Aprataxin

Aprataxin
Elérhető struktúrák
EKT Ortológus keresés: PDBe , RCSB
Azonosítók
SzimbólumAPTX  ; AOA; AOA1; AXA1; EAOH; EOAH; FHA-HIT
Külső azonosítókOMIM:  606350 MGI :  1913658 HomoloGene :  41634 GeneCards : APTX gén
RNS expressziós profil
Több információ
ortológusok
KilátásEmberiEgér
Entrez5484066408
EgyüttesENSG00000137074ENSMUSG00000028411
UniProtQ7Z2E3Q7TQC5
RefSeq (mRNS)NM_001195248NM_001025444
RefSeq (fehérje)NP_001182177NP_001020615
Locus (UCSC)Chr 9:
32,97 – 33,03 Mb
Chr 4:
40,68 – 40,7 Mb
Keresés a PubMedben[egy][2]

Az aprataxin az emberben az APTX gén által kódolt fehérje [1] [2] [3] .

Ez a gén a hisztidin -triád (HIT) szupercsalád egy tagját kódolja , amelyek egy része nukleotid-kapcsolt és diadenozin - polifoszfát hidroláz aktivitással rendelkezik . A kódolt fehérje szerepet játszhat az egyszálú DNS javításában . Ennek a génnek a mutációit oculomotoros apraxiával járó ataxiával hozták összefüggésbe . Ennek a génnek a különböző izoformáit kódoló transzkriptumoknak több változatát azonosították , azonban egyes változatok teljes természetét nem határozták meg [3] .

Funkció

Az aprataxin eltávolítja az AMP-t a DNS-végekről a sikertelen DNS-ligáz IV ligálási kísérletek után a nem homológ vég kapcsolódása idején, így lehetővé teszi a későbbi ligálási kísérleteket [4] [5] .

Interakciók

Kimutatták, hogy az aprataxin kölcsönhatásba lép a következőkkel:

Jegyzetek

  1. Dátum H., Onodera O., Tanaka H., Iwabuchi K., Uekawa K., Igarashi S., Koike R., Hiroi T., Yuasa T., Awaya Y., Sakai T., Takahashi T., Nagatomo H., Sekijima Y., Kawachi I., Takiyama Y., Nishizawa M., Fukuhara N., Saito K., Sugano S., Tsuji S. Early-onset ataxia with ocular motor apraxia and hypoalbuminémiát a mutációk okoznak egy new HIT superfamily gene  (eng.)  // Nat Genet  : Journal. - 2001. - október ( 29. évf. , 2. sz.). - P. 184-188 . - doi : 10.1038/ng1001-184 . — PMID 11586299 .
  2. Moreira MC, Barbot C., Tachi N., Kozuka N., Uchida E., Gibson T., Mendonca P., Costa M., Barros J., Yanagisawa T., Watanabe M., Ikeda Y., Aoki M. ., Nagata T., Coutinho P., Sequeiros J., Koenig M. Az ataxia-ocular apraxia 1-ben mutált gén az új HIT/Zn-finger proteint, aprataxint kódolja  (angolul)  // Nat Genet  : Journal. - 2001. - október ( 29. évf. , 2. sz.). - P. 189-193 . - doi : 10.1038/ng1001-189 . — PMID 11586300 .
  3. 1 2 Entrez gén: APTX aprataxin .
  4. Rass U., Ahel I., West SC A DNS deadeniláció molekuláris mechanizmusa az aprataxin neurológiai betegség fehérje által  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2008. - December ( 283. évf . , 49. sz.). - P. 33994-34001 . - doi : 10.1074/jbc.M807124200 . — PMID 18836178 .
  5. Reynolds JJ, El-Khamisy SF, Katyal S., Clements P., McKinnon PJ, Caldecott KW Hibás DNS ligálás a short-patch single-strand break javítás során ataxiában oculomotor apraxia 1   // Mol . sejt. Biol. : folyóirat. - 2009. - március ( 29. évf. , 5. sz.). - P. 1354-1362 . - doi : 10.1128/MCB.01471-08 . — PMID 19103743 .
  6. 1 2 Dátum H., Igarashi S., Sano Y., Takahashi T., Takahashi T., Takano H., Tsuji S., Nishizawa M., Onodera O. Az aprataxin FHA doménje kölcsönhatásba lép a C-terminális régióval XRCC1  (angol)  // Biochem. Biophys. Res. kommun. : folyóirat. - 2004. - December ( 325. évf. , 4. sz.). - P. 1279-1285 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.10.162 . — PMID 15555565 .
  7. 1 2 3 Gueven N., Becherel OJ, Kijas AW, Chen P., Howe O., Rudolph JH, Gatti R., Date H., Onodera O., Taucher-Scholz G., Lavin MF Aprataxin, a novel protein amely véd a  genotoxikus stressz  ellen // Human Molecular Genetics : folyóirat. - Oxford University Press , 2004. - május ( 13. kötet , 10. szám ). - P. 1081-1093 . doi : 10.1093 / hmg/ddh122 . — PMID 15044383 .
  8. Clements PM, Breslin C., Deeks ED, Byrd PJ, Ju L., Bieganowski P., Brenner C., Moreira MC, Taylor AM, Caldecott KW Az ataxia-oculomotor apraxia 1 génterméknek az ATM-től eltérő szerepe van, és kölcsönhatásba lép a DNS-száltörést javító fehérjékkel, az XRCC1 és XRCC4  (angol)  // DNS Repair (Amst.) : folyóirat. - 2004. - november ( 3. évf. , 11. sz.). - P. 1493-1502 . - doi : 10.1016/j.dnarep.2004.06.017 . — PMID 15380105 .

Irodalom

Linkek