Alfa-galaktozidáz
A melibiázok (vagy α-galaktozidázok ) ( EC 3.2.1.22 ) olyan glikozil-hidrolázok , amelyek általában optikai konfigurációjuk megőrzésével képesek lehasítani az α-D-galaktóz terminális, nem redukáló maradékait az α-D - galaktozidokból . beleértve a galakto -oligoszacharidokat , galaktomannánokat és galaktolipideket . Legegyszerűbb természetes szubsztrátumuk a diszacharid melibióz és a triszacharid raffinóz . Számos esetben transzgalaktozidáz aktivitást találtak a melibiázisokban. Az α-N-acetil-galaktózaminidáz biokémiai és evolúciós szempontból hasonló az α-galaktozidázokhoz ( EC 3.2.1.49 ).
Családok melibiasis
Szerkezetük alapján az összes α-galaktozidáz katalitikus doménjét hat családba sorolták: GH4 , GH27 , GH36 , GH57 , GH97 és GH110 .
- A magasabb hierarchikus szinten lévő GH27 és GH36 családok alkotják a GH-D klánt. Ennek a klánnak a doménjei háromdimenziós (β/α) 8 hordós szerkezettel rendelkeznek, más néven TIM-hordó. Ez a háromdimenziós szerkezet a legelterjedtebb az összes glikozil-hidroláz katalitikus doménje között, és az egyik leggyakoribb az összes fehérje között. Valamennyi többsejtű élőlény és a legtöbb vizsgált egysejtű eukarióta és baktérium rendelkezik α-galaktozidázokkal. Az archaeák közül csak bizonyos fajoknál találhatók meg. A legtöbb eukarióta α-galaktozidáz a GH27 családba tartozik, míg a legtöbb bakteriális α-galaktozidáz a GH36 családba tartozik. Ez a két család szinte kizárólag α-galaktozidázt és α-N-acetil-galaktózaminidázt tartalmaz. A GH36 család filogenetikai analízise kimutatta annak polifiletikus eredetét, ami lehetővé tette ennek a családnak nyolc új családra való felosztását. Ez a nyolc család a GH27 és GH31 családdal együtt alkotja az α-galaktozidáz szupercsaládot.
- A GH97 család katalitikus doménjei szintén (β/α) 8 hordós szerkezettel rendelkeznek. Jelenleg ennek a családnak csak egy képviselője mutatott ki α-galaktozidáz aktivitást - a Bacteroides thetaiotaomicron baktérium egyik fehérjéjében .
- A GH57 család katalitikus doménjei a TIM hordóhoz hasonló szerkezetűek, a (β/α) 7 hordóhoz. A GH57 család mind a mai napig ismert régészeti α-galaktozidázokat, valamint számos más aktivitású prokarióta glikozil-hidrolázt tartalmaz.
- A GH4 család széles szubsztrátspecifitással rendelkező bakteriális glikozidázokat tartalmaz. Három közülük α-galaktozidáz aktivitást mutattak.
- A GH110 család egyedülálló α-galaktozidázokat tartalmaz, amelyek képesek lehasítani az α-D-galaktóz maradékokat optikai konfigurációjuk megfordításával . Ilyen enzimeket találtak a Bacteroides fragilis , B. thetaiotaomicron és Streptomyces avermitilis baktériumokban .
Valószínű, hogy a GH27, GH36, GH57 és GH97 családok α-galaktozidáz génjei közös evolúciós eredetűek.
Az α-galaktozidáz gén sok mutációja emberben Fabry - kórhoz , az α-N-acetil-galaktózaminidáz génben pedig Schindler - kórhoz , más néven
kórhozKanzaki
Lásd még
