IFRD1

Az interferonkötő fejlődési szabályozó 1  egy fehérje , amelyet emberben az IFRD1 gén kódol . [1] [2] Ez a gén főleg a neutrofilekben , a váz- és szívizomban, az agyban és a hasnyálmirigyben expresszálódik. [1] [2] Patkányokban és egerekben e gének (és fehérjéik) homológjait PC4 [3] és Tis21 néven is ismerik. Az IFRD1 egy második gént, az IFRD2-t, más néven SKmc15-öt tartalmazó géncsalád tagja. [1] [2]

Klinikai jelentősége

Az IFRD1-et egy tüdőbetegség, például a cisztás fibrózis módosító génjeként azonosították . [négy]

Izomregeneráció indukciója

Az IFRD1 (más néven PC4 vagy Tis7, lásd fent) részt vesz a vázizomsejtek differenciálódásában. Valójában a C2C12 mioblasztok IFRD1 funkciójának gátlása megakadályozza azok morfológiai és biokémiai differenciálódását azáltal, hogy gátolja a MyoD és a miogenin expresszióját , az izomfejlődési gének fő kulcsát. [5] In vivo az IFRD1-nek is szerepe van az izomdifferenciálódásban. Az IFRD1-et nem tartalmazó egerekből származó izmok csökkent fehérje-, mRNS-szintet, MyoD-miogenint és késleltetett regenerációt mutatnak fiatal egerek izomsérülése után. [6]

A közelmúltban kimutatták, hogy az IFRD1 in vivo in vivo szabályozása sérült izmokban fokozza az izomregenerációt azáltal, hogy fokozza az álló izomsejtek (szatellitsejtek) termelését. [7] A mögöttes molekuláris mechanizmus az IFRD1 azon képességében rejlik, hogy együttműködik a MyoD-vel a MEF2C transzkripciós aktivitás kiváltásában . Ez attól függ, hogy az IFRD1 képes-e szelektíven kötődni a MEF2C-hez, így megakadályozza annak kölcsönhatását a HDAC4-gyel. [7] [8] Így úgy tűnik, hogy az IFRD1 a MyoD pozitív kofaktoraként működik. [7] [8] A közelmúltban az IFRD1-ről kimutatták, hogy egy második MyoD-fokozó mechanizmuson keresztül potencírozza az izomregenerációt, azaz az NF-kB transzkripciós aktivitásának elnyomásával , amelyről ismert, hogy gátolja a MyoD felhalmozódását az mRNS-ben. Az IFRD1 elnyomja a p65 NF-kB aktivitását azáltal, hogy fokozza a p65 alegység HDAC által közvetített dezacetilációját, ami a HDAC3 p65-re való toborzását részesíti előnyben. Valójában az IFRD1 trimolekuláris komplexeket képez a p65-tel és a HDAC3-mal. [7]

Így az IFRD1 izomregenerációt indukálhat azáltal, hogy a MyoD kulcsfontosságú szabályozójaként működik számos mechanizmuson keresztül. Tekintettel a miogén sejtek drámai csökkenésére, amely degeneratív izombetegségekben, például Duchenne-dystrophiában fordul elő, az  IFRD1 azon képessége, hogy fokozza a regenerációs folyamatot, arra utal, hogy az IFRD1 terápiás célpont lehet.

Interakciók

Kimutatták, hogy az IFRD1 kölcsönhatásba lép a SIN3 komplex számos fehérjével, beleértve a SIN3B -t , SAP30 -at , NCOR1 -et és HDAC1 -et . [9] Ezenkívül az IFRD1 fehérje kötődik a MyoD - hez, a Mef2c -hez, a HDAC4 -hez , a HDAC3 -hoz és az NF-kB p65 alegységéhez, hogy trimmolekuláris komplexeket képezzen a HDAC3 -mal és az NF-kB p65 fehérjéivel . [10] [11] Az IFRD1 fehérje homodimereket is képez . [nyolc]

Jegyzetek

1. ↑ 1 2 3 Buanne P., Incerti B., Guardavaccaro D., Avvantaggiato V., Simeone A., Tirone F. A PC4 fehérjét kódoló humán interferonnal kapcsolatos fejlődésszabályozó (IFRD1) gén klónozása, egy tagja fejlődésilag szabályozott gének új családja  (angol)  // Genomics : Journal. - 1998. - november ( 51. évf. , 2. sz.). - P. 233-242 . - doi : 10.1006/geno.1998.5260 . — PMID 9722946 .
2. ↑ 1 2 3 Entrez Gene: IFRD1 interferonhoz kapcsolódó fejlődési szabályozó 1 . (határozatlan)
3. ↑ Tirone F., Shooter EM Korai génszabályozás idegnövekedési faktor által PC12 sejtekben: interferonhoz kapcsolódó gén indukciója  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 1989. - március ( 86. évf. , 6. sz.). - P. 2088-2092 . - doi : 10.1073/pnas.86.6.2088 . — PMID 2467301 .
4. ↑ Gu Y., Harley IT, Henderson LB, Aronow BJ, Vietor I., Huber LA, Harley JB, Kilpatrick JR, Langefeld CD, Williams AH, Jegga AG, Chen J., Wills-Karp M., Arshad SH, Ewart SL, Thio CL, Flick LM, Filippi MD, Grimes HL, Drumm ML, Cutting GR, Knowles MR, Karp CL Identification of IFRD1 as a modifier gene for cystic fibrosis lung disease  //  Nature : Journal. - 2009. - április ( 458. évf. , 7241. sz.). - P. 1039-1042 . - doi : 10.1038/nature07811 . — PMID 19242412 .
5. ↑ Montagnoli A., Guardavaccaro D., Starace G., Tirone F. Az idegi növekedési faktorral indukálható PC3 azonnali korai gén túlzott expressziója a növekedés gátlásával társul  //  Molecular Cancer Research : folyóirat. - 1996. - október ( 7. évf. , 10. sz.). - P. 1327-1336 . — PMID 8891336 .
6. ↑ Vadivelu SK, Kurzbauer R., Dieplinger B., Zweyer M., Schafer R., Wernig A., Vietor I., Huber LA Muscle regeneration and myogenic differentiation defects in mice without TIS7  //  Molecular and Cellular Biology : folyóirat. - 2004. - április ( 24. évf. , 8. sz.). - P. 3514-3525 . - doi : 10.1128/mcb.24.8.3514-3525.2004 . — PMID 15060170 .
7. ↑ 1 2 3 4 Micheli L., Leonardi L., Conti F., Maresca G., Colazingari S., Mattei E., Lira SA, Farioli-Vecchioli S., Caruso M., Tirone F. PC4/Tis7/IFRD1 serkenti a vázizomzat regenerálódását, és a MyoD és az NF-kappaB szabályozójaként részt vesz a mioblasztok differenciálódásában  //  Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 2011. - február ( 286. évf . , 7. sz.). - P. 5691-5707 . - doi : 10.1074/jbc.M110.162842 . — PMID 21127072 .
8. ↑ 1 2 3 Micheli L., Leonardi L., Conti F., Buanne P., Canu N., Caruso M., Tirone F. A PC4 koaktiválja a MyoD-t a myocyte enhancer factor 2C hiszton-deacetiláz 4-mediált gátlásának enyhítésével  .)  // Molekuláris és sejtbiológia : folyóirat. - 2005. - március ( 25. évf. , 6. sz.). - P. 2242-2259 . - doi : 10.1128/MCB.25.6.2242-2259.2005 . — PMID 15743821 .
9. ↑ Vietor I., Vadivelu SK, Wick N., Hoffman R., Cotten M., Seiser C., Fialka I., Wunderlich W., Haase A., Korinkova G., Brosch G., Huber LA TIS7 kölcsönhatásba lép a emlős SIN3 hiszton-dezacetiláz komplex epiteliális sejtekben  //  The EMBO Journal : folyóirat. - 2002. - szeptember ( 21. évf. , 17. sz.). - P. 4621-4631 . - doi : 10.1093/emboj/cdf461 . — PMID 12198164 .
10. ↑ Micheli L., Leonardi L., Conti F., Maresca G., Colazingari S., Mattei E., Lira SA, Farioli-Vecchioli S., Caruso M., Tirone F. A PC4/Tis7/IFRD1 stimulálja a vázizomzat regenerálódását és részt vesz a myoblasztok differenciálódásában a MyoD és az NF-kappaB szabályozójaként  //  Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 2011. - február ( 286. évf . , 7. sz.). - P. 5691-5707 . - doi : 10.1074/jbc.M110.162842 . — PMID 21127072 .
11. ↑ Micheli L., Leonardi L., Conti F., Buanne P., Canu N., Caruso M., Tirone F. A PC4 koaktiválja a MyoD-t a myocyte enhancer factor 2C hiszton-deacetiláz 4-mediált gátlásával   // Molecular and Cellular Biológia : folyóirat. - 2005. - március ( 25. évf. , 6. sz.). - P. 2242-2259 . - doi : 10.1128/MCB.25.6.2242-2259.2005 . — PMID 15743821 .

Irodalom

• Tirone F., Shooter EM Korai génszabályozás idegnövekedési faktor által PC12 sejtekben: interferonhoz kapcsolódó gén indukciója  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - 1989. - 1. évf. 86 , sz. 6 . - P. 2088-2092 . - doi : 10.1073/pnas.86.6.2088 . — PMID 2467301 .
• Varnum BC, Lim RW, Herschman HR A TIS7, a svájci 3T3 sejtekben a tetradekanoil-forbol  -acetát tumorpromoter által indukált gén jellemzése //  Onkogén : folyóirat. - 1989. - 1. évf. 4 , sz. 10 . - P. 1263-1265 . — PMID 2797820 .
• Guardavaccaro D., Ciotti MT, Schäfer BW, Montagnoli A., Tirone F. A differenciálódás gátlása az interferonhoz kapcsolódó PC4 proteintől megfosztott  myoblasztokban  // Molecular Cancer Research : folyóirat. - 1995. - 1. évf. 6 , sz. 2 . - 159-169 . o . — PMID 7756174 .
• Guardavaccaro D., Montagnoli A., Ciotti MT, Gatti A., Lotti L., Di Lazzaro C., Torrisi MR, Tirone F. Az idegi növekedési faktor szabályozza az idegnövekedési faktorral indukálható PC4 fehérje szubcelluláris lokalizációját PC12 sejtekben  ( angol)  // Journal of Neuroscience Research : folyóirat. - 1994. - 1. évf. 37 , sz. 5 . - P. 660-674 . - doi : 10.1002/jnr.490370514 . — PMID 8028043 .
• Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: egyszerű módszer az eukarióta mRNS-ek kupakszerkezetének oligoribonukleotidokkal való helyettesítésére  (angolul)  // Gene : Journal. - 1994. - 1. évf. 138. sz . 1-2 . - 171-174 . o . - doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . — PMID 8125298 .
• Bonaldo MF, Lennon G., Soares MB Normalizálás és kivonás  : két megközelítés a génfelfedezés megkönnyítésére  // Genome Research : folyóirat. - 1996. - 1. évf. 6 , sz. 9 . - P. 791-806 . - doi : 10.1101/gr.6.9.791 . — PMID 8889548 .
• Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., Suyama A., Sugano S. Egy teljes hosszúságú és egy 5'-véggel dúsított cDNS könyvtár felépítése és jellemzése  (angol)  // Gene : Journal. - 1997. - 1. évf. 200 , nem. 1-2 . - 149-156 . o . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . — PMID 9373149 .
• Ge H., Si Y., Roeder RG A p52 és p75 új transzkripciós koaktivátorokat kódoló cDNS-ek izolálása feltárja a transzkripciós aktiválás alternatív szabályozási mechanizmusát  //  The EMBO Journal : folyóirat. - 1998. - Vol. 17 , sz. 22 . - P. 6723-6729 . - doi : 10.1093/emboj/17.22.6723 . — PMID 9822615 .
• Wistow G., Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A., Touchman JW, Bouffard G., Smith D., Peterson K. Humán RPE/choroid expresszált tagszekvencia elemzése a NEIBank projekthez: több mint 6000 nem redundáns átiratok, új gének és splice variánsok  //  Molecular Vision : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 8 . - 205-220 . — PMID 12107410 .
• Vietor I., Vadivelu SK, Wick N., Hoffman R., Cotten M., Seiser C., Fialka I., Wunderlich W., Haase A., Korinkova G., Brosch G., Huber LA TIS7 kölcsönhatásba lép az emlőssel SIN3 hiszton-dezacetiláz komplex epiteliális sejtekben  (angol)  // The EMBO Journal : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 21 , sz. 17 . - P. 4621-4631 . - doi : 10.1093/emboj/cdf461 . — PMID 12198164 .
• Roth A., Gill R., Certa U. Időbeli kísérleti és térbeli génexpressziós minták stroke után patkánymodellben és a PC4, a transzkripció potenciális szabályozója jellemzése  //  Molecular and Cellular Neuroscience : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 22 , sz. 3 . - P. 353-364 . - doi : 10.1016/S1044-7431(02)00039-8 . — PMID 12691737 .
• Imabayashi H., Mori T., Gojo S., Kiyono T., Sugiyama T., Irie R., Isogai T., Hata J., Toyama Y., Umezawa A. A dedifferenciált kondrociták újradifferenciálása és a humán csontvelő stroma chondrogenesis sejtek kondroszféra kialakításán keresztül expressziós profilozással nagyléptékű cDNS-analízissel  //  Kísérleti sejtkutatás : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 288. sz . 1 . - P. 35-50 . - doi : 10.1016/S0014-4827(03)00130-7 . — PMID 12878157 .
• Micheli L., Leonardi L., Conti F., Buanne P., Canu N., Caruso M., Tirone F. A PC4 koaktiválja a MyoD-t a myocyte enhancer factor  2C hiszton-deacetiláz 4-mediált gátlásával  // Molecular and Cellular Biology : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 25 , sz. 6 . - P. 2242-2259 . - doi : 10.1128/MCB.25.6.2242-2259.2005 . — PMID 15743821 .
• Vietor I., Kurzbauer R., Brosch G., Huber LA TIS7 a béta-catenin/Tcf-4 target gén oszteopontin (OPN) szabályozása hiszton-deacetiláz-függő  (angol)  // Journal of Biological Chemistry  : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 280 , sz. 48 . - P. 39795-39801 . - doi : 10.1074/jbc.M509836200 . — PMID 16204248 .
• Guo H., Gao C., Mi Z., Zhang J., Kuo PC A PC4 kötődomén jellemzése és kölcsönhatásai a HNF4alfával  //  Journal of Biochemistry : folyóirat. - 2007. - Vol. 141. sz . 5 . - P. 635-640 . - doi : 10.1093/jb/mvm066 . — PMID 17317687 .