Spliceosome

A spliceoszóma  egy RNS - molekulákból és fehérjékből álló nukleáris szerkezet, amely eltávolítja a nem kódoló szekvenciákat ( intronokat ) az mRNS - prekurzorokból . Ezt a folyamatot splicingnek nevezik (az angol splicing  - splicing szóból). A spliceoszóma öt kis nukleáris RNS -ből (snRNS) áll, és mindegyik legalább hét fehérjefaktorhoz kapcsolódik, amelyek kis nukleáris ribonukleoproteineket (snRNP-ket) képeznek. A spliceoszómában található snRNP-ket U1 , U2 ,  U4 , U5 és U6 [1] .

A toldás felépítése és mechanizmusa

A spliceoszóma összetett dinamikus gépezetként működik: in vitro rendszerekben a spliceoszóma több komponense az mRNS-prekurzoron (pre-mRNS) áll össze és teljesíti feladatait, majd távozik, átadva helyét a következő komponenseknek [2] .

A splicing során az 5' splice határ, az elágazási pont régió és a 3' határ felismerését nagymértékben az snRNS molekulák bázispárosodása és a pre-mRNS konszenzus szekvenciái határozzák meg. A splicing legelején az U1 komplementeren kötődik az 5'-kötési határhoz, és a BBP fehérje ( elágazáspontkötő  fehérje ) és az U2AF (U2 segédfaktor) felismeri a jövőbeni elágazási pontot. Ezután az U2 snRNP kiszorítja a BBP-t és az U2AF- et az elágazási pont régió konszenzus szekvenciájához való komplementer kötéssel. Az U2 kötődése egy elágazási ponthoz azt eredményezi, hogy a megfelelő párosítatlan adenin kilép a párosított régióból, ezáltal aktiválódik, hogy reagáljon az 5' splice határral. Ez az adenin lesz az elágazási pont. A pszeudouridin -maradékok jelenléte az U2-ben, az elágazó régióval csaknem szemben, az RNS-RNS kötések konfigurációjának megváltozásához vezet az U2-hez való kötődés során. Ezek a pszeudouridin által kiváltott szerkezeti változások a kiterjesztett adenozin 2'-OH csoportját olyan helyzetbe helyezik, amely lehetővé teszi az első splicing lépést [3] . A tripla snRNP U4/U6•U5 ezután belép a reakcióba, amelyben az U4-et és az U6-ot komplementer kötődés tartja össze. Az U1, U2, U4, U5 és U6 komplexumot B-komplexumnak nevezik. Az U5 kölcsönhatásba lép a splicing régió 5'- és 3'-végén lévő szekvenciákkal a részét képező invariáns snRNS hurok miatt [4] . Az U5 fehérje komponensei kölcsönhatásba lépnek a splicing hely 3'-régiójával [5] . A spliceoszóma egy sor átrendeződésen megy keresztül, amelyek létrehozzák a spliceoszóma aktív helyét, és elhelyezik a pre-mRNS-t az első foszforil-transzferáz reakcióhoz. Az intron jellegzetes lasszó alakot ölt. Még néhány átrendeződés történik, aminek következtében az U4 és az U6 közötti kapcsolatok megszakadnak, az U4 pedig távozik. A felszabaduló U6 helyettesíti az U1-et az 5'-splicing határon, és aktív helyet képez a második foszforil-transzferáz reakcióhoz, amelynek során az exonvégek összekapcsolódnak, és az intron kivágódik. Az U2, U5 és U6 komplexet B* komplexnek, a B* komplex létezése és az intron kivágása között létező komplexet pedig C komplexnek nevezzük. U5 [6] [7] szükséges az exonok összekapcsolásához .

Bár maguk a splicing reakciók nem igényelnek ATP -t, ez szükséges a spliceoszóma összeállításához és átrendeződéséhez. Például egyes spliceoszómafehérjék az ATP-t használják az RNS-RNS kötések megszakítására. Valójában minden szakasz, kivéve a BBP leszállását az elágazási ponton és az U1-et az 5' splicing helyen, ATP hidrolízist és további fehérjék részvételét igényli (egy illesztési eseményhez legalább 200 fehérje szükséges, beleértve az snRNP fehérjéket is ) [8] .

Az illesztés befejeztével a spliceoszóma olyan fehérjéket irányít, amelyek az mRNS-hez kötődnek az intron által korábban elfoglalt pozíció közelében. Ezeket a fehérjéket exon junction komplexnek (EJC ) nevezik [  8 ] .

Kis spliceosome

Az U2-függő nagy spliceoszómán kívül van egy U12-függő kis spliceoszóma ( angol  minor spliceosome ). A kis spliceoszóma a legtöbb eukarióta fajban jelen van , de az intronoknak csak körülbelül 0,5%-át köti össze. Az ilyen intronok valamivel kevésbé hatékonyan kapcsolódnak össze, mint a nagy spliceoszóma intronok, és várhatóan korlátozzák a megfelelő gének expresszióját . Összehasonlítva a normál intronokkal, amelyek GT-AG végekkel és alacsony konzervált 5' splice hellyel rendelkeznek, a kis spliceoszóma intronok konzerváltak 5' splice helyeket és AT-AC végeket. A kis spliceoszóma snRNP-k közé tartozik négy specifikus snRNS: U11 , U12 , U4atac és U6atac , valamint egy U5 snRNS, amely mindkét típusú spliceoszómában közös [9] . A bal oldali ábra a nagy és kis spliceosomák működésének főbb különbségeit mutatja.

Klinikai jelentősége

A spliceoszóma különféle komponenseinek mutációi és a hozzájuk tartozó rendellenességek gyakran mielodiszpláziás szindrómák [10] [11] , valamint különféle típusú rák és neuropatológiák [12] kialakulásához vezetnek . Ebben a tekintetben a rákellenes gyógyszerek jelöltjei olyan kis molekulák , amelyek modulálhatják a spliceoszóma munkáját [13] . A Taybi- Linder szindróma a kis spliceoszóma részét képező snRNS mutációihoz kapcsolódik [ 14] . 

Jegyzetek

  1. Alberts et al., 2013 , p. 537.
  2. Alberts et al., 2013 , p. 538.
  3. Newby MI , Greenbaum NL Az spliceoszomális elágazás helyfelismerési motívumának formázása konzervált pszeudouridinnel.  (angol)  // Természet szerkezetbiológia. - 2002. - 20. évf. 9, sz. 12 . - P. 958-965. doi : 10.1038 / nsb873 . — PMID 12426583 .
  4. Newman AJ , Teigelkamp S. , Beggs JD snRNS kölcsönhatások 5' és 3' splice helyeken, fotoaktivált térhálósítással monitorozva élesztő spliceoszómákban.  (angol)  // RNA (New York, NY). - 1995. - 1. évf. 1, sz. 9 . - 968-980. — PMID 8548661 .
  5. Chiara MD , Palandjian L. , Feld Kramer R. , Reed R. Bizonyíték arra, hogy az U5 snRNP felismeri a 3' illesztési helyet a II. katalitikus lépéshez emlősökben.  (angol)  // Az EMBO folyóirat. - 1997. - 1. évf. 16. sz. 15 . - P. 4746-4759. - doi : 10.1093/emboj/16.15.4746 . — PMID 9303319 .
  6. Alberts et al., 2013 , p. 538-540.
  7. Nguyen TH , Galej WP , Fica SM , Lin PC , Newman AJ , Nagai K. Két spliceoszomális komplexum CryoEM-struktúrái: előétel és desszert a spliceosome lakomán.  (angol)  // Jelenlegi vélemény a szerkezetbiológiában. - 2016. - Kt. 36. - P. 48-57. - doi : 10.1016/j.sbi.2015.12.005 . — PMID 26803803 .
  8. 1 2 Alberts et al., 2013 , p. 540.
  9. Turunen JJ , Niemelä EH , Verma B. , Frilander MJ A másik jelentős: splicing by the minor spliceosome.  (angol)  // Wiley interdiszciplináris áttekintések. RNS. - 2013. - Kt. 4, sz. 1 . - P. 61-76. - doi : 10.1002/wrna.1141 . — PMID 23074130 .
  10. Sun C. , Wang J. , Zhou X. Research Progress on Spliceosome Mutations in Hematopoietic Malignancy  (kínai)  // Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi. - 2016. - Kt. 24,第3数. - P. 925-929. — PMID 27342535 .
  11. Brierley CK , Steensma DP Targeting Splicing in the Treatment of Myelodysplastic Syndromes and Other Myeloid Neoplasms.  (angol)  // Aktuális rosszindulatú hematológiai jelentések. - 2016. - doi : 10.1007/s11899-016-0344-z . — PMID 27492253 .
  12. Chabot B. , Shkreta L. A hírvivő RNS splicing hibás kontrollja emberi betegségekben.  (angol)  // The Journal of Cell Biology. - 2016. - Kt. 212. sz. 1 . - P. 13-27. - doi : 10.1083/jcb.201510032 . — PMID 26728853 .
  13. Effenberger KA , Urabe VK , Jurica MS Modulating splicing with the small molecular inhibitors of the spliceosome.  (angol)  // Wiley interdiszciplináris áttekintések. RNS. - 2016. - doi : 10.1002/wrna.1381 . — PMID 27440103 .
  14. Putoux A. , Alqahtani A. , Pinson L. , Paulussen AD , Michel J. , Besson A. , Mazoyer S. , Borg I. , Nampoothiri S. , Vasiljevic A. , Uwineza A. , Boggio D. , Champion F . , de Die-Smulders CE , Gardeitchik T. , van Putten WK , Perez MJ , Musizzano Y. , Razavi F. , Drunat S. , Verloes A. , Hennekam R. , Guibaud L. , Alix E. , Sanlaville D. , Lesca G. , Edery P. A Taybi-Linder szindróma fenotípusos és mutációs spektrumának finomítása.  (angol)  // Klinikai genetika. - 2016. - Kt. 90, sz. 6 . - P. 550-555. - doi : 10.1111/cge.12781 . — PMID 27040866 .

Irodalom