Triptofán represszor

A triptofán-represszor (vagy trp-represszor ) egy transzkripciós faktor , amely részt vesz az aminosav- metabolizmus szabályozásában . Leginkább E. coliban tanulmányozható , ahol ez egy dimer fehérje, amely 5 gén transzkripcióját szabályozza a triptofán operonban [1] . Ha a triptofán aminosav bőségesen található a sejtben, az a fehérjéhez kötődik , ami konformációs változást okoz a fehérjében [2] , majd a represszor komplex a génekben lévő operátorszekvenciájához kötődik , amit szabályoz, kikapcsolva a géneket. [3] [4] .

A Trp-represszor által szabályozott egyik gén, a TRpr magát a triptofán-represszor fehérjét kódolja. Ez a visszacsatolás szabályozásának egy formája .

A triptofán represszor egy 25 kD fehérje homodimer, amely szabályozza a triptofán transzkripcióját a bakteriális bioszintézis során. 5 operon van, amelyeket a TRpr - trpEDCBA , TRpr , ArOH , Arol és CCO operonok szabályoznak.

Mechanizmus

Amikor a triptofán aminosav bőségesen van jelen a sejtben, a TRpr 2 triptofánmolekulát köt meg, ami ennek következtében megváltoztatja annak szerkezetét és dinamikáját, így képes lesz kötődni a DNS- operátorhoz . Amikor ez megtörténik, a DNS-transzkripció leáll, és elnyomja a gén termékeit, a triptofánt termelő fehérjéket. Amikor a sejtben a triptofán szintje csökken, a triptofán-represszor molekulák lebomlanak, így a represszor visszatér inaktív formájába.

A TRpr saját termelésének szabályozását is szabályozza, a TRpr gén szabályozásán keresztül [5] .

A korlátozott formájú ligandum és a szabad formájú ligandum szerkezetét röntgenkrisztallográfiával és NMR -rel határozták meg [6] [7] [8] [9] [10] .

A trp operon egy szabályozó génből , egy promoterből , egy operátorból és egy terminátorból áll. A trp operon csak akkor aktív, ha nincs elég sejt triptofán. Ha nincs elegendő triptofán, a represszor fehérje leválik a kezelőről (ahol a represszor normális esetben kötődne), és az RNS polimeráz befejezheti a DNS-szál leolvasását. Ha az RNS-polimeráz eléri a terminátort (a DNS-szál végén), akkor létrejön a triptofán enzim.

Jegyzetek

1. ↑ Santillan M., Mackey MC A triptofán operon dinamikus szabályozása: Modellező tanulmány és összehasonlítás kísérleti adatokkal  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 2001. - 20. évf. 98 , sz. 4 . - P. 1364-1369 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1364 . — PMID 11171956 .
2. ↑ Zhang RG, Joachimiak A., Lawson CL, Schevitz RW, Otwinowski Z., Sigler PB A trp aporepresszor kristályszerkezete 1,8 A-nál azt mutatja, hogy a triptofán kötése hogyan fokozza a DNS-affinitást  //  Nature : Journal. - 1987. - 1. évf. 327. sz . 6123 . - P. 591-597 . - doi : 10.1038/327591a0 . — PMID 3600756 .
3. ↑ Jeeves M., Evans PD, Parslow RA, Jaseja M., Hyde EI Studies of the Escherichia coli Trp represszor kötődés annak öt operátorához és variáns operátorszekvenciákhoz   // Eur . J Biochem. : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 265 , sz. 3 . - P. 919-928 . - doi : 10.1046/j.1432-1327.1999.00792.x . — PMID 10518785 .
4. ↑ Arvidson DN, Arvidson CG, Lawson CL, Miner J., Adams C., Youderian P. A triptofán-represszorszekvencia erősen konzervált az Enterobacteriaceae körében  // Nucleic Acids Res  . : folyóirat. - 1994. - 1. évf. 22 , sz. 10 . - P. 1821-1829 . - doi : 10.1093/nar/10/22/1821 . — PMID 8208606 .
5. ↑ Kelley RL, Yanofsky C. A Trp aporepresszor termelését autogén szabályozás és nem hatékony fordítás szabályozza  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 1982. - május ( 79. évf. , 10. sz.). - P. 3120-3124 . - doi : 10.1073/pnas.79.10.3120 . — PMID 7048301 .
6. ↑ Schevitz RW, Otwinowski Z., Joachimiak A., Lawson CL, Sigler PB A trp repressor háromdimenziós szerkezete   // Nature . - 1985. - 1. évf. 317. sz . 6040 . - P. 782-786 . - doi : 10.1038/317782a0 . — PMID 3903514 .
7. ↑ Otwinowski Z; Schevitz RW; Zhang R.G.; Lawson, C. L.; Joachimak, A.; Marmorstein, RQ; Luisi, BF; Sigler, PB A trp represszor/operátor komplex kristályszerkezete atomi felbontásban  (angol)  // Nature : Journal. - 1988. - 1. évf. 335. sz . 6188 . - P. 321-329 . - doi : 10.1038/335321a0 . — PMID 3419502 .
8. ↑ Lawson CL, Carey J. Tandem kötés egy trp-represszor/operátor féloldali komplex kristályaiban  //  Nature: Journal. - 1993. - 1. évf. 366. sz . 6451 . - P. 178-182 . - doi : 10.1038/366178a0 . — PMID 8232559 .
9. ↑ Zhao D., Arrowsmith CH, Jia X., Jardetzky O. Az Escherichia coli trp holo- és aporepresszor finomított oldatszerkezetei  //  J. Mol. Biol. : folyóirat. - 1993. - 1. évf. 229 , sz. 3 . - P. 735-746 . - doi : 10.1006/jmbi.1993.1076 . — PMID 8433368 .
10. ↑ Zhang H; Zhao D; Revington M; Lee, W; Jia, X; Arrowsmith, C; Jardetzky, O. A trp-represszor-operátor DNS komplex  oldatszerkezetei //  J. Mol. Biol. : folyóirat. - 1994. - 1. évf. 238. sz . 4 . - P. 592-614 . - doi : 10.1006/jmbi.1994.1317 . — PMID 8176748 .