Egyházi szeparatizmus – a szakadással ellentétben nem saját párhuzamos „egyház” létrehozása, hanem a domináns egyházhoz való formális tartozás mellett annak külső életében való teljes részvétel. Ugyanakkor csak a tudatos keresztények lehetnek „szeparatisták”, akik többé-kevésbé szigorú keresztény életvitel mellett döntöttek anélkül, hogy a hivatalos egyházhoz kapcsolódnának – és nem csak megkeresztelkedtek, hanem valójában olyan emberek, akik közömbösek az egyház iránt. egyház, és valójában nem tartoznak hozzá.
Bár egyes tudósok az egyházi szeparatizmust úgy értelmezik, mint egy személy vagy embercsoport elválasztását a hivatalos egyháztól, ezért Novatianust , Donatust , Tertullianust és a korai kereszténység más alakjait szeparatistáknak minősítik, ezt a kifejezést főként a reformáció korszakára vonatkozóan használják . Ennek a fajta szeparatizmusnak az alapítói Jodocus van Lodenstein (a „puha” változat) és Jean de Labadi (a későbbiekben azonban Labadi szeparatizmusa klasszikus szektává alakult). Az egyházi szeparatizmus meglehetősen gyakori volt pietista körökben . A szeparatisták Gottfried Arnold (működésének első időszakában), Gerhard Terstegen tanára, Wilhelm Hoffmann és sokan mások voltak. stb. A szeparatisták elkerülték az istentiszteleteken való részvételt és az úrvacsorát, otthonaikban ima- és prédikációs összejöveteleket szerveztek.