POLR2A

Polipeptid A RNS polimeráz II (irányított DNS)

Bevezetés a PDB 2GHQ alapján .
Elérhető struktúrák
EKT Ortológus keresés: PDBe , RCSB
Azonosítók
SzimbólumPOLR2A  ; POLR2; POLRA; RPB1; RPBh1; RPO2; RPOL2; RpIILS; hRPB220; hsRPB1
Külső azonosítókOMIM:  180660 MGI :  98086 HomoloGene :  721 ChEMBL : 1641353 GeneCards : POLR2A gén
EK szám2.7.7.48, 2.7.7.6
RNS expressziós profil
Több információ
ortológusok
KilátásEmberiEgér
Entrez543020020
EgyüttesENSG00000181222ENSMUSG00000005198
UniProtP24928P08775
RefSeq (mRNS)NM_000937NM_001291068
RefSeq (fehérje)NP_000928NP_001277997
Locus (UCSC)Chr 17:
7,39 – 7,42 Mb
Chr 11:
69,73 – 69,76 Mb
Keresés a PubMedben[egy][2]

A DNS-vezérelt RNS-polimeráz II RPB1 alegysége , más néven RPB1 , a POLR2A gén által emberben kódolt enzim .

Funkció

Ez a gén az RNS polimeráz II nagy alegységét kódolja, amely az eukarióták RNS szintéziséért felelős polimeráz . Ennek a génnek a terméke tartalmaz egy karboxil- terminális domént , amely a polimeráz aktivitáshoz szükséges heptapeptid ismétlődésekből áll . Ezek az ismétlődések szerint és treonint tartalmaznak, amelyek aktív állapotban foszforilálják az RNS-polimeráz transzkripcióját . Ezenkívül ez az alegység néhány más polimeráz alegységgel kombinálva alkotja a polimeráz DNS-kötő domént, amelyben a hírvivő DNS RNS-vé íródik át. [egy]

Interakciók

A POLR2A kölcsönhatásba lép a következőkkel:

Jegyzetek

  1. Entrez gén: POLR2A polimeráz (RNS) II (DNS irányított) polipeptid A, 220 kDa .
  2. Krum SA, Miranda GA, Lin C., Lane TF BRCA1 asssociates with processive RNA polymerase II  //  Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 2003. - december ( 278. évf . , 52. sz.). - P. 52012-52020 . - doi : 10.1074/jbc.M308418200 . — PMID 14506230 .
  3. 1 2 3 4 5 6 7 8 Scully R., Anderson SF, Chao DM, Wei W., Ye L., Young RA, Livingston DM, Parvin JD A BRCA1 az RNS polimeráz II   holoenzim komponense // Proceedings of the the Az Amerikai Egyesült Államok Nemzeti Tudományos Akadémiája  : folyóirat. - 1997. - május ( 94. évf. , 11. sz.). - P. 5605-5610 . - doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . — PMID 9159119 .
  4. Chiba N., Parvin JD . A BRCA1 újraelosztása négy különböző fehérjekomplex között a replikáció blokkolását követően  //  Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 2001. - október ( 276. évf . , 42. sz.). - P. 38549-38554 . - doi : 10.1074/jbc.M105227200 . — PMID 11504724 .
  5. Krum SA, Womack JE, Lane TF A szarvasmarha BRCA1 klasszikus választ mutat a genotoxikus stresszre, de alacsony in vitro transzkripciós aktivációs  aktivitást mutat //  Onkogén : folyóirat. - 2003. - szeptember ( 22. évf. , 38. sz.). - P. 6032-6044 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206515 . — PMID 12955082 .
  6. 1 2 3 4 5 6 7 Cho H., Orphanides G., Sun X., Yang XJ, Ogryzko V., Lees E., Nakatani Y., Reinberg D. A humán RNS polimeráz II komplex, amely kromatin szerkezetét módosító faktorokat tartalmaz  (angol)  // Molekuláris és sejtbiológia : folyóirat. - 1998. - szeptember ( 18. évf. , 9. sz.). - P. 5355-5363 . — PMID 9710619 .
  7. Suñé C., Hayashi T., Liu Y., Lane WS, Young RA, a Garcia-Blanco MA CA150, az RNS-polimeráz II holoenzimhez kapcsolódó magfehérje, részt vesz a Tat-aktivált humán immundeficiencia vírus 1-es típusú  transzkripciójában.)  // Molekuláris és sejtbiológia : folyóirat. - 1997. - október ( 17. évf. , 10. sz.). - P. 6029-6039 . — PMID 9315662 .
  8. Sato S., Tomomori-Sato C., Parmely TJ, Florens L., Zybailov B., Swanson SK, Banks CA, Jin J., Cai Y., Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC Konszenzusos emlősközvetítő csoport többdimenziós fehérjeazonosító technológiával azonosított alegységek  //  Molecular Cell : folyóirat. - 2004. - június ( 14. évf. , 5. sz.). - P. 685-691 . - doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . — PMID 15175163 .
  9. 1 2 3 4 Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II  subunits //  Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 1997. - július ( 272. évf . , 27. sz.). - P. 16815-16821 . doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . — PMID 9201987 .
  10. Humbert S., Saudou F. A sejtspecifitás felé az SCA1  -ben //  Neuron. - Cell Press , 2002. - május ( 34. kötet , 5. szám ). - P. 669-670 . - doi : 10.1016/s0896-6273(02)00715-8 . — PMID 12062012 .
  11. 1 2 3 Sif S., Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE Az mSin3A-t tartalmazó Brg1 és hBrm chromatin remodeling complexes tisztítása és jellemzése   // Genes & Development  : Journal. - 2001. - március ( 15. évf. , 5. sz.). - P. 603-618 . - doi : 10.1101/gad.872801 . — PMID 11238380 .
  12. 1 2 3 Wang W., Côté J., Xue Y., Zhou S., Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C., Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M., Workman JL, Crabtree GR Purification and biochemical heterogeneity of az emlős SWI-SNF komplex  //  The EMBO Journal : folyóirat. - 1996. - október ( 15. évf. , 19. sz.). - P. 5370-5382 . — PMID 8895581 .
  13. Zhao K., Wang W., Rando OJ, Xue Y., Swiderek K., Kuo A., Crabtree GR Az SWI/SNF-szerű BAF komplex gyors és foszfoinozitol-függő kötődése a kromatinhoz T limfocita receptor  jelátvitel után.)  // Cell  : napló. - Cell Press , 1998. - november ( 95. kötet , 5. szám ). - P. 625-636 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)81633-5 . — PMID 9845365 .
  14. Hamamoto R., Furukawa Y., Morita M., Iimura Y., Silva FP, Li M., Yagyu R., Nakamura Y. Az SMYD3 egy hiszton-metiltranszferázt kódol, amely részt vesz a rákos sejtek proliferációjában  (Eng.)  // Természet Sejtbiológia  : folyóirat. - 2004. - augusztus ( 6. évf . 8. sz .). - P. 731-740 . - doi : 10.1038/ncb1151 . — PMID 15235609 .
  15. Yang J., Aittomäki S., Pesu M., Carter K., Saarinen J., Kalkkinen N., Kieff E., Silvennoinen O. A p100 azonosítása a STAT6 koaktivátoraként, amely áthidalja a STAT6-ot az RNS polimeráz  II-vel)  // Az EMBO Journal : folyóirat. - 2002. - szeptember ( 21. évf. , 18. sz.). - P. 4950-4958 . - doi : 10.1093/emboj/cdf463 . — PMID 12234934 .
  16. Kim JB, Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp PA Tat-SF1 fehérje asszociál RAP30 és humán SPT5 fehérjékkel   // Molecular and Cellular Biology : folyóirat. - 1999. - szeptember ( 19. évf. , 9. sz.). - P. 5960-5968 . — PMID 10454543 .
  17. Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Ferdous A., Imai T., Hirose S., Sugimoto S., Yano K., Hartzog GA, Winston F., Buratowski S., Handa H. DSIF, a új transzkripciós elongációs faktor, amely szabályozza az RNS polimeráz II folyamatképességét, humán  Spt4 és Spt5 homológokból  áll // Genes & Development  : Journal. - 1998. - február ( 12. évf. , 3. sz.). - P. 343-356 . - doi : 10.1101/gad.12.3.343 . — PMID 9450929 .
  18. Conaway RC, Kong SE, Conaway JW TFIIS és GreB: két hasonló gondolkodású transzkripciós elongációs faktor ragadós ujjakkal  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2003. - augusztus ( 114. kötet , 3. szám ). - P. 272-274 . — PMID 12914690 .
  19. Archambault J., Pan G., Dahmus GK, Cartier M., Marshall N., Zhang S., Dahmus ME, Greenblatt J. FCP1, a RAP74-interacting subunit of a human protein phosphatase that defoszforilálja a karboxil-terminális domént RNS polimeráz IIO  (angol)  // Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 1998. - október ( 273. évf . , 42. sz.). - P. 27593-27601 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27593 . — PMID 9765293 .
  20. Pan G., Aso T., Greenblatt J. A TFIIS elongációs faktorok és az elongin A interakciója egy humán RNS polimeráz II holoenzimmel, amely képes promoter-specifikus iniciációra és reagál a transzkripciós aktivátorokra  //  Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 1997. - szeptember ( 272. évf . , 39. sz.). - P. 24563-24571 . doi : 10.1074 / jbc.272.39.24563 . — PMID 9305922 .
  21. Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C., Garcia-Blanco MA, Greenleaf AL Nukleáris funkciót szervező fehérje-kölcsönhatási modulok: A  CA150 FF doménjei megkötik az RNS polimeráz II foszfoCTD-jét  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United Amerika államai  : folyóirat. - 2000. - augusztus ( 97. évf. , 16. sz.). - P. 9015-9020 . - doi : 10.1073/pnas.160266597 . — PMID 10908677 .
  22. Grondin B., Côté F., Bazinet M., Vincent M., Aubry M. A KRAB  / Cys2-His2 cink ujjfehérje ZNF74 közvetlen kölcsönhatása az RNS polimeráz II legnagyobb alegységének hiperfoszforilált formájával  // Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 1997. - október ( 272. évf . , 44. sz.). - P. 27877-27885 . doi : 10.1074 / jbc.272.44.27877 . — PMID 9346935 .

Irodalom

Linkek