Brómodomén tartalmú fehérje 4

Brómodomén tartalmú fehérje 4
Elérhető struktúrák
EKTHumán UniProt keresés: PDBe RCSB
Azonosítók
Szimbólumok BRD4 , CAP, HUNK1, HUNKI, MCAP, 4-et tartalmazó bromodomén
Külső azonosítók OMIM: 608749 Homologén: 137685 GeneCards: 23476
A gyógyszer célpontja
gyógyszer neve Hivatkozások
Viroporin 3a [SARS-CoV-2]
RNS expressziós profil


Több információ
ortológusok
Fajták Emberi Egér
Entrez
Együttes
UniProt
RefSeq (mRNS)

NM_014299
NM_058243
NM_001330384
NM_001379291
NM_001379292

n/a

RefSeq (fehérje)

NP_001317313
NP_055114
NP_490597
NP_001366220
NP_001366221

n/a

Locus (UCSC) Chr 19: 15,24 – 15,33 Mb n/a
PubMed Keresés [2] n/a
Szerkesztés (ember)

A bromodomént tartalmazó protein 4 ( BRD4) egy kromatinkötő  fehérje , amelyet a BRD4 gén kódol emberben . Felismeri és kötődik az acetilezett lizin-maradékokhoz a hisztonokban és más fehérjékben. A BRD4 részt vesz az epigenetikai információk transzkripciójának és átvitelének szabályozásában a sejtosztódás során [1] . 2016-ban kiderült, hogy a BRD4-nek saját hiszton-acetil-transzferáz aktivitása van [2] .

A BRD4 a BET fehérjék családjába tartozik, amely két tandem bromodomént és egy extraterminális domént tartalmaz . Ebbe a családba a BRD4 mellett további három emberi fehérje tartozik: BRD2, BRD3 és BRDT [3] .

Eloszlás és intracelluláris lokalizáció

A BRD4 RNS és fehérje a sejt- és szövettípusok túlnyomó többségében jelen van [4] [3] .

A BRD4 főként a sejtmagban lokalizálódik, de kis mennyiségben a citoplazmában is jelen lehet [1] .

Gén és fehérje szerkezete

Az alternatív splicing eredményeként a fehérje két izoformája képződik. A hosszabb és gyakoribb izoforma 1362 aminosavból áll , molekulatömege pedig körülbelül 152 kDa . A BRD4 biológiai aktivitása ehhez a különleges izoformához kapcsolódik. A második izoforma a C-terminálisról lerövidült, 723 aminosavból áll, és molekulatömege 88 kDa. A rövid izoforma sokkal ritkábban található, mint a hosszú izoforma, funkciója ismeretlen [3] [1] .

A BRD4 két konzervált brómdomént tartalmaz a molekula N-terminálisán. A bromodomének négy α-hélixből állnak, amelyeket mozgatható hurkok kapcsolnak össze. A hélixek és hurkok együtt egy hidrofób zsebet alkotnak, amely felismeri a fehérjékben lévő acetilizin-maradékokat [5] .

A BRD4 C-terminális extraterminális doménje részt vesz a P-TEFb transzkripciós faktor kötődésében [5] .

Funkciók

Szerep az átírásban

A BRD4 a transzkripció globális szabályozójaként működik, és többféle módon is működhet, passzívan és aktívan.

A többsejtű szervezetek génjeinek jelentős részének transzkripciója leáll a korai elongáció szakaszában , amikor a szintetizált pre-mRNS hossza körülbelül 60 nukleotid [6] . Ennek egyik oka a DSIF ( DRB érzékenységet indukáló faktor ) és NELF ( negatív elongációs faktor ) negatív szabályozó faktorok egymás utáni kapcsolódása a transzkripciós komplexhez , amelyek meggátolják az  RNS polimeráz II további fejlődését . A transzkripció újraindítása a P-TEFb faktor részvételével történik. A P-TEFb egy heterodimer, amely ciklinfüggő kináz 9-ből és szabályozó alegységéből, a ciklin T1, T2 vagy K-ből áll. A P-TEFb foszforilezi a DSIF-et és a NELF-et, és ezáltal gátolja azok aktivitását. Ezenkívül a P-TEFb foszforilezi a heptád ismétlődéseket az RNS polimeráz II C-terminális doménjében a Ser - 2 pozícióban, ami szintén elősegíti az aktív elongációt [5] . A BRD4 felelős a P-TEFb transzkripciós komplexhez való toborzásáért, amely a gének közel promóterrégióihoz kötődik a hisztonok acetilizin-maradékaival kölcsönhatásba lépve [7] [8] .  

A BRD4 egy atipikus protein kináz : képes önállóan foszforilálni az RNS polimeráz II-t a Ser-2 pozícióban, anélkül, hogy egyértelmű szerkezeti homológiát mutatna más protein kinázokkal [9] .

Szerep az egyes gének transzkripciójában

A BRD4 stimulálja a PD-L1 fehérjét kódoló CD274 gén transzkripcióját , függetlenül a MYC-től. Példaként a petefészekrákot és a B-sejtes limfómát használva kimutatták, hogy a BRD4-gátlók, például a JQ1 alkalmazása a PD-L1 mennyiségének csökkenéséhez vezet a tumorsejtek felszínén, és T-sejtet indukál. immunválasz ellenük [10] [11] .

Szerepe a kromatin szerkezetének szabályozásában

2016-ban kiderült, hogy a BRD4 egy hisztoacetil-transzferáz [2] . A 3-as és 4-es hiszton N-terminális fragmenseiben található lizin-maradékokat, valamint a 3-as hiszton Lys-122-jét acetilezi. Ez utóbbi csoport acetilezése jelentősebb hatással van a nukleoszóma -destabilizációra , mert a globuláris C-ben található. -terminális hiszton domén és közvetlen kapcsolatban áll a DNS -sel . Csak két másik hisztoacetil-transzferáz ismert, amely képes acetilezni a Lys-122-t a hiszton 3-ban: p300 és CBP. A BRD4 hiszton-acetil-transzferáz aktivitása kromatin dekompaktációt okoz (és ezáltal serkenti a transzkripciót) a genom számos régiójában , beleértve a MYC , FOS és AURKB gének régióját is .

Szerep az emberi betegségekben

Először írták le a BRD4 különleges szerepét az emberi betegségekben egy ritka típusú karcinóma elemzésében, amelyet kromoszómatranszlokáció jellemez, t(15;19) [12] . Ez a transzlokáció egyesíti a BRD4 gén első felét és a NUT gén szinte teljes kódoló régióját [13] . Ennek eredményeként a BRD4-NUT kiméra onkoprotein képződik, amely felelős e karcinóma szokatlanul agresszív természetéért [14] .

Jegyzetek

  1. 1 2 3 BRD4 az UniProt adatbázisban . Letöltve: 2014. szeptember 11. Az eredetiből archiválva : 2017. szeptember 2..
  2. 1 2 Devaiah BN , Case-Borden C. , Gegonne A. , Hsu CH , Chen Q. , Meerzaman D. , Dey A. , Ozato K. , Singer DS A BRD4 egy hiszton-acetiltranszferáz, amely nukleoszómákat ürít ki a kromatinokból.  (angol)  // Természeti strukturális és molekuláris biológia. - 2016. - doi : 10.1038/nsmb.3228 . — PMID 27159561 .
  3. 1 2 3 Wu SY , Chiang CM A kettős brómdomént tartalmazó kromatin adapter Brd4 és a transzkripciós szabályozás.  (angol)  // The Journal of Biological Chemistry. - 2007. - Vol. 282. sz. 18 . - P. 13141-13145. - doi : 10.1074/jbc.R700001200 . — PMID 17329240 .
  4. BRD4 a Human Protein Atlas weboldalán . Letöltve: 2014. szeptember 11. Az eredetiből archiválva : 2014. július 19.
  5. 1 2 3 Shi J. , Vakoc CR A BET bromodomain gátlás terápiás aktivitásának hátterében álló mechanizmusok.  (angol)  // Molekuláris sejt. - 2014. - Kt. 54. sz. 5 . - P. 728-736. - doi : 10.1016/j.molcel.2014.05.016 . — PMID 24905006 .
  6. Kwak H. , Lis JT A transzkripciós megnyúlás szabályozása.  (angol)  // A genetika éves felülvizsgálata. - 2013. - Kt. 47. - P. 483-508. - doi : 10.1146/annurev-genet-110711-155440 . — PMID 24050178 .
  7. Jang MK , Mochizuki K. , Zhou M. , Jeong HS , Brady JN , Ozato K. A Brd4 bromodomén fehérje a P-TEFb pozitív szabályozó komponense, és stimulálja az RNS polimeráz II-függő transzkripciót.  (angol)  // Molekuláris sejt. - 2005. - 20. évf. 19, sz. 4 . - P. 523-534. - doi : 10.1016/j.molcel.2005.06.027 . — PMID 16109376 .
  8. Yang Z. , Yik JH , Chen R. , He N. , Jang MK , Ozato K. , Zhou Q. P-TEFb toborzása a Brd4 bromodomén fehérje általi transzkripciós elongáció stimulálására.  (angol)  // Molekuláris sejt. - 2005. - 20. évf. 19, sz. 4 . - P. 535-545. - doi : 10.1016/j.molcel.2005.06.029 . — PMID 16109377 .
  9. Devaiah BN , Lewis BA , Cherman N. , Hewitt MC , Albrecht BK , Robey PG , Ozato K. , Sims RJ 3rd , Singer DS A BRD4 egy atipikus kináz, amely foszforilezi az RNS-polimeráz II karboxi-RNS-terminális II doménjének szerin2-jét.  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2012. - Kt. 109. sz. 18 . - P. 6927-6932. - doi : 10.1073/pnas.1120422109 . — PMID 22509028 .
  10. Zhu H. , Bengsch F. , Svoronos N. , Rutkowski MR , Bitler BG , Allegrezza MJ , Yokoyama Y. , Kossenkov AV , Bradner JE , Conejo-Garcia JR , Zhang R. BET Bromodomain Inhibition by-tumor Immunitytes PD-L1 kifejezés.  (angol)  // Cellajelentések. - 2016. - Kt. 16. sz. 11 . - P. 2829-2837. - doi : 10.1016/j.celrep.2016.08.032 . — PMID 27626654 .
  11. Hogg SJ , Vervoort SJ , Deswal S. , Ott CJ , Li J. , Cluse LA , Beavis PA , Darcy PK , Martin BP , Spencer A. , ​​Traunbauer AK , Sadovnik I. , Bauer K. , Valent P. , Bradner JE , Zuber J. , Shortt J. , Johnstone RW BET-bromodomén-inhibitorok bekapcsolják a gazdaszervezet immunrendszerét és szabályozzák a PD-L1 immunellenőrző-ligandum expresszióját.  (angol)  // Cellajelentések. - 2017. - Kt. 18, sz. 9 . - P. 2162-2174. - doi : 10.1016/j.celrep.2017.02.011 . — PMID 28249162 .
  12. French CA , Miyoshi I. , Aster JC , Kubonishi I. , Kroll TG , Dal Cin P. , Vargas SO , Perez-Atayde AR , Fletcher JA BRD4 bromodomain génátrendeződés agresszív karcinómában transzlokációval t(15;19).  (angol)  // The American Journal of Patology. - 2001. - 20. évf. 159. sz. 6 . - P. 1987-1992. - doi : 10.1016/S0002-9440(10)63049-0 . — PMID 11733348 .
  13. Francia CA , Miyoshi I. , Kubonishi I. , Grier HE , Perez-Atayde AR , Fletcher JA BRD4-NUT fúziós onkogén: új mechanizmus az agresszív karcinómában.  (angol)  // Rákkutatás. - 2003. - 1. évf. 63. sz. 2 . - P. 304-307. — PMID 12543779 .
  14. Francia CA A NUT középvonali karcinóma patogenezise.  (angol)  // A patológia éves felülvizsgálata. - 2012. - Kt. 7. - P. 247-265. - doi : 10.1146/annurev-pathol-011811-132438 . — PMID 22017582 .