RCOR1

REST corepressor 1

Az EKT -t példaként a 2iw5 képviseli.

Elérhető struktúrák

Ortológus keresés: PDBe , RCSB

EKT azonosítók listája
2IW5 , 2UXN , 2UXX , 2V1D , 2X0L , 2XAF , 2XAG , 2XAH , 2XAJ , 2XAQ , 2XAS , 2Y48 , 3ZMS , 3ZMT , 3ZMS , 3ZMT , 3ZMN _ _ _ _ _ _ _ _

Azonosítók

Szimbólum

RCOR1 ; COREST; RCOR

Külső azonosítók

OMIM: 607675 MGI : 106340 HomoloGene : 32246 GeneCards : RCOR1 Gene

Gén ontológia
Funkció	• RNS polimeráz II core promoter proximális régió szekvencia-specifikus DNS-kötő transzkripciós faktor aktivitása, amely részt vesz a transzkripció negatív szabályozásában • kromatinkötés • fehérjekötés • transzkripció szabályozó régió DNS-kötés
sejtkomponens	• mag • nucleoplasma • nucleolus • transzkripciós represszor komplex
biológiai folyamat	• az RNS polimeráz II promoterről történő transzkripció negatív szabályozása • transzkripció, DNS-templált • véralvadás • vírusos folyamat • transzkripció negatív szabályozása, DNS-templált • hiszton H4 dezacetilezés
Források: Amigo / QuickGO

ortológusok

Kilátás

Emberi

Egér

Entrez

RefSeq (mRNS)

RefSeq (fehérje)

Locus (UCSC)

Chr 14:
103,06 – 103,2 Mb

Chr 12:
111,04 – 111,12 Mb

Keresés a PubMedben

[egy]

[2]

A REST 1 korepresszor , más néven CoREST , az emberben az RCOR1 gén által kódolt fehérje . [1] [2]

Funkció

Ez a gén olyan fehérjét kódol , amely jól konzervált, születéskor elnyomott, és specifikus szerepet játszik a neuronális differenciálódás meghatározásában. A kódolt fehérje a REST C-terminális doménjéhez kötődik ( represszor elem-1 csendesítő transzkripciós faktor ). [ 2]

Interakciók

Az RCOR1 kölcsönhatásba lép a következőkkel:

HDAC1 , [3] [4]
HDAC2 , [3] [4]
HMG20B , [3]
REST (biológia) [5] és
PHF21A . [3] [6]

Jegyzetek

↑ Andrés ME, Burger C., Peral-Rubio MJ, Battaglioli E., Anderson ME, Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: a funkcionális korepresszor szükséges a neurális specifikus génexpresszió szabályozásához ( angol) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : folyóirat. - 1999. - szeptember ( 96. évf. , 17. sz.). - P. 9873-9878 . - doi : 10.1073/pnas.96.17.9873 . — PMID 10449787 .
↑ 1 2 Entrez Gene: RCOR1 REST corepressor 1 . Az eredetiből archiválva: 2010. december 5. (határozatlan)
↑ 1 2 3 4 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. A hiszton-deacetilázt tartalmazó mag-BRAF35 komplex közvetíti a neuron-specifikus gének represszióját (angol) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : folyóirat. - 2002. - május ( 99. évf. , 11. sz.). - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
↑ 1 2 You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL A CoREST a CoREST-humán hiszton-dezacetiláz komplex szerves része // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : Journal . - 2001. - február ( 98. évf. , 4. sz.). - P. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
↑ Andrés ME, Burger C., Peral-Rubio MJ, Battaglioli E., Anderson ME, Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: a funkcionális korepresszor szükséges a neurális specifikus génexpresszió szabályozásához ( angol) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : folyóirat. - 1999. - augusztus ( 96. évf. , 17. sz.). - P. 9873-9878 . - doi : 10.1073/pnas.96.17.9873 . — PMID 10449787 .
↑ Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. A BHC80 jellemzése BRAF-HDAC komplexben, részt vesz a neuron-specifikus génrepresszióban // Biokémiai és biofizikai kutatás Kommunikáció : folyóirat. - 2004. - szeptember ( 322. évf . , 2. sz.). - P. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .

Irodalom

Nomura N., Nagase T., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Sato S., Seki N., Kawarabayasi Y., Ishikawa K., Tabata S. Azonosítatlan humán gének kódoló szekvenciáinak előrejelzése. II. 40 új gén ( KIAA0041 -KIAA0080) kódoló szekvenciája a KG-1 humán sejtvonal cDNS-klónjainak elemzésével // DNA Research : folyóirat. - 1994. - 1. évf. 1 , sz. 5 . - P. 223-229 . - doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . — PMID 7584044 .
Andersson B., Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W., Gibbs RA Egy "kettős adapteres" módszer a shotgun könyvtár felépítésének javításához // Analytical Biochemistry : folyóirat. - 1996. - 1. évf. 236. sz . 1 . - 107-113 . o . - doi : 10.1006/abio.1996.0138 . — PMID 8619474 .
Yu W., Andersson B., Worley KC, Muzny DM, Ding Y., Liu W., Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G., Gibbs RA Large-scale concatenation cDNS szekvenálás // Genome Research : folyóirat. - 1997. - 1. évf. 7 , sz. 4 . - P. 353-358 . - doi : 10.1101/gr.7.4.353 . — PMID 9110174 .
Grimes JA, Nielsen SJ, Battaglioli E., Miska EA, Speh JC, Berry DL, Atouf F., Holdener BC, Mandel G., Kouzarides T. Az mSin3A társrepresszor a REST-CoREST represszor komplex funkcionális komponense ( angol) // Journal of Biological Chemistry : folyóirat. - 2000. - Vol. 275. sz . 13 . - P. 9461-9467 . doi : 10.1074 / jbc.275.13.9461 . — PMID 10734093 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNS klónozás in vitro helyspecifikus rekombinációval // Genome Research : folyóirat. - 2000. - Vol. 10 , sz. 11 . - P. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR, Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard BH. Stabil hiszton-dezacetiláz komplexek, amelyek megkülönböztethetők a SANT doménfehérjék CoREST/kiaa0071 és Mta-L1 jelenlétével (angolul) // Journal of Biológiai kémia : folyóirat. - 2001. - 20. évf. 276. sz . 9 . - P. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL A Corest a CoREST-humán hiszton-dezacetiláz komplex szerves része (angol) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : Journal. - 2001. - 20. évf. 98 , sz. 4 . - P. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
Ballas N., Battaglioli E., Atouf F., Andres ME, Chenoweth J., Anderson ME, Burger C., Moniwa M., Davie JR, Bowers WJ, Federoff HJ, Rose DW, Rosenfeld MG, Brehm P., Mandel G. A neuronális tulajdonságok szabályozása egy új transzkripciós komplex által // Neuron : folyóirat. - Cell Press , 2001. - Vol. 31 , sz. 3 . - P. 353-365 . - doi : 10.1016/S0896-6273(01)00371-3 . — PMID 11516394 .
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. A hiszton-deacetilázt tartalmazó mag-BRAF35 komplex közvetíti a neuron-specifikus gének elnyomását (angol) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United Amerika államai : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 99 , sz. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
Battaglioli E., Andrés ME, Rose DW, Chenoweth JG, Rosenfeld MG, Anderson ME, Mandel G. A neuronális gének REST repressziójához a hSWI.SNF komplex komponensei szükségesek // Journal of Biological Chemistry : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 43 . - P. 41038-41045 . - doi : 10.1074/jbc.M205691200 . — PMID 12192000 .
Lunyak VV, Burgess R., Prefontaine GG, Nelson C., Sze SH, Chenoweth J., Schwartz P., Pevzner PA, Glass C., Mandel G., Rosenfeld MG Corepressor-dependent silenceing of chromosomal regions encoding neuronal genes // Tudomány: folyóirat. - 2002. - 20. évf. 298 , sz. 5599 . - P. 1747-1752 . - doi : 10.1126/tudomány.1076469 . — PMID 12399542 .
Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. Az X-kapcsolt mentális retardációs gén jelölt a hiszton-deacetilázt tartalmazó komplexek új családjának összetevője (angol) // Journal of Biological Chemistry : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 278. sz . 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. A BHC80 jellemzése BRAF-HDAC komplexben, részt vesz a neuron-specifikus génrepresszióban (angol) // Biokémiai és Biofizikai kutatási kommunikáció : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 322. sz . 2 . - P. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Gu H., Liang Y., Mandel G., Roizman B. A REST/CoREST/hiszton deacetiláz represszor komplex komponensei megszakadnak, módosulnak és áthelyeződnek HSV-1-fertőzött sejtekben (angol) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 102 , sz. 21 . - P. 7571-7576 . - doi : 10.1073/pnas.0502658102 . — PMID 15897453 .
Lee MG, Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. A CoREST alapvető szerepe a nukleoszomális hiszton 3 lizin 4 demetilációjában // Nature : Journal. - 2005. - 20. évf. 437 , sz. 7057 . - P. 432-435 . - doi : 10.1038/nature04021 . — PMID 16079794 .
Shi YJ, Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. Az LSD1 hiszton-demetiláz aktivitásának szabályozása kapcsolódó tényezők által // Molecular Cell : folyóirat. - 2005. - 20. évf. 19 , sz. 6 . - P. 857-864 . - doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.027 . — PMID 16140033 .
Nousiainen M., Silljé HH, Sauer G., Nigg EA, Körner R. Phosphoproteome analysis of the human mitotic spindle (angol) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : Journal. - 2006. - 20. évf. 103 , sz. 14 . - P. 5391-5396 . - doi : 10.1073/pnas.0507066103 . — PMID 16565220 .