Pax6
A Pax6 vagy a II - es típusú aniridia fehérje vagy az okulorombin egy szövetspecifikus transzkripciós faktor fehérje . Emberben a PAX6 gén kódolja .
Funkciók
A Pax6 a PAX géncsalád tagja . A szem és más érzékszervek, valamint egyes idegi és epidermális szövetek , valamint egyéb homológ struktúrák fejlődésében „ mestervezérlő génként ” működik , amelyek általában ektodermális eredetű szövetekből származnak. Felismerték azonban, hogy más parancsgének is szükségesek a szem fejlődéséhez, ezért a gének "vezérlőközpontja" kifejezése pontatlan lehet [1] . Ez a transzkripciós faktor leginkább az ektópiás szemek indukált expressziójában való részvételéről ismert, és orvosi jelentőséggel bír, mivel a heterozigóta mutánsok szemhibáinak széles skáláját mutatják, például emberben az aniridiát [2] .
Az állatok sokfélesége
A Pax6 fehérje funkciói hasonlóak bilaterális szimmetriájú állatokban. Például a Drosophila melanogasterben található egér Pax6 fehérje méhen kívüli szemek kialakulását váltja ki a végtagokon és a test más részein. Az emberi és egér Pax6 fehérje azonos aminosavszekvenciával rendelkezik [3] . A Pax6 lókusz genomi szervezete jelentősen eltér a fajok között, beleértve az exonok számában és eloszlásában , a cisz-szabályozó elemek és a transzkripciós iniciációs helyek közötti különbségeket. . A Pax6 gén megszervezésével kapcsolatos első munkát fürjeken végezték, de az egér lókuszt részletesebben tanulmányozták. Legalább két promoterrel (P0 és P1), 16 exonnal és legalább 6 enhanszerrel rendelkezik . A 16 megerősített exon 0-tól 13-ig van számozva, a 4-es és 5-ös exon között elhelyezkedő α exon hozzáadásával, és az 5a exon alternatív splicingjének függvényében. Minden promoter , amely a saját proximális exonjához kapcsolódik (0. exon P0-hoz, 1. exon P1-hez), azt eredményezi, hogy a transzkriptuma alternatív módon az 5'-nem transzlálódó régióba illeszkedik. Úgy vélték, hogy a Drosophila-ban található Pax6 négy ortológja, csak két gén, a szem nélküli és a játék gén termékei funkcionálisan homológok a gerincesek kanonikus Pax6 izoformájának géntermékeivel, míg a másik két Drosophila gén géntermékei, Az EYG és TOE másolata funkcionálisan homológ a Pax6 (5a) gerinces izoformáinak géntermékeivel.
Izoformák
A gerincesekben a Pax6 lókusz legalább 3 különböző fehérjeizoformát kódol , amelyek a kanonikus Pax6, Pax6 (5a) és Pax6 (ΔPD) fehérjét alkotják.
A kanonikus Pax6 fehérje N-terminális páros doméneket tartalmaz , amelyek linkerrel kapcsolódnak a párosított homeodoménhez és egy prolin/szerin/treonin (P/S/T) gazdag C-terminális doménhez. A páros domén és a páros típusú homeodomén DNS-kötő, míg a P/S/T-gazdag régió transzaktivációs funkcióval rendelkezik. A Pax6(5a) az 5a exon alternatív splicing terméke, amely 14 gyök páros régióba való beépülésének eredménye, ami megváltoztatja a DNS-kötő aktivitás mintázatát. A nukleotidszekvencia a linker azon régiójának felel meg, amely három alternatív triplettet kódol, amelyek transzlációt váltanak ki, amelyekből a harmadik Pax6 izoforma keletkezik. Ezek együttesen Pax6 (ΔPD) néven ismertek, vagy páratlan izoformák. Ezenkívül mindhárom génterméknek van páros doménje. A párosítatlan fehérjék molekulatömege 43, 33 vagy 32 kDa, az adott trigger tripletttől függően. A Pax6 transzatkivációs funkciója a C-terminális P/S/T-gazdag domén változó hosszúságával magyarázható, amely a humán és egér fehérjék 153 gyökjéig terjed.
Jegyzetek
- ↑ Fernald R.D. Eyes : változatosság, fejlődés és evolúció // Brain, Behavior and Evolution : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 64 , sz. 3 . - 141-147 . o . - doi : 10.1159/000079743 . — PMID 15353906 .
- ↑ Davis LK, Meyer KJ, Rudd DS, Librant AL, Epping EA, Sheffield VC, Wassink TH Pax6 3' deléció aniridiát, autizmust és mentális retardációt eredményez // Human Genetics : Journal . - 2008. - május ( 123. évf. , 4. sz.). - P. 371-378 . - doi : 10.1007/s00439-008-0484-x . — PMID 18322702 .
- ↑ Gehring WJ, Ikeo K. Pax 6: a szem morfogenezisének és a szem evolúciójának elsajátítása // Trends : folyóirat. - 1999. - szeptember ( 15. évf. , 9. sz.). - P. 371-377 . - doi : 10.1016/S0168-9525(99)01776-X . — PMID 10461206 .
Irodalom
- Callaerts P., Halder G., Gehring WJ PAX-6 a fejlesztésben és az evolúcióban. (angol) // Annual Reviews . - 1997. - 1. évf. 20 , sz. 1 . - P. 483-532 . - doi : 10.1146/annurev.neuro.20.1.483 . — PMID 9056723 .
- Prosser J., van Heyningen V. PAX6 mutációk áttekintése. (angol) // Human Mutation : folyóirat. - 1998. - 1. évf. 11 , sz. 2 . - P. 93-108 . — doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1998)11:2<93::AID-HUMU1>3.0.CO;2-M . — PMID 9482572 .
- Hever AM, Williamson KA, van Heyningen V. A szem fejlődési rendellenességei: PAX6, SOX2 és OTX2 szerepe. (angol) // Genetika : folyóirat. – Amerikai Genetikai Társaság, 2007. - 20. évf. 69 , sz. 6 . - P. 459-470 . - doi : 10.1111/j.1399-0004.2006.00619.x . — PMID 16712695 .
- Glaser T., Walton DS, Maas RL Genomiális szerkezet, evolúciós konzerváció és aniridia mutációk a humán PAX6 génben. (angol) // Nature Genetics : Journal. - 1994. - 1. évf. 2 , sz. 3 . - 232-239 . - doi : 10.1038/ng1192-232 . — PMID 1345175 .
- Ton CC, Hirvonen H., Miwa H. és mtsai. Az aniridia régióból származó páros box- és homeobox-tartalmú gén helyzeti klónozása és jellemzése. (angol) // Cell : napló. - Cell Press , 1992. - Vol. 67 , sz. 6 . - P. 1059-1074 . - doi : 10.1016/0092-8674(91)90284-6 . — PMID 1684738 .
- O'Donnell FE, Pappas HR Autoszomális domináns fovealis hypoplasia és preszenilis szürkehályog. Új szindróma. (angol) // JAMA : folyóirat. - 1982. - 1. évf. 100 , nem. 2 . - P. 279-281 . — PMID 7065945 .
- Martha A., Strong LC, Ferrell RE, Saunders GF Három új aniridia mutáció a humán PAX6 génben. (angol) // Human Mutation : folyóirat. - 1995. - 1. évf. 6 , sz. 1 . - P. 44-9 . - doi : 10.1002/humu.1380060109 . — PMID 7550230 .
- Hanson I., Brown A., van Heyningen V. Egy új PAX6 mutáció a familiáris aniridiában. (angol) // Journal of Medical Genetics : folyóirat. - 1995. - 1. évf. 32 , sz. 6 . - P. 488-489 . - doi : 10.1136/jmg.32.6.488 . — PMID 7666404 .
- Mirzayans F., Pearce WG, MacDonald IM, Walter MA A PAX6 gén mutációja autoszomális domináns keratitisben szenvedő betegeknél. (angol) // American Journal of Human Genetics : folyóirat. - 1995. - 1. évf. 57 , sz. 3 . - P. 539-548 . — PMID 7668281 .
- van Heyningen V., Little PF Report of the negyedik nemzetközi műhelymunka a humán 11-es kromoszóma feltérképezéséről, 1994. (angol) // Cytogenetic and Genome Research : folyóirat. — Karger Kiadó, 1995. - 1. évf. 69 , sz. 3-4 . - 127-158 . o . - doi : 10.1159/000133953 . — PMID 7698003 .
- Auffray C., Behar G., Bois F. és munkatársai. [IMAGE: az emberi genom elemzésének és kifejeződésének molekuláris integrációja] // Comptes rendus de l'Académie des sciences : folyóirat. - 1995. - 1. évf. 318. sz . 2 . - 263-272 . o . — PMID 7757816 .
- Martha A., Ferrell RE, Mintz-Hittner H. és mtsai. A páros doboz mutációk a családi és szórványos aniridiákban csonka aniridia fehérjéket jósolnak. (angol) // American Journal of Human Genetics : folyóirat. - 1994. - 1. évf. 54 , sz. 5 . - P. 801-811 . — PMID 7909985 .
- Glaser T., Jepeal L., Edwards JG és mtsai. A PAX6 génadagolás hatása veleszületett szürkehályoggal, anirídiával, anoftalmiával és központi idegrendszeri rendellenességekkel küzdő családban. (angol) // Nature Genetics : Journal. - 1994. - 1. évf. 7 , sz. 4 . - P. 463-471 . - doi : 10.1038/ng0894-463 . — PMID 7951315 .
- Epstein JA, Glaser T., Cai J. és mtsai. A Pax6 páros domén két független és interaktív DNS-kötő aldoménjét alternatív splicing szabályozza. (angol) // Genes & Development : Journal. - 1994. - 1. évf. 8 , sz. 17 . - P. 2022-2034 . - doi : 10.1101/gad.8.17.2022 . — PMID 7958875 .
- Davis A., Cowell JK Mutációk a PAX6 génben örökletes aniridiában szenvedő betegeknél. (angol) // Human Molecular Genetics : folyóirat. - Oxford University Press , 1994. - Vol. 2 , sz. 12 . - P. 2093-2097 . - doi : 10,1093/hmg/2.12.2093 . — PMID 8111379 .
- Hanson IM, Fletcher JM, Jordan T. és munkatársai. A PAX6 lókusz mutációi heterogén elülső szegmens malformációkban találhatók, beleértve Peters anomáliáját. (angol) // Nature Genetics : Journal. - 1994. - 1. évf. 6 , sz. 2 . - 168-173 . o . - doi : 10.1038/ng0294-168 . — PMID 8162071 .
- Hanson IM, Seawright A., Hardman K. és munkatársai. PAX6 mutációk aniridiában. (angol) // Human Molecular Genetics : folyóirat. - Oxford University Press , 1993. - Vol. 2 , sz. 7 . - P. 915-920 . - doi : 10.1093/hmg/2.7.915 . — PMID 8364574 .
- Azuma N., Nishina S., Yanagisawa H. és mtsai. PAX6 missense mutáció izolált fovealis hypoplasiában. (angol) // Nature Genetics : Journal. - 1996. - 1. évf. 13 , sz. 2 . - P. 141-142 . - doi : 10.1038/ng0696-141 . — PMID 8640214 .
Linkek