetően a szelenocisztein részt vesz az antioxidáns hatású fehérjékben [4] .

A fehérjékben található többi aminosavtól eltérően a szelenociszteinnek nincs saját specifikus kodonja a genetikai kódban [5] . Valójában különleges módon az UGA kodon kódolja, amely általában egy stopkodon . Ezt a mechanizmust transzlációs újrakódolásnak nevezik [6] , és hatékonysága a szintetizált szelenoproteintől és a transzlációs iniciációs faktoroktól függ [7] . Ha a sejtek szelén hiányában élnek, akkor a szelenoprotein transzlációja az UGA kodonnál végződik, ami egy "csonkított", nem működő enzim kialakulásához vezet. Az UGA kodon a szelenociszteint kódolja, ha az mRNS tartalmazza a szelenocisztein beillesztési szekvenciát ( SECIS elem, SECIS ) .  A SECIS elem azonosítható a jellegzetes nukleotid szekvenciák és az mRNS másodlagos szerkezetének jellemzői alapján ezen elem régiójában. Baktériumokban a SECIS elem közvetlenül az UGA kodon után helyezkedik el (vele egy leolvasási keretben ) [8] . Az archaeákban és az eukariótákban a SECIS a 3 ' nem lefordított régióban ( 3' UTR ) található, és több UGA kodont is képes szelenociszteint kódolni [9] .  

Egy másik különbség a szelenocisztein és a standard aminosavak között az, hogy nem létezik szabad formában a sejtben, mivel nagy reakcióképessége károsíthatja a sejtet. Ehelyett a sejt a szelént kevésbé aktív szelenid (H 2 Se) formájában tárolja. A szelenocisztein szintézisét speciális tRNS - eken végzik , amelyek szintén tartalmazzák a növekvő peptidláncban . A szelenocisztein-specifikus tRNS-ek, a Sec tRNS-ek elsődleges és másodlagos szerkezete több tekintetben eltér a standard tRNS-ekétől. Így az akceptor régió baktériumokban 8 bázispárt, eukariótákban 10 bázispárt tartalmaz, egy hosszabb T-hurkot ; emellett a tRNS Sec -re több, meglehetősen konzervatív bázispár szubsztitúciója is jellemző. A Sec tRNS kezdetben a szeril-tRNS ligáz enzim segítségével kötődik a szerinhez , de a létrejövő Ser-tRNS Sec komplex nem lép be a transzlációba , mert a normál transzlációs faktorok (az EF-Tu baktériumokban és az eEF1A eukariótákban) nem ismerik fel. A tRNS-hez kötött szerinmaradékot a piridoxált tartalmazó szelenocisztein- szintáz enzim szelenocisztein-maradékká alakítja . Végül, a kapott Sec-tRNS Sec komplex specifikusan kötődik egy alternatív transzlációs faktorhoz (SelB vagy mSelB (vagy eEFSec)), amely célzottan eljuttatja azt a riboszómához , amely az mRNS-t szelenoproteinre fordítja. Ennek a szállításnak a specifitása egy további fehérjedomén ( baktériumokban, SelB) vagy egy további alegység (SBP2 az eukarióta mSelB/eEFSec számára) jelenlétének köszönhető, amely a SECIS elem által alkotott megfelelő mRNS másodlagos szerkezeti elemhez kötődik.

Emberben 25 szelenoprotein ismert [10] .

A szelenocisztein-származékok, a γ-glutamil-Se-metil-szelenocisztein és a Se-metil-szelenocisztein a hagyma ( Allium ) és káposzta ( Brassica ) nemzetség növényeiben ismertek [11] .

Alkalmazás

A szelenocisztein biotechnológiai alkalmazásai közé tartozik a 73Se izotóppal jelölt Sec ( felezési idő 7,2 óra) használata a pozitronemissziós tomográfiában , valamint a 75Se tartalmú Sec ( felezési idő 118,5 nap) radioaktív jelöléshez. Szelenocisztein önmagában vagy szelenocisztein szelenometioninnal (SeMet) kombinálva, hogy megkönnyítse a meghatározási fázist több hullámhosszú anomális diszperzióval a fehérjék röntgendiffrakciós elemzésében . Lehetőség van egy stabil 77 Se izotóp beépítésére, amelynek magspinje ½, nagy felbontású mágneses magrezonanciához [2] .

Lásd még

Jegyzetek

  1. IUPAC-IUBMB Biokémiai Nómenklatúra Vegyes Bizottság (JCBN) és IUBMB Nómenklatúra Bizottsága (NC-IUBMB  )  // European Journal of Biochemistry : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 264 , sz. 2 . - P. 607-609 . doi : 10.1046 / j.1432-1327.1999.news99.x . Az eredetiből archiválva : 2018. február 19.
  2. 1 2 Johansson, L.; Gafvelin, G.; Amér, ESJ Szelenocisztein a fehérjékben – Tulajdonságok és biotechnológiai felhasználás  (német)  // Biochimica et Biophysica Acta : bolt. - 2005. - Bd. 1726 , Nr. 1 . - S. 1-13 . - doi : 10.1016/j.bbagen.2005.05.010 .
  3. Stadtman T. Szelén biokémia. - 1974. - 1. évf. 183, 4128. sz . - P. 915-922. - doi : 10.1126/tudomány.183.4128.915 .
  4. Byun, BJ; Kang, YK Conformational Preferences and pK a Value of Selenocysteined Residue  (angol)  // Biopolymer  : Journal. - 2011. - 20. évf. 95 , sz. 5 . - P. 345-353 . - doi : 10.1002/bip.21581 . — PMID 21213257 .
  5. Böck A.; Forchhammer, K.; Heider, J.; Baron, C. Selenoprotein Synthesis: An Expansion of the Genetic Code   // Trends in Biochemical Sciences : folyóirat. - Cell Press , 1991. - Vol. 16 , sz. 12 . - P. 463-467 . - doi : 10.1016/0968-0004(91)90180-4 . — PMID 1838215 .
  6. Baranov P.V.; Gesteland RF; Atkins, JF Recoding: Translational Bifurcations in Gene   Expression // Gene : folyóirat. - Elsevier , 2002. - Vol. 286. sz . 5 . - P. 187-201 . - doi : 10.1016/S0378-1119(02)00423-7 . — PMID 11943474 .
  7. Donovan, J.; Copeland, PR A szelenocisztein beépülésének hatékonyságát a fordítási iniciációs tényezők szabályozzák  //  Journal of Molecular Biology : folyóirat. - 2010. - 20. évf. 400 , nem. 4 . - P. 659-664 . - doi : 10.1016/j.jmb.2010.05.026 . — PMID 20488192 .
  8. Atkins, JF Újrakódolás : A dekódolási szabályok kiterjesztése gazdagítja a génexpressziót  . - Springer, 2009. - P. 31. - ISBN 9780387893815 . Archiválva : 2014. december 6. a Wayback Machine -nál
  9. Berry, MJ; Banu, L.; Harney, JW; Larsen, PR Az eukarióta SECIS-elemek funkcionális jellemzése, amelyek irányítják a szelenocisztein beépítését az UGA kodonokban  //  The EMBO Journal : folyóirat. - 1993. - 1. évf. 12 , sz. 8 . - P. 3315-3322 . — PMID 8344267 . Az eredetiből archiválva : 2018. szeptember 20.
  10. Krjukov, GV; Castellano, S.; Novoselov, SV; Lobanov, A. V.; Zehtab, O.; Guigó, R.; Gladyshev, VN Az emlősszelenoproteomák jellemzése  (angol)  // Tudomány. - 2003. - 1. évf. 300 , nem. 5624 . - P. 1439-1443 . - doi : 10.1126/tudomány.1083516 . — PMID 12775843 .
  11. Block, E. Fokhagyma és más alliumok: The Lore and the  Science . - Royal Society of Chemistry , 2010. - ISBN 0-85404-190-7 .

Irodalom

Linkek