SIN3B

A transzkripciós szabályozók SIN3 családjának B tagja

Az EKT az 1e91-en alapul.

Elérhető struktúrák

Ortológus keresés: PDBe , RCSB

EKT azonosítók listája
1e91 , 1pd7 , 2cr7 , 2czy , 2f05

Azonosítók

Szimbólum

SIN3B ; KIAA0700

Külső azonosítók

OMIM: 607777 MGI : 107158 HomoloGene : 81810 GeneCards : SIN3B gén

Gén ontológia
Funkció	• kromatin megkötés • transzkripciós korepresszor aktivitás • fehérjekötés
sejtkomponens	• Xkromoszóma • Y kromoszóma • XY test • sejtmag • nukleoplazma • citoplazma • autoszóm
biológiai folyamat	• transzkripció, DNS-templált • vázizomszövet fejlődése • sejtes lipid anyagcsere folyamat • kis molekulájú anyagcsere folyamat • negatív transzkripció szabályozás, DNS-templált • ritmikus folyamat • szívizomszövet fejlődése
Források: Amigo / QuickGO

RNS expressziós profil

Több információ

ortológusok

Kilátás

Emberi

Egér

Entrez

RefSeq (mRNS)

RefSeq (fehérje)

Locus (UCSC)

Chr 19:
16,94 – 16,99 Mb

Chr 8:
72,72 – 72,76 Mb

Keresés a PubMedben

[egy]

[2]

A SIN3B ( Paired amphipathic helix protein Sin3a) egy fehérje , amelyet emberben a SIN3B gén kódol [1] [2] .

Kölcsönhatások más fehérjékkel

Kimutatták, hogy a SIN3B kölcsönhatásba lép a HDAC1 -gyel [3] [4] , a cink ujjal és a 16-os fehérjét tartalmazó BTB doménnel [5] , a SUDS3 -mal [6] és az IKZF1 -gyel [4] [7] .

Jegyzetek

↑ Ishikawa K., Nagase T., Suyama M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Az azonosítatlan humán gének kódoló szekvenciáinak előrejelzése. X. Az agyból származó 100 új cDNS-klón teljes szekvenciája, amelyek in vitro nagy fehérjéket kódolhatnak // DNA Res : folyóirat. - 1998. - December ( 5. köt. , 3. sz.). - 169-176 . o . - doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . — PMID 9734811 .
↑ Entrez gén: SIN3B SIN3 homológ B, transzkripció szabályozó (élesztő) . Az eredetiből archiválva: 2010. december 5. (határozatlan)
↑ Zhang, Y; NgHH; Erdjument Bromage H; TempstP; madár A; Reinberg D. A NuRD alegységek elemzése hiszton-deacetiláz magkomplexet és DNS-metilációval való kapcsolatot tár fel // Genes Dev . : folyóirat. - EGYESÜLT ÁLLAMOK, 1999. - augusztus ( 13. köt. , 15. sz.). - P. 1924-1935 . — ISSN 0890-9369 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
↑ 1 2 Koipally, J; Renold A; Kim J; Georgopoulos K. Ikaros és Aiolos elfojtását hiszton-dezacetiláz komplexek közvetítik (angol) // EMBO J. : folyóirat. - ANGOLORSZÁG, 1999. - június ( 18. évf. , 11. sz.). - P. 3090-3100 . — ISSN 0261-4189 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
↑ David, G; Alland L; Hong S.H.; Wong CW; DePinho RA; Dejean A. Az mSin3A-val kapcsolatos hiszton-dezacetiláz az akut promielocitás leukémiával összefüggő PLZF fehérje általi repressziót közvetíti // Onkogén : folyóirat. - ANGOLORSZÁG, 1998. - május ( 16. évf. , 19. sz.). - P. 2549-2556 . — ISSN 0950-9232 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
↑ Alland, Leila; David Gregory, Shen-Li Hong, Potes Jason, Muhle Rebecca, Lee Hye-Chun, Hou Harry, Chen Ken, DePinho Ronald A. Az emlősök Sds3 azonosítása a Sin3/Histone Deacetiláz Corepressor Complex integrált komponenseként / Mol. sejt. Biol. : folyóirat. - Egyesült Államok, 2002. - április ( 22. kötet , 8. szám ). - P. 2743-2750 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . — PMID 11909966 .
↑ Koipally, József; Georgopulosz Katia. Az Ikaros elfojtási áramkörének molekuláris boncolása // J. Biol. Chem. : folyóirat. - Egyesült Államok, 2002. - augusztus ( 277. kötet , 31. szám ). - P. 27697-27705 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .

Irodalom

Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN A Mad-Max transzkripciós repressziót a Sin3 élesztőrepresszor emlős homológjaival hármas komplexképzés közvetíti // Cell : Journal. - Cell Press , 1995. - Vol. 80 , sz. 5 . - P. 767-776 . - doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . — PMID 7889570 .
David G., Alland L., Hong SH és mtsai. Az mSin3A-val kapcsolatos hiszton-dezacetiláz közvetíti az akut promielocitás leukémiával összefüggő PLZF fehérje általi repressziót // Onkogén : folyóirat. - 1998. - Vol. 16 , sz. 19 . - P. 2549-2556 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Ikaros és Aiolos represszióját hiszton-dezacetiláz komplexek közvetítik // EMBO J. : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 18 , sz. 11 . - P. 3090-3100 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
Naruse Y., Aoki T., Kojima T., Mori N. Az idegi restriktív hangtompító faktor az mSin3-at és a hiszton-deacetiláz komplexet toborozza a neuron-specifikus célgének elnyomására // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : Journal. - 2000. - Vol. 96 , sz. 24 . - P. 13691-13696 . - doi : 10.1073/pnas.96.24.13691 . — PMID 10570134 .
Spronk CA, Tessari M., Kaan AM és mtsai. A Mad1-Sin3B kölcsönhatás egy új spirális redőt foglal magában // Nat . Struktúra. Biol. : folyóirat. - 2001. - 20. évf. 7 , sz. 12 . - P. 1100-1104 . - doi : 10.1038/81944 . — PMID 11101889 .
Spronk CA, Jansen JF, Tessari M. és mtsai. A Sin3B PAH2 doménjének szekvencia-specifikus hozzárendelése szabad és Mad1-hez kötött // J. Biomol . NMR : folyóirat. - 2001. - 20. évf. 19 , sz. 4 . - P. 377-378 . - doi : 10.1023/A:1011262214741 . — PMID 11370785 .
Alland L., David G., Shen-Li H. és mtsai. Az emlős Sds3 azonosítása a Sin3/hiszton-deacetiláz korepresszor komplex szerves komponenseként // Mol . sejt. Biol. : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 22 , sz. 8 . - P. 2743-2750 . - doi : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . — PMID 11909966 .
Rayman JB, Takahashi Y., Indian VB, et al. Az E2F sejtciklus-függő transzkripciós repressziót közvetít in vivo egy HDAC1/mSin3B korepresszor komplex toborzásával // Genes Dev. : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 16 , sz. 8 . - P. 933-947 . - doi : 10.1101/gad.969202 . — PMID 11959842 .
Koipally J., Georgopoulos K. Az Ikaros repressziós áramkörének molekuláris boncolása // J. Biol. Chem. : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
Yang L., Mei Q., Zielinska-Kwiatkowska A. et al. Egy ERG-hez (ets-kapcsolódó génhez) kapcsolódó hiszton-metiltranszferáz kölcsönhatásba lép a hiszton-dezacetiláz 1/2-vel és az mSin3A/B transzkripciós társrepresszorokkal // Biochem . J. : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 369. sz . 3. pont . - P. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH és mtsai. Több mint 15 000 teljes hosszúságú emberi és egér cDNS-szekvencia előállítása és kezdeti elemzése // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : Journal . - 2003. - 1. évf. 99 , sz. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Petrie K., Guidez F., Howell L. és mtsai. A hiszton-dezacetiláz 9 gén több fehérje izoformát kódol // J. Biol. Chem. : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 278. sz . 18 . - P. 16059-16072 . - doi : 10.1074/jbc.M212935200 . — PMID 12590135 .
Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, et al. A humán Sin3 dezacetilázt és a trithoraxszal kapcsolatos Set1/Ash2 hiszton H3-K4 metiltranszferázt a HCF-1 sejtproliferációs faktor szelektíven köti össze // Genes Dev . : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 17 , sz. 7 . - P. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. és mtsai. 21 243 teljes hosszúságú humán cDNS teljes szekvenálása és jellemzése // Nat . Közönséges petymeg. : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 36 , sz. 1 . - P. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Dugast-Darzacq C., Pirity M., Blanck JK és munkatársai. Mxi1-SRalpha: egy új Mxi1 izoforma fokozott transzkripciós repressziós potenciállal // Onkogén : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 23 , sz. 55 . - P. 8887-8899 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208107 . — PMID 15467743 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA és munkatársai. Az NIH teljes hosszúságú cDNS-projekt állapota, minősége és kiterjesztése: The Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Res. : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 14 , sz. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Rampalli S., Pavithra L., Bhatt A. és mtsai. A SMAR1 tumorszuppresszor közvetíti a ciklin D1 elnyomást a SIN3/hiszton dezacetiláz 1 komplex toborzásával // Mol . sejt. Biol. : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 25 , sz. 19 . - P. 8415-8429 . - doi : 10.1128/MCB.25.19.8415-8429.2005 . — PMID 16166625 .
Xu Y., Sengupta PK, Seto E., Smith BD RFX család fehérjék eltérően kölcsönhatásba lépnek a HDAC-kkal, hogy elnyomják a kollagén alfa 2(I) gén (COL1A2) expresszióját (angol) // J. Biol. Chem. : folyóirat. - 2006. - 20. évf. 281. sz . 14 . - P. 9260-9270 . - doi : 10.1074/jbc.M511724200 . — PMID 16464847 .