Rézkötő fehérjék plasztocianin családja

Rézkötő fehérjék, plasztocianin/azurin család

A nyár plasztocianin szerkezete [1] .
Azonosítók
Szimbólum rézkötésű
Pfam PF00127
InterPro IPR000923
PROZIT PDOC00174
SCOP 1 plc
SZUPERCSALÁD 1 plc
OPM szupercsalád 101
OPM fehérje 1sfd
CDD cd00920
Elérhető fehérjeszerkezetek
Pfam szerkezetek
EKT RCSB EKT ; PDBe ; EKTj
EKT-összeg 3D modell

A plasztocianin/azurin rézkötő fehérjék családja (vagy 1-es típusú kék fehérje domén)  olyan kisméretű fehérjék családja, amelyek egyetlen rézatomot képesek megkötni , és erős, 600 nm körüli csúcsot elérő abszorpció jellemzi, aminek köszönhetően redukált állapotban általában élénkkék színűek (lásd réztartalmú fehérjék). fehérjék ) [2] [3] . Ennek a fehérjeosztálynak a legismertebb tagjai a növényi plasztocianinok , kisméretű, vízben oldódó kloroplaszt fehérjék, amelyek elektront adnak át a citokróm f -ből, és távoli rokonságban állnak az azurinok bakteriális fehérjékkel , amelyek elektronokat cserélnek a citokróm c551-gyel. Ebbe a családba tartozik még az olyan baktériumokból származó amicianin fehérje , mint például a Methylobacterium extorquens vagy a Paracoccus versutus ( Thiobacillus versutus ), amelyek képesek metilaminon növekedni ; A és B auracianinok a Chloroflexus aurantiacusból ; [4] kék rézfehérje az Alcaligenes faecalisból ; a Cucumis sativus (uborka) héjából származó cupredoxin ; [5] Cusacyanin (alap kék fehérje) uborkából; halocianin, a Natronomonas pharaonis ( Natronobacterium pharaonis ) membránhoz kötött fehérje , [6] a Pseudomonasból származó pszeudoazurin ; ruszticianin a Thiobacillus ferrooxidansból ; [7] a Rhus vernicifera (japán lakkfa) sztellacianinja; az Armoracia rusticana (torma) gyökeréből származó umecianin ; és a parlagfűből származó Ra3 allergén . Ez a pollenfehérje evolúciósan közel áll a fent felsorolt ​​polipeptidekhez, de úgy tűnik, hogy elvesztette a rézmegkötő képességét. Bár ezeknek a fehérjéknek az elsődleges szerkezete jelentős eltéréseket mutat, a rézkötő hely erősen konzervált marad.

Jegyzetek

  1. Guss JM, Bartunik HD, Freeman HC . Pontosság és precizitás a fehérjeszerkezet elemzésében: a nyár plasztocianin szerkezetének visszafogott legkisebb négyzetes finomítása 1,33 A felbontásnál   // Acta Cryst . B : folyóirat. - International Union of Crystallography , 1992. - December ( 48. kötet , 6. szám ). - P. 790-811 . - doi : 10.1107/S0108768192004270 . — PMID 1492962 .
  2. Clingeleffer DJ, Guss JM, Rogers SJ, Freeman HC, Garrett TP A nyárfa apoplasztocianin kristályszerkezete 1,8 A felbontáson. A rézkötő hely geometriáját a polipeptid hozza létre  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 1984. - 1. évf. 259 , sz. 5 . - P. 2822-2825 . — PMID 6698995 .
  3. Hunt LT, Ryden LG A fehérje komplexitásának evolúciója: a kék réztartalmú oxidázok és rokon fehérjék  //  J. Mol. Evol. : folyóirat. - 1993. - 1. évf. 36 , sz. 1 . - 41-66 . o . - doi : 10.1007/BF02407305 . — PMID 8433378 .
  4. Meyer TE, Han J., McManus JD, Brune DC, Sanders-Loehr J., Cusanovich MA, Tollin G., Blankenship RE Az auracianinok, kék rézfehérjék izolálása, jellemzése és aminosavszekvenciái a Chloroflexus aurantiacus zöld fotoszintetikus baktériumból  (angol)  // J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 1992. - 1. évf. 267. sz . 10 . - P. 6531-6540 . — PMID 1313011 .
  5. Messerschmidt A., Mann K., Thoenes U., Mehrabian Z., Nalbandyan R., Schafer W. Az uborkából izolált szokatlan szerin- és hidroxiprolinban gazdag C-terminális doménnel rendelkező I-es típusú rézfehérje aminosavszekvenciája peelings  (angol)  // FEBS Lett. : folyóirat. - 1992. - 1. évf. 314. sz . 3 . - P. 220-223 . - doi : 10.1016/0014-5793(92)81475-2 . — PMID 1468551 .
  6. Oesterhelt D., Mattar S., Scharf B., Rodewald K., Engelhard M., Kent SB A halocianin elsődleges szerkezete, egy régebbi kék rézfehérje, előrejelzi a membrán  rögzítésének horgonylipidjét  J.// Chem.  : folyóirat. - 1994. - 1. évf. 269 ​​, sz. 21 . - P. 14939-14945 . — PMID 8195126 .
  7. Yano T., Fukumori Y., Yamanaka T. A Thiobacillus ferrooxidansból izolált ruszticianin aminosavszekvenciája  // FEBS Lett  . : folyóirat. - 1991. - 1. évf. 288. sz . 1 . - P. 159-162 . - doi : 10.1016/0014-5793(91)81025-4 . — PMID 1879547 .