HMG20B

Nagy mobilitású csoport 20B

Az EKT a 2crj.

Elérhető struktúrák

Ortológus keresés: PDBe , RCSB

EKT azonosítók listája
2crj

Azonosítók

Szimbólum

HMG20B ; BRAF25; BRAF35; HMGX2; HMXB2; PP7706; SMARCE1r; SOXL; pp8857

Külső azonosítók

OMIM: 605535 MGI : 1341190 HomoloGene : 74949 GeneCards : HMG20B gén

Gén ontológia
Funkció	• DNS-kötés • fehérjekötés • fehérje heterodimerizációs aktivitás
sejtkomponens	• mag • nukleoplazma • kromoszóma • nucleolus
biológiai folyamat	• transzkripció, DNS-templált • transzkripció szabályozása, DNS-templált • sejtciklus • véralvadás • kromatin módosulás • fehérje szumoiláció negatív szabályozása • vázizom sejt differenciálódás • a neuronok differenciálódásának pozitív szabályozása
Források: Amigo / QuickGO

RNS expressziós profil

Több információ

ortológusok

Kilátás

Emberi

Egér

Entrez

RefSeq (mRNS)

RefSeq (fehérje)

Locus (UCSC)

Chr 19:
3,57 – 3,58 Mb

Chr 10:
81,35 – 81,35 Mb

Keresés a PubMedben

[egy]

[2]

SWI/SNF-asszociált, templát-asszociált aktin-függő kromatin szabályozó, az E alcsalád 1-függő tagja , egy fehérje , amelyet emberben a HMG20B gén kódol [1] [2] .

Interakciók

A HMG20B-ről kimutatták, hogy kölcsönhatásba lép a KIF4A -val [3] , a HDAC1 -gyel [4] , a hiszton-dezacetiláz-2 -vel [4] [5] , a PHF21A -val [4] [6] , az RCOR1 -gyel [4] és a BRCA2 -vel [4] [7] .

Jegyzetek

↑ Sumoy L., Carim L., Escarceller M., Nadal M., Gratacos M., Pujana MA, Estivill X., Peral B. A HMG20A és a HMG20B a 15q24 és 19p13.3 humán kromoszómákhoz illeszkedik, és a HMG külön osztályát alkotják -box gének mindenütt jelenlévő expresszióval // Citogenetika és genomkutatás : folyóirat. - 2000. - június ( 88. évf. , 1-2. sz. ). - P. 62-7 . - doi : 10.1159/000015486 . — PMID 10773667 .
↑ Entrez Gene: HMG20B nagy mobilitású 20B csoport . Az eredetiből archiválva: 2010. december 5. (határozatlan)
↑ Lee, Young Mi; Kim Wankee. A humán kinezin szupercsalád 4-es fehérjetagjának asszociációja a BRCA2-vel asszociált 35-ös faktorral // Biochemical Journal : folyóirat. – Anglia, 2003. – Szeptember ( 374. köt. , 2. sz.). - P. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
↑ 1 2 3 4 5 Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Chenoweth Josh; Lane William S; Mandel Gail; Shiekhattar Ramin. A hiszton-deacetilázt tartalmazó mag-BRAF35 komplex közvetíti a neuron-specifikus gének elnyomását (angol) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : Journal. - Egyesült Államok, 2002. - május ( 99. kötet , 11. szám ). - P. 7420-7425 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. Az X-kapcsolt mentális retardációs gén jelölt a hiszton-deacetiláz-tartalmú komplexek új családjának összetevője (angol) // Journal of Biological Chemistry : folyóirat. - Egyesült Államok, 2003. - február ( 278. kötet , 9. szám ). - P. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
↑ Iwase, Shigeki; Januma Aya; Miyamoto Kiyoko; Shono Naomi Honda Arata; Yanagisawa Junn; Baba Tadashi. A BHC80 jellemzése a BRAF-HDAC komplexben, amely részt vesz a neuron-specifikus génelnyomásban // Biokémiai és biofizikai kutatási kommunikáció : folyóirat. - Egyesült Államok, 2004. - szeptember ( 322. kötet , 2. szám ). - P. 601-608 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
↑ Marmorstein, LY; Kinev A.V.; Chan GK; Bochar D.A.; Beniya H; Epstein JA; Yen TJ; Shiekhattar R. A strukturális DNS-kötő komponenst tartalmazó humán BRCA2 komplex befolyásolja a sejtciklus progresszióját // Cell : Journal. - Egyesült Államok: Cell Press , 2001. - január ( 104. kötet , 2. szám ). - P. 247-257 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .

Irodalom

Wattler F., Wattler S., Kelly M. és mtsai. A nagy mobilitású 365-ös csoport géncsaládjának új tagjának, az egér Smarce1-hez kapcsolódó klónozása, kromoszómális elhelyezkedése és expressziós elemzése // Genomics : Journal. - 1999. - 1. évf. 60 , sz. 2 . - 172-178 . o . - doi : 10.1006/geno.1999.5913 . — PMID 10486208 .
Marmorstein LY, Kinev AV, Chan GK és mtsai. A strukturális DNS-kötő komponenst tartalmazó humán BRCA2 komplex befolyásolja a sejtciklus progresszióját // Cell : Journal. - Cell Press , 2001. - Vol. 104 , sz. 2 . - P. 247-257 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .
Lee YM, Shin H., Choi W. és mtsai. A humán SMARCE1r nagy mobilitású csoport fehérjéjének jellemzése (angol) // Biochimica et Biophysica Acta : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 1574 , sz. 3 . - 269-276 . o . - doi : 10.1016/s0167-4781(01)00373-6 . — PMID 11997092 .
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J. és mtsai. A hiszton-deacetilázt tartalmazó mag-BRAF35 komplex közvetíti a neuron-specifikus gének elnyomását (angol) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : Journal. - 2002. - 20. évf. 99 , sz. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
Wang C., McCarty IM, Balázs L. és mtsai. BRCA2-asszociált 35-ös faktor alternatív splicing fehérjét kódoló cDNS klónozása // Biokémiai és biofizikai kutatási kommunikáció : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 295 , sz. 1 . - 129-135 . o . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00624-1 . — PMID 12083779 .
Wang C., McCarty IM, Balázs L. és mtsai. A BRAF25 immunhisztológiai kimutatása humán prosztatatumor- és rákmintákban // Biokémiai és biofizikai kutatási közlemények : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 295 , sz. 1 . - P. 136-141 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00625-3 . — PMID 12083780 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH és mtsai. Több mint 15 000 teljes hosszúságú emberi és egér cDNS-szekvencia előállítása és kezdeti elemzése // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : Journal . - 2003. - 1. évf. 99 , sz. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Hakimi MA, Dong Y., Lane WS és mtsai. Az X-kapcsolt mentális retardációs gén jelölt a hiszton-deacetiláz-tartalmú komplexek új családjának összetevője (angol) // Journal of Biological Chemistry : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 278. sz . 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Lee YM, Kim W. A humán kinezin szupercsalád 4-es fehérjetagjának társulása a BRCA2-asszociált 35-ös faktorral // Biochemical Journal : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 374. sz . 2. pont . - P. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. és mtsai. 21 243 teljes hosszúságú humán cDNS teljes szekvenálása és jellemzése // Nature Genetics : folyóirat . - 2004. - 20. évf. 36 , sz. 1 . - P. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Grimwood J., Gordon LA, Olsen A. és mtsai. A 19-es humán kromoszóma DNS-szekvenciája és biológiája (angol) // Nature : Journal. - 2004. - 20. évf. 428 , sz. 6982 . - P. 529-535 . - doi : 10.1038/nature02399 . — PMID 15057824 .
Iwase S., Januma A., Miyamoto K. és mtsai. A BHC80 jellemzése a BRAF-HDAC komplexben, amely részt vesz a neuron-specifikus génelnyomásban // Biokémiai és biofizikai kutatási kommunikáció : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 322. sz . 2 . - P. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA és munkatársai. Az NIH teljes hosszúságú cDNS-projektjének állapota, minősége és kiterjesztése: az emlős géngyűjtemény (MGC ) // Genome Research : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 14 , sz. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K., Hao T. és mások. A humán fehérje-fehérje interakciós hálózat proteomléptékű térképe felé (angol) // Nature : Journal. - 2005. - 20. évf. 437 , sz. 7062 . - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .