Haplocsoport K(xLT) (Y-DNS)

Haplocsoport K(xLT) – MNOPS
A K(xLT) haplocsoport eredete - MNOPS
Típusú Y-DNS makrocsoport
Megjelenési idő 55-47 ezer évvel ezelőtt
Spawn helye Dél- vagy Közép -Ázsiában
Ősi csoport K makrocsoport
testvércsoportok LT makrocsoport ( L és T őse )
Alkládok K1, K2, K3, M és S , NO és P makrocsoportok
Marker mutációk M526/PF5979 (eredetileg rs2033003)

Az Y-kromoszómális haplocsoportokat vizsgáló populációgenetikában és humán genogeográfiában a K2 vagy K-M526 (korábbi nevén K(xLT) és MNOPS) patrilineális öröklődés , amelyet az M526/PF5979 Y-kromoszómális DNS-mutáció jellemez [1] . Mivel számos más haplocsoport származik belőle, ez egy makrocsoport . Az YFull cég szerint a K2 haplocsoport a K-M9 makrocsoportból származik 47 200 évvel ezelőtt [2] . Tamara Karafet és munkatársai egy 2014-es tanulmányukban arra a következtetésre jutottak, hogy a K2-M526 gyors diverzifikációja valószínűleg Délkelet-Ázsiában következett be [3] .

A fa korai változataiban az Y-DNS hiányzott (a K makrocsoportban a kis alkládokkal együtt az L, M, NO és P ágakat közvetlenül megkülönböztették; 2008-ban S és T hozzáadták őket). Ezt követően egy közös mutációt, az rs2033003-at fedeztek fel az NO és P csoportokban, és 2009-ben ezeket a haplocsoportokat a NOP makrocsoport ágaiként kezdték tekinteni . Azonban már 2010-ben kiderült, hogy ugyanaz a címke (M526 néven) az M és S csoportban is megtalálható, így létrejött az MNOPS makrocsoport . Továbbá 2011-ben olyan mutációkat fedeztek fel, amelyekben a rokon L és T, valamint az M526 haplocsoportokat a K1, K2, K3 és K4 kis alkládokban is megtalálták, így az LT csoport megjelent a haplocsoport fán, és az MNOPS csoportot átnevezték K-re ( xLT) . mivel most már csak két ág maradt a K makrocsoport alatt: "LT" és "nem LT".

Az IHC ( eng.  Y Chromosome Consortium (YCC) ) ezen „forradalmi” döntése számos vitára adott okot, mert először is zűrzavar támadt: a K1, K2, K3, K4 csoportok nem közvetlenül a K-hez kapcsolódnak, de ehelyett a K(xLT) alkládjára, másodszor a „K(xLT)” kifejezés hagyományosan azt jelenti, hogy „mindent, ami K-re vonatkozik, kivéve az LT-t” (vagy röviden: „K az LT-n kívül”). nem egyértelmű módja annak, hogy különbséget tegyen a régi és az új felhasználás között. Jelentésük különbsége ebben a konkrét esetben nem nagy, de egészen határozott, nevezetesen: a "K(xLT)" a hagyományos értelemben magában foglalja a K* paracsoportot és a jövőben esetleg a K azon nyitott ágait is, amelyek nem rendelkeznek címke M526, de nem tartoznak az LT-hez és az LT-hez.

A hagyományos megoldás ebben a helyzetben a következő lenne:

  1. nevezzük át a K1, K2, K3 és K4 haplocsoportokat U, V, W és X-re, az MNOPS makrocsoportot pedig MNOPSUVWX-re;
  2. a K1, K2, K3 és K4 átnevezése K(xLT)1, K(xLT)2, K(xLT)3 és K(xLT)4 névre;
  3. nevezze át az LT-t K1-re, az MNOPS-t K2-re, a K1-et, K2-t, K3-at és a K4-et pedig K2a-ra, K2b-re, K2c-re és K2d-re, ebben az esetben M, NO, P és S a K2 ág részhalmazai;

a Konzorcium azonban nem találta kielégítőnek ezeket a lehetőségeket, és úgy döntött, hogy kivételként hierarchikus inkonzisztenciát engedélyez a K és K(xLT) ágak kijelölésében.

2012-ben a K1-es alágat eltávolították a fáról, mivel nem volt elég ősi, és a K2-t, a K3-at és a K4-et átnevezték K1-re, K2-re és K3-ra.

Ősföldrajz

Fa

Az általános felépítés a következő:

A K(xLT) makrocsoport elnevezett alkládjainak fája és az azokat meghatározó mutációk 2013 elején a következő [10] (a haplocsoportok leszálló ágait kihagyjuk):

K(xLT) (M526/PF5979)


Az emberi Y-kromoszóma haplocsoportokevolúciós fája
Y-kromoszómális Ádám
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1 F2 F3     GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
én J LT(K1) K2
L(K1a)   T(K1b)       K2a/K2a1/ NO /NO1 K2b
N O   K2b1     P(K2b2) /P1  
  S(K2b1a) M(K2b1b) K R  


Jegyzetek

  1. ↑ Jacques Chiaroni, Peter A. Underhill és Luca L. Cavalli-Sforza, "Y-kromoszóma diverzitás, emberi terjeszkedés, sodródás és kulturális evolúció", a PNAS 2009. november 17-én, a nyomtatás előtt megjelent online, doi: 10.1073/pnas.0901080
  2. ↑ KYTree . Hozzáférés dátuma: 2016. július 30. Az eredetiből archiválva : 2016. május 20.
  3. ↑ Karafet, Tatiana; Mendez, Fernando; Sudoyo, Herawati. A K-M526 Y-kromoszóma haplocsoport jobb filogenetikai felbontása és gyors diverzifikációja Délkelet-Ázsiában  (angol)  // Nature : Journal. - 2014. - Kt. 23 . - P. 369-373 . - doi : 10.1038/ejhg.2014.106 . — PMID 24896152 .
  4. ↑ Kiegészítő információk 9. Az Ust'Ishim Y-kromoszóma filogenetikai rekonstrukciója . Letöltve: 2014. december 6. Az eredetiből archiválva : 2016. március 24..
  5. ↑ paleolit ​​DNS Eurázsiából Archiválva : 2016. október 3. a Wayback Machine -nél
  6. ↑ Posnik GD et al. (2016) Punctuated bursts in human male demographer 1244 világméretű Y-kromoszóma szekvenciából következtetve Archiválva : 2017. május 28., a Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593–599 (Poznik supp. 15. ábra).
  7. ↑ A mai és az ókori DNS-adatok letölthető genotípusai (publikált közleményekből összeállított) | David Reich Lab (nem elérhető link) . reich.hms.harvard.edu . Letöltve: 2019. szeptember 11. Az eredetiből archiválva : 2019. november 2. 
  8. ↑ Manfred Kayser, Ying Choi, Mannis van Oven és társai. , "Az ausztronéz terjeszkedés hatása: bizonyítékok az mtDNS és az Y-kromoszóma sokféleségéből a Melanéziai Admiralitás-szigeteken", Molecular Biology and Evolution (2008)
  9. ↑ Tatiana M. Karafet, Brian Hallmark, Murray P. Cox et al. , "A fő kelet-nyugati részleg az Y kromoszóma rétegződés hátterében áll Indonéziában", az MBE Advance Access közzététele 2010. március 5.
  10. ↑ Y-DNS Haplogroup K és alkládjai -  2013 . Nemzetközi Genetikai Genealógiai Társaság (utolsó frissítés: 2013. január 4.). Hozzáférés dátuma: 2013. január 7. Az eredetiből archiválva : 2013. január 11.

Linkek