DDX5

A feltételezett ATP-függő DDX5 RNS-helikáz , más néven DEAD 5 box protein vagy p68 RNS helikáz,  egy enzim , amelyet a DDX5 gén kódol az emberben [1] .

Funkció

A Box DEAD fehérjék , amelyeket egy konzervált Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) motívum jellemez, feltehetően RNS - helikázok . Számos sejtfolyamatban vesznek részt, mint például az RNS másodlagos szerkezetének változásaiban, a transzláció iniciációjában, a nukleáris és mitokondriális splicingben , a riboszómák és a spliceoszómák összeállításában . Elterjedési mintáik alapján a család egyes tagjairól úgy gondolják, hogy részt vesznek az embriogenezisben , a spermatogenezisben , valamint a sejtnövekedésben és -osztódásban. Ez a gén kódolja a DEAD box fehérjét, amely egy RNS-függő ATPáz , valamint egy, a majomvírus 40 tumorantigénre specifikusan reagáló, proliferációval összefüggő nukleáris antigént, amely 13 exonból áll , több intronszekvenciát tartalmazó splicing változata létezik. , de ezeket az átiratokat nem észlelték [1] .

Interakciók

A DDX5 kölcsönhatásba lép a következőkkel:

• AKAP8 , [2]
• DDX17 (72. o.), [3]
• DHX9 (helikáz RNS), [4]
• ESR1 , [5] [6]
• Fibrilláris , [7]
• HDAC1 , [8]
• NCOA1 , [9]
• NCOA2 , [9]
• NCOA3 , [9]
• 53. o ., [10]
• CTCF . [tizenegy]

Jegyzetek

1. ↑ 1 2 Entrez gén: DDX5 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polipeptid 5 . (határozatlan)
2. ↑ Akileswaran L., Taraska JW, Sayer JA, Gettemy JM, Coghlan VM Az AKAP95 A-kinázt rögzítő fehérje a nukleáris mátrixot célozza meg, és a p68 RNS-helikázhoz kapcsolódik  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2001. - május ( 276. évf . , 20. sz.). - P. 17448-17454 . - doi : 10.1074/jbc.M101171200 . — PMID 11279182 .
3. ↑ Ogilvie VC, Wilson BJ, Nicol SM, Morrice NA, Saunders LR, Barber GN, Fuller-Pace FV A nagyon rokon DEAD box RNS helikázok, p68 és p72 heterodimerekként léteznek a sejtekben  // Nucleic Acids Res  . : folyóirat. - 2003. - március ( 31. évf. , 5. sz.). - P. 1470-1480 . - doi : 10.1093/nar/gkg236 . — PMID 12595555 .
4. ↑ Wilson BJ, Giguère V. A p68 és p72 RNS-helikázok új útvonalpartnereinek azonosítása Oncomine metaanalízissel  //  BMC Genomics : folyóirat. - 2007. - Vol. 8 . - 419. o . - doi : 10.1186/1471-2164-8-419 . — PMID 18005418 .
5. ↑ Endoh H., Maruyama K., Masuhiro Y., Kobayashi Y., Goto M., Tai H., Yanagisawa J., Metzger D., Hashimoto S., Kato S. Purification and Identification of p68 RNA helicase Acting as a Az α humán ösztrogénreceptor 1. aktiválási funkciójára specifikus transzkripciós koaktivátor  (angol)  // Mol. sejt. Biol. : folyóirat. - 1999. - augusztus ( 19. évf. , 8. sz.). - P. 5363-5372 . — PMID 10409727 .
6. ↑ Rossow KL, Janknecht R. A p68 RNS helikáz és a CBP és  p300 transzkripciós koaktivátorok közötti szinergizmus //  Onkogén : folyóirat. - 2003. - január ( 22. évf. , 1. sz.). - 151-156 . o . - doi : 10.1038/sj.onc.1206067 . — PMID 12527917 .
7. ↑ Nicol SM, Causevic M., Prescott AR, Fuller-Pace FV A nukleáris DEAD box RNS helikáz p68 kölcsönhatásba lép a fibrillin nukleoláris fehérjével, és specifikusan kolokalizálódik a születő magvakban a telofázis során   // Exp . Cell Res. : folyóirat. - 2000. - június ( 257. évf. , 2. sz.). - 272-280 . - doi : 10.1006/kiv.2000.4886 . — PMID 10837141 .
8. ↑ Wilson BJ, Bates GJ, Nicol SM, Gregory DJ, Perkins ND, Fuller-Pace FV A p68 és p72 DEAD box RNS helikázok kölcsönhatásba lépnek a HDAC1-gyel, és promóter-specifikus módon elnyomják a transzkripciót  //  BMC Mol. Biol. : folyóirat. - 2004. - augusztus ( 5. köt. ). — 11. o . - doi : 10.1186/1471-2199-5-11 . — PMID 15298701 .
9. ↑ 1 2 3 Watanabe M., Yanagisawa J., Kitagawa H., Takeyama K., Ogawa S., Arao Y., Suzawa M., Kobayashi Y., Yano T., Yoshikawa H., Masuhiro Y., Kato S. Az RNS-kötő DEAD-box fehérjék egy alcsaládja ösztrogénreceptor α koaktivátorként működik az N-terminális aktivációs doménen (AF-1) keresztül egy RNS-koaktivátorral, az SRA-val  // EMBO  J. : folyóirat. - 2001. - március ( 20. évf. , 6. sz.). - P. 1341-1352 . - doi : 10.1093/emboj/20.6.1341 . — PMID 11250900 .
10. ↑ Bates GJ, Nicol SM, Wilson BJ, Jacobs AM, Bourdon JC, Wardrop J., Gregory DJ, Lane DP, Perkins ND, Fuller-Pace FV A DEAD box protein p68: a p53 tumorszuppresszor új transzkripciós koaktivátora  .)  EMBO J. : folyóirat. - 2005. - február ( 24. évf. , 3. sz.). - P. 543-553 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600550 . — PMID 15660129 .
11. ↑ Yao H., Brick K., Evrard Y., Xiao T., Camerini-Otero RD, Felsenfeld G. A CTCF transzkripciós izolálásának közvetítése DEAD-box RNS-kötő fehérje p68 és szteroid receptor RNS aktivátor   SRA segítségével / Genes Dev  : folyóirat. - 2010. - 20. évf. 24 , sz. 22 . - P. 2543-2555 . - doi : 10.1101/gad.1967810 . — PMID 20966046 .

Irodalom

• Iggo RD, Jamieson DJ, MacNeill SA és mások. p68 RNS helikáz: nukleoláris forma azonosítása és konzervált intront tartalmazó rokon gének klónozása élesztőben   // Mol . sejt. Biol. : folyóirat. - 1991. - 1. évf. 11 , sz. 3 . - P. 1326-1333 . — PMID 1996094 .
• Hloch P., Schiedner G., Stahl H. A humán p68 fehérje teljes cDNS-szekvenciája  // Nucleic Acids Res  . : folyóirat. - 1990. - 1. évf. 18 , sz. 10 . - 3045. o . doi : 10.1093 / nar/18.10.3045 . — PMID 2349099 .
• Ford MJ, Anton IA, Lane DP Nukleáris fehérje szekvenciahomológiával az eIF-4A transzlációs iniciációs faktorral  (angol)  // Nature : Journal. - 1988. - 1. évf. 332. sz . 6166 . - P. 736-738 . - doi : 10.1038/332736a0 . — PMID 2451786 .
• Iggo R., Gough A., Xu W. és mtsai. A 68 kDa-os nukleáris antigént (p68) kódoló humán gén kromoszómatérképezése polimeráz láncreakció segítségével   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States  : Journal. - 1989. - 1. évf. 86 , sz. 16 . - P. 6211-6214 . - doi : 10.1073/pnas.86.16.6211 . — PMID 2762324 .
• Buelt MK, Glidden BJ, Storm DR A p68 RNS helikáz szabályozása kalmodulin és protein kináz C által  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 1994. - 1. évf. 269 ​​, sz. 47 . - P. 29367-29370 . — PMID 7525583 .
• Brody LC, Abel KJ, Castilla LH és mások. A 17-es humán kromoszóma BRCA1 lokuszát körülvevő transzkripciós térkép készítése  // Genomics  :  Journal. - Academic Press , 1995. - 20. évf. 25 , sz. 1 . - P. 238-247 . - doi : 10.1016/0888-7543(95)80131-5 . — PMID 7774924 .
• Endoh H., Maruyama K., Masuhiro Y. és mtsai. A humán ösztrogénreceptor α aktiválási funkciójára specifikus transzkripciós koaktivátorként működő p68 RNS-helikáz tisztítása és azonosítása   // Mol . sejt. Biol. : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 19 , sz. 8 . - P. 5363-5372 . — PMID 10409727 .
• Rössler OG, Hloch P., Schütz N. et al. A humán p68 RNS-helikáz gén szerkezete és expressziója  // Nucleic Acids Res  . : folyóirat. - 2000. - Vol. 28 , sz. 4 . - P. 932-939 . doi : 10.1093 / nar/28.4.932 . — PMID 10648785 .
• Nicol SM, Causevic M., Prescott AR, Fuller-Pace FV A nukleáris DEAD box RNS helikáz p68 kölcsönhatásba lép a fibrillin nukleoláris fehérjével, és specifikusan kolokalizálódik a születő magvakban a telofázis során   // Exp . Cell Res. : folyóirat. - 2000. - Vol. 257. sz . 2 . - 272-280 . - doi : 10.1006/kiv.2000.4886 . — PMID 10837141 .
• Watanabe M., Yanagisawa J., Kitagawa H. és mtsai. Az RNS-kötő DEAD-box fehérjék egy alcsaládja ösztrogénreceptor α koaktivátorként működik az N-terminális aktivációs doménen (AF-1) keresztül egy RNS-koaktivátorral, az SRA-val  // EMBO  J. : folyóirat. - 2001. - 20. évf. 20 , sz. 6 . - P. 1341-1352 . - doi : 10.1093/emboj/20.6.1341 . — PMID 11250900 .
• Akileswaran L., Taraska JW, Sayer JA és mtsai. Az A-kinázt rögzítő AKAP95 fehérje a nukleáris mátrixot célozza meg, és a p68 RNS-helikázhoz kapcsolódik  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2001. - 20. évf. 276. sz . 20 . - P. 17448-17454 . - doi : 10.1074/jbc.M101171200 . — PMID 11279182 .
• Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. A humán nucleolus irányított proteomikai elemzése  (angol)  // Curr. Biol.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 12 , sz. 1 . - P. 1-11 . - doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . — PMID 11790298 .
• Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, et al. Háromdimenziós szerkezeti elemzésre alkalmas natív spliceoszómák tisztítása és jellemzése  //  RNA : Journal. - 2002. - 20. évf. 8 , sz. 4 . - P. 426-439 . - doi : 10.1017/S1355838202021088 . — PMID 11991638 .
• A Liu ZR p68 RNS-helikáz esszenciális emberi illesztési faktor, amely az U1 snRNS-5′ illesztési hely duplexén hat   // Mol . sejt. Biol. : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 22 , sz. 15 . - P. 5443-5450 . - doi : 10.1128/MCB.22.15.5443-5450.2002 . — PMID 12101238 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH és mtsai. Több mint 15 000 teljes hosszúságú emberi és egér cDNS-szekvencia előállítása és kezdeti elemzése  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 2003. - 1. évf. 99 , sz. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
• Rossow KL, Janknecht R. A p68 RNS-helikáz és a CBP és  p300 transzkripciós koaktivátorok közötti szinergizmus //  Onkogén : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 22 , sz. 1 . - 151-156 . o . - doi : 10.1038/sj.onc.1206067 . — PMID 12527917 .
• Guil S., Gattoni R., Carrascal M. és mtsai. A hnRNP A1, az SR fehérjék és a p68 helikáz szerepe a cH-ras alternatív splicing szabályozásában   // Mol . sejt. Biol. : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 23 , sz. 8 . - P. 2927-2941 . - doi : 10.1128/MCB.23.8.2927-2941.2003 . — PMID 12665590 .
• Fujita T., Kobayashi Y., Wada O. és mtsai. Az ösztrogénreceptor alfa-aktivációs funkciójának teljes aktiválása-1 mellráksejtek proliferációját idézi elő  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 278. sz . 29 . - P. 26704-26714 . - doi : 10.1074/jbc.M301031200 . — PMID 12738788 .
• Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. és mtsai. 21 243 teljes hosszúságú humán cDNS teljes szekvenálása és jellemzése   // Nat . Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 36 , sz. 1 . - P. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .