Poli(ADP-ribóz) polimerázok

Az oldal jelenlegi verzióját még nem ellenőrizték tapasztalt közreműködők, és jelentősen eltérhet a 2022. március 7-én felülvizsgált verziótól ; az ellenőrzések 2 szerkesztést igényelnek .

A poli(ADP-ribóz) polimerázok ( PARP ) olyan enzimek , amelyek katalizálják a poli -ADP-ribozilációt , a fehérjék poszttranszlációs módosításának egyik típusát .

A poli(ADP-ribóz) polimerázok ( EC 2.4.2.30 az Enzimek Nemzetközi Osztályozásában) a glikoziltranszferázok osztályának (EC 2.4) [1] a pentozil-transzferázok (EC 2.4.2) alosztályába tartoznak [1] , és katalizálják az ADP transzfer reakcióját. -ribozil ( adenozin-difoszfát- ribóz maradék ) a fehérjéhez kapcsolódó poli-ADP-ribozil láncon, amelyben az ADP-ribóz donor a nikotinamid-adenin-dinukleotid (NAD + ) [2] :

NAD + + (ADP-D-ribozil) n -akceptor (ADP-D-ribozil) n + 1 + nikotinamid

A különböző PARP-ok akceptorai különböző szubsztrátfehérjék, aminek következtében ezek az enzimek eltérő élettani funkciót töltenek be [3] [4] [5] . Ellentétben a PARP-val, amely több NAD + molekulát használ egy akceptor módosítására és poli-ADP-ribóz szintetizálására, a mono-ADP-ribozilációt katalizáló enzimek nem tartoznak a PARP szupercsaládba, és az enzim nómenklatúrában eltérő sorozatszámmal rendelkeznek.

A szupercsalád legismertebb tagja a PARP-1 enzim, amely a hiszton poli-ADP-riboziláción keresztül részt vesz a DNS - károsodások helyreállításában és a kromatin átalakulásában. Mivel a DNS az apoptózis során hasad, a kaszpázok hasadnak, és ezáltal inaktiválják a PARP-1-et, megakadályozva a hasított DNS helyreállítását.

Klinikai jelentősége és PARP-gátlók

Egyes esetekben a DNS-javító komplex zavarai karcinogenezishez vezetnek . Például emberben a BRCA1 és BRCA2 ( emlőrákra való hajlam fehérje ) tumorszuppresszor gének mutációi , amelyek a DNS-javításban részt vevő fehérjéket kódolnak , emlőrák kialakulásához vezetnek . A PARP-1 aktivitás elnyomása a kemoterápia során ebben az esetben olyan sejtek apoptózisához vezet, amelyek DNS-ét a citosztatikus gyógyszerek károsítják [6] . Számos PARP-gátló ( veliparib , iniparib , olaparib , rukaparib ) rákellenes gyógyszerként jelenleg klinikai vizsgálat alatt áll.  

Humán PARP gének és az általuk kódolt enzimek

Emberben 16 gén kódolja ezeket az enzimeket, egy szupercsaládot alkotva [7] [8] , amelyek mindegyike homológ katalitikus doménnel rendelkezik, és úgy tűnik, hogy ugyanabból az ősi enzimből származnak.

Gén Kromoszóma Hozzáférési kód az UniProt adatbázisban A polipeptid maximális hossza (a.a.) * A termék maximális becsült tömege (kDa) * Alternatív terméknevek A katalitikustól eltérő tartományok Megjegyzések
PARP-1 1q41-42 P09874 Archiválva : 2011. április 12. a Wayback Machine -nél 1014 113 ADPRT, PPOL BRCT, PARP-szabályozó, DNS-kötő
PARP-2 14q11.2 Q9UGN5 Archiválva : 2011. április 12. a Wayback Machine -nél 583 * 66 * ADPRT2, ADPRTL2 PARP-szabályozás
PARP-3 3p21 Q9Y6F1 Archiválva : 2010. november 14. a Wayback Machine -nél 533 60 ADPRT3, ADPRTL3
PARP-4 13q11 Q9UKK3 Archiválva : 2011. augusztus 21. a Wayback Machine -nél 1724 193 ADPRTL1, KIAA0177, PARPL, VPARP BRCT, VIT, VWFA
PARP-5a 8p23.1 O95271 Archiválva : 2011. január 19. a Wayback Machine -nél 1327 * 142 * TNKS1, tankyrase 1 Ankyric, SAM
PARP-5b 10q23.03 Q9H2K2 Archiválva : 2010. június 21. a Wayback Machine -nél 1166 127 TNKL, TNKS2, tankirase 2 Ankyric, SAM
PARP-6 15q22.3 Q2NL67 Archiválva : 2010. augusztus 6. a Wayback Machine -nél 630 * 71 * transzkriptum észlelve, fehérje karakterizálatlan
PARP-7 3q25.31 Q7Z3E1 Archiválva : 2011. május 11. a Wayback Machine -nél 657 76 TIPARP DNS-kötés, WWE
PARP-8 5q11.2 Q8N3A8 Archiválva : 2012. november 4. a Wayback Machine -nél 854 * 96 *
PARP-9 3q13-q21 Q8IXQ6 Archiválva : 2010. augusztus 6. a Wayback Machine -nél 854 * 96 * BAL makró
PARP-10 8q24.3 Q53GL7 Archiválva : 2012. november 3. a Wayback Machine -nél 1025 110
PARP-11 12p13.3 Q9NR21 Archiválva : 2010. augusztus 6. a Wayback Machine -nél 331 * 39 * C12orf6 WWE
PARP-12 7q34 Q9H0J9 Archiválva : 2012. október 25. a Wayback Machine -nél 701 79 ZC3HDC1 DNS-kötés, WWE
PARP-14 3q21.1 Q460N5 Archiválva : 2012. november 10. a Wayback Machine -nél 1720 * 194 * BAL2, KIAA1268 makró, WWE
PARP-15 3q21.1 Q460N3 Archiválva : 2012. november 10. a Wayback Machine -nél 656 * 73 * BAL3 makró
PARP-16 15q22.2 Q8N5Y8 Archiválva : 2012. november 10. a Wayback Machine -nél 322 * 36 * C15orf30 transzkriptum észlelve, fehérje karakterizálatlan

* Jelöljük azokat a géntermékeket, amelyeknél kisebb hosszúságú és molekulatömegű izoformák is ismertek.

Jegyzetek

  1. ↑ EC 2.4.2.30 // IUBMB enzim nómenklatúra . Letöltve: 2013. május 14. Az eredetiből archiválva : 2013. június 20.
  2. ↑ Nilov, DC; Puskarev, SV; Gushchina, I. V.; Manasaryan, GA; Kirsanov, KI; Shvydas, VK (2020). „A humán poli(ADP-ribóz)polimeráz 1 enzim-szubsztrát komplexeinek modellezése”. Biokémia . 85 : 116–125. DOI : 10.31857/S0320972520010091 .
  3. ↑ Piskunova TS, Yurova MN, Ovsyannikov AI, Semenchenko AV, Zabezhinski MA, Popovich IG, Wang ZQ, Anisimov VN. A poli(ADP-ribóz) polimeráz-1 (PARP-1) hiánya felgyorsítja az öregedést és a spontán karcinogenezist egerekben. Curr Gerontol Geriatr Res. 2008:754190. Epub 2008. április 14. PMID 19415146
  4. ↑ Espinoza LA, Smulson ME, Chen Z. Az elhúzódó poli(ADP-ribóz) polimeráz-1 aktivitás szabályozza a JP-8 által kiváltott tartós citokin expressziót alveoláris makrofágokban. Ingyenes Radic Biol Med. 2007. május 1.;42(9):1430-40. Epub 2007. február 1. PMID 17395016
  5. ↑ Zerfaoui M, Suzuki Y, Naura AS, Hans CP, Nichols C, Boulares AH. A p65 NF-kappaB nukleáris transzlokációja elegendő a VCAM-1 expressziójához, de nem az ICAM-1 expressziójához TNF-stimulált simaizomsejtekben: A PARP-1 expressziójának és interakciójának különbségi követelményei. sejtjel. 2008. január;20(1):186-94. Epub 2007. október 12. PMID 17993261
  6. ↑ József A.; DeSoto; Chu Xia Deng. PARP-1 gátlók: ezek a régóta keresett genetikailag specifikus gyógyszerek a BRCA1/2-vel összefüggő emlőrák kezelésére? (angol)  // International Journal of Medical Sciences   : folyóirat. - 2006. - július 15. ( 3. köt. , 4. sz.). - 117-123 . o . — ISSN 1449-1907 .
  7. ↑ Ame JC, Spenlehauer C., de Murcia G. A PARP szupercsalád. bioesszék 2004; 26:882-893. . Letöltve: 2010. augusztus 30. Az eredetiből archiválva : 2016. március 5..
  8. ↑ Manasaryan, G; Suplatov, D; Puskarev, S; Drobot, V; Kuimov, A; Švedas, V; Nilov, D (2021). „A nikotinamid kötőhely bioinformatikai elemzése poli(ADP-ribóz) polimeráz családba tartozó fehérjékben”. Rákok . 13 :1201 doi : 10.3390 / rákok13061201 . PMID 33801950 . 


Linkek

 DNS javítás
Kivágás javítás
Egyéb típusú jóvátétel
Egyéb fehérjék
Szabályozás