TATA doboz

A TATA-box ( a box egy ismétlődő nukleotidszekvencia, amely transzkripciós vagy szabályozó jelet képez), vagy a Hogness-box  az eukarióták konzervatív DNS - motívuma ( cisz-szabályozó elem ) , 5' - 3' szekvenciával [1] . A TATA-box az archaeákban és eukariótákban [ 2] található gének promoter régiójában található, körülbelül 30 nukleotiddal a transzkripció kezdőhelyétől [3] . A TATA box jelenlétéből felismerhető a DNS átírandó templátszála [ 1] . Megköti a transzkripciós faktorokat , amelyek az RNS-polimerázt a transzkripció kezdőhelyéhez vonzzák [1] (például a TFIID-faktort vagy a TATA-faktort [4] ). Így a TATA-box funkcionálisan egyenértékű a baktériumokban található Pribnow-box - szal [5] . TATAAA

Működés

Normális esetben a transzkripció elején lévő TATA-doboz a TATA-kötő fehérjéhez (TBP) kötődik, amely felcsavarja a DNS-t. Az AT-ban gazdag hely megkönnyíti a feloldódást, mivel az egy párban lévő 2 hidrogénkötés А-Тkevésbé erős, mint a 3 párban lévő kötés G-C. A TBP egy szokatlan fehérje , amely a DNS kisebb barázdájához kötődik, és β-lemezekből áll [6] .

A TATA doboz jellemzően az RNS polimeráz II kötőhelyein található . A TFIID transzkripciós faktor a TATA dobozhoz kötődik, majd utána egy másik transzkripciós faktor, a TFIIA csatlakozik a felső részéhez , a TFIIB pedig az alsó részéhez . Ezekhez a faktorokhoz való kötődést a TBP által indukált DNS-feltekeredés is elősegíti [3] . Az RNS-polimeráz II felismeri és kötődik ehhez a multiprotein komplexhez, különféle egyéb transzkripciós faktorokkal, például TFIIF , TFIIE és TFIIH kíséretében . Ez elindítja a transzkripciót, és az RNS-polimeráz II a DNS-lánc mentén mozog, míg a TFIID és a TFIIA kapcsolatban marad a TATA dobozzal. A jövőben ez megkönnyítheti az RNS-polimeráz II további molekuláinak kapcsolódását. Ezenkívül kimutatták, hogy a TATA-box nemcsak az RNS-polimeráz II, hanem az RNS-polimeráz III által végrehajtott transzkripciót is képes elindítani [7] .

Elosztás

A TATA doboz egy nagyon ősi, erősen konzervált eukarióta promoter motívum az evolúció során , és az első ilyen motívum, amelyet azonosítottak. A TATA box azonban nem túl elterjedt gerinceseknél [3] . A legtöbb humán génnek nincs TATA boxa, és bennük az iniciátor elem vagy egy összetettebb CpG típusú promoter játssza a szerepét . A humán gének hozzávetőleg 24%-a tartalmazza a központi promoterben elhelyezkedő TATA boxot [8] (más kutatók szerint a TATA box a humán génpromoterek 10%-ában található [9] ). Valamivel korábban mintegy ezer gén elemzése 32%-uk promóterében mutatta ki a TATA box jelenlétét [10] . Megállapították, hogy a TATA-box a legszélesebb körben elterjedt a sejtválaszokban és az organogenezisben részt vevő gének között. Nyilvánvalóan a TATA -boxos promoterek bizonyos sejttípusokra specifikus génekre , míg a CpG promoterek a housekeeping génekre jellemzőek [3] .

Lásd még

• Pribnov doboz

Jegyzetek

1. ↑ 1 2 3 SCitable szószedet: TATA doboz . Letöltve: 2014. március 6. Az eredetiből archiválva : 2014. március 8.. (határozatlan)
2. ↑ Smale ST , Kadonaga JT Az RNS polimeráz II magpromoter.  (angol)  // Annual review of biochemistry. - 2003. - 20. évf. 72. - P. 449-479. - doi : 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161520 . — PMID 12651739 .
3. ↑ 1 2 3 4 Barrett et. al., 2013 , p. négy.
4. ↑ Konichev, Sevastyanova, 2012 , p. 265.
5. ↑ Arefiev V. A., Lisovenko L. A. TATA-box // Genetikai kifejezések angol-orosz magyarázó szótára. - M . : VNIRO Kiadó, 1995. - ISBN 5-85382-132-6 .
6. ↑ Patikoglou GA , Kim JL , Sun L. , Yang SH , Kodadek T. , Burley SK A TATA box-binding protein általi TATA elemfelismerést az evolúció során megőrizték.  (angol)  // Gének és fejlődés. - 1999. - 1. évf. 13. sz. 24 . - P. 3217-3230. — PMID 10617571 .
7. ↑ Wang Y. , Jensen RC , Stumph WE A TATA boxszekvencia és orientáció szerepe az RNS polimeráz II/III transzkripciós specificitás meghatározásában.  (angol)  // Nukleinsavak kutatása. - 1996. - 1. évf. 24, sz. 15 . - P. 3100-3106. — PMID 8760900 .
8. ↑ Yang C. , Bolotin E. , Jiang T. , Sladek FM , Martinez E. A TATA box feletti iniciátor prevalenciája humán és élesztőgénekben, valamint a humán TATA-t nem tartalmazó magpromoterekben dúsított DNS-motívumok azonosítása.  (angol)  // Gene. - 2007. - Vol. 389. sz. 1 . - P. 52-65. - doi : 10.1016/j.gene.2006.09.029 . — PMID 17123746 .
9. ↑ Carninci P. , Sandelin A. , Lenhard B. , Katayama S. , Shimokawa K. , Ponjavic J. , Semple CA , Taylor MS , Engström PG , Frith MC , Forrest AR , Alkema WB , Tan SL , Plessy C. Kodzius R. , Ravasi T. , Kasukawa T. , Fukuda S. , Kanamori-Katayama M. , Kitazume Y. , Kawaji H. , Kai C. , Nakamura M. , Konno H. , Nakano K. , Mottagui-Tabar S. . , Arner P. , Chesi A. , Gustincich S. , Persichetti F. , Suzuki H. , Grimmond SM , Wells CA , Orlando V. , Wahlestedt C. , Liu ET , Harbers M. , Kawai J. , Bajic VB , Hume DA , Hayashizaki Y. Az emlős promoter architektúrájának és evolúciójának genomszintű elemzése.  (angol)  // Természetgenetika. - 2006. - Vol. 38. sz. 6 . - P. 626-635. - doi : 10.1038/ng1789 . — PMID 16645617 .
10. ↑ Suzuki Y. , Tsunoda T. , Sese J. , Taira H. , Mizushima-Sugano J. , Hata H. , Ota T. , Isogai T. , Tanaka T. , Nakamura Y. , Suyama A. , Sakaki Y. , Morishita S. , Okubo K. , Sugano S. 1031 féle humán gén potenciális promoter régióinak azonosítása és jellemzése.  (angol)  // Genomkutatás. - 2001. - 20. évf. 11, sz. 5 . - P. 677-684. - doi : 10.1101/gr.164001 . — PMID 11337467 .

Irodalom

• Lucy W. Barrett, Sue Fletcher, Steve D. Wilton. Lefordítatlan génrégiók és egyéb nem kódoló elemek . - SpringerBriefs in Biochemistry and Molecular Biology, 2013. - 57 p. - ISBN 978-3-0348-0679-4 .
• Konichev A.S., Sevastyanova G.A. Molekuláris biológia. - "Akadémia" Kiadói Központ, 2012. - 400 p. — ISBN 978-5-7695-9147-1 .