Karnitin palmitoil-transzferáz I

Karnitin palmitoil-transzferáz I
Elérhető struktúrák
EKTOrtológus keresés: PDBe RCSB
Azonosítók
Szimbólumok CPT1A , karnitin-palmitoil-transzferáz 1A (máj), CPT1, CPT1-L, L-CPT1, karnitin-palmitoil-transzferáz 1A
Külső azonosítók OMIM: 600528 MGI: 1098296 Homologén: 1413 GeneCards: 1374
Kapcsolódó örökletes betegségek
A betegség neve Linkek
elhízottság
diszlipidémia
karnitin palmitoiltranszferáz I hiány
ortológusok
Fajták Emberi Egér
Entrez
Együttes
UniProt
RefSeq (mRNS)

NM_001031847
NM_001876

NM_013495

RefSeq (fehérje)

NP_001027017
NP_001867

NP_038523

Locus (UCSC) Chr 11: 68,75 – 68,84 Mb Chr 19: 3,37 – 3,44 Mb
PubMed Keresés [5] [6]
Szerkesztés (ember)Szerkesztés (egér)

A karnitin-palmitoiltranszferáz I , továbbá a karnitin-acil-transzferáz I , a karnitin-acil-CoA-transzferáz I vagy a palmitoil-CoA-transzferáz I ( Carnitine palmitoyl-transferase I , röv. CPT1  ) egy mitokondriális enzim, a karnitin-O- palmito1EC2 -transzferáz ( 3.1.1 ) egyik formája. Archivált 2016. május 5-én a Wayback Machine -nél ), az aciltranszferázok családjába tartozik [1] . Katalizálja az acilcsoport (-COR) átvitelét egy hosszú szénhidrogénláncú acil-CoA zsírsavmolekuláról a karnitin molekulára, acilkarnitin és szabad koenzim-A molekula képződésével . A reakció terméke gyakran palmitoilkarnitin (innen ered az enzim neve), azonban más zsírsavmaradékok (acilcsoportok – COR) is működhetnek szubsztrátként [2] [3] . A karnitin transzportrendszerének számos enzime közül az egyik . Az ezt az enzimet kódoló gén a 11. kromoszómán található - CPT1A Archiválva : 2016. szeptember 10., a Wayback Machine -nél .

Az enzimnek 3 izoformája van: CPT1A, CPT1B és CPT1C. A CPT1 a külső mitokondriális membránhoz kapcsolódik. Ennek az enzimnek az aktivitása csökkenthető a malonil-CoA-val (amely egy inhibitor), egy köztes metabolittal, amely részt vesz a zsírsav-bioszintézisben. A karnitin-palmitoil-transzferáz I fontos szerepet játszik különféle anyagcsere-rendellenességekben, például cukorbetegségben . A kristályszerkezet azonban még mindig ismeretlen, ennek következtében pontos hatásmechanizmusa ismeretlen marad.

Szerkezet

A CPT1 egy integrált membránfehérje , amely a külső mitokondriális membránhoz kapcsolódik a peptidlánc transzmembrán régióin keresztül. Mind a terminális N-, mind a C-domén a membrán citoplazmatikus oldalán található [4] .

Az enzim mindhárom izoformája megtalálható az emlősök szöveteiben. A máj izoforma (CPT1A vagy CPTI-L) a vázizomsejtek és a barna zsírszövetsejtek kivételével az összes testsejt mitokondriumában lokalizálódik [5] [6] . Az izoforma (CPT1B vagy CPTI-M) a szívizomban, a vázizomsejtekben (miocitákban) és a barna zsírszövet sejtjeiben termelődő, erősen expresszált fehérje [4] [5] [6] . A harmadik izoformát, az agyi izoformát (CPT1C) 2002-ben izolálták, és túlnyomórészt az agyban és a herékben található . Erről a formáról keveset tudunk [7] [8] .

Az összes CPT1 izoforma pontos szerkezetét még nem határozták meg, bár in silico modelleket hoztak létre szorosan rokon CPT1 enzimek - acilkarnitin transzferázok, például karnitin-acetiltranszferáz (CRAT) alapján [9] .

A CPT1 és a CPT2, a CRAT és a karnitin-oktanoiltranszferáz (COT) közötti fontos szerkezeti különbség az, hogy a CPT1 egy további domént tartalmaz az N-terminálison, körülbelül 160 aminosavból . Azt találták, hogy ez a további N-terminális domén fontos a kulcsenzim inhibitor molekula, a malonil-CoA számára [10] .

Két különböző kötőhelyet javasoltak, amelyek a CPT1A-ban és a CPT1B-ben találhatók. Úgy tűnik, hogy az A hely vagy a CoA hely megköti a malonil-CoA-t és a palmitoil-CoA-t, valamint más koenzim-A-tartalmú molekulákat. Felmerült, hogy a malonil-CoA a CPT1A kompetitív inhibitoraként viselkedhet ezen a helyen. A másodikban, az O helyen , úgy gondolják, hogy a malonil-CoA sokkal erősebben kötődik, mint az A helyen . Az A helytől eltérően az O hely a malonil-CoA-hoz a malonát-dikarbonil-csoporton keresztül kötődik [11] . A malonil-CoA kötődése az enzimhez az A és O helyeken keresztül gátolja a CPT1A hatását azáltal, hogy megszünteti a karnitin enzim általi kötődését.

Reakció mechanizmus

Az enzim kristályszerkezetére vonatkozó adatok hiánya miatt a CPT1 katalízis pontos mechanizmusa még nem ismert. Néhány különböző lehetséges mechanizmust feltételeztek a CPT1-re, amelyek mindegyike magában foglal egy hisztidin -maradékot , a His473 -at , amely kulcsfontosságú katalitikus helyként szolgál. Az egyik ilyen mechanizmus az alább bemutatott karnitin-acetil-transzferáz modellen alapul, amelyben a His473-maradék deprotonálja a karnitint, míg a szomszédos szerinmaradék stabilizálja az oxianion tetraéderes intermedierjét .


Egy másik mechanizmus azon a feltételezésen alapul, hogy létezik egy úgynevezett katalitikus triád, amely Cys-305 , His-473 és Asp-454 aminosavakból áll , és amelyek katalitikus aciltranszfert hajtanak végre [12] . Ez a katalitikus mechanizmus magában foglalja egy kovalens tioacil enzim intermedier képződését a Cys-305-tel.

Biológiai funkciók

A karnitin-palmitoil-transzferáz rendszer fontos lépés a hosszú szénláncú zsírsavak béta-oxidációjában . A hosszú szénláncú zsírsavak, mint például a palmitoil-CoA, a rövid- és közepes szénláncú zsírsavakkal ellentétben nem tudnak szabadon átdiffundálni a belső mitokondriális membránon (át nem eresztő), ehhez az átmenethez karnitin transzfer szállítja őket a mátrixba . [13] .

A karnitin-palmitoil-transzferáz I a rendszer első komponense és a karnitin transzportrendszer sebességkorlátozó kémiai reakciója , amely katalizálja az acilcsoport átvitelét a koenzim A -ból a karnitinbe, palmitoil-karnitin képződésével. Egy transzlokáz ( karnitin-acilkarnitin transzlokáz , CACT) segítségével a palmitoil-karnitin elősegített diffúzióval ( antiport ) a belső mitokondriális membránon keresztül jut a mátrixba.

Az acilcsoport-akceptorként működő karnitin szerepet játszhat az intracelluláris koenzim A pool: acil-CoA/CoA arány szabályozásában is [14] .

rendelet

A CPT1-et a malonil-CoA gátolja, bár a gátlás pontos mechanizmusa ismeretlen. A CPT1 vázizom és szívizom izoforma (CPT1B) 30-100-szor érzékenyebb a malonil-CoA gátlására, mint az analóg CPT1A izoforma. Ez a gátlás jó célpont a CPT1 szabályozására irányuló jövőbeni kísérletekhez az anyagcserezavarok kezelésében [15] .

Az acetil-CoA karboxiláz (ACC), egy enzim, amely katalizálja a malonil-CoA képződését acetil-CoA-ból, fontos szerepet játszik a zsírsav- anyagcsere szabályozásában . A tudósok kimutatták, hogy az ACC2 knockout egerek zsír- és súlycsökkenést eredményeztek a vad típusú egerekhez képest. Ez a csökkent ACC-aktivitás eredménye, amely a malonil-CoA-koncentráció későbbi csökkenését okozza. A malonil-CoA ezen csökkent szintje viszont megakadályozza a CPT1 gátlását, ami a zsírsav-oxidáció marginális növekedését eredményezi [16] . Mivel a szív- és vázizomsejtek alacsony zsírsavszintetizáló képességgel rendelkeznek, az ACC kizárólag szabályozó enzimként tud működni ezekben a sejtekben.

Orvosi jelentősége

Emberben csak a "CPT1A" hiányt (karnitin-palmitoiltranszferáz I hiányt) írtak le [17] . Ez egy ritka betegség, amelyet a hypoketonimiás hipoglikémia, görcsrohamok, hepatikus encephalopathia és újszülöttek hirtelen csecsemőhalálának magas kockázata jellemez [18] .

A CPT1 összefüggésben áll a 2- es típusú diabetes mellitusszal és az inzulinrezisztenciával is .

Az Európai Bizottság a Sclerosis Multiplex Kezelési és Kutatási Bizottságának (ECTRIMS) 2015-ös kongresszusán bemutatott új kutatás arra utal, hogy a CPT1 szerepet játszhat a sclerosis multiplex (MS) patológiájában is [19] . A kutatók azt találták, hogy a CPT1 gén mutációi bizonyos populációkban védelmet nyújtanak a szklerózis multiplex ellen. Ez a hipotézis az, hogy a lipidmetabolizmus fokozódása az idegsejtek demielinizációjához ( mielin pusztulásához ) vezethet, ezáltal lehetővé téve az idegsejtek elleni autoimmun támadást. John Dirk Nyland PhD és munkatársai a dán Aalborg Egyetemen olyan adatokat szolgáltattak, amelyek azt mutatják, hogy az SM állatmodelljeiben a CPT1-et az etomoxir nevű molekula blokkolja, ami nagy valószínűséggel enyhíti a betegség tüneteit [20] . A kutatók jelenleg egy beteg embereken végzett klinikai vizsgálat támogatását kérik.

Kölcsönhatások más fehérjékkel

A CPT1-ről ismert, hogy kölcsönhatásba lép számos fehérjével, beleértve az NDUF családba tartozókat , a PKC1 -et és az ENO1 -et [21] .

Az shRNS - könyvtár szűrésével kiütött CPT1A gátolja a HIV-1 replikációját tenyésztett Jurkat T-sejtekben [22] .

Jegyzetek

  1. Jogl G., Tong L. A karnitin-acetiltranszferáz kristályszerkezete és következményei a katalitikus mechanizmusra és a zsírsavtranszportra  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2003. - január ( 112. kötet , 1. szám ). - 113-122 . o . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)01228-X . — PMID 12526798 .
  2. van der Leij FR, Huijkman NC, Boomsma C., Kuipers JR, Bartelds B. A humán karnitin-aciltranszferáz gének   genomikája // Molecular Genetics and Metabolism : folyóirat. - 2000. - Vol. 71 , sz. 1-2 . - 139-153 . o . - doi : 10.1006/mgme.2000.3055 . — PMID 11001805 .
  3. Bonnefont JP, Djouadi F., Prip-Buus C., Gobin S., Munnich A., Bastin J. Carnitine palmitoyltransferases 1 and 2: biochemical, molekuláris és orvosi vonatkozások   // Molecular Aspects of Medicine : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 25 , sz. 5-6 . - P. 495-520 . - doi : 10.1016/j.mam.2004.06.004 . — PMID 15363638 .
  4. 1 2 Yamazaki N., Yamanaka Y., Hashimoto Y., Shinohara Y., Shima A., Terada H. A humán izomtípust kódoló gén szerkezeti jellemzői, karnitin palmitoiltranszferáz I  //  FEBS Letters : folyóirat. - 1997. - június ( 409. évf . , 3. sz.). - P. 401-406 . - doi : 10.1016/S0014-5793(97)00561-9 . — PMID 9224698 .
  5. 1 2 Brown NF, Hill JK, Esser V., Kirkland JL, Corkey BE, Foster DW, McGarry JD Mouse fehér zsírsejtek és 3T3-L1 sejtek a karnitin palmitoiltranszferáz (CPT) I izoformájának anomális mintázatát mutatják a differenciáció során. A CPT I és CPT II enzimek szövetek és fajok közötti expressziója  //  The Biochemical Journal : folyóirat. - 1997. - október ( 327. kötet (Pt 1) ). - P. 225-231 . — PMID 9355756 .
  6. 1 2 Lee J., Ellis JM, Wolfgang MJ. A zsírsavak oxidációja szükséges a termogenezishez, és fokozza az oxidatív stressz által kiváltott gyulladást  //  Cell Reports : folyóirat. - 2015. - január ( 10. évf. , 2. sz.). - 266-279 . o . - doi : 10.1016/j.celrep.2014.12.023 . — PMID 25578732 .
  7. Price N., van der Leij F., Jackson V., Corstorphine C., Thomson R., Sorensen A., Zammit V. A novel brain-expressed protein related to carnitine palmitoyltransferase I  // Genomics  :  Journal. - Academic Press , 2002. - október ( 80. évf. , 4. szám ). - P. 433-442 . - doi : 10.1006/geno.2002.6845 . — PMID 12376098 .
  8. Lavrentyev EN, Matta SG, Cook GA Három karnitin-palmitoiltranszferáz-I izoforma expressziója a patkányagy 10 régiójában etetés, koplalás és cukorbetegség során  //  Biokémiai és biofizikai kutatási közlemények : folyóirat. - 2004. - február ( 315. évf. , 1. sz.). - 174-178 . o . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.01.040 . — PMID 15013442 .
  9. Morillas M., López-Viñas E., Valencia A., Serra D., Gómez-Puertas P., Hegardt FG, Asins G. Structural model of carnitine palmitoyltransferase I based on the  The//carnitine acetyltransferase crystal  : folyóirat. - 2004. - május ( 379. köt. , 3. sz.). - P. 777-784 . - doi : 10.1042/BJ20031373 . — PMID 14711372 .
  10. Woldegiorgis G., Dai J., Arvidson D. Structure-Function Studies with the Mitochondrial Carnitine Palmitoyltransferases I and II  //  Monatshefte fur Chemie : Journal. - 2005. - 20. évf. 136. sz . 8 . - P. 1325-1340 . - doi : 10.1007/s00706-005-0334-7 .
  11. López-Viñas E., Bentebibel A., Gurunathan C., Morillas M., de Arriaga D., Serra D., Asins G., Hegardt FG, Gómez-Puertas P. Definition by function and structure analysis of two malonyl- CoA helyek a karnitin palmitoiltranszferáz 1A-ban  (angol)  // The Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 2007. - június ( 282. évf . , 25. sz.). - P. 18212-18224 . - doi : 10.1074/jbc.M700885200 . — PMID 17452323 .
  12. Liu H., Zheng G., Treber M., Dai J., Woldegiorgis G. Az izom karnitin palmitoiltranszferáz I cisztein-szkennelő mutagenezise egyetlen cisztein-maradékot (Cys-305) tár fel a  katalízis szempontjából  The//  : folyóirat. - 2005. - február ( 280. évf. , 6. sz.). - P. 4524-4531 . - doi : 10.1074/jbc.M400893200 . — PMID 15579906 .
  13. Berg JM, Tymoczo JL, Stryer L, "Biochemistry", 6. kiadás, 2007
  14. Jogl G., Hsiao YS, Tong L. A karnitin-aciltranszferázok szerkezete és funkciója  //  Annals of the New York Academy of Sciences : folyóirat. - 2004. - november ( 1033. évf . , 1. sz.). - 17-29 . o . - doi : 10.1196/annals.1320.002 . — PMID 15591000 .
  15. Shi J., Zhu H., Arvidson DN, Woldegiorgis G. Az emberi szívizom karnitin-palmitoiltranszferáz I első 28 N-terminális aminosav-maradéka elengedhetetlen a malonil-CoA érzékenységhez és a nagy affinitású kötéshez  //  Biochemistry : Journal. - 2000. - február ( 39. évf. , 4. sz.). - P. 712-717 . doi : 10.1021 / bi9918700 . — PMID 10651636 .
  16. Abu-Elheiga L., Oh W., Kordari P., Wakil SJ Acetyl-CoA karboxiláz 2 mutáns egerek védettek az elhízással és a cukorbetegséggel szemben, amelyet a magas zsír-/magas szénhidráttartalmú diéták indukálnak   // Proceedings of the National Academy of Sciences of az Amerikai Egyesült Államok  : folyóirat. - 2003. - szeptember ( 100. évf. , 18. sz.). - P. 10207-10212 . - doi : 10.1073/pnas.1733877100 . — PMID 12920182 .
  17. Ogawa E., Kanazawa M., Yamamoto S., Ohtsuka S., Ogawa A., Ohtake A., Takayanagi M., Kohno Y. Karnitin palmitoiltranszferáz IA hiány két mutációjának expressziós elemzése  //  Journal of Human Genetics : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 47 , sz. 7 . - P. 342-347 . - doi : 10.1007/s100380200047 . — PMID 12111367 .
  18. Collins SA, Sinclair G., McIntosh S., Bamforth F., Thompson R., Sobol I., Osborne G., Corriveau A., Santos M., Hanley B., Greenberg CR, Vallance H., Arbor L. A karnitin-palmitoiltranszferáz 1A (CPT1A) P479L előfordulása élő újszülötteknél Yukonban, az északnyugati területeken és a Nunavutban  //  Molekuláris genetika és metabolizmus : folyóirat. - 2010. - 20. évf. 101 , sz. 2-3 . - P. 200-204 . - doi : 10.1016/j.ymgme.2010.07.013 . — PMID 20696606 .
  19. Wilner, AN (2015. december 1.), Exploring a New Mechanism of action of MS Drugs, Exploring a New Mechanism of action of MS Drugs, An Expert Interview with John Dirk Nieland, PhD , Medscape , < http://www.medscape.com/viewarticle/854957 > . Letöltve: 2015. december 3. Archiválva : 2016. május 25. a Wayback Machine -nél 
  20. Nieland JD Nieland JG Mørkholt AS Bolther L Nielsen S (2015. október 7–10.), Abstract P1497. A CPT1a mutáció vezeti az utat a sclerosis multiplex kezelésére szolgáló új gyógyszerek kidolgozásához, a Sclerosis Multiplex kezelésével és Kutatásával foglalkozó Európai Bizottság (ECTRIMS) 31. kongresszusa, Barcelona, ​​Spanyolország, végleges program 
  21. Havugimana PC, Hart GT, Nepusz T., Yang H., Turinsky AL, Li Z., Wang PI, Boutz DR, Fong V., Phanse S., Babu M., Craig SA, Hu P., Wan C. , Vlasblom J., Dar VU, Bezginov A., Clark GW, Wu GC, Wodak SJ, Tillier ER, Paccanaro A., Marcotte EM, Emili A. Acensus of human soluble protein complexes  (angol)  // Cell . - Cell Press , 2012. - augusztus ( 150. évf. , 5. sz.). - P. 1068-1081 . - doi : 10.1016/j.cell.2012.08.011 . — PMID 22939629 .
  22. Yeung ML, Houzet L., Yedavalli VS, Jang KT Jurkat T-sejtek genom-szintű rövid hajtű-RNS-szűrése a HIV-1 produktív replikációjához hozzájáruló humán fehérjékre  // The  Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 2009. - július ( 284. évf . , 29. sz.). - P. 19463-19473 . - doi : 10.1074/jbc.M109.010033 . — PMID 19460752 .

Lásd még