Cellulóz-szintáz (UDP-glükózt használó)

Cellulóz szintáz

A bakteriális cellulóz-szintáz szerkezete
Azonosítók
KF kód 2.4.1.12
CAS szám 9027-19-4
Enzim adatbázisok
IntEnz IntEnz nézet
BRENDA BRENDA bejegyzés
ExPASy NiceZyme nézet
MetaCyc anyagcsere út
KEGG KEGG bejegyzés
PRIAM profil
EKT struktúrák RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Keresés
PMC cikkeket
PubMed cikkeket
NCBI NCBI fehérjék
CAS 9027-19-4

Az enzimológiában a  cellulóz-szintáz  ( EC Code 2.4.1.12 , UDP - glükóz:(1→4)-β - d -glükán-4-β- d - glikoziltranszferáz ) egy olyan enzim , amely egy kémiai reakciót katalizál :

UDP-glükóz + [(1→4)-β-D-glükopiranozil] n  = UDP + [(1→4)-β-D-glükopiranozil] n+1

Így ennek az enzimnek a szubsztrátjai az UDP-glükóz és a [(1→4)-β-D-glükopiranozil] n , termékei pedig az UDP és a [ (1→4)-β- D -glükopiranozil ] n+1 .

Az enzim részt vesz a cellulóz szintézisében . Egy rokon enzim, amely GDP-glükózt használ szubsztrátként, a cellulóz-szintáz (GDP-glükóz-függő) (EC 2.4.1.29).

Cellulóz

A cellulózszálak  β-(1→4)-kapcsolt  glükózmaradékok el nem ágazó polimerláncainak  gyűjteménye   . A cellulóz a zöld növények elsődleges és másodlagos sejtfalának jelentős részét teszi ki . [1] [2] [3] [4]  Bár ez az enzim nélkülözhetetlen a szárazföldi növények sejtfalának felépítéséhez , algákban , egyes baktériumokban és számos állatban is megtalálható . [5] [6] [7] [8] A világ 2 × 10 11 tonna cellulóz mikrofibrillumot állít elő. [9]  A cellulóz a megújuló bioüzemanyagok és más növényi eredetű anyagok (fűrészáru, különféle tüzelőanyagok, növényi takarmányok, papír , pamut és egyéb rostok ) előállításának alapja. [tíz]

A cellulóz funkciói

A mikrofibrillumok a sejtmembránok felszínén szintetizálódnak a sejtfal megerősítése érdekében, amit növényi biokémikusok és sejtbiológusok alaposan tanulmányoztak, mert 1) szabályozzák a sejt morfogenezist és 2) a sejtfalban sok más összetevővel (pl. lignin ) együtt végeznek. , hemicellulóz , pektinek ) alapvető támaszai annak szerkezetének és a sejt alakjának. E tartószerkezetek nélkül a sejtnövekedés arra kényszerítené őket, hogy minden irányba terjeszkedjenek, ezáltal elveszítenék alakjukat  [11]

A cellulóz-szintáz szerkezete

A növényi cellulóz-szintázok a glikozil -transzferázok családjába tartoznak , amelyek a Föld biomasszája nagy részének bioszintézisében és hidrolízisében részt vevő fehérjék. [12] A cellulózt nagyméretű cellulóz-szintáz komplexek (CSC-k) segítségével állítják elő, amelyek szintáz izoformáiból  (CesA) állnak, amelyek egyedi hatszögletű szerkezetben, úgynevezett „rozettakomplexben” egyesülnek, 50 nm széles és 30–35 nm magas. [13] [14] Több mint 20 ilyen hosszú  integrált membránfehérje létezik , mindegyik körülbelül 1000 aminosav méretű . Ezeket a rozettakomplexeket, amelyeket korábban granulátumoknak neveztek, először 1972-ben fedezték fel elektronmikroszkóppal a Cladophora  és Chaetomorph zöld algafajtákban [15] (Robinson et al. 1972). A röntgendiffrakciós elemzés kimutatta, hogy a CesA-k a növényi sejt felszínén helyezkednek el, és megnyúlt monomerek két katalitikus doménnel , amelyek dimerekké egyesülnek . A dimerek központi része katalitikusan aktív centrum. Mivel a cellulóz minden sejtfalban szintetizálódik, a CesA fehérjék minden növényi szövetben és sejttípusban jelen vannak. A CesA-nak azonban különböző típusai vannak, és a különböző szövettípusok koncentrációarányuk eltérhet. Például az AtCesA1 (RSW1) fehérje az egész növényben részt vesz az elsődleges sejtfal bioszintézisében, az AtCesA7 (IRX3) fehérje csak a szárban expresszálódik a másodlagos sejtfalszintézishez. [16]

Cellulóz-szintáz aktivitás

A cellulóz bioszintézis egy olyan folyamat, amelyben 2000-25 000 glükózmaradék hosszúságú egyedi homogén β-(1→4)-glükánláncok szintetizálódnak, majd azonnal hidrogénkötéseket hoznak létre egymással, szilárd kristályos képződményeket - mikrofibrillákat - képezve. Az elsődleges sejtfal mikrofibrillumai körülbelül 36 lánc hosszúak, míg a másodlagos sejtfal mikrofibrillumai sokkal nagyobbak, és akár 1200 β-(1→4)-glükán láncot is tartalmaznak. Az UDP-glükóz, amelyet az UDP-glükózt termelő és a plazmamembránba szállító szacharóz-szintáz enzim szintetizál  , az a szubsztrát, amelyet a cellulóz-szintáz a glükánlánc felépítéséhez használ. [17]  Az egyetlen glükánlánchoz tartozó glükózmaradék szintézisének sebessége 300 és 1000 glükózmaradék/perc között van, a magasabb sebesség gyakrabban fordul elő a másodlagos sejtfalakban, például a xilémben. [18] [19]

Reakció UDP-glükóz használatával

Az enzimológiában a  cellulóz-szintáz (UDP-glükózt használó) ( EC - kód 2.4.1.12 ) egy kémiai reakciót katalizáló enzim .

UDP-glükóz + [(1 →4)-β- D -glükopiranozil ] n UDP + [(1→4)-β-D-glükopiranozil] n+1

Így ennek az enzimnek a két szubsztrátja az UDP-glükóz és egy (1→4)-β-D-glükopiranozil-lánc, míg két terméke az UDP és egy kiterjesztett lánc glükopiranozil-maradékok. A glükopiranozil a glükóz piranóz formája  , az (1→4) -β- D -glükopiranozil-maradékok lánca a  cellulóz , így az ebbe az osztályba tartozó enzimek fontos szerepet játszanak a cellulóz szintézisében.

Ez az enzim a hexozil-transzferázok családjába tartozik, pontosabban a  glikozil -transzferázokhoz . Ennek az enzimosztálynak a szisztematikus neve UDP-glükóz: 1,4-β- D -glükán 4-β- D - glükoziltranszferáz. Egyéb elnevezések:  UDP-glükóz-β-glükán-glükoziltranszferáz , UDP-glükóz-cellulóz-glükoziltranszferáz , GS-I , β- (1→4)-glukozil -transzferáz , uridin-difoszfoglükóz-(1→4)-β-glükán - glükóz (1→4)-glükán-szintáz , β-(1-→4)-glükán-szintáz , β-glükán-szintáz , (1→4)-β - D -glükán -szintáz , (1-→4)-β-glükán-szintáz , glükán-szintáz , UDP-glükóz-(1→4)-β-glükán-glükóz-transzferáz és uridin-difoszfoglükóz-cellulóz-glükoziltranszferáz .

Tartószerkezetek

A mikrofibrillumok szintézisét a megnyúló sejtek plazmamembránja alatt elhelyezkedő kortikális mikrotubulusok hajtják  , amelyek platformot biztosítanak, amelyen a CTC-k a glükózt kristályszerű láncokká alakíthatják. A mikrotubulusok és mikrofibrillumok kolineáris hipotézise azt sugallja, hogy a megnyúló sejtek plazmamembránja alatti kortikális mikrotubulusok olyan CTC-k számára biztosítanak utakat, amelyek a glükózmolekulákat kristályszerű cellulóz mikrofibrillumokká alakítják. [20]  A „közvetlen” hipotézis azt sugallja, hogy a CesA komplexek és a mikrotubulusok között vannak bizonyos típusú közvetlen kapcsolatok. Emellett a KORRIGAN fehérjét (KOR1) a cellulózszintézis lényeges alkotóelemének tekintik, mivel a plazmamembrán és a sejtfal között hat a cellulózra. A KOR1 kölcsönhatásba lép két specifikus CesA fehérjével, esetleg korrigálja és enyhíti a glükánlánc szintéziséből származó stresszt a rendezetlen amorf cellulóz hidrolizálásával. [21]

Környezeti hatások

A cellulóz-szintáz aktivitását számos környezeti tényező befolyásolja, például hormonok, fény, mechanikai ingerek, táplálkozás és a citoszkeletonnal való kölcsönhatások . Ezen tényezők kölcsönhatása befolyásolhatja a cellulóz lerakódását a képződött szubsztrát mennyiségének és a CTC-k koncentrációjának és/vagy aktivitásának megváltoztatásával a plazmamembránban.

Linkek

  1. Cutler, S. Nukleotid-difoszfo-cukor-glikoziltranszferázok osztályozása aminosavszekvencia hasonlóságok alapján  //  Biochemistry : Journal. - 1997. - 1. évf. 326 . - P. 929-939 . doi : 10.1042 / bj3260929u . — PMID 9334165 .
  2. Olek, Rayon, Wakowski, Kim, Badger, Ghosh, Crowley, Himmel, Bolin, Carpita, AT, C., LHR, P., J., LN, S., D., M., ME, NC A szerkezet növényi cellulóz-szintáz katalitikus doménjéről és dimerekké való összeállításáról  (angol)  // The Plant Cell  : Journal. - 2014. - Kt. 26 . - P. 2996-3009 . - doi : 10.1105/tpc.114.126862 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  3. Richmond, Todd. Magasabb növényi cellulóz-szintáz  //  BioMed Central. - 2000. - Vol. 1 . - 3001. o . - doi : 10.1186/gb-2000-1-4-reviews3001 .
  4. Lei, Li, Gu, L., S., Y. Cellulóz-szintáz komplexek: összetétel és szabályozás  //  Frontiers of Plant Science: folyóirat. - 2012. - Kt. 3 . - 75. o . - doi : 10.3389/fpls.2012.00075 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  5. Nakashima, Yamada, Satou, Azuma, Satoh, K., L., Y., J., N. Az állati cellulóz szintáz evolúciós eredete  //  Development Genes and Evolution : Journal. - 2004. - 20. évf. 214 . - 81-88 . o . - doi : 10.1007/s00427-003-0379-8 . — PMID 14740209 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  6. Yin, Huang, Xu, Y., J., Y. A cellulóz szintáz szupercsalád teljesen szekvenált növényekben és algákban  //  BMC Plant Biology : Journal. - 2009. - 1. évf. 9 . — 99. o . - doi : 10.1186/1471-2229-9-99 . — PMID 19646250 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  7. Sethaphong, Haigler, Kubicki, Zimmer, Bonetta, DeBolt, Yinling, L., CH, JD, J., D S., IG A növényi cellulózszintáz  harmadlagos modellje  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States Amerika  : folyóirat. - 2013. - Kt. 110 . - P. 7512-7517 . - doi : 10.1073/pnas.1301027110 . — PMID 23592721 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  8. Li, Lei, Gu, S., L., Y. Kevert elsődleges és szekunder cellulóz szintázokkal rendelkező komplexek funkcionális elemzése  //  Plant Signaling and Behavior : Journal. - 2012. - Kt. 8 . - P. 23179 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  9. Lieth, H. A fűtőértékek mérése.  A bioszféra elsődleges termelékenysége . - New York: Springer, 1975. - P. 119-129.
  10. Cutler, Somerville, S., C. Cellulose synthesis: Cloning in silico  // Current Biology  : Journal  . - Cell Press , 1997. - Vol. 7 . - 108-111 . o . - doi : 10.1016/S0960-9822(06)00050-9 .
  11. Hogetsu, Shibaoka, T., H. A kolhicin hatása a sejt alakjára és a mikrofibrillumok elrendezésére a Closterium acerosum sejtfalában  //  Planta: Journal. - 1978. - 1. évf. 140 . - P. 445-449 . - doi : 10.1007/BF00389374 . — PMID 24414355 .
  12. Campell, Davies, Bulone, Henrissat, JA, GJ, V., B.A .. Nukleotid-difoszfo-cukor-glikozil-transzferázok osztályozása aminosav-szekvencia hasonlóságok alapján  // Biochemical  Journal : folyóirat. - 1997. - 1. évf. 329 . - 719. o . — PMID 9445404 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  13. Giddings, Brower, Staehelin, TH, DL, LA cellulóz fibrillumok kialakulása az elsődleges és másodlagos falakban  //  Journal of Cellular Biology : folyóirat. - 1980. - 1. évf. 84 . - 327-339 . - doi : 10.1083/jcb.84.2.327 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  14. Bowling, Brown, AJ, RM Jr. A cellulóz-szintetizáló komplex citoplazmatikus doménje edényes növényekben  (angol)  // Protoplasma : Journal. - 2008. - Vol. 233 . - 115-127 . o . - doi : 10.1007/s00709-008-0302-2 .
  15. Robinson, White, Preston, DG, RK, RD A Cladophora és Chaetomorpha rajok finom szerkezete. III. Falszintézis és -fejlesztés  (angol)  // Planta : Journal. - 1972. - 1. évf. 107 . - P. 7512-7517 . - doi : 10.1007/BF00387719 . — PMID 24477398 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  16. Richmond, T. Magasabb növényi cellulóz szintáz  //  BioMed Central. - 2000. - Vol. 7 . - 3001. o . - doi : 10.1186/gb-2000-1-4-reviews3001 .
  17. Heath, IB Egységes hipotézis a membránhoz kötött enzimkomplexek és mikrotubulusok szerepéről a növényi sejtfal szintézisében  //  Journal of Theoretical Biology : folyóirat. - 1974. - 1. évf. 48 . - P. 445-449 . - doi : 10.1016/S0022-5193(74)80011-1 .
  18. Paredez, Somerville, Ehrhardt, AR, CR, DW A cellulóz-szintáz vizualizálása funkcionális kapcsolatot mutat a mikrotubulusokkal  //  Science : Journal. - 2006. - 20. évf. 312 . - P. 1491-1495 . - doi : 10.1126/tudomány.1126551 . — PMID 16627697 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )
  19. Wightman, Turner, R., S. R. A citoszkeleton szerepe a cellulóz lerakódása során a másodlagos sejtfalon  //  The Plant Journal : folyóirat. - 2008. - Vol. 54 . - P. 794-805 . - doi : 10.1111/j.1365-313X.2008.03444.x . — PMID 18266917 .
  20. Green, PB Mechanizmus a növényi sejtmorfogenezishez   // Tudomány . - 1962. - 1. évf. 138 . - P. 1404-1405 . - doi : 10.1126/tudomány.138.3548.1404 .
  21. Mansoori, Timmers, Desprez, Kamei, Dees, Vinken, Viiser, Hoefte, Venhettes, Trindade, N., J., T., CLA, DCT, JP, RGF, H., S., LM KORRIGAN1 kifejezetten kölcsönhatásba lép az integrállal a cellulóz szintáz gépezet összetevői  (angol)  // PLoS ONE  : folyóirat. - 2014. - Kt. 9 . — P. e112387 . - doi : 10.1371/journal.pone.0112387 . CS1 maint: Több név: szerzők listája ( link )