Bakterioklorofillok

A bakterioklorofillok a fotoszintetikus tetrapirrol pigmentek  heterogén csoportja , amelyeket különböző anoxigén fototróf baktériumok szintetizálnak, amelyek oxigénfejlődés nélkül fotoszintézist hajtanak végre .

A sejtekben lévő bakterioklorofillok spektrális tulajdonságai jelentősen eltérnek az oldatoktól, és molekuláik nem kovalens kölcsönhatásai határozzák meg az őket tartalmazó fehérjékkel, valamint egymással.

A bakterioklorofillok kémiai szerkezete

Az a , b és g bakterioklorofillok bakterioklorinok , azaz egy bakterioklór-makrociklust tartalmaznak  , két redukált pirrolgyűrűvel (II és IV).

A c-f bakterioklorofilleknek a klorofillekhez hasonlóan egy klórmakrociklusos gyűrűjük van, egyetlen teljesen redukált pirrolgyűrűvel IV. Az összes többi klorofillel és bakterioklorofillel ellentétben az összes többi klorofilre és bakterioklorofilra jellemző R 5 pozícióban hiányzik belőlük a -COOCH 3 csoport . Ezen bakterioklorofillok mindegyikének több formája van, amelyek különböznek az R3 és R4 gyökökben , valamint az R5 észterező alkoholban [ 1] [2] .

Név Szerkezet R1_ _ R2_ _ R3_ _ Kommunikáció C7-C8 R4_ _ R5 R6_ _ R7_ _
Bakterioklorofill a –CO–CH 3 –CH3a _ _ –CH2CH3 _ _ _ egyetlen -CH3 _ -CO-O- CH3 -kanóc

- geranilgeranil

-H
Bakterioklorofill  b -CO - CH3 -CH3a _ _ =CH- CH3 egyetlen –CH3_ _ –CO–O–CH 3 -kanóc – H
Bakterioklorofill c –CHOH– CH3 –CH3_ _ –C 2 H 5 b
– C 3 H 7
– C 4 H 9
kettős –CH3 –C2H5 _ _ _ _
– H Farnezil stb. –CH3_ _
Bakterioklorofill d –CHOH– CH3 –CH3_ _ –C 2 H 5 b
– C 3 H 7
– C 4 H 9
kettős –CH3 –C2H5 _ _ _ _
– H Farnezil stb. – H
Bakterioklorofill e –CHOH– CH3 –CHO –C 2 H 5 b
– C 3 H 7
– C 4 H 9
kettős –CH3 –C2H5 _ _ _ _
– H Farnezil stb. –CH3_ _
Bakterioklorofil f –CHOH– CH3 –CHO –C 2 H 5 b
– C 3 H 7
– C 4 H 9
kettős ––CH 3
–C 2 H 5
– H Farnezil stb. – H
Bakterioklorofil g –CH = CH2 –CH3a _ _ \u003d CH-CH 2 egyetlen –CH3_ _ –CO–O–CH 3 - geranilgeranil – H

Kémiai tulajdonságok

A bakterioklorofillok instabilak fénnyel, savakkal és oxidálószerekkel szemben. Poláros oldószerekben (például metanolban) könnyen allomerizálódnak; savak jelenlétében elvesztik a központi magnéziumatomot (feofitinizálódnak) és/vagy az észterező maradékot (fitol/farnezol/geranilgeriniol stb.) [3] .

A b   és g bakterioklorofillok , amelyek C-8 helyen etilidéncsoportot tartalmaznak, enyhén savas közegben izomerizálódnak, és klórokat képeznek. A g bakterioklorofill különösen könnyen izomerizálható , így klorofill a G [4] .

A bakterioklorofillok molekuláiban lévő oxigén hatására az öttagú V gyűrű oxidatív felszakadása következik be; a jövőben a C-13 és C-14 atomoknál képződött savmaradékok ismét egy hattagú anhidridgyűrűvé zárulhatnak bakteriopurpurin vagy purpurin képződésével [3] [5] .  

Bioszintézis

Az a, b és g bakterioklorofillidek , valamint a c-e [6] [7] (E,M)-bakterioklorofillidek bioszintézisének egyszerűsített sémája az ábrán látható.

Korábban azt feltételezték, hogy a c-e bakterioklorofillok bioszintézisének első lépése, a C13 2 helyen karboximetil-szubsztituens nélküli V gyűrű kialakulása már a 3,8-divinil-protoklorofillid a kialakulása előtt is megtörténhet [8] . Ezt jelenleg valószínűtlennek tartják [6] [9] .

A bioszintézis utolsó szakasza, a bakterioklorofillidek bakterioklorofillokká történő átalakulása az a, b és g bakterioklorofillokban a BchG gének, a klorobium -klorofillokban pedig a BchK által kódolt észterázok segítségével valósul meg. A c-e bakterioklorofillok metilált formáinak szintézisében a C12 1 -carbon BchR metiláz és a BchQ C8 2 -metiláz is részt vesz. Szubsztrátjaik nyilvánvalóan bármilyen klorofillidek, amelyek C3-nál hidroxi-metil-maradékot tartalmaznak, azaz a metilezés a 8-etil-12-metil-bakterioklorofillid d képződése után bármely szakaszban megtörténhet .

Elosztás

Az anoxigén fototróf baktériumok legszélesebb körben elterjedt pigmentje a bakterioklorofill a . Ez a domináns klór pigment a legtöbb fototróf proteobaktérium, az összes zöld kénbaktérium (Chlorobiaceae) és a fonalas anoxigén fototróf (Chloroflexia) reakcióközpontjában. Néhány fototróf proteobaktériumban az a-t bakterioklorofill teljesen felváltja a bakterioklorofill b . A bakterioklorofill g csak a baktériumok egy csoportjában található, a fajok számát és elterjedését tekintve kicsi, a heliobaktériumokban .

A c-f bakterioklorofillok kizárólag kloroszómákban, speciális fotoszintetikus antennakomplexekben találhatók meg minden zöld kénbaktériumban (Chlorobiales) , néhány fonalas anoxigén fototrófban (Chloroflexia), valamint a nemrég felfedezett fotoheterotróf acidobaktériumban , a Chloracidobacterium0 ] thermophilumban .

Pigment Baktérium csoport Maximális infravörös abszorpció in vivo ( nm )
Bakterioklorofill  a Lila baktériumok (többség), Chlorobiaceae, Chloroflexales és Chloracidobacterium thermophilum 805-815, 830-890
Bakterioklorofill b Lila baktériumok (néhány) 835-850, 1020-1040
Bakterioklorofill c Chlorobiaceae (zöld törzsek) a legtöbb Chloroflexia , Chloracidibacterium thermophilum 745-755
Bakterioklorofill  d zöld Chlorobiaceae törzsek , Chloronema ( Chloroflexia ) 705-740
Bakterioklorofill e a Chlorobiaceae barna törzsei 719-726
Bakterioklorofil f a Chlorobiaceae néhány laboratóriumi törzse ~705-707
Bakterioklorofil g Heliobacteriumok 670-788

Jegyzetek

  1. Scheer, H. (2006). A klorofillok és bakterioklorofillok áttekintése: biokémia, biofizika, funkciók és alkalmazások   In: ​​B. Grimm et al. (eds): Chlorophylls and Bacteriochlorophylls. Springer Hollandia. (1-26. o.)
  2. Orf, GS, Blankenship, RE (2013). Kloroszóma antenna komplexek zöld fotoszintetikus baktériumokból. Photosynthesis research ,  116 (2-3), p. 15-331.
  3. 1 2 Keely, BJ (2006). A klorofillok geokémiája. In  klorofillok és bakterioklorofillok  (pp. 535-561). Springer Hollandia.
  4. Kobayashi, M., Hamano, T., Akiyama, M., Watanabe, T., Inoue, K., Oh-oka, H., Amesz J., Yamamura M., Kise, H. (1998). A bakterioklorofill g fénytől független izomerizációja klorofill a-vá, gyenge savak által katalizált in vitro. Analytica chimica acta ,  365 (1), 199-203.
  5. Grin, MA és Mironov, AF (2008). Szintetikus és természetes bakteriochlorinok: szintézis, tulajdonságok és alkalmazások. In: Kémiai folyamatok biológiai és rokon vegyületek részvételével: Porfirinek, pigmentek, gyógyszerek, biológiailag lebomló polimerek és nanoszálak biofizikai és kémiai vonatkozásai , 5.
  6. 1 2 Liu, Z. és Bryant, D.A. (2011). A bakterioklorofill bioszintézisének első lépéséhez nélkülözhetetlen gén azonosítása c. Journal of Biological Chemistry ,  286 (25), 22393-22402.
  7. Tsukatani Y., Yamamoto H., Harada J., Yoshitomi T., Nomata J., Kasahara M., Mizoguchi T., Fujita Y., Tamiaki H. (2013). A bakterioklorofill b váratlanul elágazó bioszintetikus útja képes elnyelni a közeli infravörös fényt. Tudományos jelentések ,  3 .
  8. Frigaard, NU, Chew, AGM, Maresca, JA és Bryant, D.A. (2006). Bakterioklorofill bioszintézis zöld baktériumokban. In  klorofillok és bakterioklorofillok  (pp. 201-221). Springer Hollandia.
  9. Harada, J., Teramura, M., Mizoguchi, T., Tsukatani, Y., Yamamoto, K. és Tamiaki, H. (2015). C3-vinil-csoport sztereokémiai átalakítása 1-hidroxi-etil-csoporttá a bakterioklorofill c-ben a BchF és BchV hidratázok által: zöld kénbaktériumok adaptációja korlátozott fényviszonyokhoz. Molecular Microbiology ,  98 (6), 1184-1198.
  10. Bryant, Donald A.; Costas, A. M.; Maresca, JA & Chew, AG (2007. 07. 27.), Candidatus Chloracidobacterium thermophilum: An Airobic Phototrophic Acidobacterium , Science T. 317 (5837): 523–526, PMID 17656724 , doi : 10,431361212 . //www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/317/5837/523 > Archiválva : 2009. szeptember 14. a Wayback Machine -nél