| Phycoerythrin, α/β láncok | |
|---|---|
| Azonosítók | |
| Szimbólum | Phycoerythr_ab |
| Pfam | PF02972 |
| InterPro | IPR004228 |
| SCOP | 1qgw |
| SZUPERCSALÁD | 1qgw |
| Elérhető fehérjeszerkezetek | |
| Pfam | szerkezetek |
| EKT | RCSB EKT ; PDBe ; EKTj |
| EKT-összeg | 3D modell |
A fikoeritrin ( más görög φῦκος - alga és ἐρῠθρός - vörös) egy további vörös fotoszintetikus pigment , amely cianobaktériumokban és vörös algákban található . A fikoeritrin, mint minden fikobiliprotein , egy fehérjerészből áll, amely α- és β-részecskékből épül fel, hatszögben szerveződnek, és kovalensen kapcsolódnak kromoforokhoz , úgynevezett fikobilinekhez . A fikoeritrinek a legtöbb fikobilinhez képesek kötődni (α-β dimerenként akár hat is).
Az abszorpciós maximum a spektrum látható részén körülbelül 495 és 546/566 nm , és az adott organizmustól függ . Az emissziós csúcs 575 ± 10 nm tartományban van (a fikoeritrin világoszöld-kék/sárgás fényt nyel el, és világos sárga-narancssárgát bocsát ki).
A Phycoeryrin a klorofill segédpigmentje . A fényenergiát a fikoeritrin felfogja, majd a fikobiliproteineken , a fikocianinon és az allophycocyaninon keresztül a reakcióközpontba továbbítja .
Az R-Phycoerythrint laboratóriumokban fluoreszcens indikátorként használják a cianobaktériumok jelenlétére és az antitestek jelölésére az immunfluoreszcenciának nevezett technikában . Vannak más típusú fikoeritrinek is, mint például a B-fikoeritrin, amelyek kissé eltérő spektrális jellemzőkkel rendelkeznek. A B-Fikoeritrin főként körülbelül 545 nm -t nyel el (világos sárgászöld), és 572 nm-t (sárga) bocsát ki, így bizonyos laboratóriumi alkalmazásokhoz jobban megfelel. A B-Phycoerythrin emellett kevésbé ragadós, mint az R-Fikoeritrin, és kevésbé reagál a háttérjelekre, mivel bizonyos körülmények között nem specifikus kötődést mutat.
Az R-Phycoerythrin és B-Phycoerythrin a felfedezett legfényesebb fluoreszcens festékek közé tartoznak.
Az R-Fikoeritrint főként vörös algák termelik. A fehérje három különböző alegységből áll, és összetétele az azt termelő algától függően változik. Az R-fikoeritrin alegységek leggyakoribb elrendezése az (αβ) 6 γ. Az α alegységhez két fikoeritrobilin (PEB), a β alegységhez két vagy három PEB és egy ficourobilin (FUB) kapcsolódik, de a γ alegység a legújabb adatok szerint három PEB-et és két FUB-ot (γ1) vagy egyet tartalmaz. vagy két PEB és egy FUB (γ2). Az R-fikoeritrin molekulatömege 250 000 dalton .
Amint fentebb említettük, a fikoeritrin számos különböző típusú algában megtalálható, ezért számos változata létezik, amelyek különböznek a fotoszintézis elősegítéséhez szükséges fényelnyelési és -kibocsátási szintben . Ennek oka lehet az algák vízoszlopban való megtelepedése és az ebből eredő, a segédpigment hatékonyságának megváltozása.
A gyors fotofehérítés elkerülésére szolgáló technológia fejlődésével a fehérje- fluoroforok hatékony eszközzé váltak a kutatásban olyan területeken, mint a mikroszkópia , a mikrotubulus - analízis és a Western-blot. Mindezek tükrében a kutatók számára előnyössé vált az R-Phycoerythrin fajtáinak keresése, hogy az egyes kutatási típusokhoz a legmegfelelőbbet meghatározzák. A fluoreszcencia legkisebb növekedése is csökkentheti a háttérzajt és csökkentheti a hamis negatívokat.