Thaumarchaeota

Thaumarchaeota
tudományos osztályozás
Tartomány:ArchaeaTípusú:Thaumarchaeota
Nemzetközi tudományos név
Thaumarchaeota Brochier-Armanet et al. 2008
Szinonimák
Aigarchaeota Nunoura et al. 2011 [1] Nitrososphaeraeota Oren et al. 2015 [1]
Szisztematika a Wikifajtáknál Képkeresés a Wikimedia Commonsban EZ   951425 NCBI   651137 EOL   10594366

A Thaumarchaeota ( latinul , görögül thaumas  - csoda) egy olyan archaea , amely mindössze 3 termesztett fajt és körülbelül 20 jelöltet (Candidatus). Az összes jelenleg felfedezett képviselő kemolitotróf és oxidálja az ammóniát . Fontos szerepet játszhatnak a biokémiai körforgásban, különösen a nitrogénciklusban .

Tanulmánytörténet

A törzset 2008 -ban izolálták olyan filogenetikai adatok alapján , mint ezen organizmusok rRNS - génszekvenciája , valamint az I-es típusú topoizomeráz termelése , amelyről korábban azt hitték, hogy az eukariótákra jellemző [2] [3] . Ezeket a feltételezéseket további elemzések is megerősítették, amelyek eredményeit 2010-ben publikálták. Tesztelték az ammóniát oxidáló archaea Nitrosopumilus maritimus és Candidatus Nitrososphaera gargensis genomjait . E vizsgálatok eredményei alapján kiderült, hogy ennek a két fajnak külön eredete van egy másik fajjal, a Cenarchaeum symbiosummal együtt, amely a Thaumarchaeota elsőként leírt faja volt [4] .

Osztályozás

A jelenlegi besorolás az állandó nómenklatúrával rendelkező prokarióta nevek listáján (LPSN) és a Nemzeti Biotechnológiai Információs Központon (NCBI) alapul. Ha 2017 júliusában az első forrásban a típust az egyetlen Nitrososphaera viennensis [5] faj képviseli a Nitrososphaeria [6] osztályból , akkor a másodikban nagyobb számú taxon található fajtól rendig, amelyek többsége jelöltek. Az alábbi osztályozás az összes taxont tartalmazza a nemzetségig, beleértve az összes termesztett fajt [7] , az első helyen a taxonokkal, amelyek képviselői a tiszta kultúrában ismertek:

• osztály Nitrososphaeria Stieglmeier et al. 2014
  • A Nitrososphaerales Stieglmeier et al. 2014
    • A Nitrososphaeraceae család Stieglmeier et al. 2014
      • A Nitrososphaera Stieglmeier et al. 2014
        • Nitrososphaera viennensis Stieglmeier et al. 2014 [8] és további 2 jelölt
      • A Candidatus Nitrosocosmicus  Lehtovirta-Morley et al. 2016 (3 jelölt)
  • A Candidatus Nitrosocaldales  Qin et al. 2017
    • Candidatus Nitrosocaldaceae Qin  et al. 2016
      • A Candidatus Nitrosocaldus  de la Torre et al. 2008 (1 jelölt)
• Rendelések incertae sedis
  • Cenarchaeales DeLong és Preston 1996 rendelése – Crenarchaeota besorolása az LPSN-ben
    • Cenarchaeaceae DeLong és Preston család 1996
      • Cenarchaeum DeLong és Preston nemzetség 1996
        • Cenarchaeum symbiosum DeLong és Preston 1996
  • A Nitrosopumilales Konneke et al. 2005
    • Nitrosopumilaceae család Konneke et al. 2005
      • A Nitrosopumilus Konneke et al. 2005
        • Nitrosopumilus maritimus Konneke et al. 2006 és további 5 jelölt
      • A Candidatus Nitrosoarchaeum  nemzetség Blainey et al. 2011 (2 jelölt)
      • Candidatus Nitrosomarinus nemzetség ( 1 jelölt)
  • genus incertae sedis
    • A Candidatus Caldiarchaeum  Nunoura et al. 2011 (1 jelölt)
    • A Candidatus Giganthauma  Muller et al. 2010 (2 jelölt)
    • A Candidatus Nitrosopelagicus  Santoro et al. 2014 (1 jelölt)
    • A Candidatus Nitrosotalea  Lehtovirta et al. 2011 (1 jelölt)
    • A Candidatus Nitrosotenuis  Li et al. 2016 (2 jelölt)

Jegyzetek

1. ↑ 1 2 Thaumarchaeota  (angolul) a Nemzeti Biotechnológiai Információs Központ (NCBI)  honlapján . (Hozzáférés: 2017. augusztus 5.) .
2. ↑ Brochier-Armanet C., Boussau B., Gribaldo S., Forterre P. Mezofil crenarchaeota : Proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota  // Nature Reviews Microbiology  : Journal  . - 2008. - Vol. 6 , sz. 3 . - P. 245-252 . - doi : 10.1038/nrmicro1852 . — PMID 18274537 .
3. ↑ Brochier-Armanet C., Gribaldo S., Forterre P. A Thaumarchaeota-ban található DNS topoizomeráz IB tanúskodik arról, hogy ez az enzim jelen van az Archaea és Eucarya utolsó közös ősében   // Biology Direct : folyóirat. - 2008. - Vol. 3 . — 54. o . - doi : 10.1186/1745-6150-3-54 . — PMID 19105819 .
4. ↑ Spang A., Hatzenpichler R., Brochier-Armanet C., Rattei T.,. Az ammóniát oxidáló archaea két különböző vonalában található, különálló gén támogatja a Thaumarchaeota törzset  //  Trends in Microbiology : folyóirat. - Cell Press , 2010. - Vol. 18 , sz. 8 . - P. 331-340 . - doi : 10.1016/j.tim.2010.06.003 . — PMID 20598889 .
5. ↑ Nitrososphaera nemzetség  : [ eng. ]  // LPSN.  (Hozzáférés: 2017. augusztus 5.) .
6. ↑ A domének és törzsek osztályozása - Prokarióták (baktériumok) hierarchikus osztályozása : 2.0 verzió  : [ eng. ]  // LPSN. - 2016. - október 2.
7. ↑ Taxonómia böngésző: Thaumarchaeota  : [ eng. ]  // NCBI.  (Hozzáférés: 2017. augusztus 5.) .
8. ↑ Tourna M., Stieglmeier M., Spang A., Könneke M., Schintlmeister A., ​​​​Urich T., Engel M., Schloter M., Wagner M. Nitrososphaera viennensis, ammonia oxidizing archaeon from soil  (angol)  / / Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : folyóirat. - 2011. - 20. évf. 108 , sz. 20 . - P. 8420-8425 . - doi : 10.1073/pnas.1013488108 . — PMID 21525411 .