Krenarcheotes

Krenarcheotes
Sulfolobus fertőzött a Sulfolobus tengchongchongensis orsó alakú 1-es vírussal (STSV-1) [1] [2] [3] [4] . A kép bal és alsó részén két orsó alakú vírusrészecske látható, amint egy archaea sejtből bimbózik. Skála = 1 µm
tudományos osztályozás
Tartomány:ArchaeaTípusú:Krenarcheotes
Nemzetközi tudományos név
Crenarchaeota Garrity és Holt 2002
Szinonimák
Eocyta [5] Thermoproteaeota Oren et al. 2015 [5]
Szisztematika a Wikifajtáknál Képek a Wikimedia Commons oldalon EZ   951422 NCBI   28889 EOL   7953 FW   288523

A Krenarcheota [6] ( lat.  Crenarchaeota , más görögül κρήνη  - patak, ἀρχαῖος  - ősi) az archeai tartomány egyik típusa , beleértve az egyetlen Thermoprotei Reysenbach 2002 osztályt [7] [8] . A típust a 16S rRNS szekvenciák elemzése alapján izoláltuk .  

Leírás

A Krenarcheoták morfológiailag heterogén csoport. A sejtek coccoid , rúd alakú, korong alakú, fonalas. A sejtek mérete az egy mikrométernél (µm) kisebb átmérőjű coccusoktól a 100 µm-nél hosszabb filamentumokig terjed [9] .

A sejtciklus a vizsgált crenarcheotákban hasonló módon rendeződik: a DNS megkettőződése előtti (prereplikatív) periódus rövid, a megkettőződés után (posztreplikatív) pedig hosszú, a teljes sejtciklus 64-77%-át teszi ki [10] .

A csoport fiziológiai és biokémiai tulajdonságai változatosak: a krenarcheoták között megtalálhatók acidofilek és neutrofilek , szigorú és fakultatív anaerobok és szigorú aerobok , kemolitoautotrófok és kemoorganotrófok. Sok crenarcheota használ ként az anyagcserében . A krenarcheotákban a leggyakoribb energiafolyamat a következőképpen néz ki: H 2 + S 0 → H 2 S [6] .

A crenarcheotákat eredetileg rRNS-szekvenciák alapján választották el az archaea többi részétől . Később bebizonyosodott, hogy a crenarcheoták hisztonok hiányában is különböznek más archeótáktól , azonban később egyes crenarcheotákban azonosították őket [11] .

Élőhely

Először találták meg a krenarcheot képviselőit folyó forró vízben. Manapság meleg forrásokban, vulkáni üstökben és szárazföldi vulkáni mezőkből és meleg forrásokból származó talajokban , fekete füstölőkben , minivulkánokban és a víz alatti geotermikus helyek iszapjában találhatók meg. Így azt feltételezték, hogy a krenarchaeoták összetételében csak termofil és hipertermofil szervezetek szerepeltek [12] .

1996-ban azonban felfedeztek egy pszichrofil fajt , a Crenarchaeum symbiosum -ot, amely 10 °C-on él együtt a tengeri szivacsokkal . Az ilyen típusú archaeák összetételében is találtak -2 °C-ig terjedő hőmérsékleten élő fantomformákat [12] .

Manapság a krenarcheotákat szántóföldi és erdei talajokban , paleoszolokban , tavi üledékekben , tengeri törmelékben és az anaerob tisztítóberendezések elevenisszapjában találják [12] . A különböző környezetekből származó rRNS elemzése kimutatta, hogy a crenarcheotes a legtöbb archaea a tengeri környezetben [13] .

A crenarcheotok az egész világon elterjedtek. Különösen a sarki , mérsékelt és trópusi vizekben alkotják a planktonok fontos részét. Két szimbiotikus krenarcheot fajt írtak le: az egyik hidegvízi holothurokban él , a másikat pedig tengeri szivacsban találták [14] .

Szisztematika és osztályozás

Egyes adatok szerint a mezofil tengeri crenarcheota egy független Thaumarchaeota típust különböztet meg , azonban molekuláris szinten a crenarcheota és a Thaumarchaeota között nagyon csekély a különbség [15] . Jelenleg a szorosan rokon Thaumarchaeota , Aigarchaeota , Crenarchaeota és Korarchaeota típusokat a TACK szupertípusba sorolják [16] .

2017 júniusától a Thermoprotei osztály 5-6 rendet tartalmaz [7] [8] :

• Az Acidilobales Prokofeva et al. 2009
• Cenarchaeales Cavalier-Smith 2002 rendelés - az NCBI szerint a Thaumarchaeota [17] típusba tartozik.
• Rendelje meg a Desulfurococcales Huber and Stetter 2002 -t
• A Fervidicoccales Perevalova et al. 2010
• Rendelje meg a Sulfolobales Stetter 1989 -et
• Rendelje meg a Thermoproteales Zillig és Stetter 1982 emendet. Burggraf et al. 1997

A Crenarchaeota rendekre való felosztása a 16S rRNS gének szekvenciáin alapul . A crenarchaeusok legősibb evolúciós ága a Thermoproteus , Thermofilum és Pyrobaculum [9] nemzetségek .

Eocita hipotézis

Az úgynevezett eocita hipotézist az 1980-as években James Lake javasolta .  Szerinte az eukarióták prokarióta eocitákból (vagyis krenarcheótákból) származnak. Ennek a hipotézisnek egy lehetséges megerősítése az Rbp-8 alegység homológjának jelenléte az RNS-polimeráz crenarcheotákban, de más archaeákban nem [19] .

Jegyzetek

1. ↑ Krupovic M. , Quemin ERJ , Bamford DH , Forterre P. , Prangishvili D. Unification of the Globally Distributed Spindle-Shaped Viruses of the Archaea  // Journal of Virology. - 2013. - december 11. ( 88. évf. 4. szám ). - S. 2354-2358 . — ISSN 0022-538X . - doi : 10.1128/JVI.02941-13 .
2. ↑ Rebecca Hochstein , Daniel Bollschweiler , Harald Engelhardt , Lawrence C. Martin , Young Mark. Az archaeai nagy farkú orsóvírusok: a vírusos üzleti tevékenység új módja  // Journal of Virology. - 2015. - június 17. ( 89. évf. , 18. sz.). - S. 9146-9149 . — ISSN 0022-538X . - doi : 10.1128/JVI.00612-15 .
3. ↑ Robb F., Antranikian G., Grogan D., Driessen A. (szerkesztők). Termofilek: Biológia és technológia magas hőmérsékleten. - CRC Press, 2007. - P. 231-232. — 368 p. — ISBN 978-0849392146 .
4. ↑ A vírusok egyenetlen eloszlása ​​meglepő evolúciós erőt sugall  : [ eng. ]  // Scientific American.
5. ↑ 1 2 Crenarchaeota  (angolul) a National Center for Biotechnology Information (NCBI)  honlapján . (Hozzáférés: 2017. július 23.) .
6. ↑ 1 2 Vorobjova, 2007 , p. 317.
7. ↑ 1 2 Domének és törzsek osztályozása - Prokarióták (baktériumok) hierarchikus osztályozása : 2.0 verzió  : [ eng. ]  // LPSN. - 2016. - október 2.
8. ↑ 1 2 Taxonómia böngésző: Crenarchaeota  : [ eng. ]  // NCBI.  (Hozzáférés: 2017. július 23.) .
9. ↑ 1 2 Tolweb: Crenarchaeota . Letöltve: 2017. augusztus 10. Az eredetiből archiválva : 2017. augusztus 10.. (határozatlan)
10. ↑ Lundgren M. , Malandrin L. , Eriksson S. , Huber H. , Bernander R. Cell Cycle Characteristics of Crenarchaeota: Unity among Diversity  // Journal of Bacteriology. - 2008. - május 23. ( 190. évf. , 15. sz.). - S. 5362-5367 . — ISSN 0021-9193 . - doi : 10.1128/JB.00330-08 .
11. ↑ Cubonová L. , Sandman K. , Hallam SJ , Delong EF , Reeve JN Histones in crenarchaea.  (angol)  // Bakteriológiai folyóirat. - 2005. - 20. évf. 187. sz. 15 . - P. 5482-5485. - doi : 10.1128/JB.187.15.5482-5485.2005 . — PMID 16030242 .
12. ↑ 1 2 3 Pinevich, 2006 , p. 90.
13. ↑ Madigan M., Martinko J. (szerkesztők). Brock mikroorganizmusok biológiája  (határozatlan) . — 11-én. - Prentice Hall , 2005. - ISBN 0-13-144329-1 .
14. ↑ Joanne M. Willey, Linda M. Sherwood, Christopher J. Woolverton. Prescott mikrobiológiai alapelvei . — 1. kiadás. - McGraw-Hill Felsőoktatás, 2009. -  413. o . — 968 p. - ISBN 978-0-07-337523-6 .
15. ↑ Élettudományi kérdések – izom-, membrán- és általános mikrobiológia: 2012-es kiadás / Q. Ashton Acton. - ScholarlyEditions, 2012. - P. 100. - 223 p. - ISBN 978-1-4816-4674-1 .
16. ↑ Zuo G. , Xu Z. , Hao B. Archaea filogene és taxonómiája: A teljes genom alapú CVTree megközelítés összehasonlítása 16S rRNS szekvencia elemzéssel.  (angol)  // Élet (Basel, Svájc). - 2015. - Kt. 5, sz. 1 . - P. 949-968. doi : 10.3390 / life5010949 . — PMID 25789552 .
17. ↑ Taxonómia böngésző: Cenarchaeales  : [ eng. ]  // NCBI.  (Hozzáférés: 2017. július 25.) .
18. ↑ Cox CJ , Foster PG , Hirt RP , Harris SR , Embley TM Az eukarióták archaebakteriális eredete.  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2008. - Vol. 105, sz. 51 . - P. 20356-20361. - doi : 10.1073/pnas.0810647105 . — PMID 19073919 .
19. ↑ Kwapisz M. , Beckouët F. , Thuriaux P. Az eukarióta DNS-függő RNS polimerázok korai evolúciója.  (eng.)  // Trends in genetics : TIG. - 2008. - Vol. 24, sz. 5 . - P. 211-215. - doi : 10.1016/j.tig.2008.02.002 . — PMID 18384908 .

Irodalom

• Vorobjova L. I. Archei: tankönyv egyetemek számára. - M . : ICC "Akademkniga", 2007. - 447 p. - ISBN 978-5-94628-277-2 .
• Pinevich A. V. Mikrobiológia. A prokarióták biológiája: Tankönyv: 3 kötetben  - Szentpétervár.  : St. Petersburg University Publishing House, 2006. - T. 1. - 352 p. — ISBN 5-288-04057-5 .

Szótárak és enciklopédiák	Britannica (online)
Taxonómia	EOL Kövületek GBIF iNaturalist NCBI IRMNG ITIS TSN WORMS