Anyagcsere hálózat

A metabolikus hálózat  olyan anyagcsere- és fizikai folyamatok összessége, amelyek meghatározzák a sejt fiziológiai és biokémiai tulajdonságait . Mint ilyenek, ezek a hálózatok magukban foglalják az anyagcsere kémiai reakcióit , az anyagcsere-utakat , valamint az ezeket a reakciókat irányító szabályozási kölcsönhatásokat.

A teljes genom szekvenálásának köszönhetően ma már lehetséges a biokémiai reakciók hálójának rekonstrukciója számos szervezetben, a baktériumoktól az emberekig. Néhány ilyen hálózat elérhető online: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) [1] , EcoCyc [2] , BioCyc [3] és metaTIGER [4] . A metabolikus hálózatok hatékony eszközök az anyagcsere tanulmányozására és modellezésére.

Használat

A metabolikus hálózatok felhasználhatók a komorbiditási minták azonosítására beteg betegekben [5] . Egyes betegségek, mint például az elhízás és a cukorbetegség, egyszerre is jelen lehetnek ugyanabban a személyben, néha egy betegség jelentős kockázati tényező egy másik betegség számára [6] . Maguk a betegség fenotípusai általában annak az eredménye, hogy a sejt nem képes lebontani vagy előállítani a szükséges szubsztrátot. Azonban az egyik reakcióban fellépő enzimhiba befolyásolhatja a többi további reakció lefolyását. Ezek a kaszkádhatások a következő reakciókkal összefüggő anyagcsere-betegségekhez kapcsolódnak, amelyek komorbid hatásokhoz vezetnek. Így a metabolikus betegségek hálózatai felhasználhatók annak meghatározására, hogy két rendellenesség összefügg-e egymással a korrelált válaszok miatt [5] .

Lásd még

Hivatkozások

  1. GenomeNet . www.genome.ad.jp . Letöltve: 2020. április 1. Az eredetiből archiválva : 2009. február 24.
  2. EcoCyc: Encyclopedia of E. coli Genes and Metabolic Pathways . www.ecocyc.org .
  3. BioCyc Pathway/Genome Database Collection . biocyc.org .
  4. metaTIGER-Home . www.bioinformatics.leeds.ac.uk . Letöltve: 2010. június 9. Az eredetiből archiválva : 2012. március 4..
  5. 1 2 Lee, D.-S. (2008). "Az emberi metabolikus hálózat topológiájának hatása a betegségek komorbiditására." Proceedings of the National Academy of Sciences . 105 (29): 9880-9885. DOI : 10.1073/pnas.0802208105 . PMID  18599447 .
  6. Ross, R. (2000). „Az elhízás és a kapcsolódó társbetegségek csökkentése diéta vagy testmozgás okozta fogyás után férfiaknál. Véletlenszerű, kontrollált vizsgálat” . Annals of Internal Medicine . 133 (2): 92-103. DOI : 10.7326/0003-4819-133-2-200007180-00008 . PMID  10896648 .