Picornavírusok
A Picornaviridae [2] ( lat. Picornaviridae , a pico- small és az rna - RNS szóból ) egy olyan család, amely magasabb gerincesek kis ikozaéderes vírusait egyesíti, amelyek pozitív polaritású (vagyis az mRNS -sel azonos polaritású) egyszálú genomi RNS -t tartalmaznak . A kapszid mérete körülbelül 27-30 nm , a genom mérete körülbelül 7-8 ezer bázis. A picornavírusok szaporodása a fertőzött sejt citoplazmájában történik. A pikornavírusok olyan betegségek kórokozói, mint a poliomyelitis , nátha , ragadós száj- és körömfájás , hepatitis A stb. A vírusok világában a picornavírusok nagyon magas mutációs rátával tűnnek ki, ami az emberre káros változataik megjelenésének nagy valószínűségét eredményezi [3] .
A genom szerkezete
A picornavírusok genomiális RNS-e a legtöbb esetben egy nyitott leolvasási keretet tartalmaz az IRES irányítása alatt , a belső riboszóma belépési helyén . A vírus RNS transzlációja egy óriási prekurzor fehérje képződéséhez vezet, amelyet még a szintézis befejeződése előtt vírusproteázok levágnak , és érett vírusfehérjék képződnek. Egy kis fehérje kovalensen kapcsolódik a vírus RNS - VPg 5' végéhez (az angol viral protein genome linked , viral protein connecting to the genom). A 3'-vég poliadenilezett (több tíz adenin -maradékot tartalmaz , hasonlóan a sejtes mRNS-ekhez). A vírus RNS 5'- és 3'-végén találhatók az úgynevezett cisz - replikatív elemek (OriL és OriR - angol eredetű - "beginning", bal - "left", jobb - "jobb") ) - a genom replikációjához szükséges szekvenciák.
A pikornavírusok fehérjéi
A pikornavírus genomja körülbelül egy tucat fehérjét kódol, amelyek biztosítják a vírus RNS-replikációját, a sejtek újraprogramozását és az érett virionok összeállítását . A genom kódoló régiója meglehetősen feltételesen három részre oszlik:
P1 - a VP1, VP2, VP3, VP4 strukturális fehérjéket kódolja, amelyekből a vírusrészecske épül.
P2 és P3 - a sejt újraprogramozásához és replikációjához szükséges fehérjéket kódolnak:
- 2A - nem homológ a picornavírusok különböző nemzetségeinek képviselőiben. Például afto- és kardiovírusokban ez egy peptid , amely a poliprotein szintetizált fehérjeláncában kotranszlációs törést okoz , entero- és rhinovírusokban pedig szerinproteáz .
- A 2B és 3A kisméretű hidrofób fehérjék, amelyek részt vesznek a sejtmembránok pikornavírusok által okozott változásában.
- 2C - ez a fehérje homológiát mutat a helikázokkal , a picornavírus replikációs komplexének része.
- A 3B a VPg, egy fehérje, amely a vírus RNS 5' végéhez kapcsolódik.
- 3C - cisztein- proteáz , amely levágja a poliproteint [4] .
- 3D – RNS polimeráz, egy vírus RNS-t szintetizáló fehérje.
- Az L - leader fehérje szintén nem homológ a különböző nemzetségek képviselőiben, számos picornavírusban hiányzik. Az aftovírusokban ez egy proteáz, amely lehasítja magát egy poliproteinről, a cardiovírusokban [ és a Teschovirus pedig nem rendelkezik enzimatikus aktivitással.
Osztályozás
A Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) szerint 2017 márciusában a család 35 nemzetséget foglal magában [5] :
- Ampivírus (1 faj)
- Aphthovirus - Aphthoviruses (4 faj)
- Aquamavirus (1 faj)
- Avihepatovirus (1 faj)
- Avisivirus (3 faj)
- Cardiovirus – Cardioviruses [6] (3 faj)
- Cosavírus (5 faj)
- Dicipivirus (1 faj)
- Enterovírus – Enterovírusok (13 faj)
- Erbovírus (1 faj)
- Gallivírus (1 faj)
- Harkavírus (1 faj)
- Hepatovírus – Hepatovírusok [7] (9 faj)
- Hunnivírus (1 faj)
- Kobuvírus (6 faj)
- Kunsagivirus (1 faj)
- Limnipivirus (3 faj)
- Megrivírus (1 faj)
- Mischivirus (3 faj)
- Mosavírus (1 faj)
- Oscivirus (1 faj)
- Parechovírus - Parechovírusok (4 faj)
- Pasivírus (1 faj)
- Passerivirus (1 faj)
- Potamipivirus (1 faj)
- Rabovírus (1 faj)
- Rosavírus (1 faj)
- Sakobuvírus (1 faj)
- Salivirus (1 faj)
- Sapelovirus (3 faj)
- Senecavirus (1 faj)
- Sicinivírus (1 faj)
- Teschovírus (1 faj)
- Torchivirus (1 faj)
- Tremovírus (2 faj)
Lásd még
Jegyzetek
- ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján .
- ↑ Orvosi mikrobiológiai, virológiai és immunológiai atlasz: Tankönyv orvostanhallgatóknak / Szerk. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Orvosi Információs Ügynökség, 2003. - S. 117. - ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ S. Dmitriev. A vírus egy hacker, amely megtöri a sejtprogramot // Tudomány és élet . - 2022. - 5. sz . - S. 8 .
- ↑ Malcolm BA A picornavirális 3C proteinázok: cisztein nukleofilek a szerin proteináz redőkben. : [ angol ] ] // Protein Sci. - 1995. - 1. évf. 4, sz. 8 (augusztus). - P. 1439-1445.
- ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján . (Hozzáférés: 2017. március 23.) .
- ↑ Szergejev, Nepoklonov, Aliper, 2007 , p. 461.
- ↑ Szergejev, Nepoklonov, Aliper, 2007 , p. 448.
Irodalom
- Szergejev V. A. , Nepoklonov E. A. , Aliper T. I. 10.23 Picornavírusok // Vírusok és vírusoltások. - M . : Biblionika, 2007. - S. 448-462. — ISBN 5-98685-012-2 .
- Semler BL és Wimmer E. 2002. Picornavírusok molekuláris biológiája. Amerikai Mikrobiológiai Társaság, Washington, DC
Szótárak és enciklopédiák |
|
---|
Taxonómia |
|
---|
Bibliográfiai katalógusokban |
|
---|
A vírusok osztályozása Baltimore szerint |
---|
DNS | I: vírusok |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae_ | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales_ |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae_ | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae_
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Besorolatlan | Naldaviricetes | |
---|
Besorolatlan |
- család : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae_
- Thaspiviridae
- Nemzetség : Dinodnavírus
- Rhizidiovírus
|
---|
|
---|
|
| II: DNS-vírusok |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales_ |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxiviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Besorolatlan |
|
---|
|
|
|
---|
RNS | | IV: (+) RNS vírusok |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae_
- Betaflexiviridae_
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae_
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolukaviriceták | Tolivirales_ |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae_
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales_ |
- Blumeviridae
- Steitzviridae_
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Besorolatlan |
- Családok : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
TÓL TŐL | |
---|